Difference between revisions of "Test graph - BioConductor package dependancies"

From FollowTheScore
Jump to: navigation, search
 
(15 intermediate revisions by 2 users not shown)
Line 1: Line 1:
gpls NONE
+
This graph shows the package dependencies for the BioConductor software for the statistical analysis of microarrary data in R. The dependency list was generated from the BioConductor-1.9 software repository HTML pages.
sigPathway R
+
 
TypeInfo methods
+
Unfortunately it is too large to be used on this webserver (due to memory limitations). A slightly shorter list (75%) would work. See also [[Test graph 2]] ...
Biostrings R
+
 
Biostrings methods
+
{{#wgraph: png | thumb=40 |
Mfuzz R
+
nodetype * { font helvR08 }
Mfuzz Biobase
+
layoutalgorithm=forcedir
Mfuzz e1071
+
edge gpls NONE {}
LMGene R
+
edge sigPathway R {}
LMGene Biobase
+
edge TypeInfo methods {}
LMGene multtest
+
edge Biostrings R {}
LMGene survival
+
edge Biostrings methods {}
ecolitk R
+
edge Mfuzz R {}
ecolitk affy
+
edge Mfuzz Biobase {}
ecolitk ecoliLeucine
+
edge Mfuzz e1071 {}
ecolitk ecolicdf
+
edge LMGene R {}
ecolitk Biobase
+
edge LMGene Biobase {}
maCorrPlot NONE
+
edge LMGene multtest {}
OLINgui R
+
edge LMGene survival {}
OLINgui OLIN
+
edge ecolitk R {}
xcms R
+
edge ecolitk affy {}
xcms methods
+
edge ecolitk ecoliLeucine {}
rflowcyt R
+
edge ecolitk ecolicdf {}
rflowcyt survival
+
edge ecolitk Biobase {}
rflowcyt xtable
+
edge maCorrPlot NONE {}
rflowcyt stats
+
edge OLINgui R {}
rflowcyt KernSmooth
+
edge OLINgui OLIN {}
rflowcyt MASS
+
edge xcms R {}
rflowcyt grid
+
edge xcms methods {}
rflowcyt methods
+
edge rflowcyt R {}
rflowcyt hexbin
+
edge rflowcyt survival {}
rflowcyt rfcdmin
+
edge rflowcyt xtable {}
rflowcyt fields
+
edge rflowcyt stats {}
rflowcyt lattice
+
edge rflowcyt KernSmooth {}
rflowcyt locfit
+
edge rflowcyt MASS {}
daMA MASS
+
edge rflowcyt grid {}
made4 ade4
+
edge rflowcyt methods {}
made4 scatterplot3d
+
edge rflowcyt hexbin {}
biomaRt methods
+
edge rflowcyt rfcdmin {}
biomaRt XML
+
edge rflowcyt fields {}
biomaRt RCurl
+
edge rflowcyt lattice {}
gaggle R
+
edge rflowcyt locfit {}
gaggle rJava
+
edge daMA MASS {}
gaggle graph
+
edge made4 ade4 {}
affylmGUI limma
+
edge made4 scatterplot3d {}
affylmGUI tcltk
+
edge biomaRt methods {}
affylmGUI affy
+
edge biomaRt XML {}
affylmGUI Biobase
+
edge biomaRt RCurl {}
SAGElyzer R
+
edge gaggle rJava {}
SAGElyzer AnnBuilder
+
edge gaggle graph {}
SAGElyzer tkWidgets
+
edge affylmGUI limma {}
SAGElyzer genefilter
+
edge affylmGUI tcltk {}
SAGElyzer annotate
+
edge affylmGUI affy {}
GeneR NONE
+
edge affylmGUI Biobase {}
GeneSpring R
+
edge SAGElyzer AnnBuilder {}
GeneSpring Biobase
+
edge SAGElyzer tkWidgets {}
GeneSpring methods
+
edge SAGElyzer genefilter {}
geneplotter R
+
edge SAGElyzer annotate {}
geneplotter annotate
+
edge GeneR NONE {}
geneplotter Biobase
+
edge GeneSpring Biobase {}
geneplotter methods
+
edge GeneSpring methods {}
Rdbi R
+
edge geneplotter annotate {}
BioMVCClass R
+
edge geneplotter Biobase {}
BioMVCClass methods
+
edge geneplotter methods {}
BioMVCClass MVCClass
+
edge BioMVCClass methods {}
BioMVCClass Biobase
+
edge BioMVCClass MVCClass {}
BioMVCClass graph
+
edge BioMVCClass Biobase {}
BioMVCClass Rgraphviz
+
edge BioMVCClass graph {}
sizepower stats
+
edge BioMVCClass Rgraphviz {}
PROcess Icens
+
edge sizepower stats {}
snapCGH limma
+
edge PROcess Icens {}
snapCGH tilingArray
+
edge snapCGH limma {}
snapCGH DNAcopy
+
edge snapCGH tilingArray {}
snapCGH aCGH
+
edge snapCGH DNAcopy {}
snapCGH GLAD
+
edge snapCGH aCGH {}
snapCGH cluster
+
edge snapCGH GLAD {}
snapCGH methods
+
edge snapCGH cluster {}
bioDist R
+
edge snapCGH methods {}
bioDist methods
+
edge bioDist methods {}
bioDist Biobase
+
edge bioDist Biobase {}
marray R
+
edge marray limma {}
marray limma
+
edge marray methods {}
marray methods
+
edge tkWidgets methods {}
tkWidgets R
+
edge tkWidgets widgetTools {}
tkWidgets methods
+
edge tkWidgets DynDoc {}
tkWidgets widgetTools
+
edge rama NONE {}
tkWidgets DynDoc
+
edge Ruuid methods {}
rama NONE
+
edge arrayQuality marray {}
Ruuid R
+
edge arrayQuality limma {}
Ruuid methods
+
edge arrayQuality convert {}
arrayQuality R
+
edge arrayQuality hexbin {}
arrayQuality marray
+
edge arrayQuality gridBase {}
arrayQuality limma
+
edge arrayQuality RColorBrewer {}
arrayQuality convert
+
edge GraphAT MCMCpack {}
arrayQuality hexbin
+
edge GraphAT graph {}
arrayQuality gridBase
+
edge beadarray limma {}
arrayQuality RColorBrewer
+
edge beadarray Biobase {}
GraphAT MCMCpack
+
edge beadarray affy {}
GraphAT graph
+
edge beadarray methods {}
beadarray limma
+
edge ppiStats apComplex {}
beadarray Biobase
+
edge ppiStats GO {}
beadarray affy
+
edge ppiStats GOstats {}
beadarray methods
+
edge ppiStats YEAST {}
ppiStats apComplex
+
edge ppiStats graph {}
ppiStats GO
+
edge ppiStats Rgraphviz {}
ppiStats GOstats
+
edge ppiStats Category {}
ppiStats YEAST
+
edge pcaMethods MASS {}
ppiStats graph
+
edge pcaMethods ellipse {}
ppiStats Rgraphviz
+
edge pcaMethods pls {}
ppiStats Category
+
edge pcaMethods methods {}
pcaMethods R
+
edge GlobalAncova methods {}
pcaMethods MASS
+
edge webbioc Biobase {}
pcaMethods ellipse
+
edge webbioc affy {}
pcaMethods pls
+
edge webbioc multtest {}
pcaMethods methods
+
edge webbioc annaffy {}
RankProd R
+
edge webbioc vsn {}
GlobalAncova methods
+
edge webbioc gcrma {}
webbioc R
+
edge webbioc qvalue {}
webbioc Biobase
+
edge cghMCR methods {}
webbioc affy
+
edge cghMCR DNAcopy {}
webbioc multtest
+
edge cghMCR marray {}
webbioc annaffy
+
edge cghMCR arrayQuality {}
webbioc vsn
+
edge widgetInvoke methods {}
webbioc gcrma
+
edge widgetInvoke XML {}
webbioc qvalue
+
edge widgetInvoke RGtk {}
cghMCR methods
+
edge hexbin methods {}
cghMCR DNAcopy
+
edge hexbin grid {}
cghMCR marray
+
edge hexbin lattice {}
cghMCR arrayQuality
+
edge hexbin colorspace {}
widgetInvoke methods
+
edge matchprobes Biobase {}
widgetInvoke XML
+
edge matchprobes affy {}
widgetInvoke RGtk
+
edge siggenes methods {}
hexbin R
+
edge siggenes multtest {}
hexbin methods
+
edge siggenes Biobase {}
hexbin grid
+
edge AnnBuilder methods {}
hexbin lattice
+
edge AnnBuilder Biobase {}
hexbin colorspace
+
edge AnnBuilder XML {}
matchprobes R
+
edge AnnBuilder annotate {}
matchprobes Biobase
+
edge AnnBuilder utils {}
matchprobes affy
+
edge AnnBuilder RSQLite {}
siggenes methods
+
edge pamr NONE {}
siggenes multtest
+
edge RBGL graph {}
siggenes Biobase
+
edge RBGL methods {}
AnnBuilder R
+
edge biocViews methods {}
AnnBuilder methods
+
edge biocViews tools {}
AnnBuilder Biobase
+
edge biocViews graph {}
AnnBuilder XML
+
edge biocViews RBGL {}
AnnBuilder annotate
+
edge biocViews XML {}
AnnBuilder utils
+
edge CoCiteStats humanLLMappings {}
AnnBuilder RSQLite
+
edge ChromoViz RSvgDevice {}
pamr NONE
+
edge ChromoViz XML {}
RBGL graph
+
edge GOstats graph {}
RBGL methods
+
edge GOstats GO {}
biocViews R
+
edge GOstats annotate {}
biocViews methods
+
edge GOstats RBGL {}
biocViews tools
+
edge GOstats Biobase {}
biocViews graph
+
edge GOstats Category {}
biocViews RBGL
+
edge GOstats methods {}
biocViews XML
+
edge prada Biobase {}
CoCiteStats R
+
edge prada RColorBrewer {}
CoCiteStats humanLLMappings
+
edge prada grid {}
ChromoViz RSvgDevice
+
edge prada methods {}
ChromoViz XML
+
edge prada geneplotter {}
GOstats graph
+
edge bridge rama {}
GOstats GO
+
edge ontoTools methods {}
GOstats annotate
+
edge ontoTools graph {}
GOstats RBGL
+
edge ontoTools SparseM {}
GOstats Biobase
+
edge ontoTools GO {}
GOstats Category
+
edge ontoTools Biobase {}
GOstats methods
+
edge ontoTools annotate {}
prada R
+
edge MCRestimate e1071 {}
prada Biobase
+
edge MCRestimate pamr {}
prada RColorBrewer
+
edge MCRestimate randomForest {}
prada grid
+
edge MCRestimate RColorBrewer {}
prada methods
+
edge MCRestimate Biobase {}
prada geneplotter
+
edge MCRestimate golubEsets {}
bridge R
+
edge aroma.light R.oo {}
bridge rama
+
edge pkgDepTools methods {}
affxparser R
+
edge pkgDepTools graph {}
ontoTools R
+
edge pkgDepTools RBGL {}
ontoTools methods
+
edge MeasurementError.cor NONE {}
ontoTools graph
+
edge logicFS LogicReg {}
ontoTools SparseM
+
edge copa Biobase {}
ontoTools GO
+
edge copa methods {}
ontoTools Biobase
+
edge Category Biobase {}
ontoTools annotate
+
edge Category KEGG {}
MCRestimate R
+
edge Category GO {}
MCRestimate e1071
+
edge Category graph {}
MCRestimate pamr
+
edge Category annotate {}
MCRestimate randomForest
+
edge Category methods {}
MCRestimate RColorBrewer
+
edge Category genefilter {}
MCRestimate Biobase
+
edge Harshlight affy {}
MCRestimate golubEsets
+
edge OrderedList Biobase {}
aroma.light R.oo
+
edge OrderedList twilight {}
pkgDepTools methods
+
edge MVCClass methods {}
pkgDepTools graph
+
edge panp affy {}
pkgDepTools RBGL
+
edge LPE NONE {}
MeasurementError.cor NONE
+
edge MANOR GLAD {}
lapmix R
+
edge RbcBook1 Biobase {}
logicFS LogicReg
+
edge vsn Biobase {}
impute R
+
edge iSPlot methods {}
copa Biobase
+
edge iSPlot RGtk {}
copa methods
+
edge iSPlot gtkDevice {}
Category Biobase
+
edge iSPlot MVCClass {}
Category KEGG
+
edge pickgene MASS {}
Category GO
+
edge makecdfenv methods {}
Category graph
+
edge makecdfenv Biobase {}
Category annotate
+
edge makecdfenv affy {}
Category methods
+
edge makecdfenv utils {}
Category genefilter
+
edge makecdfenv affyio {}
Harshlight R
+
edge aCGH cluster {}
Harshlight affy
+
edge aCGH survival {}
OrderedList R
+
edge aCGH multtest {}
OrderedList Biobase
+
edge aCGH sma {}
OrderedList twilight
+
edge KEGGSOAP methods {}
MVCClass R
+
edge KEGGSOAP XML {}
MVCClass methods
+
edge KEGGSOAP SSOAP {}
panp affy
+
edge KEGGSOAP RCurl {}
LPE NONE
+
edge annotate methods {}
MANOR R
+
edge annotate Biobase {}
MANOR GLAD
+
edge limma methods {}
RbcBook1 Biobase
+
edge timecourse limma {}
vsn R
+
edge timecourse MASS {}
vsn Biobase
+
edge timecourse Biobase {}
iSPlot R
+
edge timecourse methods {}
iSPlot methods
+
edge nem e1071 {}
iSPlot RGtk
+
edge nem graph {}
iSPlot gtkDevice
+
edge nem Rgraphviz {}
iSPlot MVCClass
+
edge nem RBGL {}
pickgene MASS
+
edge HEM Biobase {}
makecdfenv R
+
edge SBMLR XML {}
makecdfenv methods
+
edge SBMLR odesolve {}
makecdfenv Biobase
+
edge MLInterfaces Biobase {}
makecdfenv affy
+
edge MLInterfaces methods {}
makecdfenv utils
+
edge MLInterfaces genefilter {}
makecdfenv affyio
+
edge weaver digest {}
aCGH R
+
edge weaver tools {}
aCGH cluster
+
edge weaver utils {}
aCGH survival
+
edge weaver codetools {}
aCGH multtest
+
edge goTools Biobase {}
aCGH sma
+
edge goTools annotate {}
KEGGSOAP methods
+
edge goTools GO {}
KEGGSOAP XML
+
edge applera Biobase {}
KEGGSOAP SSOAP
+
edge applera methods {}
KEGGSOAP RCurl
+
edge applera affy {}
annotate R
+
edge applera genefilter {}
annotate methods
+
edge applera limma {}
annotate Biobase
+
edge applera geneplotter {}
limma R
+
edge applera RColorBrewer {}
limma methods
+
edge applera prada {}
timecourse R
+
edge applera combinat {}
timecourse limma
+
edge annaffy methods {}
timecourse MASS
+
edge annaffy Biobase {}
timecourse Biobase
+
edge annaffy GO {}
timecourse methods
+
edge annaffy KEGG {}
qvalue R
+
edge spotSegmentation mclust {}
nem R
+
edge geneRecommender Biobase {}
nem e1071
+
edge codelink methods {}
nem graph
+
edge codelink limma {}
nem Rgraphviz
+
edge codelink annotate {}
nem RBGL
+
edge widgetTools methods {}
HEM R
+
edge widgetTools utils {}
HEM Biobase
+
edge splots grid {}
SBMLR XML
+
edge RSNPper methods {}
SBMLR odesolve
+
edge RSNPper utils {}
MLInterfaces R
+
edge RSNPper tools {}
MLInterfaces Biobase
+
edge RSNPper XML {}
MLInterfaces methods
+
edge GeneMeta methods {}
MLInterfaces genefilter
+
edge GeneMeta Biobase {}
weaver R
+
edge GeneMeta genefilter {}
weaver digest
+
edge GEOquery methods {}
weaver tools
+
edge globaltest methods {}
weaver utils
+
edge globaltest graphics {}
weaver codetools
+
edge globaltest multtest {}
goTools Biobase
+
edge pathRender graph {}
goTools annotate
+
edge pathRender Rgraphviz {}
goTools GO
+
edge pathRender cMAP {}
applera R
+
edge convert Biobase {}
applera Biobase
+
edge convert limma {}
applera methods
+
edge convert marray {}
applera affy
+
edge convert utils {}
applera genefilter
+
edge convert methods {}
applera limma
+
edge stam GO {}
applera geneplotter
+
edge stam Biobase {}
applera RColorBrewer
+
edge stam pamr {}
applera prada
+
edge stam cluster {}
applera combinat
+
edge stam annaffy {}
annaffy R
+
edge stam methods {}
annaffy methods
+
edge BSgenome methods {}
annaffy Biobase
+
edge BSgenome Biostrings {}
annaffy GO
+
edge pdmclass Biobase {}
annaffy KEGG
+
edge pdmclass fibroEset {}
spotSegmentation R
+
edge pdmclass mda {}
spotSegmentation mclust
+
edge cellHTS prada {}
geneRecommender R
+
edge cellHTS RColorBrewer {}
geneRecommender Biobase
+
edge cellHTS Biobase {}
codelink R
+
edge cellHTS genefilter {}
codelink methods
+
edge metaArray MergeMaid {}
codelink limma
+
edge EBImage methods {}
codelink annotate
+
edge arrayQCplot RGtk2 {}
widgetTools R
+
edge arrayQCplot cairoDevice {}
widgetTools methods
+
edge arrayQCplot LPE {}
widgetTools utils
+
edge hopach cluster {}
splots R
+
edge hopach Biobase {}
splots grid
+
edge DNAcopy NONE {}
RSNPper methods
+
edge ssize gdata {}
RSNPper utils
+
edge ssize xtable {}
RSNPper tools
+
edge apComplex graph {}
RSNPper XML
+
edge tilingArray methods {}
GeneMeta R
+
edge tilingArray Biobase {}
GeneMeta methods
+
edge tilingArray affy {}
GeneMeta Biobase
+
edge tilingArray RColorBrewer {}
GeneMeta genefilter
+
edge tilingArray grid {}
GEOquery methods
+
edge tilingArray strucchange {}
globaltest R
+
edge tilingArray vsn {}
globaltest methods
+
edge tilingArray genefilter {}
globaltest graphics
+
edge tilingArray geneplotter {}
globaltest multtest
+
edge tilingArray pixmap {}
pathRender graph
+
edge RMAPPER methods {}
pathRender Rgraphviz
+
edge splicegear methods {}
pathRender cMAP
+
edge splicegear utils {}
convert R
+
edge splicegear grid {}
convert Biobase
+
edge splicegear Biobase {}
convert limma
+
edge splicegear XML {}
convert marray
+
edge splicegear annotate {}
convert utils
+
edge gff3Plotter methods {}
convert methods
+
edge mmgmos methods {}
MantelCorr R
+
edge mmgmos Biobase {}
stam R
+
edge mmgmos affy {}
stam GO
+
edge plgem Biobase {}
stam Biobase
+
edge plgem MASS {}
stam pamr
+
edge DEDS methods {}
stam cluster
+
edge pgUtils Rdbi {}
stam annaffy
+
edge pgUtils RdbiPgSQL {}
stam methods
+
edge pgUtils methods {}
BSgenome R
+
edge hypergraph methods {}
BSgenome methods
+
edge hypergraph graph {}
BSgenome Biostrings
+
edge arrayMagic methods {}
pdmclass Biobase
+
edge arrayMagic utils {}
pdmclass R
+
edge arrayMagic Biobase {}
pdmclass fibroEset
+
edge arrayMagic vsn {}
pdmclass mda
+
edge arrayMagic limma {}
cellHTS R
+
edge arrayMagic genefilter {}
cellHTS prada
+
edge nudge stats {}
cellHTS RColorBrewer
+
edge sscore affy {}
cellHTS Biobase
+
edge sscore affxparser {}
cellHTS genefilter
+
edge simulatorAPMS graph {}
metaArray MergeMaid
+
edge simulatorAPMS apComplex {}
EBImage R
+
edge simulatorAPMS Rgraphviz {}
EBImage methods
+
edge simulatorAPMS ScISI {}
arrayQCplot RGtk2
+
edge simulatorAPMS ppiStats {}
arrayQCplot cairoDevice
+
edge affy Biobase {}
arrayQCplot LPE
+
edge affy methods {}
hopach R
+
edge affy utils {}
hopach cluster
+
edge affy affyio {}
hopach Biobase
+
edge OCplus akima {}
DNAcopy NONE
+
edge OCplus multtest {}
ssize gdata
+
edge diffGeneAnalysis minpack.lm {}
ssize xtable
+
edge macat Biobase {}
apComplex graph
+
edge macat annotate {}
tilingArray R
+
edge idiogram methods {}
tilingArray methods
+
edge idiogram Biobase {}
tilingArray Biobase
+
edge idiogram annotate {}
tilingArray affy
+
edge pcot2 grDevices {}
tilingArray RColorBrewer
+
edge pcot2 Biobase {}
tilingArray grid
+
edge pcot2 amap {}
tilingArray strucchange
+
edge iSNetwork methods {}
tilingArray vsn
+
edge iSNetwork graph {}
tilingArray genefilter
+
edge iSNetwork Rgraphviz {}
tilingArray geneplotter
+
edge iSNetwork RGtk {}
tilingArray pixmap
+
edge iSNetwork gtkDevice {}
RMAPPER methods
+
edge iSNetwork BioMVCClass {}
splicegear R
+
edge iSNetwork MVCClass {}
splicegear methods
+
edge iSNetwork Biobase {}
splicegear utils
+
edge iSNetwork annotate {}
splicegear grid
+
edge affyPLM affy {}
splicegear Biobase
+
edge affyPLM affydata {}
splicegear XML
+
edge affyPLM Biobase {}
splicegear annotate
+
edge affyPLM methods {}
gff3Plotter R
+
edge affyPLM gcrma {}
gff3Plotter methods
+
edge spikeLI utils {}
mmgmos R
+
edge genefilter methods {}
mmgmos methods
+
edge genefilter Biobase {}
mmgmos Biobase
+
edge genefilter survival {}
mmgmos affy
+
edge altcdfenvs methods {}
plgem R
+
edge altcdfenvs Biobase {}
plgem Biobase
+
edge altcdfenvs affy {}
plgem MASS
+
edge altcdfenvs matchprobes {}
DEDS R
+
edge altcdfenvs makecdfenv {}
DEDS methods
+
edge OLIN methods {}
pgUtils R
+
edge OLIN stats {}
pgUtils Rdbi
+
edge OLIN locfit {}
pgUtils RdbiPgSQL
+
edge OLIN Biobase {}
pgUtils methods
+
edge OLIN marray {}
hypergraph R
+
edge beadarraySNP methods {}
hypergraph methods
+
edge beadarraySNP Biobase {}
hypergraph graph
+
edge beadarraySNP limma {}
arrayMagic R
+
edge beadarraySNP quantsmooth {}
arrayMagic methods
+
edge Heatplus NONE {}
arrayMagic utils
+
edge GeneTS GeneCycle {}
arrayMagic Biobase
+
edge GeneTS GeneNet {}
arrayMagic vsn
+
edge safe methods {}
arrayMagic limma
+
edge safe Biobase {}
arrayMagic genefilter
+
edge Rgraphviz methods {}
nudge stats
+
edge Rgraphviz graph {}
sscore R
+
edge Rgraphviz geneplotter {}
sscore affy
+
edge RdbiPgSQL Rdbi {}
sscore affxparser
+
edge twilight splines {}
simulatorAPMS graph
+
edge twilight stats {}
simulatorAPMS apComplex
+
edge GeneTraffic Biobase {}
simulatorAPMS Rgraphviz
+
edge GeneTraffic affy {}
simulatorAPMS ScISI
+
edge GeneTraffic marray {}
simulatorAPMS ppiStats
+
edge GeneTraffic SSOAP {}
affy R
+
edge GeneTraffic XML {}
affy Biobase
+
edge GeneTraffic digest {}
affy methods
+
edge GeneTraffic methods {}
affy utils
+
edge simpleaffy affy {}
affy affyio
+
edge simpleaffy genefilter {}
OCplus R
+
edge maSigPro Biobase {}
OCplus akima
+
edge Icens survival {}
OCplus multtest
+
edge Rredland methods {}
diffGeneAnalysis minpack.lm
+
edge Rredland graph {}
macat Biobase
+
edge graph methods {}
macat annotate
+
edge nnNorm nnet {}
idiogram R
+
edge nnNorm marray {}
idiogram methods
+
edge genArise locfit {}
idiogram Biobase
+
edge genArise tkrplot {}
idiogram annotate
+
edge genArise xtable {}
pcot2 R
+
edge genArise methods {}
pcot2 grDevices
+
edge EBarrays Biobase {}
pcot2 Biobase
+
edge EBarrays methods {}
pcot2 amap
+
edge EBarrays utils {}
iSNetwork R
+
edge EBarrays lattice {}
iSNetwork methods
+
edge reb Biobase {}
iSNetwork graph
+
edge reb idiogram {}
iSNetwork Rgraphviz
+
edge SAGx stats {}
iSNetwork RGtk
+
edge SAGx multtest {}
iSNetwork gtkDevice
+
edge SAGx sma {}
iSNetwork BioMVCClass
+
edge SAGx methods {}
iSNetwork MVCClass
+
edge RMAGEML marray {}
iSNetwork Biobase
+
edge RMAGEML limma {}
iSNetwork annotate
+
edge RMAGEML Biobase {}
affyPLM R
+
edge affyio methods {}
affyPLM affy
+
edge edd methods {}
affyPLM affydata
+
edge edd golubEsets {}
affyPLM Biobase
+
edge edd Biobase {}
affyPLM methods
+
edge edd class {}
affyPLM gcrma
+
edge edd nnet {}
spikeLI utils
+
edge edd xtable {}
genefilter R
+
edge maDB Biobase {}
genefilter methods
+
edge maDB affy {}
genefilter Biobase
+
edge maDB limma {}
genefilter survival
+
edge maDB methods {}
altcdfenvs R
+
edge DynDoc methods {}
altcdfenvs methods
+
edge DynDoc tools {}
altcdfenvs Biobase
+
edge BeadExplorer methods {}
altcdfenvs affy
+
edge BeadExplorer widgetTools {}
altcdfenvs matchprobes
+
edge BeadExplorer affy {}
altcdfenvs makecdfenv
+
edge BeadExplorer R2HTML {}
OLIN R
+
edge BeadExplorer grDevices {}
OLIN methods
+
edge BeadExplorer tkWidgets {}
OLIN stats
+
edge affycoretools affy {}
OLIN locfit
+
edge affycoretools limma {}
OLIN Biobase
+
edge affycoretools GOstats {}
OLIN marray
+
edge affycoretools biomaRt {}
beadarraySNP methods
+
edge limmaGUI limma {}
beadarraySNP Biobase
+
edge limmaGUI tcltk {}
beadarraySNP limma
+
edge ABarray Biobase {}
beadarraySNP quantsmooth
+
edge ABarray multtest {}
Heatplus NONE
+
edge GGtools methods {}
GeneTS R
+
edge GGtools Biobase {}
GeneTS GeneCycle
+
edge GGtools hgfocus {}
GeneTS GeneNet
+
edge GGtools geneplotter {}
safe R
+
edge Biobase tools {}
safe methods
+
edge Biobase methods {}
safe Biobase
+
edge Biobase utils {}
Rgraphviz R
+
edge factDesign Biobase {}
Rgraphviz methods
+
edge factDesign affy {}
Rgraphviz graph
+
edge factDesign stats {}
Rgraphviz geneplotter
+
edge sagenhaft SparseM {}
RdbiPgSQL R
+
edge ROC utils {}
RdbiPgSQL Rdbi
+
edge ROC methods {}
twilight R
+
edge bim stats {}
twilight splines
+
edge bim qtl {}
twilight stats
+
edge gcrma Biobase {}
GeneTraffic R
+
edge gcrma affy {}
GeneTraffic Biobase
+
edge gcrma matchprobes {}
GeneTraffic affy
+
edge gcrma splines {}
GeneTraffic marray
+
edge adSplit methods {}
GeneTraffic SSOAP
+
edge adSplit stats {}
GeneTraffic XML
+
edge adSplit cluster {}
GeneTraffic digest
+
edge adSplit multtest {}
GeneTraffic methods
+
edge adSplit Biobase {}
simpleaffy R
+
edge adSplit affy {}
simpleaffy affy
+
edge adSplit GO {}
simpleaffy genefilter
+
edge adSplit KEGG {}
maSigPro R
+
edge Resourcerer AnnBuilder {}
maSigPro Biobase
+
edge MergeMaid survival {}
Icens survival
+
edge MergeMaid Biobase {}
Rredland methods
+
edge MergeMaid MASS {}
Rredland graph
+
edge MergeMaid methods {}
graph R
+
edge plier affy {}
graph methods
+
edge quantsmooth quantreg {}
nnNorm R
+
edge quantsmooth lodplot {}
nnNorm nnet
+
edge affycomp Biobase {}
nnNorm marray
+
edge stepNorm marray {}
genArise R
+
edge stepNorm MASS {}
genArise locfit
+
edge stepNorm methods {}
genArise tkrplot
+
edge clusterStab Biobase {}
genArise xtable
+
edge clusterStab methods {}
genArise methods
+
edge affyQCReport Biobase {}
EBarrays R
+
edge affyQCReport affy {}
EBarrays Biobase
+
edge affyQCReport simpleaffy {}
EBarrays methods
+
edge affypdnn affy {}
EBarrays utils
+
edge affypdnn affydata {}
EBarrays lattice
+
edge affypdnn hgu95av2probe {}
reb R
+
edge affydata affy {}
reb Biobase
+
edge pairseqsim methods {}
reb idiogram
+
edge pairseqsim stats {}
SAGx R
+
edge fdrame NONE {}
SAGx stats
+
edge ScISI methods {}
SAGx multtest
+
edge ScISI apComplex {}
SAGx sma
+
edge ScISI GO {}
SAGx methods
+
edge ScISI GOstats {}
maanova R
+
edge ScISI graph {}
RMAGEML marray
+
edge ScISI RBGL {}
RMAGEML limma
+
edge ScISI Rgraphviz {}
RMAGEML Biobase
+
edge ScISI YEAST {}
affyio methods
+
edge ScISI xtable {}
edd methods
+
edge multtest methods {}
edd golubEsets
+
edge multtest Biobase {}
edd Biobase
+
edge multtest survival {}
edd class
+
edge ctc NONE {}
edd nnet
+
edge yeastExpData graph {}
edd xtable
+
edge golubEsets Biobase {}
maDB R
+
edge estrogen affy {}
maDB Biobase
+
edge MAQCsubset Biobase {}
maDB affy
+
edge fibroEset Biobase {}
maDB limma
+
edge HEEBOdata NONE {}
maDB methods
+
edge facsDorit prada {}
DynDoc methods
+
edge Iyer517 Biobase {}
DynDoc tools
+
edge stjudem utils {}
BeadExplorer R
+
edge ProData Biobase {}
BeadExplorer methods
+
edge SpikeIn affy {}
BeadExplorer widgetTools
+
edge ALL Biobase {}
BeadExplorer affy
+
edge AmpAffyExample affy {}
BeadExplorer R2HTML
+
edge kidpack Biobase {}
BeadExplorer grDevices
+
edge CLL affy {}
BeadExplorer tkWidgets
+
edge CLL Biobase {}
affycoretools affy
+
edge SpikeInSubset Biobase {}
affycoretools limma
+
edge SpikeInSubset affy {}
affycoretools GOstats
+
edge gaschYHS Biobase {}
affycoretools biomaRt
+
edge ALLMLL affy {}
limmaGUI limma
+
edge bronchialIL13 affy {}
limmaGUI tcltk
+
edge beta7 marray {}
ABarray Biobase
+
edge lungExpression Biobase {}
ABarray multtest
+
edge HIVcDNAvantWout03 NONE {}
GGtools R
+
edge yeastCC Biobase {}
GGtools methods
+
edge harbChIP Biobase {}
GGtools Biobase
+
edge ppiData Rgraphviz {}
GGtools hgfocus
+
edge ppiData graph {}
GGtools geneplotter
+
edge colonCA Biobase {}
Biobase R
+
edge SNAData graph {}
Biobase tools
+
edge ecoliLeucine affy {}
Biobase methods
+
edge davidTiling Biobase {}
Biobase utils
+
edge davidTiling tilingArray {}
factDesign Biobase
+
edge davidTiling GO {}
factDesign affy
+
edge MEEBOdata NONE {}
factDesign stats
+
edge GGdata Biobase {}
sagenhaft R
+
edge GGdata hgfocus {}
sagenhaft SparseM
+
edge rn230rnentrezgprobe matchprobes {}
ROC R
+
edge rn230brnrefseqprobe matchprobes {}
ROC utils
+
edge dmgenome1dmense utils {}
ROC methods
+
edge medicagoprobe matchprobes {}
bim stats
+
edge dmgenome1dmugcdf utils {}
bim qtl
+
edge hsex10stv2ptentrezg utils {}
gcrma R
+
edge caninecdf utils {}
gcrma Biobase
+
edge mm430ammensgcdf utils {}
gcrma affy
+
edge mm430ammrefseqcdf utils {}
gcrma matchprobes
+
edge hsfocushsenstprobe matchprobes {}
gcrma splines
+
edge hs133bhsentrezgprobe matchprobes {}
adSplit R
+
edge drzebrafishdrugcdf utils {}
adSplit methods
+
edge mm430ammentrezg utils {}
adSplit stats
+
edge hgu133bprobe matchprobes {}
adSplit cluster
+
edge mmex10stv1mmentrezgprobe matchprobes {}
adSplit multtest
+
edge rn34arnenseprobe matchprobes {}
adSplit Biobase
+
edge soybeancdf utils {}
adSplit affy
+
edge hs133xptensgprobe matchprobes {}
adSplit GO
+
edge rtu34probe matchprobes {}
adSplit KEGG
+
edge hsex10stv2hsensgcdf utils {}
Resourcerer R
+
edge rnex10stv1rnensecdf utils {}
Resourcerer AnnBuilder
+
edge mm11ksubbmmentrezgcdf utils {}
GLAD R
+
edge mu6500subdcdf utils {}
MergeMaid R
+
edge mm74av2mmensgcdf utils {}
MergeMaid survival
+
edge mm74bv2mmentrezgcdf utils {}
MergeMaid Biobase
+
edge rn230rnenstprobe matchprobes {}
MergeMaid MASS
+
edge hs95av2hsrefseq utils {}
MergeMaid methods
+
edge hsex10stv2hsentrezg utils {}
plier R
+
edge mm430bmmenstprobe matchprobes {}
plier affy
+
edge hsex10stv2hsense utils {}
quantsmooth quantreg
+
edge mm74av2mmentrezg utils {}
quantsmooth lodplot
+
edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 methods {}
affycomp R
+
edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 Biostrings {}
affycomp Biobase
+
edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 BSgenome {}
stepNorm R
+
edge dmgenome1dmensg utils {}
stepNorm marray
+
edge mm430bmmensecdf utils {}
stepNorm MASS
+
edge mm430mmensgcdf utils {}
stepNorm methods
+
edge hu35ksubaprobe matchprobes {}
clusterStab Biobase
+
edge rn230brnensgprobe matchprobes {}
clusterStab R
+
edge hsex10stv2ptense utils {}
clusterStab methods
+
edge osriceostigrprobe matchprobes {}
affyQCReport R
+
edge hsex10stv2hsentrezgprobe matchprobes {}
affyQCReport Biobase
+
edge cfcanine2cfenstprobe matchprobes {}
affyQCReport affy
+
edge mm430mmentrezg utils {}
affyQCReport simpleaffy
+
edge mm74av1mmrefseqprobe matchprobes {}
affypdnn R
+
edge rnex10stv1rnrefseq utils {}
affypdnn affy
+
edge atgenomeattaircdf utils {}
affypdnn affydata
+
edge hs133xptensgcdf utils {}
affypdnn hgu95av2probe
+
edge mu19ksubccdf utils {}
affydata R
+
edge hgu95ecdf utils {}
affydata affy
+
edge atgenomeatrefseqcdf utils {}
pairseqsim methods
+
edge hs133phsrefseqprobe matchprobes {}
pairseqsim stats
+
edge hsex10stv2hsensg utils {}
fdrame NONE
+
edge hs133xptentrezg utils {}
ScISI methods
+
edge saureusprobe matchprobes {}
ScISI apComplex
+
edge hs133av2hsenseprobe matchprobes {}
ScISI GO
+
edge rhesusprobe matchprobes {}
ScISI GOstats
+
edge mm74av2mmense utils {}
ScISI graph
+
edge mm11ksubammenstcdf utils {}
ScISI RBGL
+
edge mmex10stv1mmrefseq utils {}
ScISI Rgraphviz
+
edge cfcanine2cfentrezgcdf utils {}
ScISI YEAST
+
edge ggchickenggenstprobe matchprobes {}
ScISI xtable
+
edge cyp450cdf utils {}
multtest R
+
edge hsex10stv2ptensg utils {}
multtest methods
+
edge hs133pptenseprobe matchprobes {}
multtest Biobase
+
edge hs133xhsensgcdf utils {}
multtest survival
+
edge poplarcdf utils {}
ctc NONE
+
edge dmdrosophila2dmrefseqprobe matchprobes {}
yeastExpData R
+
edge hs95av2hsrefseqprobe matchprobes {}
yeastExpData graph
+
edge hs133xhsentrezg utils {}
golubEsets Biobase
+
edge mm11ksubammugcdf utils {}
estrogen R
+
edge mm74av2mmensg utils {}
estrogen affy
+
edge hsex10stv2hsenstprobe matchprobes {}
MAQCsubset Biobase
+
edge mgu74cprobe matchprobes {}
fibroEset Biobase
+
edge hsfocushsenseprobe matchprobes {}
HEEBOdata NONE
+
edge hs133bhsentrezgcdf utils {}
facsDorit R
+
edge mmex10stv1mmense utils {}
facsDorit prada
+
edge mm11ksubammenstprobe matchprobes {}
Iyer517 Biobase
+
edge hs133av2ptensgprobe matchprobes {}
stjudem R
+
edge drzebrafishdrense utils {}
stjudem utils
+
edge mm430mmrefseqcdf utils {}
ProData R
+
edge cfcanine2cfenstcdf utils {}
ProData Biobase
+
edge hs133aptenstcdf utils {}
SpikeIn R
+
edge rn230rnenseprobe matchprobes {}
SpikeIn affy
+
edge mm430bmmenseprobe matchprobes {}
ALL Biobase
+
edge mm74av1mmug utils {}
faahKO R
+
edge bovinecdf utils {}
AmpAffyExample R
+
edge drzebrafishdrensecdf utils {}
AmpAffyExample affy
+
edge dmgenome1dmensecdf utils {}
rfcdmin R
+
edge rae230bcdf utils {}
hgu2beta7 R
+
edge hu6800cdf utils {}
kidpack R
+
edge ath1attairprobe matchprobes {}
kidpack Biobase
+
edge canineprobe matchprobes {}
CLL R
+
edge mmex10stv1mmensg utils {}
CLL affy
+
edge hs133ahsrefseqcdf utils {}
CLL Biobase
+
edge cfcanine2cfenseprobe matchprobes {}
SpikeInSubset R
+
edge rnex10stv1rnugcdf utils {}
SpikeInSubset Biobase
+
edge mm74av2mmrefseq utils {}
SpikeInSubset affy
+
edge hs133ahsenstcdf utils {}
gaschYHS Biobase
+
edge mm430mmrefseq utils {}
ALLMLL R
+
edge drzebrafishdrensg utils {}
ALLMLL affy
+
edge ggchickenggenstcdf utils {}
bronchialIL13 affy
+
edge mm74cv2mmenstcdf utils {}
beta7 R
+
edge hsfocusptensgprobe matchprobes {}
beta7 marray
+
edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 methods {}
lungExpression R
+
edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 Biostrings {}
lungExpression Biobase
+
edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 BSgenome {}
HIVcDNAvantWout03 NONE
+
edge hs133bhsenstprobe matchprobes {}
yeastCC Biobase
+
edge mm11ksubammugprobe matchprobes {}
harbChIP Biobase
+
edge ggchickenggenseprobe matchprobes {}
ppiData Rgraphviz
+
edge mm430mmense utils {}
ppiData graph
+
edge mm74cv2mmenstprobe matchprobes {}
lymphoma R
+
edge dmdrosophila2dmenst utils {}
colonCA Biobase
+
edge tomatocdf utils {}
SNAData R
+
edge mm74av1mmenst utils {}
SNAData graph
+
edge mgu74bv2probe matchprobes {}
ecoliLeucine R
+
edge rn230arnenstcdf utils {}
ecoliLeucine affy
+
edge hgu133acdf utils {}
davidTiling R
+
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 methods {}
davidTiling Biobase
+
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 Biostrings {}
davidTiling tilingArray
+
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 BSgenome {}
davidTiling GO
+
edge hs95av2hsenstprobe matchprobes {}
MEEBOdata NONE
+
edge atgenomeattigrprobe matchprobes {}
GGdata R
+
edge cfcanine2cfense utils {}
GGdata Biobase
+
edge rnex10stv1rnensgcdf utils {}
GGdata hgfocus
+
edge mm74cv2mmentrezgcdf utils {}
rn230rnentrezgprobe R
+
edge hs133ahsense utils {}
rn230rnentrezgprobe matchprobes
+
edge dmdrosophila2dmenstprobe matchprobes {}
rn230brnrefseqprobe R
+
edge hsex10stv2hsenseprobe matchprobes {}
rn230brnrefseqprobe matchprobes
+
edge hsfocusptentrezgprobe matchprobes {}
dmgenome1dmense utils
+
edge rnex10stv1rnentrezg utils {}
medicagoprobe R
+
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 methods {}
medicagoprobe matchprobes
+
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 Biostrings {}
dmgenome1dmugcdf utils
+
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 BSgenome {}
hsex10stv2ptentrezg utils
+
edge moe430bcdf utils {}
caninecdf utils
+
edge rnex10stv1rnensgprobe matchprobes {}
mm430ammensgcdf utils
+
edge mm430mmentrezgprobe matchprobes {}
mm430ammrefseqcdf utils
+
edge ye6100subacdf utils {}
hsfocushsenstprobe R
+
edge mm430mmensg utils {}
hsfocushsenstprobe matchprobes
+
edge hs133xhsug utils {}
ath1121501 R
+
edge mm11ksubammenseprobe matchprobes {}
hs133bhsentrezgprobe R
+
edge chickencdf utils {}
hs133bhsentrezgprobe matchprobes
+
edge mm430bmmensgcdf utils {}
drzebrafishdrugcdf utils
+
edge hs133aptense utils {}
mm430ammentrezg utils
+
edge rn230rnenstcdf utils {}
hgu133bprobe R
+
edge rn230arnenstprobe matchprobes {}
hgu133bprobe matchprobes
+
edge cfcanine2cfrefseq utils {}
mmex10stv1mmentrezgprobe R
+
edge mm430bmmentrezg utils {}
mmex10stv1mmentrezgprobe matchprobes
+
edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 methods {}
rn34arnenseprobe R
+
edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 Biostrings {}
rn34arnenseprobe matchprobes
+
edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 BSgenome {}
soybeancdf utils
+
edge cfcanine2cfugprobe matchprobes {}
hs133xptensgprobe R
+
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 methods {}
hs133xptensgprobe matchprobes
+
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 Biostrings {}
rgug4105a R
+
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 BSgenome {}
rtu34probe R
+
edge hs133phsug utils {}
rtu34probe matchprobes
+
edge zebrafishcdf utils {}
hsex10stv2hsensgcdf utils
+
edge rat2302cdf utils {}
rnex10stv1rnensecdf utils
+
edge moe430bprobe matchprobes {}
mm11ksubbmmentrezgcdf utils
+
edge rn230rnugcdf utils {}
mu6500subdcdf utils
+
edge cfcanine2cfensg utils {}
mm74av2mmensgcdf utils
+
edge hgu95bprobe matchprobes {}
mm74bv2mmentrezgcdf utils
+
edge yeast2cdf utils {}
rn230rnenstprobe R
+
edge hgu133plus2probe matchprobes {}
rn230rnenstprobe matchprobes
+
edge hs133ahsensg utils {}
h10kcod R
+
edge mm74av1mmrefseqcdf utils {}
hs95av2hsrefseq utils
+
edge mmex10stv1mmenstprobe matchprobes {}
hsex10stv2hsentrezg utils
+
edge hsfocusptenstcdf utils {}
mm430bmmenstprobe R
+
edge mm74bv2mmensecdf utils {}
mm430bmmenstprobe matchprobes
+
edge rn230brnug utils {}
hsex10stv2hsense utils
+
edge hs133xhsrefseqcdf utils {}
mm74av2mmentrezg utils
+
edge hs133aptensg utils {}
BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 R
+
edge hgu133a2probe matchprobes {}
BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 methods
+
edge citrusprobe matchprobes {}
BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 Biostrings
+
edge hs133ahsugprobe matchprobes {}
BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 BSgenome
+
edge hsex10stv2ptensgprobe matchprobes {}
dmgenome1dmensg utils
+
edge ggchickenggugprobe matchprobes {}
rgu34a R
+
edge mm74cv2mmugprobe matchprobes {}
mm430bmmensecdf utils
+
edge dmgenome1dmenst utils {}
dmehomology R
+
edge rn34arnentrezgprobe matchprobes {}
mm430mmensgcdf utils
+
edge mm74av2mmenstprobe matchprobes {}
hu35ksubaprobe R
+
edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 methods {}
hu35ksubaprobe matchprobes
+
edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 Biostrings {}
rn230brnensgprobe R
+
edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 BSgenome {}
rn230brnensgprobe matchprobes
+
edge mmex10stv1mmensecdf utils {}
hsex10stv2ptense utils
+
edge hs133bhsenseprobe matchprobes {}
osriceostigrprobe R
+
edge hsfocushsenstcdf utils {}
osriceostigrprobe matchprobes
+
edge mm74cv2mmentrezgprobe matchprobes {}
hsex10stv2hsentrezgprobe R
+
edge mm11ksubbmmenstcdf utils {}
hsex10stv2hsentrezgprobe matchprobes
+
edge mm74cv2mmenseprobe matchprobes {}
cfcanine2cfenstprobe R
+
edge hs133xhsense utils {}
cfcanine2cfenstprobe matchprobes
+
edge dmdrosophila2dmug utils {}
mm430mmentrezg utils
+
edge mm74bv2mmensgprobe matchprobes {}
mm74av1mmrefseqprobe R
+
edge rgu34cprobe matchprobes {}
mm74av1mmrefseqprobe matchprobes
+
edge rn230arnugprobe matchprobes {}
rnex10stv1rnrefseq utils
+
edge hs133xptense utils {}
atgenomeattaircdf utils
+
edge hsex10stv2hsenst utils {}
zmahomology R
+
edge hs95av2hsenseprobe matchprobes {}
rgu34b R
+
edge mgu74bv2cdf utils {}
hs133xptensgcdf utils
+
edge rn34arnrefseqcdf utils {}
mu19ksubccdf utils
+
edge hsex10stv2ptenst utils {}
hgu95ecdf utils
+
edge dmdrosophila2dmenseprobe matchprobes {}
atgenomeatrefseqcdf utils
+
edge hthgu133acdf utils {}
hs133phsrefseqprobe R
+
edge agprobe matchprobes {}
hs133phsrefseqprobe matchprobes
+
edge hsfocushsentrezgprobe matchprobes {}
hsex10stv2hsensg utils
+
edge hs133xhsensg utils {}
hs133xptentrezg utils
+
edge drzebrafishdrensgcdf utils {}
saureusprobe R
+
edge dmgenome1dmensgcdf utils {}
saureusprobe matchprobes
+
edge hu35ksubdprobe matchprobes {}
hs133av2hsenseprobe R
+
edge hs133bptensgprobe matchprobes {}
hs133av2hsenseprobe matchprobes
+
edge rn230rnugprobe matchprobes {}
rhesusprobe R
+
edge maizeprobe matchprobes {}
rhesusprobe matchprobes
+
edge rn230arnenseprobe matchprobes {}
mm74av2mmense utils
+
edge drzebrafishdrentrezg utils {}
mm11ksubammenstcdf utils
+
edge hs133xptensg utils {}
hguqiagenv3 R
+
edge hs133pptenstcdf utils {}
rgu34c R
+
edge mm74av2mmenst utils {}
mmex10stv1mmrefseq utils
+
edge vvgrapevvtigrprobe matchprobes {}
cfcanine2cfentrezgcdf utils
+
edge hsex10stv2hsugcdf utils {}
ggchickenggenstprobe R
+
edge hs133bptenstcdf utils {}
ggchickenggenstprobe matchprobes
+
edge paeg1acdf utils {}
cyp450cdf utils
+
edge mm11ksubammug utils {}
hsex10stv2ptensg utils
+
edge mm430ammugcdf utils {}
hs133pptenseprobe R
+
edge ggchickenggrefseq utils {}
hs133pptenseprobe matchprobes
+
edge hs95av2ptensgprobe matchprobes {}
hs133xhsensgcdf utils
+
edge hs133av2hsrefseqcdf utils {}
poplarcdf utils
+
edge mmex10stv1mmenseprobe matchprobes {}
dmdrosophila2dmrefseqprobe R
+
edge mm430ammensgprobe matchprobes {}
dmdrosophila2dmrefseqprobe matchprobes
+
edge hs133ahsrefseqprobe matchprobes {}
hs95av2hsrefseqprobe R
+
edge hs133bhsense utils {}
hs95av2hsrefseqprobe matchprobes
+
edge hs133phsenstcdf utils {}
hs133xhsentrezg utils
+
edge hs133bptentrezgcdf utils {}
hgug4100a R
+
edge hgu133aprobe matchprobes {}
mm11ksubammugcdf utils
+
edge hs133bhsenstcdf utils {}
mm74av2mmensg utils
+
edge dmdrosophila2dmrefseq utils {}
rgug4130a R
+
edge hs133bptense utils {}
hsex10stv2hsenstprobe R
+
edge mm74av2mmenseprobe matchprobes {}
hsex10stv2hsenstprobe matchprobes
+
edge mm11ksubammense utils {}
mgu74cprobe R
+
edge hu35ksubbcdf utils {}
mgu74cprobe matchprobes
+
edge mmex10stv1mmenst utils {}
mwgcod R
+
edge dmdrosophila2dmenstcdf utils {}
hsfocushsenseprobe R
+
edge hsfocushsugprobe matchprobes {}
hsfocushsenseprobe matchprobes
+
edge atgenomeattigr utils {}
mm24kresogen R
+
edge hgu133atagcdf utils {}
hs133bhsentrezgcdf utils
+
edge mm11ksubbmmugprobe matchprobes {}
mmex10stv1mmense utils
+
edge drzebrafishdrenst utils {}
mm11ksubammenstprobe R
+
edge hgu133a2cdf utils {}
mm11ksubammenstprobe matchprobes
+
edge drzebrafishdrenstprobe matchprobes {}
hs133av2ptensgprobe R
+
edge hs133phsentrezgcdf utils {}
hs133av2ptensgprobe matchprobes
+
edge hs95av2hsugcdf utils {}
osahomology R
+
edge hs133bhsensg utils {}
drzebrafishdrense utils
+
edge hs95av2hsentrezgcdf utils {}
mm430mmrefseqcdf utils
+
edge ye6100subccdf utils {}
cfcanine2cfenstcdf utils
+
edge rn34arnrefseqprobe matchprobes {}
hs133aptenstcdf utils
+
edge hsfocushsrefseqcdf utils {}
rn230rnenseprobe R
+
edge hsex10stv2hsug utils {}
rn230rnenseprobe matchprobes
+
edge rn230brnenstcdf utils {}
mm430bmmenseprobe R
+
edge hs133phsense utils {}
mm430bmmenseprobe matchprobes
+
edge hs133bptensg utils {}
mm74av1mmug utils
+
edge mm11ksubammensg utils {}
bovinecdf utils
+
edge rn230rnrefseqcdf utils {}
drzebrafishdrensecdf utils
+
edge mu6500subacdf utils {}
dmgenome1dmensecdf utils
+
edge hs133pptense utils {}
rae230bcdf utils
+
edge tomatoprobe matchprobes {}
hu6800cdf utils
+
edge rgu34acdf utils {}
ath1attairprobe R
+
edge mm430bmmrefseqcdf utils {}
ath1attairprobe matchprobes
+
edge osriceosrefseqprobe matchprobes {}
canineprobe R
+
edge dmdrosophila2dmugcdf utils {}
canineprobe matchprobes
+
edge bovineprobe matchprobes {}
mmex10stv1mmensg utils
+
edge hgu95av2cdf utils {}
hs133ahsrefseqcdf utils
+
edge mm74bv2mmensgcdf utils {}
cfcanine2cfenseprobe R
+
edge mm11ksubbmmugcdf utils {}
cfcanine2cfenseprobe matchprobes
+
edge mgu74bcdf utils {}
rnex10stv1rnugcdf utils
+
edge mm74av1mmugcdf utils {}
mm74av2mmrefseq utils
+
edge cfcanine2cfrefseqcdf utils {}
hs133ahsenstcdf utils
+
edge hu6800subbcdf utils {}
mm430mmrefseq utils
+
edge hs133phsensg utils {}
drzebrafishdrensg utils
+
edge rn34arnenstcdf utils {}
ggchickenggenstcdf utils
+
edge mm74bv2mmentrezg utils {}
mm74cv2mmenstcdf utils
+
edge mm74av1mmentrezgprobe matchprobes {}
zebrafish R
+
edge mm430mmenst utils {}
hsfocusptensgprobe R
+
edge hsfocushsugcdf utils {}
hsfocusptensgprobe matchprobes
+
edge test3probe matchprobes {}
mgug4121a R
+
edge soybeanprobe matchprobes {}
BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 R
+
edge mmex10stv1mmensgcdf utils {}
BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 methods
+
edge hs133pptensg utils {}
BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 Biostrings
+
edge mm74av1mmenstcdf utils {}
BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 BSgenome
+
edge dmgenome1dmenstprobe matchprobes {}
scehomology R
+
edge hgu95bcdf utils {}
hs133bhsenstprobe R
+
edge mgu74bprobe matchprobes {}
hs133bhsenstprobe matchprobes
+
edge mmex10stv1mmentrezg utils {}
mm11ksubammugprobe R
+
edge hs133xhsugcdf utils {}
mm11ksubammugprobe matchprobes
+
edge hs133phsugprobe matchprobes {}
ggchickenggenseprobe R
+
edge ggchickenggrefseqcdf utils {}
ggchickenggenseprobe matchprobes
+
edge cfcanine2cfenst utils {}
mm430mmense utils
+
edge mm430ammrefseqprobe matchprobes {}
mm74cv2mmenstprobe R
+
edge mm74av2mmug utils {}
mm74cv2mmenstprobe matchprobes
+
edge mm430mmensgprobe matchprobes {}
dmdrosophila2dmenst utils
+
edge hs133phsugcdf utils {}
tomatocdf utils
+
edge hs133bhsugprobe matchprobes {}
mm74av1mmenst utils
+
edge hs133ahsenst utils {}
mgu74bv2probe R
+
edge rnex10stv1rnentrezgcdf utils {}
mgu74bv2probe matchprobes
+
edge hs133ahsug utils {}
rn230arnenstcdf utils
+
edge dmdrosophila2dmugprobe matchprobes {}
hgu133acdf utils
+
edge mm11ksubbmmrefseq utils {}
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 R
+
edge hs133aptenst utils {}
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 methods
+
edge hs133av2hsentrezgcdf utils {}
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 Biostrings
+
edge test1cdf utils {}
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 BSgenome
+
edge rn230arnugcdf utils {}
hs95av2hsenstprobe R
+
edge maizecdf utils {}
hs95av2hsenstprobe matchprobes
+
edge plasmodiumanophelesprobe matchprobes {}
vvihomology R
+
edge drzebrafishdrenseprobe matchprobes {}
atgenomeattigrprobe R
+
edge hs133ahsensgprobe matchprobes {}
atgenomeattigrprobe matchprobes
+
edge hsex10stv2hsrefseqcdf utils {}
cfcanine2cfense utils
+
edge rn34arnrefseq utils {}
rnex10stv1rnensgcdf utils
+
edge mm74av1mmrefseq utils {}
mm74cv2mmentrezgcdf utils
+
edge gp53cdf utils {}
hs133ahsense utils
+
edge mm11ksubammrefseqcdf utils {}
rae230a R
+
edge ecoliasv2probe matchprobes {}
dmdrosophila2dmenstprobe R
+
edge rn230brnugprobe matchprobes {}
dmdrosophila2dmenstprobe matchprobes
+
edge hs133aptenstprobe matchprobes {}
hsex10stv2hsenseprobe R
+
edge atgenomeattairprobe matchprobes {}
hsex10stv2hsenseprobe matchprobes
+
edge hs133av2ptenstcdf utils {}
hsfocusptentrezgprobe R
+
edge mgu74cv2probe matchprobes {}
hsfocusptentrezgprobe matchprobes
+
edge hs95av2hsense utils {}
rnex10stv1rnentrezg utils
+
edge ggchickenggug utils {}
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 R
+
edge hgu95eprobe matchprobes {}
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 methods
+
edge hs133pptentrezgprobe matchprobes {}
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 Biostrings
+
edge canine2probe matchprobes {}
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 BSgenome
+
edge mm11ksubbmmense utils {}
moe430bcdf utils
+
edge hsfocushsense utils {}
rnex10stv1rnensgprobe R
+
edge mm11ksubbmmenstprobe matchprobes {}
rnex10stv1rnensgprobe matchprobes
+
edge rn230arnense utils {}
mm430mmentrezgprobe R
+
edge hs95av2ptense utils {}
mm430mmentrezgprobe matchprobes
+
edge ath1attigr utils {}
ye6100subacdf utils
+
edge yeast2probe matchprobes {}
mm430mmensg utils
+
edge mm430bmmrefseq utils {}
hs133xhsug utils
+
edge hsfocusptense utils {}
mm11ksubammenseprobe R
+
edge hs133av2hsenstcdf utils {}
mm11ksubammenseprobe matchprobes
+
edge agcdf utils {}
chickencdf utils
+
edge rn34arnugprobe matchprobes {}
mm430bmmensgcdf utils
+
edge hs133xhsenst utils {}
hs133aptense utils
+
edge hs95av2hsensg utils {}
rn230rnenstcdf utils
+
edge hu35ksubdcdf utils {}
rn230arnenstprobe R
+
edge mm74av1mmugprobe matchprobes {}
rn230arnenstprobe matchprobes
+
edge dmgenome1dmenseprobe matchprobes {}
rae230b R
+
edge mm11ksubbmmensg utils {}
cfcanine2cfrefseq utils
+
edge hs133xptenst utils {}
hs25kresogen R
+
edge hsfocushsensg utils {}
mm430bmmentrezg utils
+
edge cfcanine2cfrefseqprobe matchprobes {}
BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 R
+
edge hs133phsenstprobe matchprobes {}
BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 methods
+
edge hs133bhsrefseqcdf utils {}
BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 Biostrings
+
edge rn230arnensg utils {}
BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 BSgenome
+
edge hs95av2ptensg utils {}
cfcanine2cfugprobe R
+
edge mm430mmug utils {}
cfcanine2cfugprobe matchprobes
+
edge mm74cv2mmrefseqcdf utils {}
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 R
+
edge ath1121501cdf utils {}
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 methods
+
edge hsfocusptensg utils {}
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 Biostrings
+
edge ricecdf utils {}
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 BSgenome
+
edge mm11ksubammensecdf utils {}
hs133phsug utils
+
edge wheatprobe matchprobes {}
zebrafishcdf utils
+
edge hs133av2hsugcdf utils {}
rat2302cdf utils
+
edge drosophila2cdf utils {}
moe430bprobe R
+
edge moe430aprobe matchprobes {}
moe430bprobe matchprobes
+
edge hs95av2ptenstcdf utils {}
rn230rnugcdf utils
+
edge hs95av2hsrefseqcdf utils {}
cfcanine2cfensg utils
+
edge hgu95aprobe matchprobes {}
hgu95bprobe R
+
edge atgenomeattigrcdf utils {}
hgu95bprobe matchprobes
+
edge barley1probe matchprobes {}
yeast2cdf utils
+
edge mm74av1mmensgprobe matchprobes {}
hgu133plus2probe R
+
edge mu6500subccdf utils {}
hgu133plus2probe matchprobes
+
edge dmdrosophila2dmrefseqcdf utils {}
hs133ahsensg utils
+
edge dmgenome1dmrefseqprobe matchprobes {}
mm74av1mmrefseqcdf utils
+
edge rgu34ccdf utils {}
mmex10stv1mmenstprobe R
+
edge hs133xhsensgprobe matchprobes {}
mmex10stv1mmenstprobe matchprobes
+
edge hsfocushsrefseq utils {}
celhomology R
+
edge hcg110probe matchprobes {}
cfahomology R
+
edge hs95av2hsenstcdf utils {}
hsfocusptenstcdf utils
+
edge mm430mmentrezgcdf utils {}
klahomology R
+
edge hs133bhsrefseq utils {}
mm74bv2mmensecdf utils
+
edge hs133aptenseprobe matchprobes {}
rn230brnug utils
+
edge rn230rnrefseqprobe matchprobes {}
hs133xhsrefseqcdf utils
+
edge hs133xptenstprobe matchprobes {}
hs133aptensg utils
+
edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 methods {}
hgu133a2probe R
+
edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 Biostrings {}
hgu133a2probe matchprobes
+
edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 BSgenome {}
citrusprobe R
+
edge mu11ksubbprobe matchprobes {}
citrusprobe matchprobes
+
edge rn230arnrefseqcdf utils {}
hs133ahsugprobe R
+
edge osriceosrefseq utils {}
hs133ahsugprobe matchprobes
+
edge hu6800subdcdf utils {}
hsex10stv2ptensgprobe R
+
edge mm74bv2mmug utils {}
hsex10stv2ptensgprobe matchprobes
+
edge ecoliasv2cdf utils {}
ggchickenggugprobe R
+
edge hs133bhsenst utils {}
ggchickenggugprobe matchprobes
+
edge mm74av2mmentrezgprobe matchprobes {}
mm74cv2mmugprobe R
+
edge hivprtplus2cdf utils {}
mm74cv2mmugprobe matchprobes
+
edge hs133phsentrezgprobe matchprobes {}
dmgenome1dmenst utils
+
edge mm11ksubbmmenseprobe matchprobes {}
rn34arnentrezgprobe R
+
edge cfcanine2cfensecdf utils {}
rn34arnentrezgprobe matchprobes
+
edge hs133xptentrezgprobe matchprobes {}
hgu95av2 R
+
edge mm74av1mmentrezgcdf utils {}
mm74av2mmenstprobe R
+
edge hs133aptensecdf utils {}
mm74av2mmenstprobe matchprobes
+
edge hs133bptenst utils {}
BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 R
+
edge mu19ksubbcdf utils {}
BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 methods
+
edge rn230brnenstprobe matchprobes {}
BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 Biostrings
+
edge mm11ksubammenst utils {}
BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 BSgenome
+
edge hsex10stv2ptenstcdf utils {}
mmex10stv1mmensecdf utils
+
edge hgu95dcdf utils {}
hs133bhsenseprobe R
+
edge mmex10stv1mmrefseqcdf utils {}
hs133bhsenseprobe matchprobes
+
edge mm74cv2mmrefseqprobe matchprobes {}
hsfocushsenstcdf utils
+
edge rgu34bprobe matchprobes {}
mm74cv2mmentrezgprobe R
+
edge hs133av2hsugprobe matchprobes {}
mm74cv2mmentrezgprobe matchprobes
+
edge drzebrafishdrug utils {}
mm11ksubbmmenstcdf utils
+
edge hs133pptentrezgcdf utils {}
mm74cv2mmenseprobe R
+
edge hs95av2ptentrezgcdf utils {}
mm74cv2mmenseprobe matchprobes
+
edge mm430mmugcdf utils {}
hs133xhsense utils
+
edge mm430ammenstcdf utils {}
ratLLMappings R
+
edge rn34arnensgprobe matchprobes {}
dmdrosophila2dmug utils
+
edge mgu74av2cdf utils {}
hgug4101a R
+
edge ath1121501probe matchprobes {}
mm74bv2mmensgprobe R
+
edge rn230rnug utils {}
mm74bv2mmensgprobe matchprobes
+
edge osriceostigr utils {}
rgu34cprobe R
+
edge citruscdf utils {}
rgu34cprobe matchprobes
+
edge mm74av2mmrefseqcdf utils {}
rn230arnugprobe R
+
edge hs133av2hsense utils {}
rn230arnugprobe matchprobes
+
edge hs133ahsensecdf utils {}
hs133xptense utils
+
edge hs133phsenseprobe matchprobes {}
hsex10stv2hsenst utils
+
edge hsex10stv2hsenstcdf utils {}
hs95av2hsenseprobe R
+
edge ggchickenggensecdf utils {}
hs95av2hsenseprobe matchprobes
+
edge mm74av2mmenstcdf utils {}
mgu74bv2cdf utils
+
edge mm74cv2mmensecdf utils {}
rn34arnrefseqcdf utils
+
edge test3cdf utils {}
hsex10stv2ptenst utils
+
edge ath1atrefseq utils {}
ygs98 R
+
edge hs133av2ptense utils {}
dmdrosophila2dmenseprobe R
+
edge hs133phsenst utils {}
dmdrosophila2dmenseprobe matchprobes
+
edge mm74av2mmrefseqprobe matchprobes {}
hthgu133acdf utils
+
edge mm430ammentrezgcdf utils {}
agprobe R
+
edge hu35ksubcprobe matchprobes {}
agprobe matchprobes
+
edge rn230brnense utils {}
hsfocushsentrezgprobe R
+
edge hs133pptenst utils {}
hsfocushsentrezgprobe matchprobes
+
edge mm11ksubbmmug utils {}
hs133xhsensg utils
+
edge mm430bmmugcdf utils {}
drzebrafishdrensgcdf utils
+
edge mm430mmenstcdf utils {}
dmgenome1dmensgcdf utils
+
edge mm11ksubammrefseqprobe matchprobes {}
hu35ksubdprobe R
+
edge chickenprobe matchprobes {}
hu35ksubdprobe matchprobes
+
edge hs133av2hsensg utils {}
egohomology R
+
edge rn230arnentrezgcdf utils {}
hs133bptensgprobe R
+
edge atgenomeatrefseqprobe matchprobes {}
hs133bptensgprobe matchprobes
+
edge poplarprobe matchprobes {}
rtu34 R
+
edge rn230arnensecdf utils {}
rn230rnugprobe R
+
edge hs133av2hsensgprobe matchprobes {}
rn230rnugprobe matchprobes
+
edge plasmodiumanophelescdf utils {}
maizeprobe R
+
edge hs133xptenstcdf utils {}
maizeprobe matchprobes
+
edge hs133av2ptensg utils {}
rn230arnenseprobe R
+
edge bsubtilisprobe matchprobes {}
rn230arnenseprobe matchprobes
+
edge rn230arnrefseqprobe matchprobes {}
drzebrafishdrentrezg utils
+
edge hs95av2hsugprobe matchprobes {}
hs133xptensg utils
+
edge hs133av2ptenstprobe matchprobes {}
hs133pptenstcdf utils
+
edge mm74cv2mmense utils {}
hgu133a2 R
+
edge hs133pptensgprobe matchprobes {}
mm74av2mmenst utils
+
edge rn230brnensg utils {}
vvgrapevvtigrprobe R
+
edge hs133xptenseprobe matchprobes {}
vvgrapevvtigrprobe matchprobes
+
edge rae230acdf utils {}
hsex10stv2hsugcdf utils
+
edge mu11ksubbcdf utils {}
hs133bptenstcdf utils
+
edge hs133xhsentrezgcdf utils {}
paeg1acdf utils
+
edge mouse430a2cdf utils {}
mm11ksubammug utils
+
edge hgfocusprobe matchprobes {}
mm430ammugcdf utils
+
edge hs133xhsenstcdf utils {}
ggchickenggrefseq utils
+
edge drosgenome1cdf utils {}
hs95av2ptensgprobe R
+
edge hsex10stv2hsentrezgcdf utils {}
hs95av2ptensgprobe matchprobes
+
edge rn230rnensecdf utils {}
hs133av2hsrefseqcdf utils
+
edge rn230brnrefseq utils {}
mmex10stv1mmenseprobe R
+
edge cfcanine2cfentrezgprobe matchprobes {}
mmex10stv1mmenseprobe matchprobes
+
edge hs133av2ptentrezgcdf utils {}
mm430ammensgprobe R
+
edge hs133xhsentrezgprobe matchprobes {}
mm430ammensgprobe matchprobes
+
edge rn230brnenseprobe matchprobes {}
hs133ahsrefseqprobe R
+
edge hsfocushsensgprobe matchprobes {}
hs133ahsrefseqprobe matchprobes
+
edge hs133av2hsrefseq utils {}
mgug4122a R
+
edge mm74cv2mmensg utils {}
hs133bhsense utils
+
edge mm430ammugprobe matchprobes {}
hs133phsenstcdf utils
+
edge hsfocusptenstprobe matchprobes {}
hs133bptentrezgcdf utils
+
edge mm11ksubammensgcdf utils {}
hgu133aprobe R
+
edge hsfocusptensecdf utils {}
hgu133aprobe matchprobes
+
edge hsex10stv2hsrefseq utils {}
hs133bhsenstcdf utils
+
edge rn230rnensgprobe matchprobes {}
dmdrosophila2dmrefseq utils
+
edge hs133xhsrefseq utils {}
hs133bptense utils
+
edge mm430bmmensgprobe matchprobes {}
mm74av2mmenseprobe R
+
edge mm11ksubammentrezg utils {}
mm74av2mmenseprobe matchprobes
+
edge hsex10stv2hsugprobe matchprobes {}
mm11ksubammense utils
+
edge ath1atrefseqprobe matchprobes {}
hu35ksubbcdf utils
+
edge mm74av2mmugprobe matchprobes {}
mmex10stv1mmenst utils
+
edge mm74av2mmugcdf utils {}
dmdrosophila2dmenstcdf utils
+
edge rnu34cdf utils {}
hsfocushsugprobe R
+
edge mm74cv2mmug utils {}
hsfocushsugprobe matchprobes
+
edge osriceostigrcdf utils {}
atgenomeattigr utils
+
edge mm11ksubammentrezgprobe matchprobes {}
hgu133atagcdf utils
+
edge mmex10stv1mmug utils {}
mm11ksubbmmugprobe R
+
edge hs95av2ptentrezgprobe matchprobes {}
mm11ksubbmmugprobe matchprobes
+
edge drzebrafishdrrefseqcdf utils {}
drzebrafishdrenst utils
+
edge cfcanine2cfensgprobe matchprobes {}
hgu133a2cdf utils
+
edge hs95av2hsenst utils {}
drzebrafishdrenstprobe R
+
edge hsfocushsensecdf utils {}
drzebrafishdrenstprobe matchprobes
+
edge ath1attaircdf utils {}
hs133phsentrezgcdf utils
+
edge mm430mmugprobe matchprobes {}
hs95av2hsugcdf utils
+
edge mm11ksubbmmenst utils {}
hs133bhsensg utils
+
edge moe430acdf utils {}
hs95av2hsentrezgcdf utils
+
edge hsfocushsenst utils {}
ye6100subccdf utils
+
edge mm11ksubbmmensecdf utils {}
rn34arnrefseqprobe R
+
edge rn230arnenst utils {}
rn34arnrefseqprobe matchprobes
+
edge hs95av2ptenst utils {}
hsfocushsrefseqcdf utils
+
edge hsfocusptenst utils {}
hsex10stv2hsug utils
+
edge mm430ammug utils {}
rn230brnenstcdf utils
+
edge mgu74aprobe matchprobes {}
hs133phsense utils
+
edge rnex10stv1rnenstprobe matchprobes {}
hs133bptensg utils
+
edge ggchickenggensgprobe matchprobes {}
mm11ksubammensg utils
+
edge hs133bhsug utils {}
mgrhomology R
+
edge mm11ksubammentrezgcdf utils {}
cinhomology R
+
edge cfcanine2cfensgcdf utils {}
rn230rnrefseqcdf utils
+
edge hs133av2ptenseprobe matchprobes {}
mu6500subacdf utils
+
edge hs133aptensgcdf utils {}
hs133pptense utils
+
edge cfcanine2cfentrezg utils {}
tomatoprobe R
+
edge rn230brnugcdf utils {}
tomatoprobe matchprobes
+
edge hs133aptentrezg utils {}
rgu34acdf utils
+
edge mm11ksubammrefseq utils {}
mm430bmmrefseqcdf utils
+
edge rae230bprobe matchprobes {}
osriceosrefseqprobe R
+
edge mouse430a2probe matchprobes {}
osriceosrefseqprobe matchprobes
+
edge hs133xhsugprobe matchprobes {}
mi16cod R
+
edge mm74cv2mmrefseq utils {}
dmdrosophila2dmugcdf utils
+
edge hgu133atagprobe matchprobes {}
bovineprobe R
+
edge hs133pptensecdf utils {}
bovineprobe matchprobes
+
edge hsex10stv2hsensgprobe matchprobes {}
hgu95av2cdf utils
+
edge rn34arnense utils {}
m20kcod R
+
edge hs133ahsensgcdf utils {}
mm74bv2mmensgcdf utils
+
edge dmgenome1dmrefseqcdf utils {}
mm11ksubbmmugcdf utils
+
edge rnex10stv1rnenstcdf utils {}
gmahomology R
+
edge ggchickenggensgcdf utils {}
mgu74bcdf utils
+
edge mm74cv2mmensgcdf utils {}
mm74av1mmugcdf utils
+
edge hs133bptensecdf utils {}
cfcanine2cfrefseqcdf utils
+
edge rnex10stv1rnug utils {}
ri16cod R
+
edge drzebrafishdrrefseqprobe matchprobes {}
hu6800subbcdf utils
+
edge mm11ksubammensgprobe matchprobes {}
hs133phsensg utils
+
edge hs133ahsentrezg utils {}
rn34arnenstcdf utils
+
edge hs133phsrefseq utils {}
mm74bv2mmentrezg utils
+
edge riceprobe matchprobes {}
mm74av1mmentrezgprobe R
+
edge mm74cv2mmentrezg utils {}
mm74av1mmentrezgprobe matchprobes
+
edge hsex10stv2ptenstprobe matchprobes {}
mm430mmenst utils
+
edge hsfocusptenseprobe matchprobes {}
hsfocushsugcdf utils
+
edge mm430bmmenstcdf utils {}
test3probe R
+
edge barley1cdf utils {}
test3probe matchprobes
+
edge hs133phsensecdf utils {}
soybeanprobe R
+
edge hgu95dprobe matchprobes {}
soybeanprobe matchprobes
+
edge celeganscdf utils {}
ratCHRLOC R
+
edge hs133bhsensecdf utils {}
mmex10stv1mmensgcdf utils
+
edge rn34arnensg utils {}
humanLLMappings R
+
edge mm430ammense utils {}
hs133pptensg utils
+
edge mm430ammrefseq utils {}
mm74av1mmenstcdf utils
+
edge rn230arnensgcdf utils {}
dmgenome1dmenstprobe R
+
edge hs95av2hsentrezgprobe matchprobes {}
dmgenome1dmenstprobe matchprobes
+
edge dmdrosophila2dmensecdf utils {}
hgu95bcdf utils
+
edge rn230arnentrezg utils {}
mgu74bprobe R
+
edge mm74bv2mmenstprobe matchprobes {}
mgu74bprobe matchprobes
+
edge ecoli2probe matchprobes {}
rat2302 R
+
edge cfcanine2cfugcdf utils {}
mmex10stv1mmentrezg utils
+
edge hs133ahsentrezgcdf utils {}
hs133xhsugcdf utils
+
edge hs133bhsensgprobe matchprobes {}
hs133phsugprobe R
+
edge rn230brnensecdf utils {}
hs133phsugprobe matchprobes
+
edge rn230rnensgcdf utils {}
ggchickenggrefseqcdf utils
+
edge rnex10stv1rnenseprobe matchprobes {}
cfcanine2cfenst utils
+
edge mm430ammensg utils {}
mm430ammrefseqprobe R
+
edge mm74cv2mmensgprobe matchprobes {}
mm430ammrefseqprobe matchprobes
+
edge mm11ksubbmmrefseqcdf utils {}
mm74av2mmug utils
+
edge PFAM RSQLite {}
mm430mmensgprobe R
+
edge rn230rnentrezg utils {}
mm430mmensgprobe matchprobes
+
edge hs133bptenstprobe matchprobes {}
hs133phsugcdf utils
+
edge hs133av2hsenst utils {}
hs133bhsugprobe R
+
edge drosophila2probe matchprobes {}
hs133bhsugprobe matchprobes
+
edge u133x3pcdf utils {}
hs133ahsenst utils
+
edge hs95av2hsensgprobe matchprobes {}
rnex10stv1rnentrezgcdf utils
+
edge hs133av2ptenst utils {}
hs133ahsug utils
+
edge sugarcanecdf utils {}
dmdrosophila2dmugprobe R
+
edge medicagocdf utils {}
dmdrosophila2dmugprobe matchprobes
+
edge rtu34cdf utils {}
mm11ksubbmmrefseq utils
+
edge hsfocusptensgcdf utils {}
hs133aptenst utils
+
edge dmdrosophila2dmensgprobe matchprobes {}
mgug4104a R
+
edge rn230brnenst utils {}
hs133av2hsentrezgcdf utils
+
edge rnex10stv1rnrefseqprobe matchprobes {}
test1cdf utils
+
edge hs95av2ptenstprobe matchprobes {}
adme16cod R
+
edge hsfocusptentrezg utils {}
rn230arnugcdf utils
+
edge rnex10stv1rnugprobe matchprobes {}
maizecdf utils
+
edge mm430ammenstprobe matchprobes {}
pfahomology R
+
edge hgu133bcdf utils {}
xlahomology R
+
edge rn34arnensecdf utils {}
ggahomology R
+
edge hu35ksubacdf utils {}
plasmodiumanophelesprobe R
+
edge hs133phsrefseqcdf utils {}
plasmodiumanophelesprobe matchprobes
+
edge ggchickenggense utils {}
drzebrafishdrenseprobe R
+
edge xenopuslaevisprobe matchprobes {}
drzebrafishdrenseprobe matchprobes
+
edge hcg110cdf utils {}
hs133ahsensgprobe R
+
edge hs133ahsrefseq utils {}
hs133ahsensgprobe matchprobes
+
edge mm11ksubbmmentrezgprobe matchprobes {}
hsex10stv2hsrefseqcdf utils
+
edge hsex10stv2ptenseprobe matchprobes {}
rn34arnrefseq utils
+
edge mm74av1mmensecdf utils {}
mm74av1mmrefseq utils
+
edge rn230arnensgprobe matchprobes {}
spohomology R
+
edge rn230rnrefseq utils {}
gp53cdf utils
+
edge hs133ahsugcdf utils {}
mm11ksubammrefseqcdf utils
+
edge hsfocushsentrezgcdf utils {}
ecoliasv2probe R
+
edge mu11ksubaprobe matchprobes {}
ecoliasv2probe matchprobes
+
edge drzebrafishdrenstcdf utils {}
rn230brnugprobe R
+
edge dmgenome1dmenstcdf utils {}
rn230brnugprobe matchprobes
+
edge mm430bmmugprobe matchprobes {}
mgu74av2 R
+
edge hsfocushsensgcdf utils {}
hs133aptenstprobe R
+
edge mm11ksubbmmensgcdf utils {}
hs133aptenstprobe matchprobes
+
edge ye6100subbcdf utils {}
atgenomeattairprobe R
+
edge mmex10stv1mmentrezgcdf utils {}
atgenomeattairprobe matchprobes
+
edge hsfocushsentrezg utils {}
hs133av2ptenstcdf utils
+
edge canine2cdf utils {}
mgu74cv2probe R
+
edge hs133xptentrezgcdf utils {}
mgu74cv2probe matchprobes
+
edge hs133bhsrefseqprobe matchprobes {}
hs95av2hsense utils
+
edge mm74cv2mmenst utils {}
ggchickenggug utils
+
edge mm11ksubbmmentrezg utils {}
hgu95eprobe R
+
edge ecolicdf utils {}
hgu95eprobe matchprobes
+
edge mm74bv2mmugcdf utils {}
hs133pptentrezgprobe R
+
edge hsex10stv2ptentrezgcdf utils {}
hs133pptentrezgprobe matchprobes
+
edge rnex10stv1rnense utils {}
canine2probe R
+
edge vvgrapevvtigrcdf utils {}
canine2probe matchprobes
+
edge mmex10stv1mmensgprobe matchprobes {}
mm11ksubbmmense utils
+
edge ggchickenggensg utils {}
hsfocushsense utils
+
edge rnex10stv1rnentrezgprobe matchprobes {}
mguatlas5k R
+
edge hsfocushsug utils {}
hwgcod R
+
edge rn230rnense utils {}
mm11ksubbmmenstprobe R
+
edge mm74bv2mmenseprobe matchprobes {}
mm11ksubbmmenstprobe matchprobes
+
edge rgu34aprobe matchprobes {}
rn230arnense utils
+
edge vvgrapevvtigr utils {}
hs95av2ptense utils
+
edge mm74av2mmensgprobe matchprobes {}
ath1attigr utils
+
edge rhesuscdf utils {}
yeast2probe R
+
edge zebrafishprobe matchprobes {}
yeast2probe matchprobes
+
edge hsfocushsrefseqprobe matchprobes {}
mm430bmmrefseq utils
+
edge mgu74acdf utils {}
hsfocusptense utils
+
edge hu6800subacdf utils {}
hs133av2hsenstcdf utils
+
edge rnex10stv1rnensg utils {}
agcdf utils
+
edge hs133pptensgcdf utils {}
rn34arnugprobe R
+
edge hs133av2ptensecdf utils {}
rn34arnugprobe matchprobes
+
edge hu35ksubbprobe matchprobes {}
hs133xhsenst utils
+
edge rnu34probe matchprobes {}
canine2 R
+
edge xenopuslaeviscdf utils {}
hs95av2hsensg utils
+
edge hs133bptenseprobe matchprobes {}
hu35ksubdcdf utils
+
edge rn230rnensg utils {}
mm74av1mmugprobe R
+
edge rn34arnug utils {}
mm74av1mmugprobe matchprobes
+
edge rn230brnrefseqcdf utils {}
hu35ksuba R
+
edge dmgenome1dmrefseq utils {}
dmgenome1dmenseprobe R
+
edge hs133bptensgcdf utils {}
dmgenome1dmenseprobe matchprobes
+
edge hs133pptentrezg utils {}
mm11ksubbmmensg utils
+
edge mm430bmmense utils {}
humanCHRLOC R
+
edge hgu95acdf utils {}
hs133xptenst utils
+
edge ath1atrefseqcdf utils {}
hsfocushsensg utils
+
edge hs133av2ptentrezgprobe matchprobes {}
cfcanine2cfrefseqprobe R
+
edge hs133bptentrezg utils {}
cfcanine2cfrefseqprobe matchprobes
+
edge hs133xhsrefseqprobe matchprobes {}
hs133phsenstprobe R
+
edge hs133phsensgcdf utils {}
hs133phsenstprobe matchprobes
+
edge hs133av2hsensecdf utils {}
hs133bhsrefseqcdf utils
+
edge hs95av2ptenseprobe matchprobes {}
rn230arnensg utils
+
edge rn230arnentrezgprobe matchprobes {}
hs95av2ptensg utils
+
edge mm430ammentrezgprobe matchprobes {}
ncrhomology R
+
edge mm430ammenseprobe matchprobes {}
mm430mmug utils
+
edge hs133aptentrezgprobe matchprobes {}
btahomology R
+
edge hs133bhsensgcdf utils {}
mm74cv2mmrefseqcdf utils
+
edge hs133phsentrezg utils {}
ath1121501cdf utils
+
edge mm74bv2mmense utils {}
hsfocusptensg utils
+
edge rat2302probe matchprobes {}
ricecdf utils
+
edge mouse4302probe matchprobes {}
hu35ksubb R
+
edge hs133bhsentrezg utils {}
mm11ksubammensecdf utils
+
edge mm430mmenstprobe matchprobes {}
wheatprobe R
+
edge atgenomeattair utils {}
wheatprobe matchprobes
+
edge mm430bmmensg utils {}
hs133av2hsugcdf utils
+
edge drzebrafishdrugprobe matchprobes {}
drosophila2cdf utils
+
edge ecoli2cdf utils {}
moe430aprobe R
+
edge dmgenome1dmugprobe matchprobes {}
moe430aprobe matchprobes
+
edge dmdrosophila2dmensgcdf utils {}
hs95av2ptenstcdf utils
+
edge bsubtiliscdf utils {}
hs95av2hsrefseqcdf utils
+
edge mm74bv2mmenstcdf utils {}
hgu95aprobe R
+
edge rn230arnrefseq utils {}
hgu95aprobe matchprobes
+
edge hs133av2hsrefseqprobe matchprobes {}
atgenomeattigrcdf utils
+
edge atgenomeatrefseq utils {}
barley1probe R
+
edge mm430bmmrefseqprobe matchprobes {}
barley1probe matchprobes
+
edge hs95av2ptensecdf utils {}
hu35ksubc R
+
edge ygs98cdf utils {}
mm74av1mmensgprobe R
+
edge hs133ahsenstprobe matchprobes {}
mm74av1mmensgprobe matchprobes
+
edge mm74bv2mmensg utils {}
mu6500subccdf utils
+
edge rn230brnensgcdf utils {}
hguDKFZ31 R
+
edge hgu133plus2cdf utils {}
dmdrosophila2dmrefseqcdf utils
+
edge mmex10stv1mmenstcdf utils {}
dmgenome1dmrefseqprobe R
+
edge mmex10stv1mmrefseqprobe matchprobes {}
dmgenome1dmrefseqprobe matchprobes
+
edge ygs98probe matchprobes {}
rgu34ccdf utils
+
edge rn230brnentrezg utils {}
hgfocus R
+
edge hsex10stv2hsrefseqprobe matchprobes {}
hs133xhsensgprobe R
+
edge rn34arnenst utils {}
hs133xhsensgprobe matchprobes
+
edge hs95av2hsensecdf utils {}
hsfocushsrefseq utils
+
edge mm430mmrefseqprobe matchprobes {}
GO R
+
edge mm74bv2mmentrezgprobe matchprobes {}
hcg110probe R
+
edge drzebrafishdrensgprobe matchprobes {}
hcg110probe matchprobes
+
edge cfcanine2cfug utils {}
hu35ksubd R
+
edge rn34arnensgcdf utils {}
hs95av2hsenstcdf utils
+
edge hu35ksubccdf utils {}
mm430mmentrezgcdf utils
+
edge mm430bmmug utils {}
hs133bhsrefseq utils
+
edge rn34arnentrezg utils {}
hs133aptenseprobe R
+
edge mm74av1mmensgcdf utils {}
hs133aptenseprobe matchprobes
+
edge hs133av2hsentrezgprobe matchprobes {}
rn230rnrefseqprobe R
+
edge mm430ammenst utils {}
rn230rnrefseqprobe matchprobes
+
edge u133aaofav2cdf utils {}
hs133xptenstprobe R
+
edge hsex10stv2ptensecdf utils {}
hs133xptenstprobe matchprobes
+
edge ggchickenggugcdf utils {}
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 R
+
edge mm74av1mmentrezg utils {}
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 methods
+
edge drzebrafishdrrefseq utils {}
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 Biostrings
+
edge ecoliprobe matchprobes {}
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 BSgenome
+
edge ye6100subdcdf utils {}
mu11ksubbprobe R
+
edge hs95av2hsug utils {}
mu11ksubbprobe matchprobes
+
edge porcineprobe matchprobes {}
rn230arnrefseqcdf utils
+
edge mm430ammensecdf utils {}
osriceosrefseq utils
+
edge hs133aptentrezgcdf utils {}
hu6800subdcdf utils
+
edge mm74bv2mmrefseq utils {}
mm74bv2mmug utils
+
edge hs133ahsentrezgprobe matchprobes {}
hcg110 R
+
edge mm430mmenseprobe matchprobes {}
ecoliasv2cdf utils
+
edge ath1attigrprobe matchprobes {}
hs133bhsenst utils
+
edge rn230rnentrezgcdf utils {}
mm74av2mmentrezgprobe R
+
edge hsex10stv2hsensecdf utils {}
mm74av2mmentrezgprobe matchprobes
+
edge mu6500subbcdf utils {}
hivprtplus2cdf utils
+
edge mm74av2mmensecdf utils {}
hs133phsentrezgprobe R
+
edge mm74av2mmentrezgcdf utils {}
hs133phsentrezgprobe matchprobes
+
edge rgu34bcdf utils {}
mm11ksubbmmenseprobe R
+
edge rae230aprobe matchprobes {}
mm11ksubbmmenseprobe matchprobes
+
edge sugarcaneprobe matchprobes {}
cfcanine2cfensecdf utils
+
edge mm74bv2mmugprobe matchprobes {}
hs133xptentrezgprobe R
+
edge saureuscdf utils {}
hs133xptentrezgprobe matchprobes
+
edge mgu74av2probe matchprobes {}
mm74av1mmentrezgcdf utils
+
edge htratfocuscdf utils {}
hs133aptensecdf utils
+
edge mm74av1mmenstprobe matchprobes {}
hs133bptenst utils
+
edge mm430mmensecdf utils {}
mu19ksubbcdf utils
+
edge dmgenome1dmensgprobe matchprobes {}
rn230brnenstprobe R
+
edge drzebrafishdrentrezgcdf utils {}
rn230brnenstprobe matchprobes
+
edge mgu74ccdf utils {}
mm11ksubammenst utils
+
edge mm74cv2mmugcdf utils {}
hsex10stv2ptenstcdf utils
+
edge hu6800subccdf utils {}
hgu95dcdf utils
+
edge hs133ahsenseprobe matchprobes {}
mmex10stv1mmrefseqcdf utils
+
edge hs133xhsenstprobe matchprobes {}
mm74cv2mmrefseqprobe R
+
edge mmex10stv1mmugprobe matchprobes {}
mm74cv2mmrefseqprobe matchprobes
+
edge rnex10stv1rnrefseqcdf utils {}
rgu34bprobe R
+
edge mouse4302cdf utils {}
rgu34bprobe matchprobes
+
edge hs133av2ptensgcdf utils {}
hs133av2hsugprobe R
+
edge paeg1aprobe matchprobes {}
hs133av2hsugprobe matchprobes
+
edge hs133xptensecdf utils {}
drzebrafishdrug utils
+
edge mu19ksubacdf utils {}
hs133pptentrezgcdf utils
+
edge hs133av2ptentrezg utils {}
hs95av2ptentrezgcdf utils
+
edge hgu95ccdf utils {}
mm430mmugcdf utils
+
edge mm430bmmentrezgcdf utils {}
mm430ammenstcdf utils
+
edge hsfocusptentrezgcdf utils {}
rn34arnensgprobe R
+
edge ath1attair utils {}
rn34arnensgprobe matchprobes
+
edge ggchickenggenst utils {}
mgu74av2cdf utils
+
edge wheatcdf utils {}
ath1121501probe R
+
edge celegansprobe matchprobes {}
ath1121501probe matchprobes
+
edge hgu95cprobe matchprobes {}
rn230rnug utils
+
edge vitisviniferaprobe matchprobes {}
osriceostigr utils
+
edge hgu95av2probe matchprobes {}
citruscdf utils
+
edge drosgenome1probe matchprobes {}
mmuhomology R
+
edge hs133av2hsensgcdf utils {}
mm74av2mmrefseqcdf utils
+
edge rn230brnentrezgprobe matchprobes {}
hs133av2hsense utils
+
edge mm430bmmentrezgprobe matchprobes {}
hs133ahsensecdf utils
+
edge hs133bptentrezgprobe matchprobes {}
hs133phsenseprobe R
+
edge rn230brnentrezgcdf utils {}
hs133phsenseprobe matchprobes
+
edge hs133xhsensecdf utils {}
indac R
+
edge hs133av2hsentrezg utils {}
hsex10stv2hsenstcdf utils
+
edge osriceosrefseqcdf utils {}
ggchickenggensecdf utils
+
edge hgfocuscdf utils {}
mm74av2mmenstcdf utils
+
edge test2cdf utils {}
mm74cv2mmensecdf utils
+
edge hs133aptensgprobe matchprobes {}
test3cdf utils
+
edge mmex10stv1mmugcdf utils {}
ath1atrefseq utils
+
edge rn34arnenstprobe matchprobes {}
hs133av2ptense utils
+
edge rnex10stv1rnenst utils {}
hs133phsenst utils
+
edge dmdrosophila2dmense utils {}
mm74av2mmrefseqprobe R
+
edge mm74av1mmense utils {}
mm74av2mmrefseqprobe matchprobes
+
edge rn230arnug utils {}
mm430ammentrezgcdf utils
+
edge rn230rnenst utils {}
hu35ksubcprobe R
+
edge mm11ksubbmmensgprobe matchprobes {}
hu35ksubcprobe matchprobes
+
edge drzebrafishdrentrezgprobe matchprobes {}
rn230brnense utils
+
edge rn34arnentrezgcdf utils {}
hs133pptenst utils
+
edge hs95av2ptensgcdf utils {}
mm11ksubbmmug utils
+
edge hsex10stv2ptentrezgprobe matchprobes {}
mm430bmmugcdf utils
+
edge hs133av2hsug utils {}
mm430mmenstcdf utils
+
edge mm74bv2mmrefseqcdf utils {}
mm11ksubammrefseqprobe R
+
edge hs95av2ptentrezg utils {}
mm11ksubammrefseqprobe matchprobes
+
edge dmgenome1dmug utils {}
chickenprobe R
+
edge mgu74cv2cdf utils {}
chickenprobe matchprobes
+
edge rn34arnugcdf utils {}
hgu95a R
+
edge dmdrosophila2dmensg utils {}
hs133av2hsensg utils
+
edge mm74av1mmensg utils {}
rn230arnentrezgcdf utils
+
edge mm74av1mmenseprobe matchprobes {}
atgenomeatrefseqprobe R
+
edge hs133bhsugcdf utils {}
atgenomeatrefseqprobe matchprobes
+
edge mm430bmmenst utils {}
poplarprobe R
+
edge hs133av2hsenstprobe matchprobes {}
poplarprobe matchprobes
+
edge hs133phsensgprobe matchprobes {}
rn230arnensecdf utils
+
edge hs95av2hsensgcdf utils {}
hs133av2hsensgprobe R
+
edge mu11ksubacdf utils {}
hs133av2hsensgprobe matchprobes
+
edge hs133xhsenseprobe matchprobes {}
plasmodiumanophelescdf utils
+
edge ggchickenggrefseqprobe matchprobes {}
hs133xptenstcdf utils
+
edge porcinecdf utils {}
hs133av2ptensg utils
+
edge u133x3pprobe matchprobes {}
bsubtilisprobe R
+
edge mm11ksubbmmrefseqprobe matchprobes {}
bsubtilisprobe matchprobes
+
edge hs95av2hsentrezg utils {}
rn230arnrefseqprobe R
+
edge hu6800probe matchprobes {}
rn230arnrefseqprobe matchprobes
+
edge hs133pptenstprobe matchprobes {}
hgu95b R
+
edge mm74bv2mmrefseqprobe matchprobes {}
hs95av2hsugprobe R
+
edge ath1attigrcdf utils {}
hs95av2hsugprobe matchprobes
+
edge mm74bv2mmenst utils {}
hs133av2ptenstprobe R
+
edge vitisviniferacdf utils {}
hs133av2ptenstprobe matchprobes
+
edge hsex10stv2ptensgcdf utils {}
mm74cv2mmense utils
+
edge LogitBoost NONE {}
hs133pptensgprobe R
+
edge XML methods {}
hs133pptensgprobe matchprobes
+
edge RMySQL methods {}
rn230brnensg utils
+
edge RMySQL DBI {}
hs133xptenseprobe R
+
edge SSOAP methods {}
hs133xptenseprobe matchprobes
+
edge SSOAP XML {}
rae230acdf utils
+
edge SSOAP RCurl {}
rnohomology R
+
edge RCurl methods {}
mu11ksubbcdf utils
+
}}
hs133xhsentrezgcdf utils
 
mouse430a2cdf utils
 
hgfocusprobe R
 
hgfocusprobe matchprobes
 
hgu95c R
 
hs133xhsenstcdf utils
 
drosgenome1cdf utils
 
hsex10stv2hsentrezgcdf utils
 
rn230rnensecdf utils
 
yeast2 R
 
rn230brnrefseq utils
 
cfcanine2cfentrezgprobe R
 
cfcanine2cfentrezgprobe matchprobes
 
mouse430a2 R
 
hs133av2ptentrezgcdf utils
 
hs133xhsentrezgprobe R
 
hs133xhsentrezgprobe matchprobes
 
rn230brnenseprobe R
 
rn230brnenseprobe matchprobes
 
hsfocushsensgprobe R
 
hsfocushsensgprobe matchprobes
 
taehomology R
 
hgu95d R
 
hs133av2hsrefseq utils
 
mm74cv2mmensg utils
 
mm430ammugprobe R
 
mm430ammugprobe matchprobes
 
mouseCHRLOC R
 
ag R
 
hsfocusptenstprobe R
 
hsfocusptenstprobe matchprobes
 
mm11ksubammensgcdf utils
 
hsfocusptensecdf utils
 
hsex10stv2hsrefseq utils
 
rn230rnensgprobe R
 
rn230rnensgprobe matchprobes
 
hgu95e R
 
hs133xhsrefseq utils
 
mm430bmmensgprobe R
 
mm430bmmensgprobe matchprobes
 
mm11ksubammentrezg utils
 
hsex10stv2hsugprobe R
 
hsex10stv2hsugprobe matchprobes
 
mgu74cv2 R
 
ath1atrefseqprobe R
 
ath1atrefseqprobe matchprobes
 
mm74av2mmugprobe R
 
mm74av2mmugprobe matchprobes
 
mm74av2mmugcdf utils
 
rnu34cdf utils
 
mm74cv2mmug utils
 
osriceostigrcdf utils
 
mm11ksubammentrezgprobe R
 
mm11ksubammentrezgprobe matchprobes
 
mmex10stv1mmug utils
 
hs95av2ptentrezgprobe R
 
hs95av2ptentrezgprobe matchprobes
 
drzebrafishdrrefseqcdf utils
 
drehomology R
 
m10kcod R
 
cfcanine2cfensgprobe R
 
cfcanine2cfensgprobe matchprobes
 
hs95av2hsenst utils
 
hsfocushsensecdf utils
 
ath1attaircdf utils
 
mm430mmugprobe R
 
mm430mmugprobe matchprobes
 
mm11ksubbmmenst utils
 
moe430acdf utils
 
hsfocushsenst utils
 
mm11ksubbmmensecdf utils
 
rn230arnenst utils
 
hs95av2ptenst utils
 
r10kcod R
 
hsfocusptenst utils
 
xenopuslaevis R
 
mm430ammug utils
 
mgu74aprobe R
 
mgu74aprobe matchprobes
 
moe430a R
 
rnex10stv1rnenstprobe R
 
rnex10stv1rnenstprobe matchprobes
 
ggchickenggensgprobe R
 
ggchickenggensgprobe matchprobes
 
hs133bhsug utils
 
mm11ksubammentrezgcdf utils
 
cfcanine2cfensgcdf utils
 
YEAST R
 
hs133av2ptenseprobe R
 
hs133av2ptenseprobe matchprobes
 
hs133aptensgcdf utils
 
cfcanine2cfentrezg utils
 
rn230brnugcdf utils
 
hs133aptentrezg utils
 
moe430b R
 
mm11ksubammrefseq utils
 
rae230bprobe R
 
rae230bprobe matchprobes
 
mouse430a2probe R
 
mouse430a2probe matchprobes
 
hs133xhsugprobe R
 
hs133xhsugprobe matchprobes
 
mm74cv2mmrefseq utils
 
hgu133atagprobe R
 
hgu133atagprobe matchprobes
 
rwgcod R
 
hs133pptensecdf utils
 
hsex10stv2hsensgprobe R
 
hsex10stv2hsensgprobe matchprobes
 
rn34arnense utils
 
hs133ahsensgcdf utils
 
dmgenome1dmrefseqcdf utils
 
rnex10stv1rnenstcdf utils
 
ggchickenggensgcdf utils
 
mm74cv2mmensgcdf utils
 
hs133bptensecdf utils
 
rnex10stv1rnug utils
 
drzebrafishdrrefseqprobe R
 
drzebrafishdrrefseqprobe matchprobes
 
mm11ksubammensgprobe R
 
mm11ksubammensgprobe matchprobes
 
hs133ahsentrezg utils
 
u133x3p R
 
hs133phsrefseq utils
 
riceprobe R
 
riceprobe matchprobes
 
mm74cv2mmentrezg utils
 
hsex10stv2ptenstprobe R
 
hsex10stv2ptenstprobe matchprobes
 
hsfocusptenseprobe R
 
hsfocusptenseprobe matchprobes
 
mm430bmmenstcdf utils
 
barley1cdf utils
 
hs133phsensecdf utils
 
hgubeta7 R
 
hgu95dprobe R
 
hgu95dprobe matchprobes
 
celeganscdf utils
 
hs133bhsensecdf utils
 
drosophila2 R
 
rn34arnensg utils
 
mm430ammense utils
 
mm430ammrefseq utils
 
rn230arnensgcdf utils
 
hs95av2hsentrezgprobe R
 
hs95av2hsentrezgprobe matchprobes
 
dmdrosophila2dmensecdf utils
 
rn230arnentrezg utils
 
mm74bv2mmenstprobe R
 
mm74bv2mmenstprobe matchprobes
 
ecoli2probe R
 
ecoli2probe matchprobes
 
cfcanine2cfugcdf utils
 
hs133ahsentrezgcdf utils
 
hs133bhsensgprobe R
 
hs133bhsensgprobe matchprobes
 
rn230brnensecdf utils
 
rn230rnensgcdf utils
 
hgug4110b R
 
rnex10stv1rnenseprobe R
 
rnex10stv1rnenseprobe matchprobes
 
mm430ammensg utils
 
mm74cv2mmensgprobe R
 
mm74cv2mmensgprobe matchprobes
 
mm11ksubbmmrefseqcdf utils
 
PFAM R
 
PFAM RSQLite
 
rn230rnentrezg utils
 
hs133bptenstprobe R
 
hs133bptenstprobe matchprobes
 
hgu133plus2 R
 
hs133av2hsenst utils
 
drosophila2probe R
 
drosophila2probe matchprobes
 
u133x3pcdf utils
 
hs95av2hsensgprobe R
 
hs95av2hsensgprobe matchprobes
 
hs133av2ptenst utils
 
sugarcanecdf utils
 
medicagocdf utils
 
rtu34cdf utils
 
hsfocusptensgcdf utils
 
dmdrosophila2dmensgprobe R
 
dmdrosophila2dmensgprobe matchprobes
 
rn230brnenst utils
 
rnex10stv1rnrefseqprobe R
 
rnex10stv1rnrefseqprobe matchprobes
 
hs95av2ptenstprobe R
 
hs95av2ptenstprobe matchprobes
 
hsfocusptentrezg utils
 
rnex10stv1rnugprobe R
 
rnex10stv1rnugprobe matchprobes
 
mm430ammenstprobe R
 
mm430ammenstprobe matchprobes
 
hgu133bcdf utils
 
rn34arnensecdf utils
 
hu35ksubacdf utils
 
hs133phsrefseqcdf utils
 
ggchickenggense utils
 
xenopuslaevisprobe R
 
xenopuslaevisprobe matchprobes
 
hcg110cdf utils
 
hs133ahsrefseq utils
 
mm11ksubbmmentrezgprobe R
 
mm11ksubbmmentrezgprobe matchprobes
 
hsex10stv2ptenseprobe R
 
hsex10stv2ptenseprobe matchprobes
 
mm74av1mmensecdf utils
 
rn230arnensgprobe R
 
rn230arnensgprobe matchprobes
 
rn230rnrefseq utils
 
hs133ahsugcdf utils
 
hsfocushsentrezgcdf utils
 
mu11ksubaprobe R
 
mu11ksubaprobe matchprobes
 
drzebrafishdrenstcdf utils
 
dmgenome1dmenstcdf utils
 
mm430bmmugprobe R
 
mm430bmmugprobe matchprobes
 
hsfocushsensgcdf utils
 
mm11ksubbmmensgcdf utils
 
ye6100subbcdf utils
 
mmex10stv1mmentrezgcdf utils
 
hsfocushsentrezg utils
 
canine2cdf utils
 
hs133xptentrezgcdf utils
 
hs133bhsrefseqprobe R
 
hs133bhsrefseqprobe matchprobes
 
mm74cv2mmenst utils
 
mm11ksubbmmentrezg utils
 
ecolicdf utils
 
mm74bv2mmugcdf utils
 
hsex10stv2ptentrezgcdf utils
 
rnex10stv1rnense utils
 
rnu34 R
 
vvgrapevvtigrcdf utils
 
mmex10stv1mmensgprobe R
 
mmex10stv1mmensgprobe matchprobes
 
ggchickenggensg utils
 
rnex10stv1rnentrezgprobe R
 
rnex10stv1rnentrezgprobe matchprobes
 
hsfocushsug utils
 
rn230rnense utils
 
mm74bv2mmenseprobe R
 
mm74bv2mmenseprobe matchprobes
 
rgu34aprobe R
 
rgu34aprobe matchprobes
 
hi16cod R
 
vvgrapevvtigr utils
 
mm74av2mmensgprobe R
 
mm74av2mmensgprobe matchprobes
 
rhesuscdf utils
 
zebrafishprobe R
 
zebrafishprobe matchprobes
 
hsfocushsrefseqprobe R
 
hsfocushsrefseqprobe matchprobes
 
h20kcod R
 
mgu74acdf utils
 
hu6800subacdf utils
 
rnex10stv1rnensg utils
 
hs133pptensgcdf utils
 
hs133av2ptensecdf utils
 
hu35ksubbprobe R
 
hu35ksubbprobe matchprobes
 
rnu34probe R
 
rnu34probe matchprobes
 
xenopuslaeviscdf utils
 
hs133bptenseprobe R
 
hs133bptenseprobe matchprobes
 
ptrhomology R
 
rn230rnensg utils
 
rn34arnug utils
 
rn230brnrefseqcdf utils
 
dmgenome1dmrefseq utils
 
hs133bptensgcdf utils
 
hs133pptentrezg utils
 
mm430bmmense utils
 
hgu95acdf utils
 
ath1atrefseqcdf utils
 
hs133av2ptentrezgprobe R
 
hs133av2ptentrezgprobe matchprobes
 
hs133bptentrezg utils
 
hs133xhsrefseqprobe R
 
hs133xhsrefseqprobe matchprobes
 
hs133phsensgcdf utils
 
hs133av2hsensecdf utils
 
hs95av2ptenseprobe R
 
hs95av2ptenseprobe matchprobes
 
mouse4302 R
 
rn230arnentrezgprobe R
 
rn230arnentrezgprobe matchprobes
 
mm430ammentrezgprobe R
 
mm430ammentrezgprobe matchprobes
 
mm430ammenseprobe R
 
mm430ammenseprobe matchprobes
 
hs133aptentrezgprobe R
 
hs133aptentrezgprobe matchprobes
 
hs133bhsensgcdf utils
 
hs133phsentrezg utils
 
mm74bv2mmense utils
 
rat2302probe R
 
rat2302probe matchprobes
 
hguatlas13k R
 
mouse4302probe R
 
mouse4302probe matchprobes
 
hs133bhsentrezg utils
 
mm430mmenstprobe R
 
mm430mmenstprobe matchprobes
 
atgenomeattair utils
 
mm430bmmensg utils
 
hsahomology R
 
drzebrafishdrugprobe R
 
drzebrafishdrugprobe matchprobes
 
cMAP R
 
ecoli2cdf utils
 
dmgenome1dmugprobe R
 
dmgenome1dmugprobe matchprobes
 
dmdrosophila2dmensgcdf utils
 
celegans R
 
rguatlas4k R
 
bsubtiliscdf utils
 
mm74bv2mmenstcdf utils
 
rn230arnrefseq utils
 
hs133av2hsrefseqprobe R
 
hs133av2hsrefseqprobe matchprobes
 
xtrhomology R
 
atgenomeatrefseq utils
 
hgug4111a R
 
mm430bmmrefseqprobe R
 
mm430bmmrefseqprobe matchprobes
 
hs95av2ptensecdf utils
 
ygs98cdf utils
 
hs133ahsenstprobe R
 
hs133ahsenstprobe matchprobes
 
mm74bv2mmensg utils
 
rn230brnensgcdf utils
 
hgu133plus2cdf utils
 
mmex10stv1mmenstcdf utils
 
mmex10stv1mmrefseqprobe R
 
mmex10stv1mmrefseqprobe matchprobes
 
ygs98probe R
 
ygs98probe matchprobes
 
rn230brnentrezg utils
 
hsex10stv2hsrefseqprobe R
 
hsex10stv2hsrefseqprobe matchprobes
 
rn34arnenst utils
 
agahomology R
 
hs95av2hsensecdf utils
 
mm430mmrefseqprobe R
 
mm430mmrefseqprobe matchprobes
 
mm74bv2mmentrezgprobe R
 
mm74bv2mmentrezgprobe matchprobes
 
drosgenome1 R
 
drzebrafishdrensgprobe R
 
drzebrafishdrensgprobe matchprobes
 
cfcanine2cfug utils
 
rn34arnensgcdf utils
 
hu35ksubccdf utils
 
mu19ksuba R
 
mm430bmmug utils
 
rn34arnentrezg utils
 
mm74av1mmensgcdf utils
 
hs133av2hsentrezgprobe R
 
hs133av2hsentrezgprobe matchprobes
 
mm430ammenst utils
 
u133aaofav2cdf utils
 
hsex10stv2ptensecdf utils
 
ggchickenggugcdf utils
 
mm74av1mmentrezg utils
 
mu19ksubb R
 
drzebrafishdrrefseq utils
 
ecoliprobe R
 
ecoliprobe matchprobes
 
athhomology R
 
ye6100subdcdf utils
 
hs95av2hsug utils
 
porcineprobe R
 
porcineprobe matchprobes
 
mm430ammensecdf utils
 
hs133aptentrezgcdf utils
 
mgu74a R
 
mm74bv2mmrefseq utils
 
hs133ahsentrezgprobe R
 
hs133ahsentrezgprobe matchprobes
 
mu19ksubc R
 
mm430mmenseprobe R
 
mm430mmenseprobe matchprobes
 
ath1attigrprobe R
 
ath1attigrprobe matchprobes
 
rn230rnentrezgcdf utils
 
hsex10stv2hsensecdf utils
 
mu6500subbcdf utils
 
mm74av2mmensecdf utils
 
mm74av2mmentrezgcdf utils
 
mgu74b R
 
rgu34bcdf utils
 
rae230aprobe R
 
rae230aprobe matchprobes
 
sugarcaneprobe R
 
sugarcaneprobe matchprobes
 
mm74bv2mmugprobe R
 
mm74bv2mmugprobe matchprobes
 
saureuscdf utils
 
mgu74av2probe R
 
mgu74av2probe matchprobes
 
htratfocuscdf utils
 
mm74av1mmenstprobe R
 
mm74av1mmenstprobe matchprobes
 
mm430mmensecdf utils
 
dmgenome1dmensgprobe R
 
dmgenome1dmensgprobe matchprobes
 
drzebrafishdrentrezgcdf utils
 
mgu74c R
 
mgu74ccdf utils
 
mm74cv2mmugcdf utils
 
hu6800subccdf utils
 
hs133ahsenseprobe R
 
hs133ahsenseprobe matchprobes
 
hs133xhsenstprobe R
 
hs133xhsenstprobe matchprobes
 
mmex10stv1mmugprobe R
 
mmex10stv1mmugprobe matchprobes
 
rnex10stv1rnrefseqcdf utils
 
mouse4302cdf utils
 
hs133av2ptensgcdf utils
 
paeg1aprobe R
 
paeg1aprobe matchprobes
 
hs133xptensecdf utils
 
mu19ksubacdf utils
 
hs133av2ptentrezg utils
 
hgu95ccdf utils
 
mm430bmmentrezgcdf utils
 
hvuhomology R
 
hsfocusptentrezgcdf utils
 
ath1attair utils
 
ggchickenggenst utils
 
wheatcdf utils
 
celegansprobe R
 
celegansprobe matchprobes
 
hgu95cprobe R
 
hgu95cprobe matchprobes
 
vitisviniferaprobe R
 
vitisviniferaprobe matchprobes
 
hgu95av2probe R
 
hgu95av2probe matchprobes
 
drosgenome1probe R
 
drosgenome1probe matchprobes
 
hs133av2hsensgcdf utils
 
rn230brnentrezgprobe R
 
rn230brnentrezgprobe matchprobes
 
mm430bmmentrezgprobe R
 
mm430bmmentrezgprobe matchprobes
 
hs133bptentrezgprobe R
 
hs133bptentrezgprobe matchprobes
 
rn230brnentrezgcdf utils
 
hs133xhsensecdf utils
 
hu6800 R
 
hgu133a R
 
hs133av2hsentrezg utils
 
osriceosrefseqcdf utils
 
hgfocuscdf utils
 
test2cdf utils
 
hs133aptensgprobe R
 
hs133aptensgprobe matchprobes
 
mmex10stv1mmugcdf utils
 
rn34arnenstprobe R
 
rn34arnenstprobe matchprobes
 
rnex10stv1rnenst utils
 
dmdrosophila2dmense utils
 
mm74av1mmense utils
 
mouseLLMappings R
 
rn230arnug utils
 
rn230rnenst utils
 
hgu133b R
 
KEGG R
 
mm11ksubbmmensgprobe R
 
mm11ksubbmmensgprobe matchprobes
 
mu11ksuba R
 
drzebrafishdrentrezgprobe R
 
drzebrafishdrentrezgprobe matchprobes
 
sschomology R
 
rn34arnentrezgcdf utils
 
hs95av2ptensgcdf utils
 
hsex10stv2ptentrezgprobe R
 
hsex10stv2ptentrezgprobe matchprobes
 
hs133av2hsug utils
 
mm74bv2mmrefseqcdf utils
 
hs95av2ptentrezg utils
 
hgug4112a R
 
mu11ksubb R
 
dmgenome1dmug utils
 
mgu74cv2cdf utils
 
rn34arnugcdf utils
 
dmdrosophila2dmensg utils
 
mm74av1mmensg utils
 
mm74av1mmenseprobe R
 
mm74av1mmenseprobe matchprobes
 
omyhomology R
 
hs133bhsugcdf utils
 
mm430bmmenst utils
 
hs133av2hsenstprobe R
 
hs133av2hsenstprobe matchprobes
 
hs133phsensgprobe R
 
hs133phsensgprobe matchprobes
 
hs95av2hsensgcdf utils
 
mu11ksubacdf utils
 
hs133xhsenseprobe R
 
hs133xhsenseprobe matchprobes
 
ggchickenggrefseqprobe R
 
ggchickenggrefseqprobe matchprobes
 
porcinecdf utils
 
mgug4120a R
 
mgu74bv2 R
 
u133x3pprobe R
 
u133x3pprobe matchprobes
 
mm11ksubbmmrefseqprobe R
 
mm11ksubbmmrefseqprobe matchprobes
 
hs95av2hsentrezg utils
 
hu6800probe R
 
hu6800probe matchprobes
 
hs133pptenstprobe R
 
hs133pptenstprobe matchprobes
 
mm74bv2mmrefseqprobe R
 
mm74bv2mmrefseqprobe matchprobes
 
ath1attigrcdf utils
 
mm74bv2mmenst utils
 
vitisviniferacdf utils
 
hsex10stv2ptensgcdf utils
 
LogitBoost NONE
 
codetools R
 
RGtk R
 
XML R
 
XML methods
 
SJava R
 
RMySQL R
 
RMySQL methods
 
RMySQL DBI
 
SSOAP R
 
SSOAP methods
 
SSOAP XML
 
SSOAP RCurl
 
RCurl methods
 

Latest revision as of 14:22, 6 October 2007

This graph shows the package dependencies for the BioConductor software for the statistical analysis of microarrary data in R. The dependency list was generated from the BioConductor-1.9 software repository HTML pages.

Unfortunately it is too large to be used on this webserver (due to memory limitations). A slightly shorter list (75%) would work. See also Test graph 2 ...

{{#wgraph: png | thumb=40 | nodetype * { font helvR08 } layoutalgorithm=forcedir edge gpls NONE {} edge sigPathway R {} edge TypeInfo methods {} edge Biostrings R {} edge Biostrings methods {} edge Mfuzz R {} edge Mfuzz Biobase {} edge Mfuzz e1071 {} edge LMGene R {} edge LMGene Biobase {} edge LMGene multtest {} edge LMGene survival {} edge ecolitk R {} edge ecolitk affy {} edge ecolitk ecoliLeucine {} edge ecolitk ecolicdf {} edge ecolitk Biobase {} edge maCorrPlot NONE {} edge OLINgui R {} edge OLINgui OLIN {} edge xcms R {} edge xcms methods {} edge rflowcyt R {} edge rflowcyt survival {} edge rflowcyt xtable {} edge rflowcyt stats {} edge rflowcyt KernSmooth {} edge rflowcyt MASS {} edge rflowcyt grid {} edge rflowcyt methods {} edge rflowcyt hexbin {} edge rflowcyt rfcdmin {} edge rflowcyt fields {} edge rflowcyt lattice {} edge rflowcyt locfit {} edge daMA MASS {} edge made4 ade4 {} edge made4 scatterplot3d {} edge biomaRt methods {} edge biomaRt XML {} edge biomaRt RCurl {} edge gaggle rJava {} edge gaggle graph {} edge affylmGUI limma {} edge affylmGUI tcltk {} edge affylmGUI affy {} edge affylmGUI Biobase {} edge SAGElyzer AnnBuilder {} edge SAGElyzer tkWidgets {} edge SAGElyzer genefilter {} edge SAGElyzer annotate {} edge GeneR NONE {} edge GeneSpring Biobase {} edge GeneSpring methods {} edge geneplotter annotate {} edge geneplotter Biobase {} edge geneplotter methods {} edge BioMVCClass methods {} edge BioMVCClass MVCClass {} edge BioMVCClass Biobase {} edge BioMVCClass graph {} edge BioMVCClass Rgraphviz {} edge sizepower stats {} edge PROcess Icens {} edge snapCGH limma {} edge snapCGH tilingArray {} edge snapCGH DNAcopy {} edge snapCGH aCGH {} edge snapCGH GLAD {} edge snapCGH cluster {} edge snapCGH methods {} edge bioDist methods {} edge bioDist Biobase {} edge marray limma {} edge marray methods {} edge tkWidgets methods {} edge tkWidgets widgetTools {} edge tkWidgets DynDoc {} edge rama NONE {} edge Ruuid methods {} edge arrayQuality marray {} edge arrayQuality limma {} edge arrayQuality convert {} edge arrayQuality hexbin {} edge arrayQuality gridBase {} edge arrayQuality RColorBrewer {} edge GraphAT MCMCpack {} edge GraphAT graph {} edge beadarray limma {} edge beadarray Biobase {} edge beadarray affy {} edge beadarray methods {} edge ppiStats apComplex {} edge ppiStats GO {} edge ppiStats GOstats {} edge ppiStats YEAST {} edge ppiStats graph {} edge ppiStats Rgraphviz {} edge ppiStats Category {} edge pcaMethods MASS {} edge pcaMethods ellipse {} edge pcaMethods pls {} edge pcaMethods methods {} edge GlobalAncova methods {} edge webbioc Biobase {} edge webbioc affy {} edge webbioc multtest {} edge webbioc annaffy {} edge webbioc vsn {} edge webbioc gcrma {} edge webbioc qvalue {} edge cghMCR methods {} edge cghMCR DNAcopy {} edge cghMCR marray {} edge cghMCR arrayQuality {} edge widgetInvoke methods {} edge widgetInvoke XML {} edge widgetInvoke RGtk {} edge hexbin methods {} edge hexbin grid {} edge hexbin lattice {} edge hexbin colorspace {} edge matchprobes Biobase {} edge matchprobes affy {} edge siggenes methods {} edge siggenes multtest {} edge siggenes Biobase {} edge AnnBuilder methods {} edge AnnBuilder Biobase {} edge AnnBuilder XML {} edge AnnBuilder annotate {} edge AnnBuilder utils {} edge AnnBuilder RSQLite {} edge pamr NONE {} edge RBGL graph {} edge RBGL methods {} edge biocViews methods {} edge biocViews tools {} edge biocViews graph {} edge biocViews RBGL {} edge biocViews XML {} edge CoCiteStats humanLLMappings {} edge ChromoViz RSvgDevice {} edge ChromoViz XML {} edge GOstats graph {} edge GOstats GO {} edge GOstats annotate {} edge GOstats RBGL {} edge GOstats Biobase {} edge GOstats Category {} edge GOstats methods {} edge prada Biobase {} edge prada RColorBrewer {} edge prada grid {} edge prada methods {} edge prada geneplotter {} edge bridge rama {} edge ontoTools methods {} edge ontoTools graph {} edge ontoTools SparseM {} edge ontoTools GO {} edge ontoTools Biobase {} edge ontoTools annotate {} edge MCRestimate e1071 {} edge MCRestimate pamr {} edge MCRestimate randomForest {} edge MCRestimate RColorBrewer {} edge MCRestimate Biobase {} edge MCRestimate golubEsets {} edge aroma.light R.oo {} edge pkgDepTools methods {} edge pkgDepTools graph {} edge pkgDepTools RBGL {} edge MeasurementError.cor NONE {} edge logicFS LogicReg {} edge copa Biobase {} edge copa methods {} edge Category Biobase {} edge Category KEGG {} edge Category GO {} edge Category graph {} edge Category annotate {} edge Category methods {} edge Category genefilter {} edge Harshlight affy {} edge OrderedList Biobase {} edge OrderedList twilight {} edge MVCClass methods {} edge panp affy {} edge LPE NONE {} edge MANOR GLAD {} edge RbcBook1 Biobase {} edge vsn Biobase {} edge iSPlot methods {} edge iSPlot RGtk {} edge iSPlot gtkDevice {} edge iSPlot MVCClass {} edge pickgene MASS {} edge makecdfenv methods {} edge makecdfenv Biobase {} edge makecdfenv affy {} edge makecdfenv utils {} edge makecdfenv affyio {} edge aCGH cluster {} edge aCGH survival {} edge aCGH multtest {} edge aCGH sma {} edge KEGGSOAP methods {} edge KEGGSOAP XML {} edge KEGGSOAP SSOAP {} edge KEGGSOAP RCurl {} edge annotate methods {} edge annotate Biobase {} edge limma methods {} edge timecourse limma {} edge timecourse MASS {} edge timecourse Biobase {} edge timecourse methods {} edge nem e1071 {} edge nem graph {} edge nem Rgraphviz {} edge nem RBGL {} edge HEM Biobase {} edge SBMLR XML {} edge SBMLR odesolve {} edge MLInterfaces Biobase {} edge MLInterfaces methods {} edge MLInterfaces genefilter {} edge weaver digest {} edge weaver tools {} edge weaver utils {} edge weaver codetools {} edge goTools Biobase {} edge goTools annotate {} edge goTools GO {} edge applera Biobase {} edge applera methods {} edge applera affy {} edge applera genefilter {} edge applera limma {} edge applera geneplotter {} edge applera RColorBrewer {} edge applera prada {} edge applera combinat {} edge annaffy methods {} edge annaffy Biobase {} edge annaffy GO {} edge annaffy KEGG {} edge spotSegmentation mclust {} edge geneRecommender Biobase {} edge codelink methods {} edge codelink limma {} edge codelink annotate {} edge widgetTools methods {} edge widgetTools utils {} edge splots grid {} edge RSNPper methods {} edge RSNPper utils {} edge RSNPper tools {} edge RSNPper XML {} edge GeneMeta methods {} edge GeneMeta Biobase {} edge GeneMeta genefilter {} edge GEOquery methods {} edge globaltest methods {} edge globaltest graphics {} edge globaltest multtest {} edge pathRender graph {} edge pathRender Rgraphviz {} edge pathRender cMAP {} edge convert Biobase {} edge convert limma {} edge convert marray {} edge convert utils {} edge convert methods {} edge stam GO {} edge stam Biobase {} edge stam pamr {} edge stam cluster {} edge stam annaffy {} edge stam methods {} edge BSgenome methods {} edge BSgenome Biostrings {} edge pdmclass Biobase {} edge pdmclass fibroEset {} edge pdmclass mda {} edge cellHTS prada {} edge cellHTS RColorBrewer {} edge cellHTS Biobase {} edge cellHTS genefilter {} edge metaArray MergeMaid {} edge EBImage methods {} edge arrayQCplot RGtk2 {} edge arrayQCplot cairoDevice {} edge arrayQCplot LPE {} edge hopach cluster {} edge hopach Biobase {} edge DNAcopy NONE {} edge ssize gdata {} edge ssize xtable {} edge apComplex graph {} edge tilingArray methods {} edge tilingArray Biobase {} edge tilingArray affy {} edge tilingArray RColorBrewer {} edge tilingArray grid {} edge tilingArray strucchange {} edge tilingArray vsn {} edge tilingArray genefilter {} edge tilingArray geneplotter {} edge tilingArray pixmap {} edge RMAPPER methods {} edge splicegear methods {} edge splicegear utils {} edge splicegear grid {} edge splicegear Biobase {} edge splicegear XML {} edge splicegear annotate {} edge gff3Plotter methods {} edge mmgmos methods {} edge mmgmos Biobase {} edge mmgmos affy {} edge plgem Biobase {} edge plgem MASS {} edge DEDS methods {} edge pgUtils Rdbi {} edge pgUtils RdbiPgSQL {} edge pgUtils methods {} edge hypergraph methods {} edge hypergraph graph {} edge arrayMagic methods {} edge arrayMagic utils {} edge arrayMagic Biobase {} edge arrayMagic vsn {} edge arrayMagic limma {} edge arrayMagic genefilter {} edge nudge stats {} edge sscore affy {} edge sscore affxparser {} edge simulatorAPMS graph {} edge simulatorAPMS apComplex {} edge simulatorAPMS Rgraphviz {} edge simulatorAPMS ScISI {} edge simulatorAPMS ppiStats {} edge affy Biobase {} edge affy methods {} edge affy utils {} edge affy affyio {} edge OCplus akima {} edge OCplus multtest {} edge diffGeneAnalysis minpack.lm {} edge macat Biobase {} edge macat annotate {} edge idiogram methods {} edge idiogram Biobase {} edge idiogram annotate {} edge pcot2 grDevices {} edge pcot2 Biobase {} edge pcot2 amap {} edge iSNetwork methods {} edge iSNetwork graph {} edge iSNetwork Rgraphviz {} edge iSNetwork RGtk {} edge iSNetwork gtkDevice {} edge iSNetwork BioMVCClass {} edge iSNetwork MVCClass {} edge iSNetwork Biobase {} edge iSNetwork annotate {} edge affyPLM affy {} edge affyPLM affydata {} edge affyPLM Biobase {} edge affyPLM methods {} edge affyPLM gcrma {} edge spikeLI utils {} edge genefilter methods {} edge genefilter Biobase {} edge genefilter survival {} edge altcdfenvs methods {} edge altcdfenvs Biobase {} edge altcdfenvs affy {} edge altcdfenvs matchprobes {} edge altcdfenvs makecdfenv {} edge OLIN methods {} edge OLIN stats {} edge OLIN locfit {} edge OLIN Biobase {} edge OLIN marray {} edge beadarraySNP methods {} edge beadarraySNP Biobase {} edge beadarraySNP limma {} edge beadarraySNP quantsmooth {} edge Heatplus NONE {} edge GeneTS GeneCycle {} edge GeneTS GeneNet {} edge safe methods {} edge safe Biobase {} edge Rgraphviz methods {} edge Rgraphviz graph {} edge Rgraphviz geneplotter {} edge RdbiPgSQL Rdbi {} edge twilight splines {} edge twilight stats {} edge GeneTraffic Biobase {} edge GeneTraffic affy {} edge GeneTraffic marray {} edge GeneTraffic SSOAP {} edge GeneTraffic XML {} edge GeneTraffic digest {} edge GeneTraffic methods {} edge simpleaffy affy {} edge simpleaffy genefilter {} edge maSigPro Biobase {} edge Icens survival {} edge Rredland methods {} edge Rredland graph {} edge graph methods {} edge nnNorm nnet {} edge nnNorm marray {} edge genArise locfit {} edge genArise tkrplot {} edge genArise xtable {} edge genArise methods {} edge EBarrays Biobase {} edge EBarrays methods {} edge EBarrays utils {} edge EBarrays lattice {} edge reb Biobase {} edge reb idiogram {} edge SAGx stats {} edge SAGx multtest {} edge SAGx sma {} edge SAGx methods {} edge RMAGEML marray {} edge RMAGEML limma {} edge RMAGEML Biobase {} edge affyio methods {} edge edd methods {} edge edd golubEsets {} edge edd Biobase {} edge edd class {} edge edd nnet {} edge edd xtable {} edge maDB Biobase {} edge maDB affy {} edge maDB limma {} edge maDB methods {} edge DynDoc methods {} edge DynDoc tools {} edge BeadExplorer methods {} edge BeadExplorer widgetTools {} edge BeadExplorer affy {} edge BeadExplorer R2HTML {} edge BeadExplorer grDevices {} edge BeadExplorer tkWidgets {} edge affycoretools affy {} edge affycoretools limma {} edge affycoretools GOstats {} edge affycoretools biomaRt {} edge limmaGUI limma {} edge limmaGUI tcltk {} edge ABarray Biobase {} edge ABarray multtest {} edge GGtools methods {} edge GGtools Biobase {} edge GGtools hgfocus {} edge GGtools geneplotter {} edge Biobase tools {} edge Biobase methods {} edge Biobase utils {} edge factDesign Biobase {} edge factDesign affy {} edge factDesign stats {} edge sagenhaft SparseM {} edge ROC utils {} edge ROC methods {} edge bim stats {} edge bim qtl {} edge gcrma Biobase {} edge gcrma affy {} edge gcrma matchprobes {} edge gcrma splines {} edge adSplit methods {} edge adSplit stats {} edge adSplit cluster {} edge adSplit multtest {} edge adSplit Biobase {} edge adSplit affy {} edge adSplit GO {} edge adSplit KEGG {} edge Resourcerer AnnBuilder {} edge MergeMaid survival {} edge MergeMaid Biobase {} edge MergeMaid MASS {} edge MergeMaid methods {} edge plier affy {} edge quantsmooth quantreg {} edge quantsmooth lodplot {} edge affycomp Biobase {} edge stepNorm marray {} edge stepNorm MASS {} edge stepNorm methods {} edge clusterStab Biobase {} edge clusterStab methods {} edge affyQCReport Biobase {} edge affyQCReport affy {} edge affyQCReport simpleaffy {} edge affypdnn affy {} edge affypdnn affydata {} edge affypdnn hgu95av2probe {} edge affydata affy {} edge pairseqsim methods {} edge pairseqsim stats {} edge fdrame NONE {} edge ScISI methods {} edge ScISI apComplex {} edge ScISI GO {} edge ScISI GOstats {} edge ScISI graph {} edge ScISI RBGL {} edge ScISI Rgraphviz {} edge ScISI YEAST {} edge ScISI xtable {} edge multtest methods {} edge multtest Biobase {} edge multtest survival {} edge ctc NONE {} edge yeastExpData graph {} edge golubEsets Biobase {} edge estrogen affy {} edge MAQCsubset Biobase {} edge fibroEset Biobase {} edge HEEBOdata NONE {} edge facsDorit prada {} edge Iyer517 Biobase {} edge stjudem utils {} edge ProData Biobase {} edge SpikeIn affy {} edge ALL Biobase {} edge AmpAffyExample affy {} edge kidpack Biobase {} edge CLL affy {} edge CLL Biobase {} edge SpikeInSubset Biobase {} edge SpikeInSubset affy {} edge gaschYHS Biobase {} edge ALLMLL affy {} edge bronchialIL13 affy {} edge beta7 marray {} edge lungExpression Biobase {} edge HIVcDNAvantWout03 NONE {} edge yeastCC Biobase {} edge harbChIP Biobase {} edge ppiData Rgraphviz {} edge ppiData graph {} edge colonCA Biobase {} edge SNAData graph {} edge ecoliLeucine affy {} edge davidTiling Biobase {} edge davidTiling tilingArray {} edge davidTiling GO {} edge MEEBOdata NONE {} edge GGdata Biobase {} edge GGdata hgfocus {} edge rn230rnentrezgprobe matchprobes {} edge rn230brnrefseqprobe matchprobes {} edge dmgenome1dmense utils {} edge medicagoprobe matchprobes {} edge dmgenome1dmugcdf utils {} edge hsex10stv2ptentrezg utils {} edge caninecdf utils {} edge mm430ammensgcdf utils {} edge mm430ammrefseqcdf utils {} edge hsfocushsenstprobe matchprobes {} edge hs133bhsentrezgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrugcdf utils {} edge mm430ammentrezg utils {} edge hgu133bprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmentrezgprobe matchprobes {} edge rn34arnenseprobe matchprobes {} edge soybeancdf utils {} edge hs133xptensgprobe matchprobes {} edge rtu34probe matchprobes {} edge hsex10stv2hsensgcdf utils {} edge rnex10stv1rnensecdf utils {} edge mm11ksubbmmentrezgcdf utils {} edge mu6500subdcdf utils {} edge mm74av2mmensgcdf utils {} edge mm74bv2mmentrezgcdf utils {} edge rn230rnenstprobe matchprobes {} edge hs95av2hsrefseq utils {} edge hsex10stv2hsentrezg utils {} edge mm430bmmenstprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsense utils {} edge mm74av2mmentrezg utils {} edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 methods {} edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 Biostrings {} edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 BSgenome {} edge dmgenome1dmensg utils {} edge mm430bmmensecdf utils {} edge mm430mmensgcdf utils {} edge hu35ksubaprobe matchprobes {} edge rn230brnensgprobe matchprobes {} edge hsex10stv2ptense utils {} edge osriceostigrprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsentrezgprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfenstprobe matchprobes {} edge mm430mmentrezg utils {} edge mm74av1mmrefseqprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnrefseq utils {} edge atgenomeattaircdf utils {} edge hs133xptensgcdf utils {} edge mu19ksubccdf utils {} edge hgu95ecdf utils {} edge atgenomeatrefseqcdf utils {} edge hs133phsrefseqprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsensg utils {} edge hs133xptentrezg utils {} edge saureusprobe matchprobes {} edge hs133av2hsenseprobe matchprobes {} edge rhesusprobe matchprobes {} edge mm74av2mmense utils {} edge mm11ksubammenstcdf utils {} edge mmex10stv1mmrefseq utils {} edge cfcanine2cfentrezgcdf utils {} edge ggchickenggenstprobe matchprobes {} edge cyp450cdf utils {} edge hsex10stv2ptensg utils {} edge hs133pptenseprobe matchprobes {} edge hs133xhsensgcdf utils {} edge poplarcdf utils {} edge dmdrosophila2dmrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2hsrefseqprobe matchprobes {} edge hs133xhsentrezg utils {} edge mm11ksubammugcdf utils {} edge mm74av2mmensg utils {} edge hsex10stv2hsenstprobe matchprobes {} edge mgu74cprobe matchprobes {} edge hsfocushsenseprobe matchprobes {} edge hs133bhsentrezgcdf utils {} edge mmex10stv1mmense utils {} edge mm11ksubammenstprobe matchprobes {} edge hs133av2ptensgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrense utils {} edge mm430mmrefseqcdf utils {} edge cfcanine2cfenstcdf utils {} edge hs133aptenstcdf utils {} edge rn230rnenseprobe matchprobes {} edge mm430bmmenseprobe matchprobes {} edge mm74av1mmug utils {} edge bovinecdf utils {} edge drzebrafishdrensecdf utils {} edge dmgenome1dmensecdf utils {} edge rae230bcdf utils {} edge hu6800cdf utils {} edge ath1attairprobe matchprobes {} edge canineprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmensg utils {} edge hs133ahsrefseqcdf utils {} edge cfcanine2cfenseprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnugcdf utils {} edge mm74av2mmrefseq utils {} edge hs133ahsenstcdf utils {} edge mm430mmrefseq utils {} edge drzebrafishdrensg utils {} edge ggchickenggenstcdf utils {} edge mm74cv2mmenstcdf utils {} edge hsfocusptensgprobe matchprobes {} edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 methods {} edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 Biostrings {} edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 BSgenome {} edge hs133bhsenstprobe matchprobes {} edge mm11ksubammugprobe matchprobes {} edge ggchickenggenseprobe matchprobes {} edge mm430mmense utils {} edge mm74cv2mmenstprobe matchprobes {} edge dmdrosophila2dmenst utils {} edge tomatocdf utils {} edge mm74av1mmenst utils {} edge mgu74bv2probe matchprobes {} edge rn230arnenstcdf utils {} edge hgu133acdf utils {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 methods {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 Biostrings {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 BSgenome {} edge hs95av2hsenstprobe matchprobes {} edge atgenomeattigrprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfense utils {} edge rnex10stv1rnensgcdf utils {} edge mm74cv2mmentrezgcdf utils {} edge hs133ahsense utils {} edge dmdrosophila2dmenstprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsenseprobe matchprobes {} edge hsfocusptentrezgprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnentrezg utils {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 methods {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 Biostrings {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 BSgenome {} edge moe430bcdf utils {} edge rnex10stv1rnensgprobe matchprobes {} edge mm430mmentrezgprobe matchprobes {} edge ye6100subacdf utils {} edge mm430mmensg utils {} edge hs133xhsug utils {} edge mm11ksubammenseprobe matchprobes {} edge chickencdf utils {} edge mm430bmmensgcdf utils {} edge hs133aptense utils {} edge rn230rnenstcdf utils {} edge rn230arnenstprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfrefseq utils {} edge mm430bmmentrezg utils {} edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 methods {} edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 Biostrings {} edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 BSgenome {} edge cfcanine2cfugprobe matchprobes {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 methods {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 Biostrings {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 BSgenome {} edge hs133phsug utils {} edge zebrafishcdf utils {} edge rat2302cdf utils {} edge moe430bprobe matchprobes {} edge rn230rnugcdf utils {} edge cfcanine2cfensg utils {} edge hgu95bprobe matchprobes {} edge yeast2cdf utils {} edge hgu133plus2probe matchprobes {} edge hs133ahsensg utils {} edge mm74av1mmrefseqcdf utils {} edge mmex10stv1mmenstprobe matchprobes {} edge hsfocusptenstcdf utils {} edge mm74bv2mmensecdf utils {} edge rn230brnug utils {} edge hs133xhsrefseqcdf utils {} edge hs133aptensg utils {} edge hgu133a2probe matchprobes {} edge citrusprobe matchprobes {} edge hs133ahsugprobe matchprobes {} edge hsex10stv2ptensgprobe matchprobes {} edge ggchickenggugprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmugprobe matchprobes {} edge dmgenome1dmenst utils {} edge rn34arnentrezgprobe matchprobes {} edge mm74av2mmenstprobe matchprobes {} edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 methods {} edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 Biostrings {} edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 BSgenome {} edge mmex10stv1mmensecdf utils {} edge hs133bhsenseprobe matchprobes {} edge hsfocushsenstcdf utils {} edge mm74cv2mmentrezgprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmenstcdf utils {} edge mm74cv2mmenseprobe matchprobes {} edge hs133xhsense utils {} edge dmdrosophila2dmug utils {} edge mm74bv2mmensgprobe matchprobes {} edge rgu34cprobe matchprobes {} edge rn230arnugprobe matchprobes {} edge hs133xptense utils {} edge hsex10stv2hsenst utils {} edge hs95av2hsenseprobe matchprobes {} edge mgu74bv2cdf utils {} edge rn34arnrefseqcdf utils {} edge hsex10stv2ptenst utils {} edge dmdrosophila2dmenseprobe matchprobes {} edge hthgu133acdf utils {} edge agprobe matchprobes {} edge hsfocushsentrezgprobe matchprobes {} edge hs133xhsensg utils {} edge drzebrafishdrensgcdf utils {} edge dmgenome1dmensgcdf utils {} edge hu35ksubdprobe matchprobes {} edge hs133bptensgprobe matchprobes {} edge rn230rnugprobe matchprobes {} edge maizeprobe matchprobes {} edge rn230arnenseprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrentrezg utils {} edge hs133xptensg utils {} edge hs133pptenstcdf utils {} edge mm74av2mmenst utils {} edge vvgrapevvtigrprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsugcdf utils {} edge hs133bptenstcdf utils {} edge paeg1acdf utils {} edge mm11ksubammug utils {} edge mm430ammugcdf utils {} edge ggchickenggrefseq utils {} edge hs95av2ptensgprobe matchprobes {} edge hs133av2hsrefseqcdf utils {} edge mmex10stv1mmenseprobe matchprobes {} edge mm430ammensgprobe matchprobes {} edge hs133ahsrefseqprobe matchprobes {} edge hs133bhsense utils {} edge hs133phsenstcdf utils {} edge hs133bptentrezgcdf utils {} edge hgu133aprobe matchprobes {} edge hs133bhsenstcdf utils {} edge dmdrosophila2dmrefseq utils {} edge hs133bptense utils {} edge mm74av2mmenseprobe matchprobes {} edge mm11ksubammense utils {} edge hu35ksubbcdf utils {} edge mmex10stv1mmenst utils {} edge dmdrosophila2dmenstcdf utils {} edge hsfocushsugprobe matchprobes {} edge atgenomeattigr utils {} edge hgu133atagcdf utils {} edge mm11ksubbmmugprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrenst utils {} edge hgu133a2cdf utils {} edge drzebrafishdrenstprobe matchprobes {} edge hs133phsentrezgcdf utils {} edge hs95av2hsugcdf utils {} edge hs133bhsensg utils {} edge hs95av2hsentrezgcdf utils {} edge ye6100subccdf utils {} edge rn34arnrefseqprobe matchprobes {} edge hsfocushsrefseqcdf utils {} edge hsex10stv2hsug utils {} edge rn230brnenstcdf utils {} edge hs133phsense utils {} edge hs133bptensg utils {} edge mm11ksubammensg utils {} edge rn230rnrefseqcdf utils {} edge mu6500subacdf utils {} edge hs133pptense utils {} edge tomatoprobe matchprobes {} edge rgu34acdf utils {} edge mm430bmmrefseqcdf utils {} edge osriceosrefseqprobe matchprobes {} edge dmdrosophila2dmugcdf utils {} edge bovineprobe matchprobes {} edge hgu95av2cdf utils {} edge mm74bv2mmensgcdf utils {} edge mm11ksubbmmugcdf utils {} edge mgu74bcdf utils {} edge mm74av1mmugcdf utils {} edge cfcanine2cfrefseqcdf utils {} edge hu6800subbcdf utils {} edge hs133phsensg utils {} edge rn34arnenstcdf utils {} edge mm74bv2mmentrezg utils {} edge mm74av1mmentrezgprobe matchprobes {} edge mm430mmenst utils {} edge hsfocushsugcdf utils {} edge test3probe matchprobes {} edge soybeanprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmensgcdf utils {} edge hs133pptensg utils {} edge mm74av1mmenstcdf utils {} edge dmgenome1dmenstprobe matchprobes {} edge hgu95bcdf utils {} edge mgu74bprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmentrezg utils {} edge hs133xhsugcdf utils {} edge hs133phsugprobe matchprobes {} edge ggchickenggrefseqcdf utils {} edge cfcanine2cfenst utils {} edge mm430ammrefseqprobe matchprobes {} edge mm74av2mmug utils {} edge mm430mmensgprobe matchprobes {} edge hs133phsugcdf utils {} edge hs133bhsugprobe matchprobes {} edge hs133ahsenst utils {} edge rnex10stv1rnentrezgcdf utils {} edge hs133ahsug utils {} edge dmdrosophila2dmugprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmrefseq utils {} edge hs133aptenst utils {} edge hs133av2hsentrezgcdf utils {} edge test1cdf utils {} edge rn230arnugcdf utils {} edge maizecdf utils {} edge plasmodiumanophelesprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrenseprobe matchprobes {} edge hs133ahsensgprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsrefseqcdf utils {} edge rn34arnrefseq utils {} edge mm74av1mmrefseq utils {} edge gp53cdf utils {} edge mm11ksubammrefseqcdf utils {} edge ecoliasv2probe matchprobes {} edge rn230brnugprobe matchprobes {} edge hs133aptenstprobe matchprobes {} edge atgenomeattairprobe matchprobes {} edge hs133av2ptenstcdf utils {} edge mgu74cv2probe matchprobes {} edge hs95av2hsense utils {} edge ggchickenggug utils {} edge hgu95eprobe matchprobes {} edge hs133pptentrezgprobe matchprobes {} edge canine2probe matchprobes {} edge mm11ksubbmmense utils {} edge hsfocushsense utils {} edge mm11ksubbmmenstprobe matchprobes {} edge rn230arnense utils {} edge hs95av2ptense utils {} edge ath1attigr utils {} edge yeast2probe matchprobes {} edge mm430bmmrefseq utils {} edge hsfocusptense utils {} edge hs133av2hsenstcdf utils {} edge agcdf utils {} edge rn34arnugprobe matchprobes {} edge hs133xhsenst utils {} edge hs95av2hsensg utils {} edge hu35ksubdcdf utils {} edge mm74av1mmugprobe matchprobes {} edge dmgenome1dmenseprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmensg utils {} edge hs133xptenst utils {} edge hsfocushsensg utils {} edge cfcanine2cfrefseqprobe matchprobes {} edge hs133phsenstprobe matchprobes {} edge hs133bhsrefseqcdf utils {} edge rn230arnensg utils {} edge hs95av2ptensg utils {} edge mm430mmug utils {} edge mm74cv2mmrefseqcdf utils {} edge ath1121501cdf utils {} edge hsfocusptensg utils {} edge ricecdf utils {} edge mm11ksubammensecdf utils {} edge wheatprobe matchprobes {} edge hs133av2hsugcdf utils {} edge drosophila2cdf utils {} edge moe430aprobe matchprobes {} edge hs95av2ptenstcdf utils {} edge hs95av2hsrefseqcdf utils {} edge hgu95aprobe matchprobes {} edge atgenomeattigrcdf utils {} edge barley1probe matchprobes {} edge mm74av1mmensgprobe matchprobes {} edge mu6500subccdf utils {} edge dmdrosophila2dmrefseqcdf utils {} edge dmgenome1dmrefseqprobe matchprobes {} edge rgu34ccdf utils {} edge hs133xhsensgprobe matchprobes {} edge hsfocushsrefseq utils {} edge hcg110probe matchprobes {} edge hs95av2hsenstcdf utils {} edge mm430mmentrezgcdf utils {} edge hs133bhsrefseq utils {} edge hs133aptenseprobe matchprobes {} edge rn230rnrefseqprobe matchprobes {} edge hs133xptenstprobe matchprobes {} edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 methods {} edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 Biostrings {} edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 BSgenome {} edge mu11ksubbprobe matchprobes {} edge rn230arnrefseqcdf utils {} edge osriceosrefseq utils {} edge hu6800subdcdf utils {} edge mm74bv2mmug utils {} edge ecoliasv2cdf utils {} edge hs133bhsenst utils {} edge mm74av2mmentrezgprobe matchprobes {} edge hivprtplus2cdf utils {} edge hs133phsentrezgprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmenseprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfensecdf utils {} edge hs133xptentrezgprobe matchprobes {} edge mm74av1mmentrezgcdf utils {} edge hs133aptensecdf utils {} edge hs133bptenst utils {} edge mu19ksubbcdf utils {} edge rn230brnenstprobe matchprobes {} edge mm11ksubammenst utils {} edge hsex10stv2ptenstcdf utils {} edge hgu95dcdf utils {} edge mmex10stv1mmrefseqcdf utils {} edge mm74cv2mmrefseqprobe matchprobes {} edge rgu34bprobe matchprobes {} edge hs133av2hsugprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrug utils {} edge hs133pptentrezgcdf utils {} edge hs95av2ptentrezgcdf utils {} edge mm430mmugcdf utils {} edge mm430ammenstcdf utils {} edge rn34arnensgprobe matchprobes {} edge mgu74av2cdf utils {} edge ath1121501probe matchprobes {} edge rn230rnug utils {} edge osriceostigr utils {} edge citruscdf utils {} edge mm74av2mmrefseqcdf utils {} edge hs133av2hsense utils {} edge hs133ahsensecdf utils {} edge hs133phsenseprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsenstcdf utils {} edge ggchickenggensecdf utils {} edge mm74av2mmenstcdf utils {} edge mm74cv2mmensecdf utils {} edge test3cdf utils {} edge ath1atrefseq utils {} edge hs133av2ptense utils {} edge hs133phsenst utils {} edge mm74av2mmrefseqprobe matchprobes {} edge mm430ammentrezgcdf utils {} edge hu35ksubcprobe matchprobes {} edge rn230brnense utils {} edge hs133pptenst utils {} edge mm11ksubbmmug utils {} edge mm430bmmugcdf utils {} edge mm430mmenstcdf utils {} edge mm11ksubammrefseqprobe matchprobes {} edge chickenprobe matchprobes {} edge hs133av2hsensg utils {} edge rn230arnentrezgcdf utils {} edge atgenomeatrefseqprobe matchprobes {} edge poplarprobe matchprobes {} edge rn230arnensecdf utils {} edge hs133av2hsensgprobe matchprobes {} edge plasmodiumanophelescdf utils {} edge hs133xptenstcdf utils {} edge hs133av2ptensg utils {} edge bsubtilisprobe matchprobes {} edge rn230arnrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2hsugprobe matchprobes {} edge hs133av2ptenstprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmense utils {} edge hs133pptensgprobe matchprobes {} edge rn230brnensg utils {} edge hs133xptenseprobe matchprobes {} edge rae230acdf utils {} edge mu11ksubbcdf utils {} edge hs133xhsentrezgcdf utils {} edge mouse430a2cdf utils {} edge hgfocusprobe matchprobes {} edge hs133xhsenstcdf utils {} edge drosgenome1cdf utils {} edge hsex10stv2hsentrezgcdf utils {} edge rn230rnensecdf utils {} edge rn230brnrefseq utils {} edge cfcanine2cfentrezgprobe matchprobes {} edge hs133av2ptentrezgcdf utils {} edge hs133xhsentrezgprobe matchprobes {} edge rn230brnenseprobe matchprobes {} edge hsfocushsensgprobe matchprobes {} edge hs133av2hsrefseq utils {} edge mm74cv2mmensg utils {} edge mm430ammugprobe matchprobes {} edge hsfocusptenstprobe matchprobes {} edge mm11ksubammensgcdf utils {} edge hsfocusptensecdf utils {} edge hsex10stv2hsrefseq utils {} edge rn230rnensgprobe matchprobes {} edge hs133xhsrefseq utils {} edge mm430bmmensgprobe matchprobes {} edge mm11ksubammentrezg utils {} edge hsex10stv2hsugprobe matchprobes {} edge ath1atrefseqprobe matchprobes {} edge mm74av2mmugprobe matchprobes {} edge mm74av2mmugcdf utils {} edge rnu34cdf utils {} edge mm74cv2mmug utils {} edge osriceostigrcdf utils {} edge mm11ksubammentrezgprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmug utils {} edge hs95av2ptentrezgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrrefseqcdf utils {} edge cfcanine2cfensgprobe matchprobes {} edge hs95av2hsenst utils {} edge hsfocushsensecdf utils {} edge ath1attaircdf utils {} edge mm430mmugprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmenst utils {} edge moe430acdf utils {} edge hsfocushsenst utils {} edge mm11ksubbmmensecdf utils {} edge rn230arnenst utils {} edge hs95av2ptenst utils {} edge hsfocusptenst utils {} edge mm430ammug utils {} edge mgu74aprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnenstprobe matchprobes {} edge ggchickenggensgprobe matchprobes {} edge hs133bhsug utils {} edge mm11ksubammentrezgcdf utils {} edge cfcanine2cfensgcdf utils {} edge hs133av2ptenseprobe matchprobes {} edge hs133aptensgcdf utils {} edge cfcanine2cfentrezg utils {} edge rn230brnugcdf utils {} edge hs133aptentrezg utils {} edge mm11ksubammrefseq utils {} edge rae230bprobe matchprobes {} edge mouse430a2probe matchprobes {} edge hs133xhsugprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmrefseq utils {} edge hgu133atagprobe matchprobes {} edge hs133pptensecdf utils {} edge hsex10stv2hsensgprobe matchprobes {} edge rn34arnense utils {} edge hs133ahsensgcdf utils {} edge dmgenome1dmrefseqcdf utils {} edge rnex10stv1rnenstcdf utils {} edge ggchickenggensgcdf utils {} edge mm74cv2mmensgcdf utils {} edge hs133bptensecdf utils {} edge rnex10stv1rnug utils {} edge drzebrafishdrrefseqprobe matchprobes {} edge mm11ksubammensgprobe matchprobes {} edge hs133ahsentrezg utils {} edge hs133phsrefseq utils {} edge riceprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmentrezg utils {} edge hsex10stv2ptenstprobe matchprobes {} edge hsfocusptenseprobe matchprobes {} edge mm430bmmenstcdf utils {} edge barley1cdf utils {} edge hs133phsensecdf utils {} edge hgu95dprobe matchprobes {} edge celeganscdf utils {} edge hs133bhsensecdf utils {} edge rn34arnensg utils {} edge mm430ammense utils {} edge mm430ammrefseq utils {} edge rn230arnensgcdf utils {} edge hs95av2hsentrezgprobe matchprobes {} edge dmdrosophila2dmensecdf utils {} edge rn230arnentrezg utils {} edge mm74bv2mmenstprobe matchprobes {} edge ecoli2probe matchprobes {} edge cfcanine2cfugcdf utils {} edge hs133ahsentrezgcdf utils {} edge hs133bhsensgprobe matchprobes {} edge rn230brnensecdf utils {} edge rn230rnensgcdf utils {} edge rnex10stv1rnenseprobe matchprobes {} edge mm430ammensg utils {} edge mm74cv2mmensgprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmrefseqcdf utils {} edge PFAM RSQLite {} edge rn230rnentrezg utils {} edge hs133bptenstprobe matchprobes {} edge hs133av2hsenst utils {} edge drosophila2probe matchprobes {} edge u133x3pcdf utils {} edge hs95av2hsensgprobe matchprobes {} edge hs133av2ptenst utils {} edge sugarcanecdf utils {} edge medicagocdf utils {} edge rtu34cdf utils {} edge hsfocusptensgcdf utils {} edge dmdrosophila2dmensgprobe matchprobes {} edge rn230brnenst utils {} edge rnex10stv1rnrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2ptenstprobe matchprobes {} edge hsfocusptentrezg utils {} edge rnex10stv1rnugprobe matchprobes {} edge mm430ammenstprobe matchprobes {} edge hgu133bcdf utils {} edge rn34arnensecdf utils {} edge hu35ksubacdf utils {} edge hs133phsrefseqcdf utils {} edge ggchickenggense utils {} edge xenopuslaevisprobe matchprobes {} edge hcg110cdf utils {} edge hs133ahsrefseq utils {} edge mm11ksubbmmentrezgprobe matchprobes {} edge hsex10stv2ptenseprobe matchprobes {} edge mm74av1mmensecdf utils {} edge rn230arnensgprobe matchprobes {} edge rn230rnrefseq utils {} edge hs133ahsugcdf utils {} edge hsfocushsentrezgcdf utils {} edge mu11ksubaprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrenstcdf utils {} edge dmgenome1dmenstcdf utils {} edge mm430bmmugprobe matchprobes {} edge hsfocushsensgcdf utils {} edge mm11ksubbmmensgcdf utils {} edge ye6100subbcdf utils {} edge mmex10stv1mmentrezgcdf utils {} edge hsfocushsentrezg utils {} edge canine2cdf utils {} edge hs133xptentrezgcdf utils {} edge hs133bhsrefseqprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmenst utils {} edge mm11ksubbmmentrezg utils {} edge ecolicdf utils {} edge mm74bv2mmugcdf utils {} edge hsex10stv2ptentrezgcdf utils {} edge rnex10stv1rnense utils {} edge vvgrapevvtigrcdf utils {} edge mmex10stv1mmensgprobe matchprobes {} edge ggchickenggensg utils {} edge rnex10stv1rnentrezgprobe matchprobes {} edge hsfocushsug utils {} edge rn230rnense utils {} edge mm74bv2mmenseprobe matchprobes {} edge rgu34aprobe matchprobes {} edge vvgrapevvtigr utils {} edge mm74av2mmensgprobe matchprobes {} edge rhesuscdf utils {} edge zebrafishprobe matchprobes {} edge hsfocushsrefseqprobe matchprobes {} edge mgu74acdf utils {} edge hu6800subacdf utils {} edge rnex10stv1rnensg utils {} edge hs133pptensgcdf utils {} edge hs133av2ptensecdf utils {} edge hu35ksubbprobe matchprobes {} edge rnu34probe matchprobes {} edge xenopuslaeviscdf utils {} edge hs133bptenseprobe matchprobes {} edge rn230rnensg utils {} edge rn34arnug utils {} edge rn230brnrefseqcdf utils {} edge dmgenome1dmrefseq utils {} edge hs133bptensgcdf utils {} edge hs133pptentrezg utils {} edge mm430bmmense utils {} edge hgu95acdf utils {} edge ath1atrefseqcdf utils {} edge hs133av2ptentrezgprobe matchprobes {} edge hs133bptentrezg utils {} edge hs133xhsrefseqprobe matchprobes {} edge hs133phsensgcdf utils {} edge hs133av2hsensecdf utils {} edge hs95av2ptenseprobe matchprobes {} edge rn230arnentrezgprobe matchprobes {} edge mm430ammentrezgprobe matchprobes {} edge mm430ammenseprobe matchprobes {} edge hs133aptentrezgprobe matchprobes {} edge hs133bhsensgcdf utils {} edge hs133phsentrezg utils {} edge mm74bv2mmense utils {} edge rat2302probe matchprobes {} edge mouse4302probe matchprobes {} edge hs133bhsentrezg utils {} edge mm430mmenstprobe matchprobes {} edge atgenomeattair utils {} edge mm430bmmensg utils {} edge drzebrafishdrugprobe matchprobes {} edge ecoli2cdf utils {} edge dmgenome1dmugprobe matchprobes {} edge dmdrosophila2dmensgcdf utils {} edge bsubtiliscdf utils {} edge mm74bv2mmenstcdf utils {} edge rn230arnrefseq utils {} edge hs133av2hsrefseqprobe matchprobes {} edge atgenomeatrefseq utils {} edge mm430bmmrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2ptensecdf utils {} edge ygs98cdf utils {} edge hs133ahsenstprobe matchprobes {} edge mm74bv2mmensg utils {} edge rn230brnensgcdf utils {} edge hgu133plus2cdf utils {} edge mmex10stv1mmenstcdf utils {} edge mmex10stv1mmrefseqprobe matchprobes {} edge ygs98probe matchprobes {} edge rn230brnentrezg utils {} edge hsex10stv2hsrefseqprobe matchprobes {} edge rn34arnenst utils {} edge hs95av2hsensecdf utils {} edge mm430mmrefseqprobe matchprobes {} edge mm74bv2mmentrezgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrensgprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfug utils {} edge rn34arnensgcdf utils {} edge hu35ksubccdf utils {} edge mm430bmmug utils {} edge rn34arnentrezg utils {} edge mm74av1mmensgcdf utils {} edge hs133av2hsentrezgprobe matchprobes {} edge mm430ammenst utils {} edge u133aaofav2cdf utils {} edge hsex10stv2ptensecdf utils {} edge ggchickenggugcdf utils {} edge mm74av1mmentrezg utils {} edge drzebrafishdrrefseq utils {} edge ecoliprobe matchprobes {} edge ye6100subdcdf utils {} edge hs95av2hsug utils {} edge porcineprobe matchprobes {} edge mm430ammensecdf utils {} edge hs133aptentrezgcdf utils {} edge mm74bv2mmrefseq utils {} edge hs133ahsentrezgprobe matchprobes {} edge mm430mmenseprobe matchprobes {} edge ath1attigrprobe matchprobes {} edge rn230rnentrezgcdf utils {} edge hsex10stv2hsensecdf utils {} edge mu6500subbcdf utils {} edge mm74av2mmensecdf utils {} edge mm74av2mmentrezgcdf utils {} edge rgu34bcdf utils {} edge rae230aprobe matchprobes {} edge sugarcaneprobe matchprobes {} edge mm74bv2mmugprobe matchprobes {} edge saureuscdf utils {} edge mgu74av2probe matchprobes {} edge htratfocuscdf utils {} edge mm74av1mmenstprobe matchprobes {} edge mm430mmensecdf utils {} edge dmgenome1dmensgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrentrezgcdf utils {} edge mgu74ccdf utils {} edge mm74cv2mmugcdf utils {} edge hu6800subccdf utils {} edge hs133ahsenseprobe matchprobes {} edge hs133xhsenstprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmugprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnrefseqcdf utils {} edge mouse4302cdf utils {} edge hs133av2ptensgcdf utils {} edge paeg1aprobe matchprobes {} edge hs133xptensecdf utils {} edge mu19ksubacdf utils {} edge hs133av2ptentrezg utils {} edge hgu95ccdf utils {} edge mm430bmmentrezgcdf utils {} edge hsfocusptentrezgcdf utils {} edge ath1attair utils {} edge ggchickenggenst utils {} edge wheatcdf utils {} edge celegansprobe matchprobes {} edge hgu95cprobe matchprobes {} edge vitisviniferaprobe matchprobes {} edge hgu95av2probe matchprobes {} edge drosgenome1probe matchprobes {} edge hs133av2hsensgcdf utils {} edge rn230brnentrezgprobe matchprobes {} edge mm430bmmentrezgprobe matchprobes {} edge hs133bptentrezgprobe matchprobes {} edge rn230brnentrezgcdf utils {} edge hs133xhsensecdf utils {} edge hs133av2hsentrezg utils {} edge osriceosrefseqcdf utils {} edge hgfocuscdf utils {} edge test2cdf utils {} edge hs133aptensgprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmugcdf utils {} edge rn34arnenstprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnenst utils {} edge dmdrosophila2dmense utils {} edge mm74av1mmense utils {} edge rn230arnug utils {} edge rn230rnenst utils {} edge mm11ksubbmmensgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrentrezgprobe matchprobes {} edge rn34arnentrezgcdf utils {} edge hs95av2ptensgcdf utils {} edge hsex10stv2ptentrezgprobe matchprobes {} edge hs133av2hsug utils {} edge mm74bv2mmrefseqcdf utils {} edge hs95av2ptentrezg utils {} edge dmgenome1dmug utils {} edge mgu74cv2cdf utils {} edge rn34arnugcdf utils {} edge dmdrosophila2dmensg utils {} edge mm74av1mmensg utils {} edge mm74av1mmenseprobe matchprobes {} edge hs133bhsugcdf utils {} edge mm430bmmenst utils {} edge hs133av2hsenstprobe matchprobes {} edge hs133phsensgprobe matchprobes {} edge hs95av2hsensgcdf utils {} edge mu11ksubacdf utils {} edge hs133xhsenseprobe matchprobes {} edge ggchickenggrefseqprobe matchprobes {} edge porcinecdf utils {} edge u133x3pprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2hsentrezg utils {} edge hu6800probe matchprobes {} edge hs133pptenstprobe matchprobes {} edge mm74bv2mmrefseqprobe matchprobes {} edge ath1attigrcdf utils {} edge mm74bv2mmenst utils {} edge vitisviniferacdf utils {} edge hsex10stv2ptensgcdf utils {} edge LogitBoost NONE {} edge XML methods {} edge RMySQL methods {} edge RMySQL DBI {} edge SSOAP methods {} edge SSOAP XML {} edge SSOAP RCurl {} edge RCurl methods {} }}