Difference between revisions of "Test graph - BioConductor package dependancies"

From FollowTheScore
Jump to: navigation, search
(Replacing page with '{{#wgraph: svg | thumb = 40 | node hs133xptentrezgcdf node hs95av2hsrefseqprobe node pfahomology node mm74av2mmug }}')
 
(14 intermediate revisions by 2 users not shown)
Line 1: Line 1:
−
{{#wgraph: svg | thumb = 40 |
+
This graph shows the package dependencies for the BioConductor software for the statistical analysis of microarrary data in R. The dependency list was generated from the BioConductor-1.9 software repository HTML pages.
−
node hs133xptentrezgcdf
+
 
−
node hs95av2hsrefseqprobe  
+
Unfortunately it is too large to be used on this webserver (due to memory limitations). A slightly shorter list (75%) would work. See also [[Test graph 2]] ...
−
node pfahomology
+
 
−
node mm74av2mmug  
+
{{#wgraph: png | thumb=40 |  
 +
nodetype * { font helvR08 }
 +
layoutalgorithm=forcedir
 +
edge gpls NONE {}
 +
edge sigPathway R {}
 +
edge TypeInfo methods {}
 +
edge Biostrings R {}
 +
edge Biostrings methods {}
 +
edge Mfuzz R {}
 +
edge Mfuzz Biobase {}
 +
edge Mfuzz e1071 {}
 +
edge LMGene R {}
 +
edge LMGene Biobase {}
 +
edge LMGene multtest {}
 +
edge LMGene survival {}
 +
edge ecolitk R {}
 +
edge ecolitk affy {}
 +
edge ecolitk ecoliLeucine {}
 +
edge ecolitk ecolicdf {}
 +
edge ecolitk Biobase {}
 +
edge maCorrPlot NONE {}
 +
edge OLINgui R {}
 +
edge OLINgui OLIN {}
 +
edge xcms R {}
 +
edge xcms methods {}
 +
edge rflowcyt R {}
 +
edge rflowcyt survival {}
 +
edge rflowcyt xtable {}
 +
edge rflowcyt stats {}
 +
edge rflowcyt KernSmooth {}
 +
edge rflowcyt MASS {}
 +
edge rflowcyt grid {}
 +
edge rflowcyt methods {}
 +
edge rflowcyt hexbin {}
 +
edge rflowcyt rfcdmin {}
 +
edge rflowcyt fields {}
 +
edge rflowcyt lattice {}
 +
edge rflowcyt locfit {}
 +
edge daMA MASS {}
 +
edge made4 ade4 {}
 +
edge made4 scatterplot3d {}
 +
edge biomaRt methods {}
 +
edge biomaRt XML {}
 +
edge biomaRt RCurl {}
 +
edge gaggle rJava {}
 +
edge gaggle graph {}
 +
edge affylmGUI limma {}
 +
edge affylmGUI tcltk {}
 +
edge affylmGUI affy {}
 +
edge affylmGUI Biobase {}
 +
edge SAGElyzer AnnBuilder {}
 +
edge SAGElyzer tkWidgets {}
 +
edge SAGElyzer genefilter {}
 +
edge SAGElyzer annotate {}
 +
edge GeneR NONE {}
 +
edge GeneSpring Biobase {}
 +
edge GeneSpring methods {}
 +
edge geneplotter annotate {}
 +
edge geneplotter Biobase {}
 +
edge geneplotter methods {}
 +
edge BioMVCClass methods {}
 +
edge BioMVCClass MVCClass {}
 +
edge BioMVCClass Biobase {}
 +
edge BioMVCClass graph {}
 +
edge BioMVCClass Rgraphviz {}
 +
edge sizepower stats {}
 +
edge PROcess Icens {}
 +
edge snapCGH limma {}
 +
edge snapCGH tilingArray {}
 +
edge snapCGH DNAcopy {}
 +
edge snapCGH aCGH {}
 +
edge snapCGH GLAD {}
 +
edge snapCGH cluster {}
 +
edge snapCGH methods {}
 +
edge bioDist methods {}
 +
edge bioDist Biobase {}
 +
edge marray limma {}
 +
edge marray methods {}
 +
edge tkWidgets methods {}
 +
edge tkWidgets widgetTools {}
 +
edge tkWidgets DynDoc {}
 +
edge rama NONE {}
 +
edge Ruuid methods {}
 +
edge arrayQuality marray {}
 +
edge arrayQuality limma {}
 +
edge arrayQuality convert {}
 +
edge arrayQuality hexbin {}
 +
edge arrayQuality gridBase {}
 +
edge arrayQuality RColorBrewer {}
 +
edge GraphAT MCMCpack {}
 +
edge GraphAT graph {}
 +
edge beadarray limma {}
 +
edge beadarray Biobase {}
 +
edge beadarray affy {}
 +
edge beadarray methods {}
 +
edge ppiStats apComplex {}
 +
edge ppiStats GO {}
 +
edge ppiStats GOstats {}
 +
edge ppiStats YEAST {}
 +
edge ppiStats graph {}
 +
edge ppiStats Rgraphviz {}
 +
edge ppiStats Category {}
 +
edge pcaMethods MASS {}
 +
edge pcaMethods ellipse {}
 +
edge pcaMethods pls {}
 +
edge pcaMethods methods {}
 +
edge GlobalAncova methods {}
 +
edge webbioc Biobase {}
 +
edge webbioc affy {}
 +
edge webbioc multtest {}
 +
edge webbioc annaffy {}
 +
edge webbioc vsn {}
 +
edge webbioc gcrma {}
 +
edge webbioc qvalue {}
 +
edge cghMCR methods {}
 +
edge cghMCR DNAcopy {}
 +
edge cghMCR marray {}
 +
edge cghMCR arrayQuality {}
 +
edge widgetInvoke methods {}
 +
edge widgetInvoke XML {}
 +
edge widgetInvoke RGtk {}
 +
edge hexbin methods {}
 +
edge hexbin grid {}
 +
edge hexbin lattice {}
 +
edge hexbin colorspace {}
 +
edge matchprobes Biobase {}
 +
edge matchprobes affy {}
 +
edge siggenes methods {}
 +
edge siggenes multtest {}
 +
edge siggenes Biobase {}
 +
edge AnnBuilder methods {}
 +
edge AnnBuilder Biobase {}
 +
edge AnnBuilder XML {}
 +
edge AnnBuilder annotate {}
 +
edge AnnBuilder utils {}
 +
edge AnnBuilder RSQLite {}
 +
edge pamr NONE {}
 +
edge RBGL graph {}
 +
edge RBGL methods {}
 +
edge biocViews methods {}
 +
edge biocViews tools {}
 +
edge biocViews graph {}
 +
edge biocViews RBGL {}
 +
edge biocViews XML {}
 +
edge CoCiteStats humanLLMappings {}
 +
edge ChromoViz RSvgDevice {}
 +
edge ChromoViz XML {}
 +
edge GOstats graph {}
 +
edge GOstats GO {}
 +
edge GOstats annotate {}
 +
edge GOstats RBGL {}
 +
edge GOstats Biobase {}
 +
edge GOstats Category {}
 +
edge GOstats methods {}
 +
edge prada Biobase {}
 +
edge prada RColorBrewer {}
 +
edge prada grid {}
 +
edge prada methods {}
 +
edge prada geneplotter {}
 +
edge bridge rama {}
 +
edge ontoTools methods {}
 +
edge ontoTools graph {}
 +
edge ontoTools SparseM {}
 +
edge ontoTools GO {}
 +
edge ontoTools Biobase {}
 +
edge ontoTools annotate {}
 +
edge MCRestimate e1071 {}
 +
edge MCRestimate pamr {}
 +
edge MCRestimate randomForest {}
 +
edge MCRestimate RColorBrewer {}
 +
edge MCRestimate Biobase {}
 +
edge MCRestimate golubEsets {}
 +
edge aroma.light R.oo {}
 +
edge pkgDepTools methods {}
 +
edge pkgDepTools graph {}
 +
edge pkgDepTools RBGL {}
 +
edge MeasurementError.cor NONE {}
 +
edge logicFS LogicReg {}
 +
edge copa Biobase {}
 +
edge copa methods {}
 +
edge Category Biobase {}
 +
edge Category KEGG {}
 +
edge Category GO {}
 +
edge Category graph {}
 +
edge Category annotate {}
 +
edge Category methods {}
 +
edge Category genefilter {}
 +
edge Harshlight affy {}
 +
edge OrderedList Biobase {}
 +
edge OrderedList twilight {}
 +
edge MVCClass methods {}
 +
edge panp affy {}
 +
edge LPE NONE {}
 +
edge MANOR GLAD {}
 +
edge RbcBook1 Biobase {}
 +
edge vsn Biobase {}
 +
edge iSPlot methods {}
 +
edge iSPlot RGtk {}
 +
edge iSPlot gtkDevice {}
 +
edge iSPlot MVCClass {}
 +
edge pickgene MASS {}
 +
edge makecdfenv methods {}
 +
edge makecdfenv Biobase {}
 +
edge makecdfenv affy {}
 +
edge makecdfenv utils {}
 +
edge makecdfenv affyio {}
 +
edge aCGH cluster {}
 +
edge aCGH survival {}
 +
edge aCGH multtest {}
 +
edge aCGH sma {}
 +
edge KEGGSOAP methods {}
 +
edge KEGGSOAP XML {}
 +
edge KEGGSOAP SSOAP {}
 +
edge KEGGSOAP RCurl {}
 +
edge annotate methods {}
 +
edge annotate Biobase {}
 +
edge limma methods {}
 +
edge timecourse limma {}
 +
edge timecourse MASS {}
 +
edge timecourse Biobase {}
 +
edge timecourse methods {}
 +
edge nem e1071 {}
 +
edge nem graph {}
 +
edge nem Rgraphviz {}
 +
edge nem RBGL {}
 +
edge HEM Biobase {}
 +
edge SBMLR XML {}
 +
edge SBMLR odesolve {}
 +
edge MLInterfaces Biobase {}
 +
edge MLInterfaces methods {}
 +
edge MLInterfaces genefilter {}
 +
edge weaver digest {}
 +
edge weaver tools {}
 +
edge weaver utils {}
 +
edge weaver codetools {}
 +
edge goTools Biobase {}
 +
edge goTools annotate {}
 +
edge goTools GO {}
 +
edge applera Biobase {}
 +
edge applera methods {}
 +
edge applera affy {}
 +
edge applera genefilter {}
 +
edge applera limma {}
 +
edge applera geneplotter {}
 +
edge applera RColorBrewer {}
 +
edge applera prada {}
 +
edge applera combinat {}
 +
edge annaffy methods {}
 +
edge annaffy Biobase {}
 +
edge annaffy GO {}
 +
edge annaffy KEGG {}
 +
edge spotSegmentation mclust {}
 +
edge geneRecommender Biobase {}
 +
edge codelink methods {}
 +
edge codelink limma {}
 +
edge codelink annotate {}
 +
edge widgetTools methods {}
 +
edge widgetTools utils {}
 +
edge splots grid {}
 +
edge RSNPper methods {}
 +
edge RSNPper utils {}
 +
edge RSNPper tools {}
 +
edge RSNPper XML {}
 +
edge GeneMeta methods {}
 +
edge GeneMeta Biobase {}
 +
edge GeneMeta genefilter {}
 +
edge GEOquery methods {}
 +
edge globaltest methods {}
 +
edge globaltest graphics {}
 +
edge globaltest multtest {}
 +
edge pathRender graph {}
 +
edge pathRender Rgraphviz {}
 +
edge pathRender cMAP {}
 +
edge convert Biobase {}
 +
edge convert limma {}
 +
edge convert marray {}
 +
edge convert utils {}
 +
edge convert methods {}
 +
edge stam GO {}
 +
edge stam Biobase {}
 +
edge stam pamr {}
 +
edge stam cluster {}
 +
edge stam annaffy {}
 +
edge stam methods {}
 +
edge BSgenome methods {}
 +
edge BSgenome Biostrings {}
 +
edge pdmclass Biobase {}
 +
edge pdmclass fibroEset {}
 +
edge pdmclass mda {}
 +
edge cellHTS prada {}
 +
edge cellHTS RColorBrewer {}
 +
edge cellHTS Biobase {}
 +
edge cellHTS genefilter {}
 +
edge metaArray MergeMaid {}
 +
edge EBImage methods {}
 +
edge arrayQCplot RGtk2 {}
 +
edge arrayQCplot cairoDevice {}
 +
edge arrayQCplot LPE {}
 +
edge hopach cluster {}
 +
edge hopach Biobase {}
 +
edge DNAcopy NONE {}
 +
edge ssize gdata {}
 +
edge ssize xtable {}
 +
edge apComplex graph {}
 +
edge tilingArray methods {}
 +
edge tilingArray Biobase {}
 +
edge tilingArray affy {}
 +
edge tilingArray RColorBrewer {}
 +
edge tilingArray grid {}
 +
edge tilingArray strucchange {}
 +
edge tilingArray vsn {}
 +
edge tilingArray genefilter {}
 +
edge tilingArray geneplotter {}
 +
edge tilingArray pixmap {}
 +
edge RMAPPER methods {}
 +
edge splicegear methods {}
 +
edge splicegear utils {}
 +
edge splicegear grid {}
 +
edge splicegear Biobase {}
 +
edge splicegear XML {}
 +
edge splicegear annotate {}
 +
edge gff3Plotter methods {}
 +
edge mmgmos methods {}
 +
edge mmgmos Biobase {}
 +
edge mmgmos affy {}
 +
edge plgem Biobase {}
 +
edge plgem MASS {}
 +
edge DEDS methods {}
 +
edge pgUtils Rdbi {}
 +
edge pgUtils RdbiPgSQL {}
 +
edge pgUtils methods {}
 +
edge hypergraph methods {}
 +
edge hypergraph graph {}
 +
edge arrayMagic methods {}
 +
edge arrayMagic utils {}
 +
edge arrayMagic Biobase {}
 +
edge arrayMagic vsn {}
 +
edge arrayMagic limma {}
 +
edge arrayMagic genefilter {}
 +
edge nudge stats {}
 +
edge sscore affy {}
 +
edge sscore affxparser {}
 +
edge simulatorAPMS graph {}
 +
edge simulatorAPMS apComplex {}
 +
edge simulatorAPMS Rgraphviz {}
 +
edge simulatorAPMS ScISI {}
 +
edge simulatorAPMS ppiStats {}
 +
edge affy Biobase {}
 +
edge affy methods {}
 +
edge affy utils {}
 +
edge affy affyio {}
 +
edge OCplus akima {}
 +
edge OCplus multtest {}
 +
edge diffGeneAnalysis minpack.lm {}
 +
edge macat Biobase {}
 +
edge macat annotate {}
 +
edge idiogram methods {}
 +
edge idiogram Biobase {}
 +
edge idiogram annotate {}
 +
edge pcot2 grDevices {}
 +
edge pcot2 Biobase {}
 +
edge pcot2 amap {}
 +
edge iSNetwork methods {}
 +
edge iSNetwork graph {}
 +
edge iSNetwork Rgraphviz {}
 +
edge iSNetwork RGtk {}
 +
edge iSNetwork gtkDevice {}
 +
edge iSNetwork BioMVCClass {}
 +
edge iSNetwork MVCClass {}
 +
edge iSNetwork Biobase {}
 +
edge iSNetwork annotate {}
 +
edge affyPLM affy {}
 +
edge affyPLM affydata {}
 +
edge affyPLM Biobase {}
 +
edge affyPLM methods {}
 +
edge affyPLM gcrma {}
 +
edge spikeLI utils {}
 +
edge genefilter methods {}
 +
edge genefilter Biobase {}
 +
edge genefilter survival {}
 +
edge altcdfenvs methods {}
 +
edge altcdfenvs Biobase {}
 +
edge altcdfenvs affy {}
 +
edge altcdfenvs matchprobes {}
 +
edge altcdfenvs makecdfenv {}
 +
edge OLIN methods {}
 +
edge OLIN stats {}
 +
edge OLIN locfit {}
 +
edge OLIN Biobase {}
 +
edge OLIN marray {}
 +
edge beadarraySNP methods {}
 +
edge beadarraySNP Biobase {}
 +
edge beadarraySNP limma {}
 +
edge beadarraySNP quantsmooth {}
 +
edge Heatplus NONE {}
 +
edge GeneTS GeneCycle {}
 +
edge GeneTS GeneNet {}
 +
edge safe methods {}
 +
edge safe Biobase {}
 +
edge Rgraphviz methods {}
 +
edge Rgraphviz graph {}
 +
edge Rgraphviz geneplotter {}
 +
edge RdbiPgSQL Rdbi {}
 +
edge twilight splines {}
 +
edge twilight stats {}
 +
edge GeneTraffic Biobase {}
 +
edge GeneTraffic affy {}
 +
edge GeneTraffic marray {}
 +
edge GeneTraffic SSOAP {}
 +
edge GeneTraffic XML {}
 +
edge GeneTraffic digest {}
 +
edge GeneTraffic methods {}
 +
edge simpleaffy affy {}
 +
edge simpleaffy genefilter {}
 +
edge maSigPro Biobase {}
 +
edge Icens survival {}
 +
edge Rredland methods {}
 +
edge Rredland graph {}
 +
edge graph methods {}
 +
edge nnNorm nnet {}
 +
edge nnNorm marray {}
 +
edge genArise locfit {}
 +
edge genArise tkrplot {}
 +
edge genArise xtable {}
 +
edge genArise methods {}
 +
edge EBarrays Biobase {}
 +
edge EBarrays methods {}
 +
edge EBarrays utils {}
 +
edge EBarrays lattice {}
 +
edge reb Biobase {}
 +
edge reb idiogram {}
 +
edge SAGx stats {}
 +
edge SAGx multtest {}
 +
edge SAGx sma {}
 +
edge SAGx methods {}
 +
edge RMAGEML marray {}
 +
edge RMAGEML limma {}
 +
edge RMAGEML Biobase {}
 +
edge affyio methods {}
 +
edge edd methods {}
 +
edge edd golubEsets {}
 +
edge edd Biobase {}
 +
edge edd class {}
 +
edge edd nnet {}
 +
edge edd xtable {}
 +
edge maDB Biobase {}
 +
edge maDB affy {}
 +
edge maDB limma {}
 +
edge maDB methods {}
 +
edge DynDoc methods {}
 +
edge DynDoc tools {}
 +
edge BeadExplorer methods {}
 +
edge BeadExplorer widgetTools {}
 +
edge BeadExplorer affy {}
 +
edge BeadExplorer R2HTML {}
 +
edge BeadExplorer grDevices {}
 +
edge BeadExplorer tkWidgets {}
 +
edge affycoretools affy {}
 +
edge affycoretools limma {}
 +
edge affycoretools GOstats {}
 +
edge affycoretools biomaRt {}
 +
edge limmaGUI limma {}
 +
edge limmaGUI tcltk {}
 +
edge ABarray Biobase {}
 +
edge ABarray multtest {}
 +
edge GGtools methods {}
 +
edge GGtools Biobase {}
 +
edge GGtools hgfocus {}
 +
edge GGtools geneplotter {}
 +
edge Biobase tools {}
 +
edge Biobase methods {}
 +
edge Biobase utils {}
 +
edge factDesign Biobase {}
 +
edge factDesign affy {}
 +
edge factDesign stats {}
 +
edge sagenhaft SparseM {}
 +
edge ROC utils {}
 +
edge ROC methods {}
 +
edge bim stats {}
 +
edge bim qtl {}
 +
edge gcrma Biobase {}
 +
edge gcrma affy {}
 +
edge gcrma matchprobes {}
 +
edge gcrma splines {}
 +
edge adSplit methods {}
 +
edge adSplit stats {}
 +
edge adSplit cluster {}
 +
edge adSplit multtest {}
 +
edge adSplit Biobase {}
 +
edge adSplit affy {}
 +
edge adSplit GO {}
 +
edge adSplit KEGG {}
 +
edge Resourcerer AnnBuilder {}
 +
edge MergeMaid survival {}
 +
edge MergeMaid Biobase {}
 +
edge MergeMaid MASS {}
 +
edge MergeMaid methods {}
 +
edge plier affy {}
 +
edge quantsmooth quantreg {}
 +
edge quantsmooth lodplot {}
 +
edge affycomp Biobase {}
 +
edge stepNorm marray {}
 +
edge stepNorm MASS {}
 +
edge stepNorm methods {}
 +
edge clusterStab Biobase {}
 +
edge clusterStab methods {}
 +
edge affyQCReport Biobase {}
 +
edge affyQCReport affy {}
 +
edge affyQCReport simpleaffy {}
 +
edge affypdnn affy {}
 +
edge affypdnn affydata {}
 +
edge affypdnn hgu95av2probe {}
 +
edge affydata affy {}
 +
edge pairseqsim methods {}
 +
edge pairseqsim stats {}
 +
edge fdrame NONE {}
 +
edge ScISI methods {}
 +
edge ScISI apComplex {}
 +
edge ScISI GO {}
 +
edge ScISI GOstats {}
 +
edge ScISI graph {}
 +
edge ScISI RBGL {}
 +
edge ScISI Rgraphviz {}
 +
edge ScISI YEAST {}
 +
edge ScISI xtable {}
 +
edge multtest methods {}
 +
edge multtest Biobase {}
 +
edge multtest survival {}
 +
edge ctc NONE {}
 +
edge yeastExpData graph {}
 +
edge golubEsets Biobase {}
 +
edge estrogen affy {}
 +
edge MAQCsubset Biobase {}
 +
edge fibroEset Biobase {}
 +
edge HEEBOdata NONE {}
 +
edge facsDorit prada {}
 +
edge Iyer517 Biobase {}
 +
edge stjudem utils {}
 +
edge ProData Biobase {}
 +
edge SpikeIn affy {}
 +
edge ALL Biobase {}
 +
edge AmpAffyExample affy {}
 +
edge kidpack Biobase {}
 +
edge CLL affy {}
 +
edge CLL Biobase {}
 +
edge SpikeInSubset Biobase {}
 +
edge SpikeInSubset affy {}
 +
edge gaschYHS Biobase {}
 +
edge ALLMLL affy {}
 +
edge bronchialIL13 affy {}
 +
edge beta7 marray {}
 +
edge lungExpression Biobase {}
 +
edge HIVcDNAvantWout03 NONE {}
 +
edge yeastCC Biobase {}
 +
edge harbChIP Biobase {}
 +
edge ppiData Rgraphviz {}
 +
edge ppiData graph {}
 +
edge colonCA Biobase {}
 +
edge SNAData graph {}
 +
edge ecoliLeucine affy {}
 +
edge davidTiling Biobase {}
 +
edge davidTiling tilingArray {}
 +
edge davidTiling GO {}
 +
edge MEEBOdata NONE {}
 +
edge GGdata Biobase {}
 +
edge GGdata hgfocus {}
 +
edge rn230rnentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge rn230brnrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge dmgenome1dmense utils {}
 +
edge medicagoprobe matchprobes {}
 +
edge dmgenome1dmugcdf utils {}
 +
edge hsex10stv2ptentrezg utils {}
 +
edge caninecdf utils {}
 +
edge mm430ammensgcdf utils {}
 +
edge mm430ammrefseqcdf utils {}
 +
edge hsfocushsenstprobe matchprobes {}
 +
edge hs133bhsentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge drzebrafishdrugcdf utils {}
 +
edge mm430ammentrezg utils {}
 +
edge hgu133bprobe matchprobes {}
 +
edge mmex10stv1mmentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge rn34arnenseprobe matchprobes {}
 +
edge soybeancdf utils {}
 +
edge hs133xptensgprobe matchprobes {}
 +
edge rtu34probe matchprobes {}
 +
edge hsex10stv2hsensgcdf utils {}
 +
edge rnex10stv1rnensecdf utils {}
 +
edge mm11ksubbmmentrezgcdf utils {}
 +
edge mu6500subdcdf utils {}
 +
edge mm74av2mmensgcdf utils {}
 +
edge mm74bv2mmentrezgcdf utils {}
 +
edge rn230rnenstprobe matchprobes {}
 +
edge hs95av2hsrefseq utils {}
 +
edge hsex10stv2hsentrezg utils {}
 +
edge mm430bmmenstprobe matchprobes {}
 +
edge hsex10stv2hsense utils {}
 +
edge mm74av2mmentrezg utils {}
 +
edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 methods {}
 +
edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 Biostrings {}
 +
edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 BSgenome {}
 +
edge dmgenome1dmensg utils {}
 +
edge mm430bmmensecdf utils {}
 +
edge mm430mmensgcdf utils {}
 +
edge hu35ksubaprobe matchprobes {}
 +
edge rn230brnensgprobe matchprobes {}
 +
edge hsex10stv2ptense utils {}
 +
edge osriceostigrprobe matchprobes {}
 +
edge hsex10stv2hsentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge cfcanine2cfenstprobe matchprobes {}
 +
edge mm430mmentrezg utils {}
 +
edge mm74av1mmrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge rnex10stv1rnrefseq utils {}
 +
edge atgenomeattaircdf utils {}
 +
edge hs133xptensgcdf utils {}
 +
edge mu19ksubccdf utils {}
 +
edge hgu95ecdf utils {}
 +
edge atgenomeatrefseqcdf utils {}
 +
edge hs133phsrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge hsex10stv2hsensg utils {}
 +
edge hs133xptentrezg utils {}
 +
edge saureusprobe matchprobes {}
 +
edge hs133av2hsenseprobe matchprobes {}
 +
edge rhesusprobe matchprobes {}
 +
edge mm74av2mmense utils {}
 +
edge mm11ksubammenstcdf utils {}
 +
edge mmex10stv1mmrefseq utils {}
 +
edge cfcanine2cfentrezgcdf utils {}
 +
edge ggchickenggenstprobe matchprobes {}
 +
edge cyp450cdf utils {}
 +
edge hsex10stv2ptensg utils {}
 +
edge hs133pptenseprobe matchprobes {}
 +
edge hs133xhsensgcdf utils {}
 +
edge poplarcdf utils {}
 +
edge dmdrosophila2dmrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge hs95av2hsrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge hs133xhsentrezg utils {}
 +
edge mm11ksubammugcdf utils {}
 +
edge mm74av2mmensg utils {}
 +
edge hsex10stv2hsenstprobe matchprobes {}
 +
edge mgu74cprobe matchprobes {}
 +
edge hsfocushsenseprobe matchprobes {}
 +
edge hs133bhsentrezgcdf utils {}
 +
edge mmex10stv1mmense utils {}
 +
edge mm11ksubammenstprobe matchprobes {}
 +
edge hs133av2ptensgprobe matchprobes {}
 +
edge drzebrafishdrense utils {}
 +
edge mm430mmrefseqcdf utils {}
 +
edge cfcanine2cfenstcdf utils {}
 +
edge hs133aptenstcdf utils {}
 +
edge rn230rnenseprobe matchprobes {}
 +
edge mm430bmmenseprobe matchprobes {}
 +
edge mm74av1mmug utils {}
 +
edge bovinecdf utils {}
 +
edge drzebrafishdrensecdf utils {}
 +
edge dmgenome1dmensecdf utils {}
 +
edge rae230bcdf utils {}
 +
edge hu6800cdf utils {}
 +
edge ath1attairprobe matchprobes {}
 +
edge canineprobe matchprobes {}
 +
edge mmex10stv1mmensg utils {}
 +
edge hs133ahsrefseqcdf utils {}
 +
edge cfcanine2cfenseprobe matchprobes {}
 +
edge rnex10stv1rnugcdf utils {}
 +
edge mm74av2mmrefseq utils {}
 +
edge hs133ahsenstcdf utils {}
 +
edge mm430mmrefseq utils {}
 +
edge drzebrafishdrensg utils {}
 +
edge ggchickenggenstcdf utils {}
 +
edge mm74cv2mmenstcdf utils {}
 +
edge hsfocusptensgprobe matchprobes {}
 +
edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 methods {}
 +
edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 Biostrings {}
 +
edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 BSgenome {}
 +
edge hs133bhsenstprobe matchprobes {}
 +
edge mm11ksubammugprobe matchprobes {}
 +
edge ggchickenggenseprobe matchprobes {}
 +
edge mm430mmense utils {}
 +
edge mm74cv2mmenstprobe matchprobes {}
 +
edge dmdrosophila2dmenst utils {}
 +
edge tomatocdf utils {}
 +
edge mm74av1mmenst utils {}
 +
edge mgu74bv2probe matchprobes {}
 +
edge rn230arnenstcdf utils {}
 +
edge hgu133acdf utils {}
 +
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 methods {}
 +
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 Biostrings {}
 +
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 BSgenome {}
 +
edge hs95av2hsenstprobe matchprobes {}
 +
edge atgenomeattigrprobe matchprobes {}
 +
edge cfcanine2cfense utils {}
 +
edge rnex10stv1rnensgcdf utils {}
 +
edge mm74cv2mmentrezgcdf utils {}
 +
edge hs133ahsense utils {}
 +
edge dmdrosophila2dmenstprobe matchprobes {}
 +
edge hsex10stv2hsenseprobe matchprobes {}
 +
edge hsfocusptentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge rnex10stv1rnentrezg utils {}
 +
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 methods {}
 +
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 Biostrings {}
 +
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 BSgenome {}
 +
edge moe430bcdf utils {}
 +
edge rnex10stv1rnensgprobe matchprobes {}
 +
edge mm430mmentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge ye6100subacdf utils {}
 +
edge mm430mmensg utils {}
 +
edge hs133xhsug utils {}
 +
edge mm11ksubammenseprobe matchprobes {}
 +
edge chickencdf utils {}
 +
edge mm430bmmensgcdf utils {}
 +
edge hs133aptense utils {}
 +
edge rn230rnenstcdf utils {}
 +
edge rn230arnenstprobe matchprobes {}
 +
edge cfcanine2cfrefseq utils {}
 +
edge mm430bmmentrezg utils {}
 +
edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 methods {}
 +
edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 Biostrings {}
 +
edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 BSgenome {}
 +
edge cfcanine2cfugprobe matchprobes {}
 +
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 methods {}
 +
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 Biostrings {}
 +
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 BSgenome {}
 +
edge hs133phsug utils {}
 +
edge zebrafishcdf utils {}
 +
edge rat2302cdf utils {}
 +
edge moe430bprobe matchprobes {}
 +
edge rn230rnugcdf utils {}
 +
edge cfcanine2cfensg utils {}
 +
edge hgu95bprobe matchprobes {}
 +
edge yeast2cdf utils {}
 +
edge hgu133plus2probe matchprobes {}
 +
edge hs133ahsensg utils {}
 +
edge mm74av1mmrefseqcdf utils {}
 +
edge mmex10stv1mmenstprobe matchprobes {}
 +
edge hsfocusptenstcdf utils {}
 +
edge mm74bv2mmensecdf utils {}
 +
edge rn230brnug utils {}
 +
edge hs133xhsrefseqcdf utils {}
 +
edge hs133aptensg utils {}
 +
edge hgu133a2probe matchprobes {}
 +
edge citrusprobe matchprobes {}
 +
edge hs133ahsugprobe matchprobes {}
 +
edge hsex10stv2ptensgprobe matchprobes {}
 +
edge ggchickenggugprobe matchprobes {}
 +
edge mm74cv2mmugprobe matchprobes {}
 +
edge dmgenome1dmenst utils {}
 +
edge rn34arnentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge mm74av2mmenstprobe matchprobes {}
 +
edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 methods {}
 +
edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 Biostrings {}
 +
edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 BSgenome {}
 +
edge mmex10stv1mmensecdf utils {}
 +
edge hs133bhsenseprobe matchprobes {}
 +
edge hsfocushsenstcdf utils {}
 +
edge mm74cv2mmentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge mm11ksubbmmenstcdf utils {}
 +
edge mm74cv2mmenseprobe matchprobes {}
 +
edge hs133xhsense utils {}
 +
edge dmdrosophila2dmug utils {}
 +
edge mm74bv2mmensgprobe matchprobes {}
 +
edge rgu34cprobe matchprobes {}
 +
edge rn230arnugprobe matchprobes {}
 +
edge hs133xptense utils {}
 +
edge hsex10stv2hsenst utils {}
 +
edge hs95av2hsenseprobe matchprobes {}
 +
edge mgu74bv2cdf utils {}
 +
edge rn34arnrefseqcdf utils {}
 +
edge hsex10stv2ptenst utils {}
 +
edge dmdrosophila2dmenseprobe matchprobes {}
 +
edge hthgu133acdf utils {}
 +
edge agprobe matchprobes {}
 +
edge hsfocushsentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge hs133xhsensg utils {}
 +
edge drzebrafishdrensgcdf utils {}
 +
edge dmgenome1dmensgcdf utils {}
 +
edge hu35ksubdprobe matchprobes {}
 +
edge hs133bptensgprobe matchprobes {}
 +
edge rn230rnugprobe matchprobes {}
 +
edge maizeprobe matchprobes {}
 +
edge rn230arnenseprobe matchprobes {}
 +
edge drzebrafishdrentrezg utils {}
 +
edge hs133xptensg utils {}
 +
edge hs133pptenstcdf utils {}
 +
edge mm74av2mmenst utils {}
 +
edge vvgrapevvtigrprobe matchprobes {}
 +
edge hsex10stv2hsugcdf utils {}
 +
edge hs133bptenstcdf utils {}
 +
edge paeg1acdf utils {}
 +
edge mm11ksubammug utils {}
 +
edge mm430ammugcdf utils {}
 +
edge ggchickenggrefseq utils {}
 +
edge hs95av2ptensgprobe matchprobes {}
 +
edge hs133av2hsrefseqcdf utils {}
 +
edge mmex10stv1mmenseprobe matchprobes {}
 +
edge mm430ammensgprobe matchprobes {}
 +
edge hs133ahsrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge hs133bhsense utils {}
 +
edge hs133phsenstcdf utils {}
 +
edge hs133bptentrezgcdf utils {}
 +
edge hgu133aprobe matchprobes {}
 +
edge hs133bhsenstcdf utils {}
 +
edge dmdrosophila2dmrefseq utils {}
 +
edge hs133bptense utils {}
 +
edge mm74av2mmenseprobe matchprobes {}
 +
edge mm11ksubammense utils {}
 +
edge hu35ksubbcdf utils {}
 +
edge mmex10stv1mmenst utils {}
 +
edge dmdrosophila2dmenstcdf utils {}
 +
edge hsfocushsugprobe matchprobes {}
 +
edge atgenomeattigr utils {}
 +
edge hgu133atagcdf utils {}
 +
edge mm11ksubbmmugprobe matchprobes {}
 +
edge drzebrafishdrenst utils {}
 +
edge hgu133a2cdf utils {}
 +
edge drzebrafishdrenstprobe matchprobes {}
 +
edge hs133phsentrezgcdf utils {}
 +
edge hs95av2hsugcdf utils {}
 +
edge hs133bhsensg utils {}
 +
edge hs95av2hsentrezgcdf utils {}
 +
edge ye6100subccdf utils {}
 +
edge rn34arnrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge hsfocushsrefseqcdf utils {}
 +
edge hsex10stv2hsug utils {}
 +
edge rn230brnenstcdf utils {}
 +
edge hs133phsense utils {}
 +
edge hs133bptensg utils {}
 +
edge mm11ksubammensg utils {}
 +
edge rn230rnrefseqcdf utils {}
 +
edge mu6500subacdf utils {}
 +
edge hs133pptense utils {}
 +
edge tomatoprobe matchprobes {}
 +
edge rgu34acdf utils {}
 +
edge mm430bmmrefseqcdf utils {}
 +
edge osriceosrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge dmdrosophila2dmugcdf utils {}
 +
edge bovineprobe matchprobes {}
 +
edge hgu95av2cdf utils {}
 +
edge mm74bv2mmensgcdf utils {}
 +
edge mm11ksubbmmugcdf utils {}
 +
edge mgu74bcdf utils {}
 +
edge mm74av1mmugcdf utils {}
 +
edge cfcanine2cfrefseqcdf utils {}
 +
edge hu6800subbcdf utils {}
 +
edge hs133phsensg utils {}
 +
edge rn34arnenstcdf utils {}
 +
edge mm74bv2mmentrezg utils {}
 +
edge mm74av1mmentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge mm430mmenst utils {}
 +
edge hsfocushsugcdf utils {}
 +
edge test3probe matchprobes {}
 +
edge soybeanprobe matchprobes {}
 +
edge mmex10stv1mmensgcdf utils {}
 +
edge hs133pptensg utils {}
 +
edge mm74av1mmenstcdf utils {}
 +
edge dmgenome1dmenstprobe matchprobes {}
 +
edge hgu95bcdf utils {}
 +
edge mgu74bprobe matchprobes {}
 +
edge mmex10stv1mmentrezg utils {}
 +
edge hs133xhsugcdf utils {}
 +
edge hs133phsugprobe matchprobes {}
 +
edge ggchickenggrefseqcdf utils {}
 +
edge cfcanine2cfenst utils {}
 +
edge mm430ammrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge mm74av2mmug utils {}
 +
edge mm430mmensgprobe matchprobes {}
 +
edge hs133phsugcdf utils {}
 +
edge hs133bhsugprobe matchprobes {}
 +
edge hs133ahsenst utils {}
 +
edge rnex10stv1rnentrezgcdf utils {}
 +
edge hs133ahsug utils {}
 +
edge dmdrosophila2dmugprobe matchprobes {}
 +
edge mm11ksubbmmrefseq utils {}
 +
edge hs133aptenst utils {}
 +
edge hs133av2hsentrezgcdf utils {}
 +
edge test1cdf utils {}
 +
edge rn230arnugcdf utils {}
 +
edge maizecdf utils {}
 +
edge plasmodiumanophelesprobe matchprobes {}
 +
edge drzebrafishdrenseprobe matchprobes {}
 +
edge hs133ahsensgprobe matchprobes {}
 +
edge hsex10stv2hsrefseqcdf utils {}
 +
edge rn34arnrefseq utils {}
 +
edge mm74av1mmrefseq utils {}
 +
edge gp53cdf utils {}
 +
edge mm11ksubammrefseqcdf utils {}
 +
edge ecoliasv2probe matchprobes {}
 +
edge rn230brnugprobe matchprobes {}
 +
edge hs133aptenstprobe matchprobes {}
 +
edge atgenomeattairprobe matchprobes {}
 +
edge hs133av2ptenstcdf utils {}
 +
edge mgu74cv2probe matchprobes {}
 +
edge hs95av2hsense utils {}
 +
edge ggchickenggug utils {}
 +
edge hgu95eprobe matchprobes {}
 +
edge hs133pptentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge canine2probe matchprobes {}
 +
edge mm11ksubbmmense utils {}
 +
edge hsfocushsense utils {}
 +
edge mm11ksubbmmenstprobe matchprobes {}
 +
edge rn230arnense utils {}
 +
edge hs95av2ptense utils {}
 +
edge ath1attigr utils {}
 +
edge yeast2probe matchprobes {}
 +
edge mm430bmmrefseq utils {}
 +
edge hsfocusptense utils {}
 +
edge hs133av2hsenstcdf utils {}
 +
edge agcdf utils {}
 +
edge rn34arnugprobe matchprobes {}
 +
edge hs133xhsenst utils {}
 +
edge hs95av2hsensg utils {}
 +
edge hu35ksubdcdf utils {}
 +
edge mm74av1mmugprobe matchprobes {}
 +
edge dmgenome1dmenseprobe matchprobes {}
 +
edge mm11ksubbmmensg utils {}
 +
edge hs133xptenst utils {}
 +
edge hsfocushsensg utils {}
 +
edge cfcanine2cfrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge hs133phsenstprobe matchprobes {}
 +
edge hs133bhsrefseqcdf utils {}
 +
edge rn230arnensg utils {}
 +
edge hs95av2ptensg utils {}
 +
edge mm430mmug utils {}
 +
edge mm74cv2mmrefseqcdf utils {}
 +
edge ath1121501cdf utils {}
 +
edge hsfocusptensg utils {}
 +
edge ricecdf utils {}
 +
edge mm11ksubammensecdf utils {}
 +
edge wheatprobe matchprobes {}
 +
edge hs133av2hsugcdf utils {}
 +
edge drosophila2cdf utils {}
 +
edge moe430aprobe matchprobes {}
 +
edge hs95av2ptenstcdf utils {}
 +
edge hs95av2hsrefseqcdf utils {}
 +
edge hgu95aprobe matchprobes {}
 +
edge atgenomeattigrcdf utils {}
 +
edge barley1probe matchprobes {}
 +
edge mm74av1mmensgprobe matchprobes {}
 +
edge mu6500subccdf utils {}
 +
edge dmdrosophila2dmrefseqcdf utils {}
 +
edge dmgenome1dmrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge rgu34ccdf utils {}
 +
edge hs133xhsensgprobe matchprobes {}
 +
edge hsfocushsrefseq utils {}
 +
edge hcg110probe matchprobes {}
 +
edge hs95av2hsenstcdf utils {}
 +
edge mm430mmentrezgcdf utils {}
 +
edge hs133bhsrefseq utils {}
 +
edge hs133aptenseprobe matchprobes {}
 +
edge rn230rnrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge hs133xptenstprobe matchprobes {}
 +
edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 methods {}
 +
edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 Biostrings {}
 +
edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 BSgenome {}
 +
edge mu11ksubbprobe matchprobes {}
 +
edge rn230arnrefseqcdf utils {}
 +
edge osriceosrefseq utils {}
 +
edge hu6800subdcdf utils {}
 +
edge mm74bv2mmug utils {}
 +
edge ecoliasv2cdf utils {}
 +
edge hs133bhsenst utils {}
 +
edge mm74av2mmentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge hivprtplus2cdf utils {}
 +
edge hs133phsentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge mm11ksubbmmenseprobe matchprobes {}
 +
edge cfcanine2cfensecdf utils {}
 +
edge hs133xptentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge mm74av1mmentrezgcdf utils {}
 +
edge hs133aptensecdf utils {}
 +
edge hs133bptenst utils {}
 +
edge mu19ksubbcdf utils {}
 +
edge rn230brnenstprobe matchprobes {}
 +
edge mm11ksubammenst utils {}
 +
edge hsex10stv2ptenstcdf utils {}
 +
edge hgu95dcdf utils {}
 +
edge mmex10stv1mmrefseqcdf utils {}
 +
edge mm74cv2mmrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge rgu34bprobe matchprobes {}
 +
edge hs133av2hsugprobe matchprobes {}
 +
edge drzebrafishdrug utils {}
 +
edge hs133pptentrezgcdf utils {}
 +
edge hs95av2ptentrezgcdf utils {}
 +
edge mm430mmugcdf utils {}
 +
edge mm430ammenstcdf utils {}
 +
edge rn34arnensgprobe matchprobes {}
 +
edge mgu74av2cdf utils {}
 +
edge ath1121501probe matchprobes {}
 +
edge rn230rnug utils {}
 +
edge osriceostigr utils {}
 +
edge citruscdf utils {}
 +
edge mm74av2mmrefseqcdf utils {}
 +
edge hs133av2hsense utils {}
 +
edge hs133ahsensecdf utils {}
 +
edge hs133phsenseprobe matchprobes {}
 +
edge hsex10stv2hsenstcdf utils {}
 +
edge ggchickenggensecdf utils {}
 +
edge mm74av2mmenstcdf utils {}
 +
edge mm74cv2mmensecdf utils {}
 +
edge test3cdf utils {}
 +
edge ath1atrefseq utils {}
 +
edge hs133av2ptense utils {}
 +
edge hs133phsenst utils {}
 +
edge mm74av2mmrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge mm430ammentrezgcdf utils {}
 +
edge hu35ksubcprobe matchprobes {}
 +
edge rn230brnense utils {}
 +
edge hs133pptenst utils {}
 +
edge mm11ksubbmmug utils {}
 +
edge mm430bmmugcdf utils {}
 +
edge mm430mmenstcdf utils {}
 +
edge mm11ksubammrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge chickenprobe matchprobes {}
 +
edge hs133av2hsensg utils {}
 +
edge rn230arnentrezgcdf utils {}
 +
edge atgenomeatrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge poplarprobe matchprobes {}
 +
edge rn230arnensecdf utils {}
 +
edge hs133av2hsensgprobe matchprobes {}
 +
edge plasmodiumanophelescdf utils {}
 +
edge hs133xptenstcdf utils {}
 +
edge hs133av2ptensg utils {}
 +
edge bsubtilisprobe matchprobes {}
 +
edge rn230arnrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge hs95av2hsugprobe matchprobes {}
 +
edge hs133av2ptenstprobe matchprobes {}
 +
edge mm74cv2mmense utils {}
 +
edge hs133pptensgprobe matchprobes {}
 +
edge rn230brnensg utils {}
 +
edge hs133xptenseprobe matchprobes {}
 +
edge rae230acdf utils {}
 +
edge mu11ksubbcdf utils {}
 +
edge hs133xhsentrezgcdf utils {}
 +
edge mouse430a2cdf utils {}
 +
edge hgfocusprobe matchprobes {}
 +
edge hs133xhsenstcdf utils {}
 +
edge drosgenome1cdf utils {}
 +
edge hsex10stv2hsentrezgcdf utils {}
 +
edge rn230rnensecdf utils {}
 +
edge rn230brnrefseq utils {}
 +
edge cfcanine2cfentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge hs133av2ptentrezgcdf utils {}
 +
edge hs133xhsentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge rn230brnenseprobe matchprobes {}
 +
edge hsfocushsensgprobe matchprobes {}
 +
edge hs133av2hsrefseq utils {}
 +
edge mm74cv2mmensg utils {}
 +
edge mm430ammugprobe matchprobes {}
 +
edge hsfocusptenstprobe matchprobes {}
 +
edge mm11ksubammensgcdf utils {}
 +
edge hsfocusptensecdf utils {}
 +
edge hsex10stv2hsrefseq utils {}
 +
edge rn230rnensgprobe matchprobes {}
 +
edge hs133xhsrefseq utils {}
 +
edge mm430bmmensgprobe matchprobes {}
 +
edge mm11ksubammentrezg utils {}
 +
edge hsex10stv2hsugprobe matchprobes {}
 +
edge ath1atrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge mm74av2mmugprobe matchprobes {}
 +
edge mm74av2mmugcdf utils {}
 +
edge rnu34cdf utils {}
 +
edge mm74cv2mmug utils {}
 +
edge osriceostigrcdf utils {}
 +
edge mm11ksubammentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge mmex10stv1mmug utils {}
 +
edge hs95av2ptentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge drzebrafishdrrefseqcdf utils {}
 +
edge cfcanine2cfensgprobe matchprobes {}
 +
edge hs95av2hsenst utils {}
 +
edge hsfocushsensecdf utils {}
 +
edge ath1attaircdf utils {}
 +
edge mm430mmugprobe matchprobes {}
 +
edge mm11ksubbmmenst utils {}
 +
edge moe430acdf utils {}
 +
edge hsfocushsenst utils {}
 +
edge mm11ksubbmmensecdf utils {}
 +
edge rn230arnenst utils {}
 +
edge hs95av2ptenst utils {}
 +
edge hsfocusptenst utils {}
 +
edge mm430ammug utils {}
 +
edge mgu74aprobe matchprobes {}
 +
edge rnex10stv1rnenstprobe matchprobes {}
 +
edge ggchickenggensgprobe matchprobes {}
 +
edge hs133bhsug utils {}
 +
edge mm11ksubammentrezgcdf utils {}
 +
edge cfcanine2cfensgcdf utils {}
 +
edge hs133av2ptenseprobe matchprobes {}
 +
edge hs133aptensgcdf utils {}
 +
edge cfcanine2cfentrezg utils {}
 +
edge rn230brnugcdf utils {}
 +
edge hs133aptentrezg utils {}
 +
edge mm11ksubammrefseq utils {}
 +
edge rae230bprobe matchprobes {}
 +
edge mouse430a2probe matchprobes {}
 +
edge hs133xhsugprobe matchprobes {}
 +
edge mm74cv2mmrefseq utils {}
 +
edge hgu133atagprobe matchprobes {}
 +
edge hs133pptensecdf utils {}
 +
edge hsex10stv2hsensgprobe matchprobes {}
 +
edge rn34arnense utils {}
 +
edge hs133ahsensgcdf utils {}
 +
edge dmgenome1dmrefseqcdf utils {}
 +
edge rnex10stv1rnenstcdf utils {}
 +
edge ggchickenggensgcdf utils {}
 +
edge mm74cv2mmensgcdf utils {}
 +
edge hs133bptensecdf utils {}
 +
edge rnex10stv1rnug utils {}
 +
edge drzebrafishdrrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge mm11ksubammensgprobe matchprobes {}
 +
edge hs133ahsentrezg utils {}
 +
edge hs133phsrefseq utils {}
 +
edge riceprobe matchprobes {}
 +
edge mm74cv2mmentrezg utils {}
 +
edge hsex10stv2ptenstprobe matchprobes {}
 +
edge hsfocusptenseprobe matchprobes {}
 +
edge mm430bmmenstcdf utils {}
 +
edge barley1cdf utils {}
 +
edge hs133phsensecdf utils {}
 +
edge hgu95dprobe matchprobes {}
 +
edge celeganscdf utils {}
 +
edge hs133bhsensecdf utils {}
 +
edge rn34arnensg utils {}
 +
edge mm430ammense utils {}
 +
edge mm430ammrefseq utils {}
 +
edge rn230arnensgcdf utils {}
 +
edge hs95av2hsentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge dmdrosophila2dmensecdf utils {}
 +
edge rn230arnentrezg utils {}
 +
edge mm74bv2mmenstprobe matchprobes {}
 +
edge ecoli2probe matchprobes {}
 +
edge cfcanine2cfugcdf utils {}
 +
edge hs133ahsentrezgcdf utils {}
 +
edge hs133bhsensgprobe matchprobes {}
 +
edge rn230brnensecdf utils {}
 +
edge rn230rnensgcdf utils {}
 +
edge rnex10stv1rnenseprobe matchprobes {}
 +
edge mm430ammensg utils {}
 +
edge mm74cv2mmensgprobe matchprobes {}
 +
edge mm11ksubbmmrefseqcdf utils {}
 +
edge PFAM RSQLite {}
 +
edge rn230rnentrezg utils {}
 +
edge hs133bptenstprobe matchprobes {}
 +
edge hs133av2hsenst utils {}
 +
edge drosophila2probe matchprobes {}
 +
edge u133x3pcdf utils {}
 +
edge hs95av2hsensgprobe matchprobes {}
 +
edge hs133av2ptenst utils {}
 +
edge sugarcanecdf utils {}
 +
edge medicagocdf utils {}
 +
edge rtu34cdf utils {}
 +
edge hsfocusptensgcdf utils {}
 +
edge dmdrosophila2dmensgprobe matchprobes {}
 +
edge rn230brnenst utils {}
 +
edge rnex10stv1rnrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge hs95av2ptenstprobe matchprobes {}
 +
edge hsfocusptentrezg utils {}
 +
edge rnex10stv1rnugprobe matchprobes {}
 +
edge mm430ammenstprobe matchprobes {}
 +
edge hgu133bcdf utils {}
 +
edge rn34arnensecdf utils {}
 +
edge hu35ksubacdf utils {}
 +
edge hs133phsrefseqcdf utils {}
 +
edge ggchickenggense utils {}
 +
edge xenopuslaevisprobe matchprobes {}
 +
edge hcg110cdf utils {}
 +
edge hs133ahsrefseq utils {}
 +
edge mm11ksubbmmentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge hsex10stv2ptenseprobe matchprobes {}
 +
edge mm74av1mmensecdf utils {}
 +
edge rn230arnensgprobe matchprobes {}
 +
edge rn230rnrefseq utils {}
 +
edge hs133ahsugcdf utils {}
 +
edge hsfocushsentrezgcdf utils {}
 +
edge mu11ksubaprobe matchprobes {}
 +
edge drzebrafishdrenstcdf utils {}
 +
edge dmgenome1dmenstcdf utils {}
 +
edge mm430bmmugprobe matchprobes {}
 +
edge hsfocushsensgcdf utils {}
 +
edge mm11ksubbmmensgcdf utils {}
 +
edge ye6100subbcdf utils {}
 +
edge mmex10stv1mmentrezgcdf utils {}
 +
edge hsfocushsentrezg utils {}
 +
edge canine2cdf utils {}
 +
edge hs133xptentrezgcdf utils {}
 +
edge hs133bhsrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge mm74cv2mmenst utils {}
 +
edge mm11ksubbmmentrezg utils {}
 +
edge ecolicdf utils {}
 +
edge mm74bv2mmugcdf utils {}
 +
edge hsex10stv2ptentrezgcdf utils {}
 +
edge rnex10stv1rnense utils {}
 +
edge vvgrapevvtigrcdf utils {}
 +
edge mmex10stv1mmensgprobe matchprobes {}
 +
edge ggchickenggensg utils {}
 +
edge rnex10stv1rnentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge hsfocushsug utils {}
 +
edge rn230rnense utils {}
 +
edge mm74bv2mmenseprobe matchprobes {}
 +
edge rgu34aprobe matchprobes {}
 +
edge vvgrapevvtigr utils {}
 +
edge mm74av2mmensgprobe matchprobes {}
 +
edge rhesuscdf utils {}
 +
edge zebrafishprobe matchprobes {}
 +
edge hsfocushsrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge mgu74acdf utils {}
 +
edge hu6800subacdf utils {}
 +
edge rnex10stv1rnensg utils {}
 +
edge hs133pptensgcdf utils {}
 +
edge hs133av2ptensecdf utils {}
 +
edge hu35ksubbprobe matchprobes {}
 +
edge rnu34probe matchprobes {}
 +
edge xenopuslaeviscdf utils {}
 +
edge hs133bptenseprobe matchprobes {}
 +
edge rn230rnensg utils {}
 +
edge rn34arnug utils {}
 +
edge rn230brnrefseqcdf utils {}
 +
edge dmgenome1dmrefseq utils {}
 +
edge hs133bptensgcdf utils {}
 +
edge hs133pptentrezg utils {}
 +
edge mm430bmmense utils {}
 +
edge hgu95acdf utils {}
 +
edge ath1atrefseqcdf utils {}
 +
edge hs133av2ptentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge hs133bptentrezg utils {}
 +
edge hs133xhsrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge hs133phsensgcdf utils {}
 +
edge hs133av2hsensecdf utils {}
 +
edge hs95av2ptenseprobe matchprobes {}
 +
edge rn230arnentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge mm430ammentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge mm430ammenseprobe matchprobes {}
 +
edge hs133aptentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge hs133bhsensgcdf utils {}
 +
edge hs133phsentrezg utils {}
 +
edge mm74bv2mmense utils {}
 +
edge rat2302probe matchprobes {}
 +
edge mouse4302probe matchprobes {}
 +
edge hs133bhsentrezg utils {}
 +
edge mm430mmenstprobe matchprobes {}
 +
edge atgenomeattair utils {}
 +
edge mm430bmmensg utils {}
 +
edge drzebrafishdrugprobe matchprobes {}
 +
edge ecoli2cdf utils {}
 +
edge dmgenome1dmugprobe matchprobes {}
 +
edge dmdrosophila2dmensgcdf utils {}
 +
edge bsubtiliscdf utils {}
 +
edge mm74bv2mmenstcdf utils {}
 +
edge rn230arnrefseq utils {}
 +
edge hs133av2hsrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge atgenomeatrefseq utils {}
 +
edge mm430bmmrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge hs95av2ptensecdf utils {}
 +
edge ygs98cdf utils {}
 +
edge hs133ahsenstprobe matchprobes {}
 +
edge mm74bv2mmensg utils {}
 +
edge rn230brnensgcdf utils {}
 +
edge hgu133plus2cdf utils {}
 +
edge mmex10stv1mmenstcdf utils {}
 +
edge mmex10stv1mmrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge ygs98probe matchprobes {}
 +
edge rn230brnentrezg utils {}
 +
edge hsex10stv2hsrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge rn34arnenst utils {}
 +
edge hs95av2hsensecdf utils {}
 +
edge mm430mmrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge mm74bv2mmentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge drzebrafishdrensgprobe matchprobes {}
 +
edge cfcanine2cfug utils {}
 +
edge rn34arnensgcdf utils {}
 +
edge hu35ksubccdf utils {}
 +
edge mm430bmmug utils {}
 +
edge rn34arnentrezg utils {}
 +
edge mm74av1mmensgcdf utils {}
 +
edge hs133av2hsentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge mm430ammenst utils {}
 +
edge u133aaofav2cdf utils {}
 +
edge hsex10stv2ptensecdf utils {}
 +
edge ggchickenggugcdf utils {}
 +
edge mm74av1mmentrezg utils {}
 +
edge drzebrafishdrrefseq utils {}
 +
edge ecoliprobe matchprobes {}
 +
edge ye6100subdcdf utils {}
 +
edge hs95av2hsug utils {}
 +
edge porcineprobe matchprobes {}
 +
edge mm430ammensecdf utils {}
 +
edge hs133aptentrezgcdf utils {}
 +
edge mm74bv2mmrefseq utils {}
 +
edge hs133ahsentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge mm430mmenseprobe matchprobes {}
 +
edge ath1attigrprobe matchprobes {}
 +
edge rn230rnentrezgcdf utils {}
 +
edge hsex10stv2hsensecdf utils {}
 +
edge mu6500subbcdf utils {}
 +
edge mm74av2mmensecdf utils {}
 +
edge mm74av2mmentrezgcdf utils {}
 +
edge rgu34bcdf utils {}
 +
edge rae230aprobe matchprobes {}
 +
edge sugarcaneprobe matchprobes {}
 +
edge mm74bv2mmugprobe matchprobes {}
 +
edge saureuscdf utils {}
 +
edge mgu74av2probe matchprobes {}
 +
edge htratfocuscdf utils {}
 +
edge mm74av1mmenstprobe matchprobes {}
 +
edge mm430mmensecdf utils {}
 +
edge dmgenome1dmensgprobe matchprobes {}
 +
edge drzebrafishdrentrezgcdf utils {}
 +
edge mgu74ccdf utils {}
 +
edge mm74cv2mmugcdf utils {}
 +
edge hu6800subccdf utils {}
 +
edge hs133ahsenseprobe matchprobes {}
 +
edge hs133xhsenstprobe matchprobes {}
 +
edge mmex10stv1mmugprobe matchprobes {}
 +
edge rnex10stv1rnrefseqcdf utils {}
 +
edge mouse4302cdf utils {}
 +
edge hs133av2ptensgcdf utils {}
 +
edge paeg1aprobe matchprobes {}
 +
edge hs133xptensecdf utils {}
 +
edge mu19ksubacdf utils {}
 +
edge hs133av2ptentrezg utils {}
 +
edge hgu95ccdf utils {}
 +
edge mm430bmmentrezgcdf utils {}
 +
edge hsfocusptentrezgcdf utils {}
 +
edge ath1attair utils {}
 +
edge ggchickenggenst utils {}
 +
edge wheatcdf utils {}
 +
edge celegansprobe matchprobes {}
 +
edge hgu95cprobe matchprobes {}
 +
edge vitisviniferaprobe matchprobes {}
 +
edge hgu95av2probe matchprobes {}
 +
edge drosgenome1probe matchprobes {}
 +
edge hs133av2hsensgcdf utils {}
 +
edge rn230brnentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge mm430bmmentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge hs133bptentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge rn230brnentrezgcdf utils {}
 +
edge hs133xhsensecdf utils {}
 +
edge hs133av2hsentrezg utils {}
 +
edge osriceosrefseqcdf utils {}
 +
edge hgfocuscdf utils {}
 +
edge test2cdf utils {}
 +
edge hs133aptensgprobe matchprobes {}
 +
edge mmex10stv1mmugcdf utils {}
 +
edge rn34arnenstprobe matchprobes {}
 +
edge rnex10stv1rnenst utils {}
 +
edge dmdrosophila2dmense utils {}
 +
edge mm74av1mmense utils {}
 +
edge rn230arnug utils {}
 +
edge rn230rnenst utils {}
 +
edge mm11ksubbmmensgprobe matchprobes {}
 +
edge drzebrafishdrentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge rn34arnentrezgcdf utils {}
 +
edge hs95av2ptensgcdf utils {}
 +
edge hsex10stv2ptentrezgprobe matchprobes {}
 +
edge hs133av2hsug utils {}
 +
edge mm74bv2mmrefseqcdf utils {}
 +
edge hs95av2ptentrezg utils {}
 +
edge dmgenome1dmug utils {}
 +
edge mgu74cv2cdf utils {}
 +
edge rn34arnugcdf utils {}
 +
edge dmdrosophila2dmensg utils {}
 +
edge mm74av1mmensg utils {}
 +
edge mm74av1mmenseprobe matchprobes {}
 +
edge hs133bhsugcdf utils {}
 +
edge mm430bmmenst utils {}
 +
edge hs133av2hsenstprobe matchprobes {}
 +
edge hs133phsensgprobe matchprobes {}
 +
edge hs95av2hsensgcdf utils {}
 +
edge mu11ksubacdf utils {}
 +
edge hs133xhsenseprobe matchprobes {}
 +
edge ggchickenggrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge porcinecdf utils {}
 +
edge u133x3pprobe matchprobes {}
 +
edge mm11ksubbmmrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge hs95av2hsentrezg utils {}
 +
edge hu6800probe matchprobes {}
 +
edge hs133pptenstprobe matchprobes {}
 +
edge mm74bv2mmrefseqprobe matchprobes {}
 +
edge ath1attigrcdf utils {}
 +
edge mm74bv2mmenst utils {}
 +
edge vitisviniferacdf utils {}
 +
edge hsex10stv2ptensgcdf utils {}
 +
edge LogitBoost NONE {}
 +
edge XML methods {}
 +
edge RMySQL methods {}
 +
edge RMySQL DBI {}
 +
edge SSOAP methods {}
 +
edge SSOAP XML {}
 +
edge SSOAP RCurl {}
 +
edge RCurl methods {}
 
}}
 
}}

Latest revision as of 14:22, 6 October 2007

This graph shows the package dependencies for the BioConductor software for the statistical analysis of microarrary data in R. The dependency list was generated from the BioConductor-1.9 software repository HTML pages.

Unfortunately it is too large to be used on this webserver (due to memory limitations). A slightly shorter list (75%) would work. See also Test graph 2 ...

{{#wgraph: png | thumb=40 | nodetype * { font helvR08 } layoutalgorithm=forcedir edge gpls NONE {} edge sigPathway R {} edge TypeInfo methods {} edge Biostrings R {} edge Biostrings methods {} edge Mfuzz R {} edge Mfuzz Biobase {} edge Mfuzz e1071 {} edge LMGene R {} edge LMGene Biobase {} edge LMGene multtest {} edge LMGene survival {} edge ecolitk R {} edge ecolitk affy {} edge ecolitk ecoliLeucine {} edge ecolitk ecolicdf {} edge ecolitk Biobase {} edge maCorrPlot NONE {} edge OLINgui R {} edge OLINgui OLIN {} edge xcms R {} edge xcms methods {} edge rflowcyt R {} edge rflowcyt survival {} edge rflowcyt xtable {} edge rflowcyt stats {} edge rflowcyt KernSmooth {} edge rflowcyt MASS {} edge rflowcyt grid {} edge rflowcyt methods {} edge rflowcyt hexbin {} edge rflowcyt rfcdmin {} edge rflowcyt fields {} edge rflowcyt lattice {} edge rflowcyt locfit {} edge daMA MASS {} edge made4 ade4 {} edge made4 scatterplot3d {} edge biomaRt methods {} edge biomaRt XML {} edge biomaRt RCurl {} edge gaggle rJava {} edge gaggle graph {} edge affylmGUI limma {} edge affylmGUI tcltk {} edge affylmGUI affy {} edge affylmGUI Biobase {} edge SAGElyzer AnnBuilder {} edge SAGElyzer tkWidgets {} edge SAGElyzer genefilter {} edge SAGElyzer annotate {} edge GeneR NONE {} edge GeneSpring Biobase {} edge GeneSpring methods {} edge geneplotter annotate {} edge geneplotter Biobase {} edge geneplotter methods {} edge BioMVCClass methods {} edge BioMVCClass MVCClass {} edge BioMVCClass Biobase {} edge BioMVCClass graph {} edge BioMVCClass Rgraphviz {} edge sizepower stats {} edge PROcess Icens {} edge snapCGH limma {} edge snapCGH tilingArray {} edge snapCGH DNAcopy {} edge snapCGH aCGH {} edge snapCGH GLAD {} edge snapCGH cluster {} edge snapCGH methods {} edge bioDist methods {} edge bioDist Biobase {} edge marray limma {} edge marray methods {} edge tkWidgets methods {} edge tkWidgets widgetTools {} edge tkWidgets DynDoc {} edge rama NONE {} edge Ruuid methods {} edge arrayQuality marray {} edge arrayQuality limma {} edge arrayQuality convert {} edge arrayQuality hexbin {} edge arrayQuality gridBase {} edge arrayQuality RColorBrewer {} edge GraphAT MCMCpack {} edge GraphAT graph {} edge beadarray limma {} edge beadarray Biobase {} edge beadarray affy {} edge beadarray methods {} edge ppiStats apComplex {} edge ppiStats GO {} edge ppiStats GOstats {} edge ppiStats YEAST {} edge ppiStats graph {} edge ppiStats Rgraphviz {} edge ppiStats Category {} edge pcaMethods MASS {} edge pcaMethods ellipse {} edge pcaMethods pls {} edge pcaMethods methods {} edge GlobalAncova methods {} edge webbioc Biobase {} edge webbioc affy {} edge webbioc multtest {} edge webbioc annaffy {} edge webbioc vsn {} edge webbioc gcrma {} edge webbioc qvalue {} edge cghMCR methods {} edge cghMCR DNAcopy {} edge cghMCR marray {} edge cghMCR arrayQuality {} edge widgetInvoke methods {} edge widgetInvoke XML {} edge widgetInvoke RGtk {} edge hexbin methods {} edge hexbin grid {} edge hexbin lattice {} edge hexbin colorspace {} edge matchprobes Biobase {} edge matchprobes affy {} edge siggenes methods {} edge siggenes multtest {} edge siggenes Biobase {} edge AnnBuilder methods {} edge AnnBuilder Biobase {} edge AnnBuilder XML {} edge AnnBuilder annotate {} edge AnnBuilder utils {} edge AnnBuilder RSQLite {} edge pamr NONE {} edge RBGL graph {} edge RBGL methods {} edge biocViews methods {} edge biocViews tools {} edge biocViews graph {} edge biocViews RBGL {} edge biocViews XML {} edge CoCiteStats humanLLMappings {} edge ChromoViz RSvgDevice {} edge ChromoViz XML {} edge GOstats graph {} edge GOstats GO {} edge GOstats annotate {} edge GOstats RBGL {} edge GOstats Biobase {} edge GOstats Category {} edge GOstats methods {} edge prada Biobase {} edge prada RColorBrewer {} edge prada grid {} edge prada methods {} edge prada geneplotter {} edge bridge rama {} edge ontoTools methods {} edge ontoTools graph {} edge ontoTools SparseM {} edge ontoTools GO {} edge ontoTools Biobase {} edge ontoTools annotate {} edge MCRestimate e1071 {} edge MCRestimate pamr {} edge MCRestimate randomForest {} edge MCRestimate RColorBrewer {} edge MCRestimate Biobase {} edge MCRestimate golubEsets {} edge aroma.light R.oo {} edge pkgDepTools methods {} edge pkgDepTools graph {} edge pkgDepTools RBGL {} edge MeasurementError.cor NONE {} edge logicFS LogicReg {} edge copa Biobase {} edge copa methods {} edge Category Biobase {} edge Category KEGG {} edge Category GO {} edge Category graph {} edge Category annotate {} edge Category methods {} edge Category genefilter {} edge Harshlight affy {} edge OrderedList Biobase {} edge OrderedList twilight {} edge MVCClass methods {} edge panp affy {} edge LPE NONE {} edge MANOR GLAD {} edge RbcBook1 Biobase {} edge vsn Biobase {} edge iSPlot methods {} edge iSPlot RGtk {} edge iSPlot gtkDevice {} edge iSPlot MVCClass {} edge pickgene MASS {} edge makecdfenv methods {} edge makecdfenv Biobase {} edge makecdfenv affy {} edge makecdfenv utils {} edge makecdfenv affyio {} edge aCGH cluster {} edge aCGH survival {} edge aCGH multtest {} edge aCGH sma {} edge KEGGSOAP methods {} edge KEGGSOAP XML {} edge KEGGSOAP SSOAP {} edge KEGGSOAP RCurl {} edge annotate methods {} edge annotate Biobase {} edge limma methods {} edge timecourse limma {} edge timecourse MASS {} edge timecourse Biobase {} edge timecourse methods {} edge nem e1071 {} edge nem graph {} edge nem Rgraphviz {} edge nem RBGL {} edge HEM Biobase {} edge SBMLR XML {} edge SBMLR odesolve {} edge MLInterfaces Biobase {} edge MLInterfaces methods {} edge MLInterfaces genefilter {} edge weaver digest {} edge weaver tools {} edge weaver utils {} edge weaver codetools {} edge goTools Biobase {} edge goTools annotate {} edge goTools GO {} edge applera Biobase {} edge applera methods {} edge applera affy {} edge applera genefilter {} edge applera limma {} edge applera geneplotter {} edge applera RColorBrewer {} edge applera prada {} edge applera combinat {} edge annaffy methods {} edge annaffy Biobase {} edge annaffy GO {} edge annaffy KEGG {} edge spotSegmentation mclust {} edge geneRecommender Biobase {} edge codelink methods {} edge codelink limma {} edge codelink annotate {} edge widgetTools methods {} edge widgetTools utils {} edge splots grid {} edge RSNPper methods {} edge RSNPper utils {} edge RSNPper tools {} edge RSNPper XML {} edge GeneMeta methods {} edge GeneMeta Biobase {} edge GeneMeta genefilter {} edge GEOquery methods {} edge globaltest methods {} edge globaltest graphics {} edge globaltest multtest {} edge pathRender graph {} edge pathRender Rgraphviz {} edge pathRender cMAP {} edge convert Biobase {} edge convert limma {} edge convert marray {} edge convert utils {} edge convert methods {} edge stam GO {} edge stam Biobase {} edge stam pamr {} edge stam cluster {} edge stam annaffy {} edge stam methods {} edge BSgenome methods {} edge BSgenome Biostrings {} edge pdmclass Biobase {} edge pdmclass fibroEset {} edge pdmclass mda {} edge cellHTS prada {} edge cellHTS RColorBrewer {} edge cellHTS Biobase {} edge cellHTS genefilter {} edge metaArray MergeMaid {} edge EBImage methods {} edge arrayQCplot RGtk2 {} edge arrayQCplot cairoDevice {} edge arrayQCplot LPE {} edge hopach cluster {} edge hopach Biobase {} edge DNAcopy NONE {} edge ssize gdata {} edge ssize xtable {} edge apComplex graph {} edge tilingArray methods {} edge tilingArray Biobase {} edge tilingArray affy {} edge tilingArray RColorBrewer {} edge tilingArray grid {} edge tilingArray strucchange {} edge tilingArray vsn {} edge tilingArray genefilter {} edge tilingArray geneplotter {} edge tilingArray pixmap {} edge RMAPPER methods {} edge splicegear methods {} edge splicegear utils {} edge splicegear grid {} edge splicegear Biobase {} edge splicegear XML {} edge splicegear annotate {} edge gff3Plotter methods {} edge mmgmos methods {} edge mmgmos Biobase {} edge mmgmos affy {} edge plgem Biobase {} edge plgem MASS {} edge DEDS methods {} edge pgUtils Rdbi {} edge pgUtils RdbiPgSQL {} edge pgUtils methods {} edge hypergraph methods {} edge hypergraph graph {} edge arrayMagic methods {} edge arrayMagic utils {} edge arrayMagic Biobase {} edge arrayMagic vsn {} edge arrayMagic limma {} edge arrayMagic genefilter {} edge nudge stats {} edge sscore affy {} edge sscore affxparser {} edge simulatorAPMS graph {} edge simulatorAPMS apComplex {} edge simulatorAPMS Rgraphviz {} edge simulatorAPMS ScISI {} edge simulatorAPMS ppiStats {} edge affy Biobase {} edge affy methods {} edge affy utils {} edge affy affyio {} edge OCplus akima {} edge OCplus multtest {} edge diffGeneAnalysis minpack.lm {} edge macat Biobase {} edge macat annotate {} edge idiogram methods {} edge idiogram Biobase {} edge idiogram annotate {} edge pcot2 grDevices {} edge pcot2 Biobase {} edge pcot2 amap {} edge iSNetwork methods {} edge iSNetwork graph {} edge iSNetwork Rgraphviz {} edge iSNetwork RGtk {} edge iSNetwork gtkDevice {} edge iSNetwork BioMVCClass {} edge iSNetwork MVCClass {} edge iSNetwork Biobase {} edge iSNetwork annotate {} edge affyPLM affy {} edge affyPLM affydata {} edge affyPLM Biobase {} edge affyPLM methods {} edge affyPLM gcrma {} edge spikeLI utils {} edge genefilter methods {} edge genefilter Biobase {} edge genefilter survival {} edge altcdfenvs methods {} edge altcdfenvs Biobase {} edge altcdfenvs affy {} edge altcdfenvs matchprobes {} edge altcdfenvs makecdfenv {} edge OLIN methods {} edge OLIN stats {} edge OLIN locfit {} edge OLIN Biobase {} edge OLIN marray {} edge beadarraySNP methods {} edge beadarraySNP Biobase {} edge beadarraySNP limma {} edge beadarraySNP quantsmooth {} edge Heatplus NONE {} edge GeneTS GeneCycle {} edge GeneTS GeneNet {} edge safe methods {} edge safe Biobase {} edge Rgraphviz methods {} edge Rgraphviz graph {} edge Rgraphviz geneplotter {} edge RdbiPgSQL Rdbi {} edge twilight splines {} edge twilight stats {} edge GeneTraffic Biobase {} edge GeneTraffic affy {} edge GeneTraffic marray {} edge GeneTraffic SSOAP {} edge GeneTraffic XML {} edge GeneTraffic digest {} edge GeneTraffic methods {} edge simpleaffy affy {} edge simpleaffy genefilter {} edge maSigPro Biobase {} edge Icens survival {} edge Rredland methods {} edge Rredland graph {} edge graph methods {} edge nnNorm nnet {} edge nnNorm marray {} edge genArise locfit {} edge genArise tkrplot {} edge genArise xtable {} edge genArise methods {} edge EBarrays Biobase {} edge EBarrays methods {} edge EBarrays utils {} edge EBarrays lattice {} edge reb Biobase {} edge reb idiogram {} edge SAGx stats {} edge SAGx multtest {} edge SAGx sma {} edge SAGx methods {} edge RMAGEML marray {} edge RMAGEML limma {} edge RMAGEML Biobase {} edge affyio methods {} edge edd methods {} edge edd golubEsets {} edge edd Biobase {} edge edd class {} edge edd nnet {} edge edd xtable {} edge maDB Biobase {} edge maDB affy {} edge maDB limma {} edge maDB methods {} edge DynDoc methods {} edge DynDoc tools {} edge BeadExplorer methods {} edge BeadExplorer widgetTools {} edge BeadExplorer affy {} edge BeadExplorer R2HTML {} edge BeadExplorer grDevices {} edge BeadExplorer tkWidgets {} edge affycoretools affy {} edge affycoretools limma {} edge affycoretools GOstats {} edge affycoretools biomaRt {} edge limmaGUI limma {} edge limmaGUI tcltk {} edge ABarray Biobase {} edge ABarray multtest {} edge GGtools methods {} edge GGtools Biobase {} edge GGtools hgfocus {} edge GGtools geneplotter {} edge Biobase tools {} edge Biobase methods {} edge Biobase utils {} edge factDesign Biobase {} edge factDesign affy {} edge factDesign stats {} edge sagenhaft SparseM {} edge ROC utils {} edge ROC methods {} edge bim stats {} edge bim qtl {} edge gcrma Biobase {} edge gcrma affy {} edge gcrma matchprobes {} edge gcrma splines {} edge adSplit methods {} edge adSplit stats {} edge adSplit cluster {} edge adSplit multtest {} edge adSplit Biobase {} edge adSplit affy {} edge adSplit GO {} edge adSplit KEGG {} edge Resourcerer AnnBuilder {} edge MergeMaid survival {} edge MergeMaid Biobase {} edge MergeMaid MASS {} edge MergeMaid methods {} edge plier affy {} edge quantsmooth quantreg {} edge quantsmooth lodplot {} edge affycomp Biobase {} edge stepNorm marray {} edge stepNorm MASS {} edge stepNorm methods {} edge clusterStab Biobase {} edge clusterStab methods {} edge affyQCReport Biobase {} edge affyQCReport affy {} edge affyQCReport simpleaffy {} edge affypdnn affy {} edge affypdnn affydata {} edge affypdnn hgu95av2probe {} edge affydata affy {} edge pairseqsim methods {} edge pairseqsim stats {} edge fdrame NONE {} edge ScISI methods {} edge ScISI apComplex {} edge ScISI GO {} edge ScISI GOstats {} edge ScISI graph {} edge ScISI RBGL {} edge ScISI Rgraphviz {} edge ScISI YEAST {} edge ScISI xtable {} edge multtest methods {} edge multtest Biobase {} edge multtest survival {} edge ctc NONE {} edge yeastExpData graph {} edge golubEsets Biobase {} edge estrogen affy {} edge MAQCsubset Biobase {} edge fibroEset Biobase {} edge HEEBOdata NONE {} edge facsDorit prada {} edge Iyer517 Biobase {} edge stjudem utils {} edge ProData Biobase {} edge SpikeIn affy {} edge ALL Biobase {} edge AmpAffyExample affy {} edge kidpack Biobase {} edge CLL affy {} edge CLL Biobase {} edge SpikeInSubset Biobase {} edge SpikeInSubset affy {} edge gaschYHS Biobase {} edge ALLMLL affy {} edge bronchialIL13 affy {} edge beta7 marray {} edge lungExpression Biobase {} edge HIVcDNAvantWout03 NONE {} edge yeastCC Biobase {} edge harbChIP Biobase {} edge ppiData Rgraphviz {} edge ppiData graph {} edge colonCA Biobase {} edge SNAData graph {} edge ecoliLeucine affy {} edge davidTiling Biobase {} edge davidTiling tilingArray {} edge davidTiling GO {} edge MEEBOdata NONE {} edge GGdata Biobase {} edge GGdata hgfocus {} edge rn230rnentrezgprobe matchprobes {} edge rn230brnrefseqprobe matchprobes {} edge dmgenome1dmense utils {} edge medicagoprobe matchprobes {} edge dmgenome1dmugcdf utils {} edge hsex10stv2ptentrezg utils {} edge caninecdf utils {} edge mm430ammensgcdf utils {} edge mm430ammrefseqcdf utils {} edge hsfocushsenstprobe matchprobes {} edge hs133bhsentrezgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrugcdf utils {} edge mm430ammentrezg utils {} edge hgu133bprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmentrezgprobe matchprobes {} edge rn34arnenseprobe matchprobes {} edge soybeancdf utils {} edge hs133xptensgprobe matchprobes {} edge rtu34probe matchprobes {} edge hsex10stv2hsensgcdf utils {} edge rnex10stv1rnensecdf utils {} edge mm11ksubbmmentrezgcdf utils {} edge mu6500subdcdf utils {} edge mm74av2mmensgcdf utils {} edge mm74bv2mmentrezgcdf utils {} edge rn230rnenstprobe matchprobes {} edge hs95av2hsrefseq utils {} edge hsex10stv2hsentrezg utils {} edge mm430bmmenstprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsense utils {} edge mm74av2mmentrezg utils {} edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 methods {} edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 Biostrings {} edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 BSgenome {} edge dmgenome1dmensg utils {} edge mm430bmmensecdf utils {} edge mm430mmensgcdf utils {} edge hu35ksubaprobe matchprobes {} edge rn230brnensgprobe matchprobes {} edge hsex10stv2ptense utils {} edge osriceostigrprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsentrezgprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfenstprobe matchprobes {} edge mm430mmentrezg utils {} edge mm74av1mmrefseqprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnrefseq utils {} edge atgenomeattaircdf utils {} edge hs133xptensgcdf utils {} edge mu19ksubccdf utils {} edge hgu95ecdf utils {} edge atgenomeatrefseqcdf utils {} edge hs133phsrefseqprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsensg utils {} edge hs133xptentrezg utils {} edge saureusprobe matchprobes {} edge hs133av2hsenseprobe matchprobes {} edge rhesusprobe matchprobes {} edge mm74av2mmense utils {} edge mm11ksubammenstcdf utils {} edge mmex10stv1mmrefseq utils {} edge cfcanine2cfentrezgcdf utils {} edge ggchickenggenstprobe matchprobes {} edge cyp450cdf utils {} edge hsex10stv2ptensg utils {} edge hs133pptenseprobe matchprobes {} edge hs133xhsensgcdf utils {} edge poplarcdf utils {} edge dmdrosophila2dmrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2hsrefseqprobe matchprobes {} edge hs133xhsentrezg utils {} edge mm11ksubammugcdf utils {} edge mm74av2mmensg utils {} edge hsex10stv2hsenstprobe matchprobes {} edge mgu74cprobe matchprobes {} edge hsfocushsenseprobe matchprobes {} edge hs133bhsentrezgcdf utils {} edge mmex10stv1mmense utils {} edge mm11ksubammenstprobe matchprobes {} edge hs133av2ptensgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrense utils {} edge mm430mmrefseqcdf utils {} edge cfcanine2cfenstcdf utils {} edge hs133aptenstcdf utils {} edge rn230rnenseprobe matchprobes {} edge mm430bmmenseprobe matchprobes {} edge mm74av1mmug utils {} edge bovinecdf utils {} edge drzebrafishdrensecdf utils {} edge dmgenome1dmensecdf utils {} edge rae230bcdf utils {} edge hu6800cdf utils {} edge ath1attairprobe matchprobes {} edge canineprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmensg utils {} edge hs133ahsrefseqcdf utils {} edge cfcanine2cfenseprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnugcdf utils {} edge mm74av2mmrefseq utils {} edge hs133ahsenstcdf utils {} edge mm430mmrefseq utils {} edge drzebrafishdrensg utils {} edge ggchickenggenstcdf utils {} edge mm74cv2mmenstcdf utils {} edge hsfocusptensgprobe matchprobes {} edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 methods {} edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 Biostrings {} edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 BSgenome {} edge hs133bhsenstprobe matchprobes {} edge mm11ksubammugprobe matchprobes {} edge ggchickenggenseprobe matchprobes {} edge mm430mmense utils {} edge mm74cv2mmenstprobe matchprobes {} edge dmdrosophila2dmenst utils {} edge tomatocdf utils {} edge mm74av1mmenst utils {} edge mgu74bv2probe matchprobes {} edge rn230arnenstcdf utils {} edge hgu133acdf utils {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 methods {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 Biostrings {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 BSgenome {} edge hs95av2hsenstprobe matchprobes {} edge atgenomeattigrprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfense utils {} edge rnex10stv1rnensgcdf utils {} edge mm74cv2mmentrezgcdf utils {} edge hs133ahsense utils {} edge dmdrosophila2dmenstprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsenseprobe matchprobes {} edge hsfocusptentrezgprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnentrezg utils {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 methods {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 Biostrings {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 BSgenome {} edge moe430bcdf utils {} edge rnex10stv1rnensgprobe matchprobes {} edge mm430mmentrezgprobe matchprobes {} edge ye6100subacdf utils {} edge mm430mmensg utils {} edge hs133xhsug utils {} edge mm11ksubammenseprobe matchprobes {} edge chickencdf utils {} edge mm430bmmensgcdf utils {} edge hs133aptense utils {} edge rn230rnenstcdf utils {} edge rn230arnenstprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfrefseq utils {} edge mm430bmmentrezg utils {} edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 methods {} edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 Biostrings {} edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 BSgenome {} edge cfcanine2cfugprobe matchprobes {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 methods {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 Biostrings {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 BSgenome {} edge hs133phsug utils {} edge zebrafishcdf utils {} edge rat2302cdf utils {} edge moe430bprobe matchprobes {} edge rn230rnugcdf utils {} edge cfcanine2cfensg utils {} edge hgu95bprobe matchprobes {} edge yeast2cdf utils {} edge hgu133plus2probe matchprobes {} edge hs133ahsensg utils {} edge mm74av1mmrefseqcdf utils {} edge mmex10stv1mmenstprobe matchprobes {} edge hsfocusptenstcdf utils {} edge mm74bv2mmensecdf utils {} edge rn230brnug utils {} edge hs133xhsrefseqcdf utils {} edge hs133aptensg utils {} edge hgu133a2probe matchprobes {} edge citrusprobe matchprobes {} edge hs133ahsugprobe matchprobes {} edge hsex10stv2ptensgprobe matchprobes {} edge ggchickenggugprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmugprobe matchprobes {} edge dmgenome1dmenst utils {} edge rn34arnentrezgprobe matchprobes {} edge mm74av2mmenstprobe matchprobes {} edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 methods {} edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 Biostrings {} edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 BSgenome {} edge mmex10stv1mmensecdf utils {} edge hs133bhsenseprobe matchprobes {} edge hsfocushsenstcdf utils {} edge mm74cv2mmentrezgprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmenstcdf utils {} edge mm74cv2mmenseprobe matchprobes {} edge hs133xhsense utils {} edge dmdrosophila2dmug utils {} edge mm74bv2mmensgprobe matchprobes {} edge rgu34cprobe matchprobes {} edge rn230arnugprobe matchprobes {} edge hs133xptense utils {} edge hsex10stv2hsenst utils {} edge hs95av2hsenseprobe matchprobes {} edge mgu74bv2cdf utils {} edge rn34arnrefseqcdf utils {} edge hsex10stv2ptenst utils {} edge dmdrosophila2dmenseprobe matchprobes {} edge hthgu133acdf utils {} edge agprobe matchprobes {} edge hsfocushsentrezgprobe matchprobes {} edge hs133xhsensg utils {} edge drzebrafishdrensgcdf utils {} edge dmgenome1dmensgcdf utils {} edge hu35ksubdprobe matchprobes {} edge hs133bptensgprobe matchprobes {} edge rn230rnugprobe matchprobes {} edge maizeprobe matchprobes {} edge rn230arnenseprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrentrezg utils {} edge hs133xptensg utils {} edge hs133pptenstcdf utils {} edge mm74av2mmenst utils {} edge vvgrapevvtigrprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsugcdf utils {} edge hs133bptenstcdf utils {} edge paeg1acdf utils {} edge mm11ksubammug utils {} edge mm430ammugcdf utils {} edge ggchickenggrefseq utils {} edge hs95av2ptensgprobe matchprobes {} edge hs133av2hsrefseqcdf utils {} edge mmex10stv1mmenseprobe matchprobes {} edge mm430ammensgprobe matchprobes {} edge hs133ahsrefseqprobe matchprobes {} edge hs133bhsense utils {} edge hs133phsenstcdf utils {} edge hs133bptentrezgcdf utils {} edge hgu133aprobe matchprobes {} edge hs133bhsenstcdf utils {} edge dmdrosophila2dmrefseq utils {} edge hs133bptense utils {} edge mm74av2mmenseprobe matchprobes {} edge mm11ksubammense utils {} edge hu35ksubbcdf utils {} edge mmex10stv1mmenst utils {} edge dmdrosophila2dmenstcdf utils {} edge hsfocushsugprobe matchprobes {} edge atgenomeattigr utils {} edge hgu133atagcdf utils {} edge mm11ksubbmmugprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrenst utils {} edge hgu133a2cdf utils {} edge drzebrafishdrenstprobe matchprobes {} edge hs133phsentrezgcdf utils {} edge hs95av2hsugcdf utils {} edge hs133bhsensg utils {} edge hs95av2hsentrezgcdf utils {} edge ye6100subccdf utils {} edge rn34arnrefseqprobe matchprobes {} edge hsfocushsrefseqcdf utils {} edge hsex10stv2hsug utils {} edge rn230brnenstcdf utils {} edge hs133phsense utils {} edge hs133bptensg utils {} edge mm11ksubammensg utils {} edge rn230rnrefseqcdf utils {} edge mu6500subacdf utils {} edge hs133pptense utils {} edge tomatoprobe matchprobes {} edge rgu34acdf utils {} edge mm430bmmrefseqcdf utils {} edge osriceosrefseqprobe matchprobes {} edge dmdrosophila2dmugcdf utils {} edge bovineprobe matchprobes {} edge hgu95av2cdf utils {} edge mm74bv2mmensgcdf utils {} edge mm11ksubbmmugcdf utils {} edge mgu74bcdf utils {} edge mm74av1mmugcdf utils {} edge cfcanine2cfrefseqcdf utils {} edge hu6800subbcdf utils {} edge hs133phsensg utils {} edge rn34arnenstcdf utils {} edge mm74bv2mmentrezg utils {} edge mm74av1mmentrezgprobe matchprobes {} edge mm430mmenst utils {} edge hsfocushsugcdf utils {} edge test3probe matchprobes {} edge soybeanprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmensgcdf utils {} edge hs133pptensg utils {} edge mm74av1mmenstcdf utils {} edge dmgenome1dmenstprobe matchprobes {} edge hgu95bcdf utils {} edge mgu74bprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmentrezg utils {} edge hs133xhsugcdf utils {} edge hs133phsugprobe matchprobes {} edge ggchickenggrefseqcdf utils {} edge cfcanine2cfenst utils {} edge mm430ammrefseqprobe matchprobes {} edge mm74av2mmug utils {} edge mm430mmensgprobe matchprobes {} edge hs133phsugcdf utils {} edge hs133bhsugprobe matchprobes {} edge hs133ahsenst utils {} edge rnex10stv1rnentrezgcdf utils {} edge hs133ahsug utils {} edge dmdrosophila2dmugprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmrefseq utils {} edge hs133aptenst utils {} edge hs133av2hsentrezgcdf utils {} edge test1cdf utils {} edge rn230arnugcdf utils {} edge maizecdf utils {} edge plasmodiumanophelesprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrenseprobe matchprobes {} edge hs133ahsensgprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsrefseqcdf utils {} edge rn34arnrefseq utils {} edge mm74av1mmrefseq utils {} edge gp53cdf utils {} edge mm11ksubammrefseqcdf utils {} edge ecoliasv2probe matchprobes {} edge rn230brnugprobe matchprobes {} edge hs133aptenstprobe matchprobes {} edge atgenomeattairprobe matchprobes {} edge hs133av2ptenstcdf utils {} edge mgu74cv2probe matchprobes {} edge hs95av2hsense utils {} edge ggchickenggug utils {} edge hgu95eprobe matchprobes {} edge hs133pptentrezgprobe matchprobes {} edge canine2probe matchprobes {} edge mm11ksubbmmense utils {} edge hsfocushsense utils {} edge mm11ksubbmmenstprobe matchprobes {} edge rn230arnense utils {} edge hs95av2ptense utils {} edge ath1attigr utils {} edge yeast2probe matchprobes {} edge mm430bmmrefseq utils {} edge hsfocusptense utils {} edge hs133av2hsenstcdf utils {} edge agcdf utils {} edge rn34arnugprobe matchprobes {} edge hs133xhsenst utils {} edge hs95av2hsensg utils {} edge hu35ksubdcdf utils {} edge mm74av1mmugprobe matchprobes {} edge dmgenome1dmenseprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmensg utils {} edge hs133xptenst utils {} edge hsfocushsensg utils {} edge cfcanine2cfrefseqprobe matchprobes {} edge hs133phsenstprobe matchprobes {} edge hs133bhsrefseqcdf utils {} edge rn230arnensg utils {} edge hs95av2ptensg utils {} edge mm430mmug utils {} edge mm74cv2mmrefseqcdf utils {} edge ath1121501cdf utils {} edge hsfocusptensg utils {} edge ricecdf utils {} edge mm11ksubammensecdf utils {} edge wheatprobe matchprobes {} edge hs133av2hsugcdf utils {} edge drosophila2cdf utils {} edge moe430aprobe matchprobes {} edge hs95av2ptenstcdf utils {} edge hs95av2hsrefseqcdf utils {} edge hgu95aprobe matchprobes {} edge atgenomeattigrcdf utils {} edge barley1probe matchprobes {} edge mm74av1mmensgprobe matchprobes {} edge mu6500subccdf utils {} edge dmdrosophila2dmrefseqcdf utils {} edge dmgenome1dmrefseqprobe matchprobes {} edge rgu34ccdf utils {} edge hs133xhsensgprobe matchprobes {} edge hsfocushsrefseq utils {} edge hcg110probe matchprobes {} edge hs95av2hsenstcdf utils {} edge mm430mmentrezgcdf utils {} edge hs133bhsrefseq utils {} edge hs133aptenseprobe matchprobes {} edge rn230rnrefseqprobe matchprobes {} edge hs133xptenstprobe matchprobes {} edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 methods {} edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 Biostrings {} edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 BSgenome {} edge mu11ksubbprobe matchprobes {} edge rn230arnrefseqcdf utils {} edge osriceosrefseq utils {} edge hu6800subdcdf utils {} edge mm74bv2mmug utils {} edge ecoliasv2cdf utils {} edge hs133bhsenst utils {} edge mm74av2mmentrezgprobe matchprobes {} edge hivprtplus2cdf utils {} edge hs133phsentrezgprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmenseprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfensecdf utils {} edge hs133xptentrezgprobe matchprobes {} edge mm74av1mmentrezgcdf utils {} edge hs133aptensecdf utils {} edge hs133bptenst utils {} edge mu19ksubbcdf utils {} edge rn230brnenstprobe matchprobes {} edge mm11ksubammenst utils {} edge hsex10stv2ptenstcdf utils {} edge hgu95dcdf utils {} edge mmex10stv1mmrefseqcdf utils {} edge mm74cv2mmrefseqprobe matchprobes {} edge rgu34bprobe matchprobes {} edge hs133av2hsugprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrug utils {} edge hs133pptentrezgcdf utils {} edge hs95av2ptentrezgcdf utils {} edge mm430mmugcdf utils {} edge mm430ammenstcdf utils {} edge rn34arnensgprobe matchprobes {} edge mgu74av2cdf utils {} edge ath1121501probe matchprobes {} edge rn230rnug utils {} edge osriceostigr utils {} edge citruscdf utils {} edge mm74av2mmrefseqcdf utils {} edge hs133av2hsense utils {} edge hs133ahsensecdf utils {} edge hs133phsenseprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsenstcdf utils {} edge ggchickenggensecdf utils {} edge mm74av2mmenstcdf utils {} edge mm74cv2mmensecdf utils {} edge test3cdf utils {} edge ath1atrefseq utils {} edge hs133av2ptense utils {} edge hs133phsenst utils {} edge mm74av2mmrefseqprobe matchprobes {} edge mm430ammentrezgcdf utils {} edge hu35ksubcprobe matchprobes {} edge rn230brnense utils {} edge hs133pptenst utils {} edge mm11ksubbmmug utils {} edge mm430bmmugcdf utils {} edge mm430mmenstcdf utils {} edge mm11ksubammrefseqprobe matchprobes {} edge chickenprobe matchprobes {} edge hs133av2hsensg utils {} edge rn230arnentrezgcdf utils {} edge atgenomeatrefseqprobe matchprobes {} edge poplarprobe matchprobes {} edge rn230arnensecdf utils {} edge hs133av2hsensgprobe matchprobes {} edge plasmodiumanophelescdf utils {} edge hs133xptenstcdf utils {} edge hs133av2ptensg utils {} edge bsubtilisprobe matchprobes {} edge rn230arnrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2hsugprobe matchprobes {} edge hs133av2ptenstprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmense utils {} edge hs133pptensgprobe matchprobes {} edge rn230brnensg utils {} edge hs133xptenseprobe matchprobes {} edge rae230acdf utils {} edge mu11ksubbcdf utils {} edge hs133xhsentrezgcdf utils {} edge mouse430a2cdf utils {} edge hgfocusprobe matchprobes {} edge hs133xhsenstcdf utils {} edge drosgenome1cdf utils {} edge hsex10stv2hsentrezgcdf utils {} edge rn230rnensecdf utils {} edge rn230brnrefseq utils {} edge cfcanine2cfentrezgprobe matchprobes {} edge hs133av2ptentrezgcdf utils {} edge hs133xhsentrezgprobe matchprobes {} edge rn230brnenseprobe matchprobes {} edge hsfocushsensgprobe matchprobes {} edge hs133av2hsrefseq utils {} edge mm74cv2mmensg utils {} edge mm430ammugprobe matchprobes {} edge hsfocusptenstprobe matchprobes {} edge mm11ksubammensgcdf utils {} edge hsfocusptensecdf utils {} edge hsex10stv2hsrefseq utils {} edge rn230rnensgprobe matchprobes {} edge hs133xhsrefseq utils {} edge mm430bmmensgprobe matchprobes {} edge mm11ksubammentrezg utils {} edge hsex10stv2hsugprobe matchprobes {} edge ath1atrefseqprobe matchprobes {} edge mm74av2mmugprobe matchprobes {} edge mm74av2mmugcdf utils {} edge rnu34cdf utils {} edge mm74cv2mmug utils {} edge osriceostigrcdf utils {} edge mm11ksubammentrezgprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmug utils {} edge hs95av2ptentrezgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrrefseqcdf utils {} edge cfcanine2cfensgprobe matchprobes {} edge hs95av2hsenst utils {} edge hsfocushsensecdf utils {} edge ath1attaircdf utils {} edge mm430mmugprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmenst utils {} edge moe430acdf utils {} edge hsfocushsenst utils {} edge mm11ksubbmmensecdf utils {} edge rn230arnenst utils {} edge hs95av2ptenst utils {} edge hsfocusptenst utils {} edge mm430ammug utils {} edge mgu74aprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnenstprobe matchprobes {} edge ggchickenggensgprobe matchprobes {} edge hs133bhsug utils {} edge mm11ksubammentrezgcdf utils {} edge cfcanine2cfensgcdf utils {} edge hs133av2ptenseprobe matchprobes {} edge hs133aptensgcdf utils {} edge cfcanine2cfentrezg utils {} edge rn230brnugcdf utils {} edge hs133aptentrezg utils {} edge mm11ksubammrefseq utils {} edge rae230bprobe matchprobes {} edge mouse430a2probe matchprobes {} edge hs133xhsugprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmrefseq utils {} edge hgu133atagprobe matchprobes {} edge hs133pptensecdf utils {} edge hsex10stv2hsensgprobe matchprobes {} edge rn34arnense utils {} edge hs133ahsensgcdf utils {} edge dmgenome1dmrefseqcdf utils {} edge rnex10stv1rnenstcdf utils {} edge ggchickenggensgcdf utils {} edge mm74cv2mmensgcdf utils {} edge hs133bptensecdf utils {} edge rnex10stv1rnug utils {} edge drzebrafishdrrefseqprobe matchprobes {} edge mm11ksubammensgprobe matchprobes {} edge hs133ahsentrezg utils {} edge hs133phsrefseq utils {} edge riceprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmentrezg utils {} edge hsex10stv2ptenstprobe matchprobes {} edge hsfocusptenseprobe matchprobes {} edge mm430bmmenstcdf utils {} edge barley1cdf utils {} edge hs133phsensecdf utils {} edge hgu95dprobe matchprobes {} edge celeganscdf utils {} edge hs133bhsensecdf utils {} edge rn34arnensg utils {} edge mm430ammense utils {} edge mm430ammrefseq utils {} edge rn230arnensgcdf utils {} edge hs95av2hsentrezgprobe matchprobes {} edge dmdrosophila2dmensecdf utils {} edge rn230arnentrezg utils {} edge mm74bv2mmenstprobe matchprobes {} edge ecoli2probe matchprobes {} edge cfcanine2cfugcdf utils {} edge hs133ahsentrezgcdf utils {} edge hs133bhsensgprobe matchprobes {} edge rn230brnensecdf utils {} edge rn230rnensgcdf utils {} edge rnex10stv1rnenseprobe matchprobes {} edge mm430ammensg utils {} edge mm74cv2mmensgprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmrefseqcdf utils {} edge PFAM RSQLite {} edge rn230rnentrezg utils {} edge hs133bptenstprobe matchprobes {} edge hs133av2hsenst utils {} edge drosophila2probe matchprobes {} edge u133x3pcdf utils {} edge hs95av2hsensgprobe matchprobes {} edge hs133av2ptenst utils {} edge sugarcanecdf utils {} edge medicagocdf utils {} edge rtu34cdf utils {} edge hsfocusptensgcdf utils {} edge dmdrosophila2dmensgprobe matchprobes {} edge rn230brnenst utils {} edge rnex10stv1rnrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2ptenstprobe matchprobes {} edge hsfocusptentrezg utils {} edge rnex10stv1rnugprobe matchprobes {} edge mm430ammenstprobe matchprobes {} edge hgu133bcdf utils {} edge rn34arnensecdf utils {} edge hu35ksubacdf utils {} edge hs133phsrefseqcdf utils {} edge ggchickenggense utils {} edge xenopuslaevisprobe matchprobes {} edge hcg110cdf utils {} edge hs133ahsrefseq utils {} edge mm11ksubbmmentrezgprobe matchprobes {} edge hsex10stv2ptenseprobe matchprobes {} edge mm74av1mmensecdf utils {} edge rn230arnensgprobe matchprobes {} edge rn230rnrefseq utils {} edge hs133ahsugcdf utils {} edge hsfocushsentrezgcdf utils {} edge mu11ksubaprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrenstcdf utils {} edge dmgenome1dmenstcdf utils {} edge mm430bmmugprobe matchprobes {} edge hsfocushsensgcdf utils {} edge mm11ksubbmmensgcdf utils {} edge ye6100subbcdf utils {} edge mmex10stv1mmentrezgcdf utils {} edge hsfocushsentrezg utils {} edge canine2cdf utils {} edge hs133xptentrezgcdf utils {} edge hs133bhsrefseqprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmenst utils {} edge mm11ksubbmmentrezg utils {} edge ecolicdf utils {} edge mm74bv2mmugcdf utils {} edge hsex10stv2ptentrezgcdf utils {} edge rnex10stv1rnense utils {} edge vvgrapevvtigrcdf utils {} edge mmex10stv1mmensgprobe matchprobes {} edge ggchickenggensg utils {} edge rnex10stv1rnentrezgprobe matchprobes {} edge hsfocushsug utils {} edge rn230rnense utils {} edge mm74bv2mmenseprobe matchprobes {} edge rgu34aprobe matchprobes {} edge vvgrapevvtigr utils {} edge mm74av2mmensgprobe matchprobes {} edge rhesuscdf utils {} edge zebrafishprobe matchprobes {} edge hsfocushsrefseqprobe matchprobes {} edge mgu74acdf utils {} edge hu6800subacdf utils {} edge rnex10stv1rnensg utils {} edge hs133pptensgcdf utils {} edge hs133av2ptensecdf utils {} edge hu35ksubbprobe matchprobes {} edge rnu34probe matchprobes {} edge xenopuslaeviscdf utils {} edge hs133bptenseprobe matchprobes {} edge rn230rnensg utils {} edge rn34arnug utils {} edge rn230brnrefseqcdf utils {} edge dmgenome1dmrefseq utils {} edge hs133bptensgcdf utils {} edge hs133pptentrezg utils {} edge mm430bmmense utils {} edge hgu95acdf utils {} edge ath1atrefseqcdf utils {} edge hs133av2ptentrezgprobe matchprobes {} edge hs133bptentrezg utils {} edge hs133xhsrefseqprobe matchprobes {} edge hs133phsensgcdf utils {} edge hs133av2hsensecdf utils {} edge hs95av2ptenseprobe matchprobes {} edge rn230arnentrezgprobe matchprobes {} edge mm430ammentrezgprobe matchprobes {} edge mm430ammenseprobe matchprobes {} edge hs133aptentrezgprobe matchprobes {} edge hs133bhsensgcdf utils {} edge hs133phsentrezg utils {} edge mm74bv2mmense utils {} edge rat2302probe matchprobes {} edge mouse4302probe matchprobes {} edge hs133bhsentrezg utils {} edge mm430mmenstprobe matchprobes {} edge atgenomeattair utils {} edge mm430bmmensg utils {} edge drzebrafishdrugprobe matchprobes {} edge ecoli2cdf utils {} edge dmgenome1dmugprobe matchprobes {} edge dmdrosophila2dmensgcdf utils {} edge bsubtiliscdf utils {} edge mm74bv2mmenstcdf utils {} edge rn230arnrefseq utils {} edge hs133av2hsrefseqprobe matchprobes {} edge atgenomeatrefseq utils {} edge mm430bmmrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2ptensecdf utils {} edge ygs98cdf utils {} edge hs133ahsenstprobe matchprobes {} edge mm74bv2mmensg utils {} edge rn230brnensgcdf utils {} edge hgu133plus2cdf utils {} edge mmex10stv1mmenstcdf utils {} edge mmex10stv1mmrefseqprobe matchprobes {} edge ygs98probe matchprobes {} edge rn230brnentrezg utils {} edge hsex10stv2hsrefseqprobe matchprobes {} edge rn34arnenst utils {} edge hs95av2hsensecdf utils {} edge mm430mmrefseqprobe matchprobes {} edge mm74bv2mmentrezgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrensgprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfug utils {} edge rn34arnensgcdf utils {} edge hu35ksubccdf utils {} edge mm430bmmug utils {} edge rn34arnentrezg utils {} edge mm74av1mmensgcdf utils {} edge hs133av2hsentrezgprobe matchprobes {} edge mm430ammenst utils {} edge u133aaofav2cdf utils {} edge hsex10stv2ptensecdf utils {} edge ggchickenggugcdf utils {} edge mm74av1mmentrezg utils {} edge drzebrafishdrrefseq utils {} edge ecoliprobe matchprobes {} edge ye6100subdcdf utils {} edge hs95av2hsug utils {} edge porcineprobe matchprobes {} edge mm430ammensecdf utils {} edge hs133aptentrezgcdf utils {} edge mm74bv2mmrefseq utils {} edge hs133ahsentrezgprobe matchprobes {} edge mm430mmenseprobe matchprobes {} edge ath1attigrprobe matchprobes {} edge rn230rnentrezgcdf utils {} edge hsex10stv2hsensecdf utils {} edge mu6500subbcdf utils {} edge mm74av2mmensecdf utils {} edge mm74av2mmentrezgcdf utils {} edge rgu34bcdf utils {} edge rae230aprobe matchprobes {} edge sugarcaneprobe matchprobes {} edge mm74bv2mmugprobe matchprobes {} edge saureuscdf utils {} edge mgu74av2probe matchprobes {} edge htratfocuscdf utils {} edge mm74av1mmenstprobe matchprobes {} edge mm430mmensecdf utils {} edge dmgenome1dmensgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrentrezgcdf utils {} edge mgu74ccdf utils {} edge mm74cv2mmugcdf utils {} edge hu6800subccdf utils {} edge hs133ahsenseprobe matchprobes {} edge hs133xhsenstprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmugprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnrefseqcdf utils {} edge mouse4302cdf utils {} edge hs133av2ptensgcdf utils {} edge paeg1aprobe matchprobes {} edge hs133xptensecdf utils {} edge mu19ksubacdf utils {} edge hs133av2ptentrezg utils {} edge hgu95ccdf utils {} edge mm430bmmentrezgcdf utils {} edge hsfocusptentrezgcdf utils {} edge ath1attair utils {} edge ggchickenggenst utils {} edge wheatcdf utils {} edge celegansprobe matchprobes {} edge hgu95cprobe matchprobes {} edge vitisviniferaprobe matchprobes {} edge hgu95av2probe matchprobes {} edge drosgenome1probe matchprobes {} edge hs133av2hsensgcdf utils {} edge rn230brnentrezgprobe matchprobes {} edge mm430bmmentrezgprobe matchprobes {} edge hs133bptentrezgprobe matchprobes {} edge rn230brnentrezgcdf utils {} edge hs133xhsensecdf utils {} edge hs133av2hsentrezg utils {} edge osriceosrefseqcdf utils {} edge hgfocuscdf utils {} edge test2cdf utils {} edge hs133aptensgprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmugcdf utils {} edge rn34arnenstprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnenst utils {} edge dmdrosophila2dmense utils {} edge mm74av1mmense utils {} edge rn230arnug utils {} edge rn230rnenst utils {} edge mm11ksubbmmensgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrentrezgprobe matchprobes {} edge rn34arnentrezgcdf utils {} edge hs95av2ptensgcdf utils {} edge hsex10stv2ptentrezgprobe matchprobes {} edge hs133av2hsug utils {} edge mm74bv2mmrefseqcdf utils {} edge hs95av2ptentrezg utils {} edge dmgenome1dmug utils {} edge mgu74cv2cdf utils {} edge rn34arnugcdf utils {} edge dmdrosophila2dmensg utils {} edge mm74av1mmensg utils {} edge mm74av1mmenseprobe matchprobes {} edge hs133bhsugcdf utils {} edge mm430bmmenst utils {} edge hs133av2hsenstprobe matchprobes {} edge hs133phsensgprobe matchprobes {} edge hs95av2hsensgcdf utils {} edge mu11ksubacdf utils {} edge hs133xhsenseprobe matchprobes {} edge ggchickenggrefseqprobe matchprobes {} edge porcinecdf utils {} edge u133x3pprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2hsentrezg utils {} edge hu6800probe matchprobes {} edge hs133pptenstprobe matchprobes {} edge mm74bv2mmrefseqprobe matchprobes {} edge ath1attigrcdf utils {} edge mm74bv2mmenst utils {} edge vitisviniferacdf utils {} edge hsex10stv2ptensgcdf utils {} edge LogitBoost NONE {} edge XML methods {} edge RMySQL methods {} edge RMySQL DBI {} edge SSOAP methods {} edge SSOAP XML {} edge SSOAP RCurl {} edge RCurl methods {} }}

Retrieved from "http://followthescore.org/dpldemo/index.php?title=Test_graph_-_BioConductor_package_dependancies&oldid=7227"