Difference between revisions of "Test graph - BioConductor package dependancies"

Revision as of 19:35, 26 September 2007

See also Test graph 2 ...

{{#wgraph: png | thumb=40 | layoutalgorithm=forcedir edge gpls NONE {} edge sigPathway R {} edge TypeInfo methods {} edge Biostrings R {} edge Biostrings methods {} edge Mfuzz R {} edge Mfuzz Biobase {} edge Mfuzz e1071 {} edge LMGene R {} edge LMGene Biobase {} edge LMGene multtest {} edge LMGene survival {} edge ecolitk R {} edge ecolitk affy {} edge ecolitk ecoliLeucine {} edge ecolitk ecolicdf {} edge ecolitk Biobase {} edge maCorrPlot NONE {} edge OLINgui R {} edge OLINgui OLIN {} edge xcms R {} edge xcms methods {} edge rflowcyt R {} edge rflowcyt survival {} edge rflowcyt xtable {} edge rflowcyt stats {} edge rflowcyt KernSmooth {} edge rflowcyt MASS {} edge rflowcyt grid {} edge rflowcyt methods {} edge rflowcyt hexbin {} edge rflowcyt rfcdmin {} edge rflowcyt fields {} edge rflowcyt lattice {} edge rflowcyt locfit {} edge daMA MASS {} edge made4 ade4 {} edge made4 scatterplot3d {} edge biomaRt methods {} edge biomaRt XML {} edge biomaRt RCurl {} edge gaggle R {} edge gaggle rJava {} edge gaggle graph {} edge affylmGUI limma {} edge affylmGUI tcltk {} edge affylmGUI affy {} edge affylmGUI Biobase {} edge SAGElyzer R {} edge SAGElyzer AnnBuilder {} edge SAGElyzer tkWidgets {} edge SAGElyzer genefilter {} edge SAGElyzer annotate {} edge GeneR NONE {} edge GeneSpring R {} edge GeneSpring Biobase {} edge GeneSpring methods {} edge geneplotter R {} edge geneplotter annotate {} edge geneplotter Biobase {} edge geneplotter methods {} edge Rdbi R {} edge BioMVCClass R {} edge BioMVCClass methods {} edge BioMVCClass MVCClass {} edge BioMVCClass Biobase {} edge BioMVCClass graph {} edge BioMVCClass Rgraphviz {} edge sizepower stats {} edge PROcess Icens {} edge snapCGH limma {} edge snapCGH tilingArray {} edge snapCGH DNAcopy {} edge snapCGH aCGH {} edge snapCGH GLAD {} edge snapCGH cluster {} edge snapCGH methods {} edge bioDist R {} edge bioDist methods {} edge bioDist Biobase {} edge marray R {} edge marray limma {} edge marray methods {} edge tkWidgets R {} edge tkWidgets methods {} edge tkWidgets widgetTools {} edge tkWidgets DynDoc {} edge rama NONE {} edge Ruuid R {} edge Ruuid methods {} edge arrayQuality R {} edge arrayQuality marray {} edge arrayQuality limma {} edge arrayQuality convert {} edge arrayQuality hexbin {} edge arrayQuality gridBase {} edge arrayQuality RColorBrewer {} edge GraphAT MCMCpack {} edge GraphAT graph {} edge beadarray limma {} edge beadarray Biobase {} edge beadarray affy {} edge beadarray methods {} edge ppiStats apComplex {} edge ppiStats GO {} edge ppiStats GOstats {} edge ppiStats YEAST {} edge ppiStats graph {} edge ppiStats Rgraphviz {} edge ppiStats Category {} edge pcaMethods R {} edge pcaMethods MASS {} edge pcaMethods ellipse {} edge pcaMethods pls {} edge pcaMethods methods {} edge RankProd R {} edge GlobalAncova methods {} edge webbioc R {} edge webbioc Biobase {} edge webbioc affy {} edge webbioc multtest {} edge webbioc annaffy {} edge webbioc vsn {} edge webbioc gcrma {} edge webbioc qvalue {} edge cghMCR methods {} edge cghMCR DNAcopy {} edge cghMCR marray {} edge cghMCR arrayQuality {} edge widgetInvoke methods {} edge widgetInvoke XML {} edge widgetInvoke RGtk {} edge hexbin R {} edge hexbin methods {} edge hexbin grid {} edge hexbin lattice {} edge hexbin colorspace {} edge matchprobes R {} edge matchprobes Biobase {} edge matchprobes affy {} edge siggenes methods {} edge siggenes multtest {} edge siggenes Biobase {} edge AnnBuilder R {} edge AnnBuilder methods {} edge AnnBuilder Biobase {} edge AnnBuilder XML {} edge AnnBuilder annotate {} edge AnnBuilder utils {} edge AnnBuilder RSQLite {} edge pamr NONE {} edge RBGL graph {} edge RBGL methods {} edge biocViews R {} edge biocViews methods {} edge biocViews tools {} edge biocViews graph {} edge biocViews RBGL {} edge biocViews XML {} edge CoCiteStats R {} edge CoCiteStats humanLLMappings {} edge ChromoViz RSvgDevice {} edge ChromoViz XML {} edge GOstats graph {} edge GOstats GO {} edge GOstats annotate {} edge GOstats RBGL {} edge GOstats Biobase {} edge GOstats Category {} edge GOstats methods {} edge prada R {} edge prada Biobase {} edge prada RColorBrewer {} edge prada grid {} edge prada methods {} edge prada geneplotter {} edge bridge R {} edge bridge rama {} edge affxparser R {} edge ontoTools R {} edge ontoTools methods {} edge ontoTools graph {} edge ontoTools SparseM {} edge ontoTools GO {} edge ontoTools Biobase {} edge ontoTools annotate {} edge MCRestimate R {} edge MCRestimate e1071 {} edge MCRestimate pamr {} edge MCRestimate randomForest {} edge MCRestimate RColorBrewer {} edge MCRestimate Biobase {} edge MCRestimate golubEsets {} edge aroma.light R.oo {} edge pkgDepTools methods {} edge pkgDepTools graph {} edge pkgDepTools RBGL {} edge MeasurementError.cor NONE {} edge lapmix R {} edge logicFS LogicReg {} edge impute R {} edge copa Biobase {} edge copa methods {} edge Category Biobase {} edge Category KEGG {} edge Category GO {} edge Category graph {} edge Category annotate {} edge Category methods {} edge Category genefilter {} edge Harshlight R {} edge Harshlight affy {} edge OrderedList R {} edge OrderedList Biobase {} edge OrderedList twilight {} edge MVCClass R {} edge MVCClass methods {} edge panp affy {} edge LPE NONE {} edge MANOR R {} edge MANOR GLAD {} edge RbcBook1 Biobase {} edge vsn R {} edge vsn Biobase {} edge iSPlot R {} edge iSPlot methods {} edge iSPlot RGtk {} edge iSPlot gtkDevice {} edge iSPlot MVCClass {} edge pickgene MASS {} edge makecdfenv R {} edge makecdfenv methods {} edge makecdfenv Biobase {} edge makecdfenv affy {} edge makecdfenv utils {} edge makecdfenv affyio {} edge aCGH R {} edge aCGH cluster {} edge aCGH survival {} edge aCGH multtest {} edge aCGH sma {} edge KEGGSOAP methods {} edge KEGGSOAP XML {} edge KEGGSOAP SSOAP {} edge KEGGSOAP RCurl {} edge annotate R {} edge annotate methods {} edge annotate Biobase {} edge limma R {} edge limma methods {} edge timecourse R {} edge timecourse limma {} edge timecourse MASS {} edge timecourse Biobase {} edge timecourse methods {} edge qvalue R {} edge nem R {} edge nem e1071 {} edge nem graph {} edge nem Rgraphviz {} edge nem RBGL {} edge HEM R {} edge HEM Biobase {} edge SBMLR XML {} edge SBMLR odesolve {} edge MLInterfaces R {} edge MLInterfaces Biobase {} edge MLInterfaces methods {} edge MLInterfaces genefilter {} edge weaver R {} edge weaver digest {} edge weaver tools {} edge weaver utils {} edge weaver codetools {} edge goTools Biobase {} edge goTools annotate {} edge goTools GO {} edge applera R {} edge applera Biobase {} edge applera methods {} edge applera affy {} edge applera genefilter {} edge applera limma {} edge applera geneplotter {} edge applera RColorBrewer {} edge applera prada {} edge applera combinat {} edge annaffy R {} edge annaffy methods {} edge annaffy Biobase {} edge annaffy GO {} edge annaffy KEGG {} edge spotSegmentation R {} edge spotSegmentation mclust {} edge geneRecommender R {} edge geneRecommender Biobase {} edge codelink R {} edge codelink methods {} edge codelink limma {} edge codelink annotate {} edge widgetTools R {} edge widgetTools methods {} edge widgetTools utils {} edge splots R {} edge splots grid {} edge RSNPper methods {} edge RSNPper utils {} edge RSNPper tools {} edge RSNPper XML {} edge GeneMeta R {} edge GeneMeta methods {} edge GeneMeta Biobase {} edge GeneMeta genefilter {} edge GEOquery methods {} edge globaltest R {} edge globaltest methods {} edge globaltest graphics {} edge globaltest multtest {} edge pathRender graph {} edge pathRender Rgraphviz {} edge pathRender cMAP {} edge convert R {} edge convert Biobase {} edge convert limma {} edge convert marray {} edge convert utils {} edge convert methods {} edge MantelCorr R {} edge stam R {} edge stam GO {} edge stam Biobase {} edge stam pamr {} edge stam cluster {} edge stam annaffy {} edge stam methods {} edge BSgenome R {} edge BSgenome methods {} edge BSgenome Biostrings {} edge pdmclass Biobase {} edge pdmclass R {} edge pdmclass fibroEset {} edge pdmclass mda {} edge cellHTS R {} edge cellHTS prada {} edge cellHTS RColorBrewer {} edge cellHTS Biobase {} edge cellHTS genefilter {} edge metaArray MergeMaid {} edge EBImage R {} edge EBImage methods {} edge arrayQCplot RGtk2 {} edge arrayQCplot cairoDevice {} edge arrayQCplot LPE {} edge hopach R {} edge hopach cluster {} edge hopach Biobase {} edge DNAcopy NONE {} edge ssize gdata {} edge ssize xtable {} edge apComplex graph {} edge tilingArray R {} edge tilingArray methods {} edge tilingArray Biobase {} edge tilingArray affy {} edge tilingArray RColorBrewer {} edge tilingArray grid {} edge tilingArray strucchange {} edge tilingArray vsn {} edge tilingArray genefilter {} edge tilingArray geneplotter {} edge tilingArray pixmap {} edge RMAPPER methods {} edge splicegear R {} edge splicegear methods {} edge splicegear utils {} edge splicegear grid {} edge splicegear Biobase {} edge splicegear XML {} edge splicegear annotate {} edge gff3Plotter R {} edge gff3Plotter methods {} edge mmgmos R {} edge mmgmos methods {} edge mmgmos Biobase {} edge mmgmos affy {} edge plgem R {} edge plgem Biobase {} edge plgem MASS {} edge DEDS R {} edge DEDS methods {} edge pgUtils R {} edge pgUtils Rdbi {} edge pgUtils RdbiPgSQL {} edge pgUtils methods {} edge hypergraph R {} edge hypergraph methods {} edge hypergraph graph {} edge arrayMagic R {} edge arrayMagic methods {} edge arrayMagic utils {} edge arrayMagic Biobase {} edge arrayMagic vsn {} edge arrayMagic limma {} edge arrayMagic genefilter {} edge nudge stats {} edge sscore R {} edge sscore affy {} edge sscore affxparser {} edge simulatorAPMS graph {} edge simulatorAPMS apComplex {} edge simulatorAPMS Rgraphviz {} edge simulatorAPMS ScISI {} edge simulatorAPMS ppiStats {} edge affy R {} edge affy Biobase {} edge affy methods {} edge affy utils {} edge affy affyio {} edge OCplus R {} edge OCplus akima {} edge OCplus multtest {} edge diffGeneAnalysis minpack.lm {} edge macat Biobase {} edge macat annotate {} edge idiogram R {} edge idiogram methods {} edge idiogram Biobase {} edge idiogram annotate {} edge pcot2 R {} edge pcot2 grDevices {} edge pcot2 Biobase {} edge pcot2 amap {} edge iSNetwork R {} edge iSNetwork methods {} edge iSNetwork graph {} edge iSNetwork Rgraphviz {} edge iSNetwork RGtk {} edge iSNetwork gtkDevice {} edge iSNetwork BioMVCClass {} edge iSNetwork MVCClass {} edge iSNetwork Biobase {} edge iSNetwork annotate {} edge affyPLM R {} edge affyPLM affy {} edge affyPLM affydata {} edge affyPLM Biobase {} edge affyPLM methods {} edge affyPLM gcrma {} edge spikeLI utils {} edge genefilter R {} edge genefilter methods {} edge genefilter Biobase {} edge genefilter survival {} edge altcdfenvs R {} edge altcdfenvs methods {} edge altcdfenvs Biobase {} edge altcdfenvs affy {} edge altcdfenvs matchprobes {} edge altcdfenvs makecdfenv {} edge OLIN R {} edge OLIN methods {} edge OLIN stats {} edge OLIN locfit {} edge OLIN Biobase {} edge OLIN marray {} edge beadarraySNP methods {} edge beadarraySNP Biobase {} edge beadarraySNP limma {} edge beadarraySNP quantsmooth {} edge Heatplus NONE {} edge GeneTS R {} edge GeneTS GeneCycle {} edge GeneTS GeneNet {} edge safe R {} edge safe methods {} edge safe Biobase {} edge Rgraphviz R {} edge Rgraphviz methods {} edge Rgraphviz graph {} edge Rgraphviz geneplotter {} edge RdbiPgSQL R {} edge RdbiPgSQL Rdbi {} edge twilight R {} edge twilight splines {} edge twilight stats {} edge GeneTraffic R {} edge GeneTraffic Biobase {} edge GeneTraffic affy {} edge GeneTraffic marray {} edge GeneTraffic SSOAP {} edge GeneTraffic XML {} edge GeneTraffic digest {} edge GeneTraffic methods {} edge simpleaffy R {} edge simpleaffy affy {} edge simpleaffy genefilter {} edge maSigPro R {} edge maSigPro Biobase {} edge Icens survival {} edge Rredland methods {} edge Rredland graph {} edge graph R {} edge graph methods {} edge nnNorm R {} edge nnNorm nnet {} edge nnNorm marray {} edge genArise R {} edge genArise locfit {} edge genArise tkrplot {} edge genArise xtable {} edge genArise methods {} edge EBarrays R {} edge EBarrays Biobase {} edge EBarrays methods {} edge EBarrays utils {} edge EBarrays lattice {} edge reb R {} edge reb Biobase {} edge reb idiogram {} edge SAGx R {} edge SAGx stats {} edge SAGx multtest {} edge SAGx sma {} edge SAGx methods {} edge maanova R {} edge RMAGEML marray {} edge RMAGEML limma {} edge RMAGEML Biobase {} edge affyio methods {} edge edd methods {} edge edd golubEsets {} edge edd Biobase {} edge edd class {} edge edd nnet {} edge edd xtable {} edge maDB R {} edge maDB Biobase {} edge maDB affy {} edge maDB limma {} edge maDB methods {} edge DynDoc methods {} edge DynDoc tools {} edge BeadExplorer R {} edge BeadExplorer methods {} edge BeadExplorer widgetTools {} edge BeadExplorer affy {} edge BeadExplorer R2HTML {} edge BeadExplorer grDevices {} edge BeadExplorer tkWidgets {} edge affycoretools affy {} edge affycoretools limma {} edge affycoretools GOstats {} edge affycoretools biomaRt {} edge limmaGUI limma {} edge limmaGUI tcltk {} edge ABarray Biobase {} edge ABarray multtest {} edge GGtools R {} edge GGtools methods {} edge GGtools Biobase {} edge GGtools hgfocus {} edge GGtools geneplotter {} edge Biobase R {} edge Biobase tools {} edge Biobase methods {} edge Biobase utils {} edge factDesign Biobase {} edge factDesign affy {} edge factDesign stats {} edge sagenhaft R {} edge sagenhaft SparseM {} edge ROC R {} edge ROC utils {} edge ROC methods {} edge bim stats {} edge bim qtl {} edge gcrma R {} edge gcrma Biobase {} edge gcrma affy {} edge gcrma matchprobes {} edge gcrma splines {} edge adSplit R {} edge adSplit methods {} edge adSplit stats {} edge adSplit cluster {} edge adSplit multtest {} edge adSplit Biobase {} edge adSplit affy {} edge adSplit GO {} edge adSplit KEGG {} edge Resourcerer R {} edge Resourcerer AnnBuilder {} edge GLAD R {} edge MergeMaid R {} edge MergeMaid survival {} edge MergeMaid Biobase {} edge MergeMaid MASS {} edge MergeMaid methods {} edge plier R {} edge plier affy {} edge quantsmooth quantreg {} edge quantsmooth lodplot {} edge affycomp R {} edge affycomp Biobase {} edge stepNorm R {} edge stepNorm marray {} edge stepNorm MASS {} edge stepNorm methods {} edge clusterStab Biobase {} edge clusterStab R {} edge clusterStab methods {} edge affyQCReport R {} edge affyQCReport Biobase {} edge affyQCReport affy {} edge affyQCReport simpleaffy {} edge affypdnn R {} edge affypdnn affy {} edge affypdnn affydata {} edge affypdnn hgu95av2probe {} edge affydata R {} edge affydata affy {} edge pairseqsim methods {} edge pairseqsim stats {} edge fdrame NONE {} edge ScISI methods {} edge ScISI apComplex {} edge ScISI GO {} edge ScISI GOstats {} edge ScISI graph {} edge ScISI RBGL {} edge ScISI Rgraphviz {} edge ScISI YEAST {} edge ScISI xtable {} edge multtest R {} edge multtest methods {} edge multtest Biobase {} edge multtest survival {} edge ctc NONE {} edge yeastExpData R {} edge yeastExpData graph {} edge golubEsets Biobase {} edge estrogen R {} edge estrogen affy {} edge MAQCsubset Biobase {} edge fibroEset Biobase {} edge HEEBOdata NONE {} edge facsDorit R {} edge facsDorit prada {} edge Iyer517 Biobase {} edge stjudem R {} edge stjudem utils {} edge ProData R {} edge ProData Biobase {} edge SpikeIn R {} edge SpikeIn affy {} edge ALL Biobase {} edge faahKO R {} edge AmpAffyExample R {} edge AmpAffyExample affy {} edge rfcdmin R {} edge hgu2beta7 R {} edge kidpack R {} edge kidpack Biobase {} edge CLL R {} edge CLL affy {} edge CLL Biobase {} edge SpikeInSubset R {} edge SpikeInSubset Biobase {} edge SpikeInSubset affy {} edge gaschYHS Biobase {} edge ALLMLL R {} edge ALLMLL affy {} edge bronchialIL13 affy {} edge beta7 R {} edge beta7 marray {} edge lungExpression R {} edge lungExpression Biobase {} edge HIVcDNAvantWout03 NONE {} edge yeastCC Biobase {} edge harbChIP Biobase {} edge ppiData Rgraphviz {} edge ppiData graph {} edge lymphoma R {} edge colonCA Biobase {} edge SNAData R {} edge SNAData graph {} edge ecoliLeucine R {} edge ecoliLeucine affy {} edge davidTiling R {} edge davidTiling Biobase {} edge davidTiling tilingArray {} edge davidTiling GO {} edge MEEBOdata NONE {} edge GGdata R {} edge GGdata Biobase {} edge GGdata hgfocus {} edge rn230rnentrezgprobe R {} edge rn230rnentrezgprobe matchprobes {} edge rn230brnrefseqprobe R {} edge rn230brnrefseqprobe matchprobes {} edge dmgenome1dmense utils {} edge medicagoprobe R {} edge medicagoprobe matchprobes {} edge dmgenome1dmugcdf utils {} edge hsex10stv2ptentrezg utils {} edge caninecdf utils {} edge mm430ammensgcdf utils {} edge mm430ammrefseqcdf utils {} edge hsfocushsenstprobe R {} edge hsfocushsenstprobe matchprobes {} edge ath1121501 R {} edge hs133bhsentrezgprobe R {} edge hs133bhsentrezgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrugcdf utils {} edge mm430ammentrezg utils {} edge hgu133bprobe R {} edge hgu133bprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmentrezgprobe R {} edge mmex10stv1mmentrezgprobe matchprobes {} edge rn34arnenseprobe R {} edge rn34arnenseprobe matchprobes {} edge soybeancdf utils {} edge hs133xptensgprobe R {} edge hs133xptensgprobe matchprobes {} edge rgug4105a R {} edge rtu34probe R {} edge rtu34probe matchprobes {} edge hsex10stv2hsensgcdf utils {} edge rnex10stv1rnensecdf utils {} edge mm11ksubbmmentrezgcdf utils {} edge mu6500subdcdf utils {} edge mm74av2mmensgcdf utils {} edge mm74bv2mmentrezgcdf utils {} edge rn230rnenstprobe R {} edge rn230rnenstprobe matchprobes {} edge h10kcod R {} edge hs95av2hsrefseq utils {} edge hsex10stv2hsentrezg utils {} edge mm430bmmenstprobe R {} edge mm430bmmenstprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsense utils {} edge mm74av2mmentrezg utils {} edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 R {} edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 methods {} edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 Biostrings {} edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 BSgenome {} edge dmgenome1dmensg utils {} edge rgu34a R {} edge mm430bmmensecdf utils {} edge dmehomology R {} edge mm430mmensgcdf utils {} edge hu35ksubaprobe R {} edge hu35ksubaprobe matchprobes {} edge rn230brnensgprobe R {} edge rn230brnensgprobe matchprobes {} edge hsex10stv2ptense utils {} edge osriceostigrprobe R {} edge osriceostigrprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsentrezgprobe R {} edge hsex10stv2hsentrezgprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfenstprobe R {} edge cfcanine2cfenstprobe matchprobes {} edge mm430mmentrezg utils {} edge mm74av1mmrefseqprobe R {} edge mm74av1mmrefseqprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnrefseq utils {} edge atgenomeattaircdf utils {} edge zmahomology R {} edge rgu34b R {} edge hs133xptensgcdf utils {} edge mu19ksubccdf utils {} edge hgu95ecdf utils {} edge atgenomeatrefseqcdf utils {} edge hs133phsrefseqprobe R {} edge hs133phsrefseqprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsensg utils {} edge hs133xptentrezg utils {} edge saureusprobe R {} edge saureusprobe matchprobes {} edge hs133av2hsenseprobe R {} edge hs133av2hsenseprobe matchprobes {} edge rhesusprobe R {} edge rhesusprobe matchprobes {} edge mm74av2mmense utils {} edge mm11ksubammenstcdf utils {} edge hguqiagenv3 R {} edge rgu34c R {} edge mmex10stv1mmrefseq utils {} edge cfcanine2cfentrezgcdf utils {} edge ggchickenggenstprobe R {} edge ggchickenggenstprobe matchprobes {} edge cyp450cdf utils {} edge hsex10stv2ptensg utils {} edge hs133pptenseprobe R {} edge hs133pptenseprobe matchprobes {} edge hs133xhsensgcdf utils {} edge poplarcdf utils {} edge dmdrosophila2dmrefseqprobe R {} edge dmdrosophila2dmrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2hsrefseqprobe R {} edge hs95av2hsrefseqprobe matchprobes {} edge hs133xhsentrezg utils {} edge hgug4100a R {} edge mm11ksubammugcdf utils {} edge mm74av2mmensg utils {} edge rgug4130a R {} edge hsex10stv2hsenstprobe R {} edge hsex10stv2hsenstprobe matchprobes {} edge mgu74cprobe R {} edge mgu74cprobe matchprobes {} edge mwgcod R {} edge hsfocushsenseprobe R {} edge hsfocushsenseprobe matchprobes {} edge mm24kresogen R {} edge hs133bhsentrezgcdf utils {} edge mmex10stv1mmense utils {} edge mm11ksubammenstprobe R {} edge mm11ksubammenstprobe matchprobes {} edge hs133av2ptensgprobe R {} edge hs133av2ptensgprobe matchprobes {} edge osahomology R {} edge drzebrafishdrense utils {} edge mm430mmrefseqcdf utils {} edge cfcanine2cfenstcdf utils {} edge hs133aptenstcdf utils {} edge rn230rnenseprobe R {} edge rn230rnenseprobe matchprobes {} edge mm430bmmenseprobe R {} edge mm430bmmenseprobe matchprobes {} edge mm74av1mmug utils {} edge bovinecdf utils {} edge drzebrafishdrensecdf utils {} edge dmgenome1dmensecdf utils {} edge rae230bcdf utils {} edge hu6800cdf utils {} edge ath1attairprobe R {} edge ath1attairprobe matchprobes {} edge canineprobe R {} edge canineprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmensg utils {} edge hs133ahsrefseqcdf utils {} edge cfcanine2cfenseprobe R {} edge cfcanine2cfenseprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnugcdf utils {} edge mm74av2mmrefseq utils {} edge hs133ahsenstcdf utils {} edge mm430mmrefseq utils {} edge drzebrafishdrensg utils {} edge ggchickenggenstcdf utils {} edge mm74cv2mmenstcdf utils {} edge zebrafish R {} edge hsfocusptensgprobe R {} edge hsfocusptensgprobe matchprobes {} edge mgug4121a R {} edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 R {} edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 methods {} edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 Biostrings {} edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 BSgenome {} edge scehomology R {} edge hs133bhsenstprobe R {} edge hs133bhsenstprobe matchprobes {} edge mm11ksubammugprobe R {} edge mm11ksubammugprobe matchprobes {} edge ggchickenggenseprobe R {} edge ggchickenggenseprobe matchprobes {} edge mm430mmense utils {} edge mm74cv2mmenstprobe R {} edge mm74cv2mmenstprobe matchprobes {} edge dmdrosophila2dmenst utils {} edge tomatocdf utils {} edge mm74av1mmenst utils {} edge mgu74bv2probe R {} edge mgu74bv2probe matchprobes {} edge rn230arnenstcdf utils {} edge hgu133acdf utils {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 R {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 methods {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 Biostrings {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 BSgenome {} edge hs95av2hsenstprobe R {} edge hs95av2hsenstprobe matchprobes {} edge vvihomology R {} edge atgenomeattigrprobe R {} edge atgenomeattigrprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfense utils {} edge rnex10stv1rnensgcdf utils {} edge mm74cv2mmentrezgcdf utils {} edge hs133ahsense utils {} edge rae230a R {} edge dmdrosophila2dmenstprobe R {} edge dmdrosophila2dmenstprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsenseprobe R {} edge hsex10stv2hsenseprobe matchprobes {} edge hsfocusptentrezgprobe R {} edge hsfocusptentrezgprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnentrezg utils {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 R {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 methods {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 Biostrings {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 BSgenome {} edge moe430bcdf utils {} edge rnex10stv1rnensgprobe R {} edge rnex10stv1rnensgprobe matchprobes {} edge mm430mmentrezgprobe R {} edge mm430mmentrezgprobe matchprobes {} edge ye6100subacdf utils {} edge mm430mmensg utils {} edge hs133xhsug utils {} edge mm11ksubammenseprobe R {} edge mm11ksubammenseprobe matchprobes {} edge chickencdf utils {} edge mm430bmmensgcdf utils {} edge hs133aptense utils {} edge rn230rnenstcdf utils {} edge rn230arnenstprobe R {} edge rn230arnenstprobe matchprobes {} edge rae230b R {} edge cfcanine2cfrefseq utils {} edge hs25kresogen R {} edge mm430bmmentrezg utils {} edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 R {} edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 methods {} edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 Biostrings {} edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 BSgenome {} edge cfcanine2cfugprobe R {} edge cfcanine2cfugprobe matchprobes {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 R {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 methods {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 Biostrings {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 BSgenome {} edge hs133phsug utils {} edge zebrafishcdf utils {} edge rat2302cdf utils {} edge moe430bprobe R {} edge moe430bprobe matchprobes {} edge rn230rnugcdf utils {} edge cfcanine2cfensg utils {} edge hgu95bprobe R {} edge hgu95bprobe matchprobes {} edge yeast2cdf utils {} edge hgu133plus2probe R {} edge hgu133plus2probe matchprobes {} edge hs133ahsensg utils {} edge mm74av1mmrefseqcdf utils {} edge mmex10stv1mmenstprobe R {} edge mmex10stv1mmenstprobe matchprobes {} edge celhomology R {} edge cfahomology R {} edge hsfocusptenstcdf utils {} edge klahomology R {} edge mm74bv2mmensecdf utils {} edge rn230brnug utils {} edge hs133xhsrefseqcdf utils {} edge hs133aptensg utils {} edge hgu133a2probe R {} edge hgu133a2probe matchprobes {} edge citrusprobe R {} edge citrusprobe matchprobes {} edge hs133ahsugprobe R {} edge hs133ahsugprobe matchprobes {} edge hsex10stv2ptensgprobe R {} edge hsex10stv2ptensgprobe matchprobes {} edge ggchickenggugprobe R {} edge ggchickenggugprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmugprobe R {} edge mm74cv2mmugprobe matchprobes {} edge dmgenome1dmenst utils {} edge rn34arnentrezgprobe R {} edge rn34arnentrezgprobe matchprobes {} edge hgu95av2 R {} edge mm74av2mmenstprobe R {} edge mm74av2mmenstprobe matchprobes {} edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 R {} edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 methods {} edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 Biostrings {} edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 BSgenome {} edge mmex10stv1mmensecdf utils {} edge hs133bhsenseprobe R {} edge hs133bhsenseprobe matchprobes {} edge hsfocushsenstcdf utils {} edge mm74cv2mmentrezgprobe R {} edge mm74cv2mmentrezgprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmenstcdf utils {} edge mm74cv2mmenseprobe R {} edge mm74cv2mmenseprobe matchprobes {} edge hs133xhsense utils {} edge ratLLMappings R {} edge dmdrosophila2dmug utils {} edge hgug4101a R {} edge mm74bv2mmensgprobe R {} edge mm74bv2mmensgprobe matchprobes {} edge rgu34cprobe R {} edge rgu34cprobe matchprobes {} edge rn230arnugprobe R {} edge rn230arnugprobe matchprobes {} edge hs133xptense utils {} edge hsex10stv2hsenst utils {} edge hs95av2hsenseprobe R {} edge hs95av2hsenseprobe matchprobes {} edge mgu74bv2cdf utils {} edge rn34arnrefseqcdf utils {} edge hsex10stv2ptenst utils {} edge ygs98 R {} edge dmdrosophila2dmenseprobe R {} edge dmdrosophila2dmenseprobe matchprobes {} edge hthgu133acdf utils {} edge agprobe R {} edge agprobe matchprobes {} edge hsfocushsentrezgprobe R {} edge hsfocushsentrezgprobe matchprobes {} edge hs133xhsensg utils {} edge drzebrafishdrensgcdf utils {} edge dmgenome1dmensgcdf utils {} edge hu35ksubdprobe R {} edge hu35ksubdprobe matchprobes {} edge egohomology R {} edge hs133bptensgprobe R {} edge hs133bptensgprobe matchprobes {} edge rtu34 R {} edge rn230rnugprobe R {} edge rn230rnugprobe matchprobes {} edge maizeprobe R {} edge maizeprobe matchprobes {} edge rn230arnenseprobe R {} edge rn230arnenseprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrentrezg utils {} edge hs133xptensg utils {} edge hs133pptenstcdf utils {} edge hgu133a2 R {} edge mm74av2mmenst utils {} edge vvgrapevvtigrprobe R {} edge vvgrapevvtigrprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsugcdf utils {} edge hs133bptenstcdf utils {} edge paeg1acdf utils {} edge mm11ksubammug utils {} edge mm430ammugcdf utils {} edge ggchickenggrefseq utils {} edge hs95av2ptensgprobe R {} edge hs95av2ptensgprobe matchprobes {} edge hs133av2hsrefseqcdf utils {} edge mmex10stv1mmenseprobe R {} edge mmex10stv1mmenseprobe matchprobes {} edge mm430ammensgprobe R {} edge mm430ammensgprobe matchprobes {} edge hs133ahsrefseqprobe R {} edge hs133ahsrefseqprobe matchprobes {} edge mgug4122a R {} edge hs133bhsense utils {} edge hs133phsenstcdf utils {} edge hs133bptentrezgcdf utils {} edge hgu133aprobe R {} edge hgu133aprobe matchprobes {} edge hs133bhsenstcdf utils {} edge dmdrosophila2dmrefseq utils {} edge hs133bptense utils {} edge mm74av2mmenseprobe R {} edge mm74av2mmenseprobe matchprobes {} edge mm11ksubammense utils {} edge hu35ksubbcdf utils {} edge mmex10stv1mmenst utils {} edge dmdrosophila2dmenstcdf utils {} edge hsfocushsugprobe R {} edge hsfocushsugprobe matchprobes {} edge atgenomeattigr utils {} edge hgu133atagcdf utils {} edge mm11ksubbmmugprobe R {} edge mm11ksubbmmugprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrenst utils {} edge hgu133a2cdf utils {} edge drzebrafishdrenstprobe R {} edge drzebrafishdrenstprobe matchprobes {} edge hs133phsentrezgcdf utils {} edge hs95av2hsugcdf utils {} edge hs133bhsensg utils {} edge hs95av2hsentrezgcdf utils {} edge ye6100subccdf utils {} edge rn34arnrefseqprobe R {} edge rn34arnrefseqprobe matchprobes {} edge hsfocushsrefseqcdf utils {} edge hsex10stv2hsug utils {} edge rn230brnenstcdf utils {} edge hs133phsense utils {} edge hs133bptensg utils {} edge mm11ksubammensg utils {} edge mgrhomology R {} edge cinhomology R {} edge rn230rnrefseqcdf utils {} edge mu6500subacdf utils {} edge hs133pptense utils {} edge tomatoprobe R {} edge tomatoprobe matchprobes {} edge rgu34acdf utils {} edge mm430bmmrefseqcdf utils {} edge osriceosrefseqprobe R {} edge osriceosrefseqprobe matchprobes {} edge mi16cod R {} edge dmdrosophila2dmugcdf utils {} edge bovineprobe R {} edge bovineprobe matchprobes {} edge hgu95av2cdf utils {} edge m20kcod R {} edge mm74bv2mmensgcdf utils {} edge mm11ksubbmmugcdf utils {} edge gmahomology R {} edge mgu74bcdf utils {} edge mm74av1mmugcdf utils {} edge cfcanine2cfrefseqcdf utils {} edge ri16cod R {} edge hu6800subbcdf utils {} edge hs133phsensg utils {} edge rn34arnenstcdf utils {} edge mm74bv2mmentrezg utils {} edge mm74av1mmentrezgprobe R {} edge mm74av1mmentrezgprobe matchprobes {} edge mm430mmenst utils {} edge hsfocushsugcdf utils {} edge test3probe R {} edge test3probe matchprobes {} edge soybeanprobe R {} edge soybeanprobe matchprobes {} edge ratCHRLOC R {} edge mmex10stv1mmensgcdf utils {} edge humanLLMappings R {} edge hs133pptensg utils {} edge mm74av1mmenstcdf utils {} edge dmgenome1dmenstprobe R {} edge dmgenome1dmenstprobe matchprobes {} edge hgu95bcdf utils {} edge mgu74bprobe R {} edge mgu74bprobe matchprobes {} edge rat2302 R {} edge mmex10stv1mmentrezg utils {} edge hs133xhsugcdf utils {} edge hs133phsugprobe R {} edge hs133phsugprobe matchprobes {} edge ggchickenggrefseqcdf utils {} edge cfcanine2cfenst utils {} edge mm430ammrefseqprobe R {} edge mm430ammrefseqprobe matchprobes {} edge mm74av2mmug utils {} edge mm430mmensgprobe R {} edge mm430mmensgprobe matchprobes {} edge hs133phsugcdf utils {} edge hs133bhsugprobe R {} edge hs133bhsugprobe matchprobes {} edge hs133ahsenst utils {} edge rnex10stv1rnentrezgcdf utils {} edge hs133ahsug utils {} edge dmdrosophila2dmugprobe R {} edge dmdrosophila2dmugprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmrefseq utils {} edge hs133aptenst utils {} edge mgug4104a R {} edge hs133av2hsentrezgcdf utils {} edge test1cdf utils {} edge adme16cod R {} edge rn230arnugcdf utils {} edge maizecdf utils {} edge pfahomology R {} edge xlahomology R {} edge ggahomology R {} edge plasmodiumanophelesprobe R {} edge plasmodiumanophelesprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrenseprobe R {} edge drzebrafishdrenseprobe matchprobes {} edge hs133ahsensgprobe R {} edge hs133ahsensgprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsrefseqcdf utils {} edge rn34arnrefseq utils {} edge mm74av1mmrefseq utils {} edge spohomology R {} edge gp53cdf utils {} edge mm11ksubammrefseqcdf utils {} edge ecoliasv2probe R {} edge ecoliasv2probe matchprobes {} edge rn230brnugprobe R {} edge rn230brnugprobe matchprobes {} edge mgu74av2 R {} edge hs133aptenstprobe R {} edge hs133aptenstprobe matchprobes {} edge atgenomeattairprobe R {} edge atgenomeattairprobe matchprobes {} edge hs133av2ptenstcdf utils {} edge mgu74cv2probe R {} edge mgu74cv2probe matchprobes {} edge hs95av2hsense utils {} edge ggchickenggug utils {} edge hgu95eprobe R {} edge hgu95eprobe matchprobes {} edge hs133pptentrezgprobe R {} edge hs133pptentrezgprobe matchprobes {} edge canine2probe R {} edge canine2probe matchprobes {} edge mm11ksubbmmense utils {} edge hsfocushsense utils {} edge mguatlas5k R {} edge hwgcod R {} edge mm11ksubbmmenstprobe R {} edge mm11ksubbmmenstprobe matchprobes {} edge rn230arnense utils {} edge hs95av2ptense utils {} edge ath1attigr utils {} edge yeast2probe R {} edge yeast2probe matchprobes {} edge mm430bmmrefseq utils {} edge hsfocusptense utils {} edge hs133av2hsenstcdf utils {} edge agcdf utils {} edge rn34arnugprobe R {} edge rn34arnugprobe matchprobes {} edge hs133xhsenst utils {} edge canine2 R {} edge hs95av2hsensg utils {} edge hu35ksubdcdf utils {} edge mm74av1mmugprobe R {} edge mm74av1mmugprobe matchprobes {} edge hu35ksuba R {} edge dmgenome1dmenseprobe R {} edge dmgenome1dmenseprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmensg utils {} edge humanCHRLOC R {} edge hs133xptenst utils {} edge hsfocushsensg utils {} edge cfcanine2cfrefseqprobe R {} edge cfcanine2cfrefseqprobe matchprobes {} edge hs133phsenstprobe R {} edge hs133phsenstprobe matchprobes {} edge hs133bhsrefseqcdf utils {} edge rn230arnensg utils {} edge hs95av2ptensg utils {} edge ncrhomology R {} edge mm430mmug utils {} edge btahomology R {} edge mm74cv2mmrefseqcdf utils {} edge ath1121501cdf utils {} edge hsfocusptensg utils {} edge ricecdf utils {} edge hu35ksubb R {} edge mm11ksubammensecdf utils {} edge wheatprobe R {} edge wheatprobe matchprobes {} edge hs133av2hsugcdf utils {} edge drosophila2cdf utils {} edge moe430aprobe R {} edge moe430aprobe matchprobes {} edge hs95av2ptenstcdf utils {} edge hs95av2hsrefseqcdf utils {} edge hgu95aprobe R {} edge hgu95aprobe matchprobes {} edge atgenomeattigrcdf utils {} edge barley1probe R {} edge barley1probe matchprobes {} edge hu35ksubc R {} edge mm74av1mmensgprobe R {} edge mm74av1mmensgprobe matchprobes {} edge mu6500subccdf utils {} edge hguDKFZ31 R {} edge dmdrosophila2dmrefseqcdf utils {} edge dmgenome1dmrefseqprobe R {} edge dmgenome1dmrefseqprobe matchprobes {} edge rgu34ccdf utils {} edge hgfocus R {} edge hs133xhsensgprobe R {} edge hs133xhsensgprobe matchprobes {} edge hsfocushsrefseq utils {} edge GO R {} edge hcg110probe R {} edge hcg110probe matchprobes {} edge hu35ksubd R {} edge hs95av2hsenstcdf utils {} edge mm430mmentrezgcdf utils {} edge hs133bhsrefseq utils {} edge hs133aptenseprobe R {} edge hs133aptenseprobe matchprobes {} edge rn230rnrefseqprobe R {} edge rn230rnrefseqprobe matchprobes {} edge hs133xptenstprobe R {} edge hs133xptenstprobe matchprobes {} edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 R {} edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 methods {} edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 Biostrings {} edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 BSgenome {} edge mu11ksubbprobe R {} edge mu11ksubbprobe matchprobes {} edge rn230arnrefseqcdf utils {} edge osriceosrefseq utils {} edge hu6800subdcdf utils {} edge mm74bv2mmug utils {} edge hcg110 R {} edge ecoliasv2cdf utils {} edge hs133bhsenst utils {} edge mm74av2mmentrezgprobe R {} edge mm74av2mmentrezgprobe matchprobes {} edge hivprtplus2cdf utils {} edge hs133phsentrezgprobe R {} edge hs133phsentrezgprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmenseprobe R {} edge mm11ksubbmmenseprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfensecdf utils {} edge hs133xptentrezgprobe R {} edge hs133xptentrezgprobe matchprobes {} edge mm74av1mmentrezgcdf utils {} edge hs133aptensecdf utils {} edge hs133bptenst utils {} edge mu19ksubbcdf utils {} edge rn230brnenstprobe R {} edge rn230brnenstprobe matchprobes {} edge mm11ksubammenst utils {} edge hsex10stv2ptenstcdf utils {} edge hgu95dcdf utils {} edge mmex10stv1mmrefseqcdf utils {} edge mm74cv2mmrefseqprobe R {} edge mm74cv2mmrefseqprobe matchprobes {} edge rgu34bprobe R {} edge rgu34bprobe matchprobes {} edge hs133av2hsugprobe R {} edge hs133av2hsugprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrug utils {} edge hs133pptentrezgcdf utils {} edge hs95av2ptentrezgcdf utils {} edge mm430mmugcdf utils {} edge mm430ammenstcdf utils {} edge rn34arnensgprobe R {} edge rn34arnensgprobe matchprobes {} edge mgu74av2cdf utils {} edge ath1121501probe R {} edge ath1121501probe matchprobes {} edge rn230rnug utils {} edge osriceostigr utils {} edge citruscdf utils {} edge mmuhomology R {} edge mm74av2mmrefseqcdf utils {} edge hs133av2hsense utils {} edge hs133ahsensecdf utils {} edge hs133phsenseprobe R {} edge hs133phsenseprobe matchprobes {} edge indac R {} edge hsex10stv2hsenstcdf utils {} edge ggchickenggensecdf utils {} edge mm74av2mmenstcdf utils {} edge mm74cv2mmensecdf utils {} edge test3cdf utils {} edge ath1atrefseq utils {} edge hs133av2ptense utils {} edge hs133phsenst utils {} edge mm74av2mmrefseqprobe R {} edge mm74av2mmrefseqprobe matchprobes {} edge mm430ammentrezgcdf utils {} edge hu35ksubcprobe R {} edge hu35ksubcprobe matchprobes {} edge rn230brnense utils {} edge hs133pptenst utils {} edge mm11ksubbmmug utils {} edge mm430bmmugcdf utils {} edge mm430mmenstcdf utils {} edge mm11ksubammrefseqprobe R {} edge mm11ksubammrefseqprobe matchprobes {} edge chickenprobe R {} edge chickenprobe matchprobes {} edge hgu95a R {} edge hs133av2hsensg utils {} edge rn230arnentrezgcdf utils {} edge atgenomeatrefseqprobe R {} edge atgenomeatrefseqprobe matchprobes {} edge poplarprobe R {} edge poplarprobe matchprobes {} edge rn230arnensecdf utils {} edge hs133av2hsensgprobe R {} edge hs133av2hsensgprobe matchprobes {} edge plasmodiumanophelescdf utils {} edge hs133xptenstcdf utils {} edge hs133av2ptensg utils {} edge bsubtilisprobe R {} edge bsubtilisprobe matchprobes {} edge rn230arnrefseqprobe R {} edge rn230arnrefseqprobe matchprobes {} edge hgu95b R {} edge hs95av2hsugprobe R {} edge hs95av2hsugprobe matchprobes {} edge hs133av2ptenstprobe R {} edge hs133av2ptenstprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmense utils {} edge hs133pptensgprobe R {} edge hs133pptensgprobe matchprobes {} edge rn230brnensg utils {} edge hs133xptenseprobe R {} edge hs133xptenseprobe matchprobes {} edge rae230acdf utils {} edge rnohomology R {} edge mu11ksubbcdf utils {} edge hs133xhsentrezgcdf utils {} edge mouse430a2cdf utils {} edge hgfocusprobe R {} edge hgfocusprobe matchprobes {} edge hgu95c R {} edge hs133xhsenstcdf utils {} edge drosgenome1cdf utils {} edge hsex10stv2hsentrezgcdf utils {} edge rn230rnensecdf utils {} edge yeast2 R {} edge rn230brnrefseq utils {} edge cfcanine2cfentrezgprobe R {} edge cfcanine2cfentrezgprobe matchprobes {} edge mouse430a2 R {} edge hs133av2ptentrezgcdf utils {} edge hs133xhsentrezgprobe R {} edge hs133xhsentrezgprobe matchprobes {} edge rn230brnenseprobe R {} edge rn230brnenseprobe matchprobes {} edge hsfocushsensgprobe R {} edge hsfocushsensgprobe matchprobes {} edge taehomology R {} edge hgu95d R {} edge hs133av2hsrefseq utils {} edge mm74cv2mmensg utils {} edge mm430ammugprobe R {} edge mm430ammugprobe matchprobes {} edge mouseCHRLOC R {} edge ag R {} edge hsfocusptenstprobe R {} edge hsfocusptenstprobe matchprobes {} edge mm11ksubammensgcdf utils {} edge hsfocusptensecdf utils {} edge hsex10stv2hsrefseq utils {} edge rn230rnensgprobe R {} edge rn230rnensgprobe matchprobes {} edge hgu95e R {} edge hs133xhsrefseq utils {} edge mm430bmmensgprobe R {} edge mm430bmmensgprobe matchprobes {} edge mm11ksubammentrezg utils {} edge hsex10stv2hsugprobe R {} edge hsex10stv2hsugprobe matchprobes {} edge mgu74cv2 R {} edge ath1atrefseqprobe R {} edge ath1atrefseqprobe matchprobes {} edge mm74av2mmugprobe R {} edge mm74av2mmugprobe matchprobes {} edge mm74av2mmugcdf utils {} edge rnu34cdf utils {} edge mm74cv2mmug utils {} edge osriceostigrcdf utils {} edge mm11ksubammentrezgprobe R {} edge mm11ksubammentrezgprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmug utils {} edge hs95av2ptentrezgprobe R {} edge hs95av2ptentrezgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrrefseqcdf utils {} edge drehomology R {} edge m10kcod R {} edge cfcanine2cfensgprobe R {} edge cfcanine2cfensgprobe matchprobes {} edge hs95av2hsenst utils {} edge hsfocushsensecdf utils {} edge ath1attaircdf utils {} edge mm430mmugprobe R {} edge mm430mmugprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmenst utils {} edge moe430acdf utils {} edge hsfocushsenst utils {} edge mm11ksubbmmensecdf utils {} edge rn230arnenst utils {} edge hs95av2ptenst utils {} edge r10kcod R {} edge hsfocusptenst utils {} edge xenopuslaevis R {} edge mm430ammug utils {} edge mgu74aprobe R {} edge mgu74aprobe matchprobes {} edge moe430a R {} edge rnex10stv1rnenstprobe R {} edge rnex10stv1rnenstprobe matchprobes {} edge ggchickenggensgprobe R {} edge ggchickenggensgprobe matchprobes {} edge hs133bhsug utils {} edge mm11ksubammentrezgcdf utils {} edge cfcanine2cfensgcdf utils {} edge YEAST R {} edge hs133av2ptenseprobe R {} edge hs133av2ptenseprobe matchprobes {} edge hs133aptensgcdf utils {} edge cfcanine2cfentrezg utils {} edge rn230brnugcdf utils {} edge hs133aptentrezg utils {} edge moe430b R {} edge mm11ksubammrefseq utils {} edge rae230bprobe R {} edge rae230bprobe matchprobes {} edge mouse430a2probe R {} edge mouse430a2probe matchprobes {} edge hs133xhsugprobe R {} edge hs133xhsugprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmrefseq utils {} edge hgu133atagprobe R {} edge hgu133atagprobe matchprobes {} edge rwgcod R {} edge hs133pptensecdf utils {} edge hsex10stv2hsensgprobe R {} edge hsex10stv2hsensgprobe matchprobes {} edge rn34arnense utils {} edge hs133ahsensgcdf utils {} edge dmgenome1dmrefseqcdf utils {} edge rnex10stv1rnenstcdf utils {} edge ggchickenggensgcdf utils {} edge mm74cv2mmensgcdf utils {} edge hs133bptensecdf utils {} edge rnex10stv1rnug utils {} edge drzebrafishdrrefseqprobe R {} edge drzebrafishdrrefseqprobe matchprobes {} edge mm11ksubammensgprobe R {} edge mm11ksubammensgprobe matchprobes {} edge hs133ahsentrezg utils {} edge u133x3p R {} edge hs133phsrefseq utils {} edge riceprobe R {} edge riceprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmentrezg utils {} edge hsex10stv2ptenstprobe R {} edge hsex10stv2ptenstprobe matchprobes {} edge hsfocusptenseprobe R {} edge hsfocusptenseprobe matchprobes {} edge mm430bmmenstcdf utils {} edge barley1cdf utils {} edge hs133phsensecdf utils {} edge hgubeta7 R {} edge hgu95dprobe R {} edge hgu95dprobe matchprobes {} edge celeganscdf utils {} edge hs133bhsensecdf utils {} edge drosophila2 R {} edge rn34arnensg utils {} edge mm430ammense utils {} edge mm430ammrefseq utils {} edge rn230arnensgcdf utils {} edge hs95av2hsentrezgprobe R {} edge hs95av2hsentrezgprobe matchprobes {} edge dmdrosophila2dmensecdf utils {} edge rn230arnentrezg utils {} edge mm74bv2mmenstprobe R {} edge mm74bv2mmenstprobe matchprobes {} edge ecoli2probe R {} edge ecoli2probe matchprobes {} edge cfcanine2cfugcdf utils {} edge hs133ahsentrezgcdf utils {} edge hs133bhsensgprobe R {} edge hs133bhsensgprobe matchprobes {} edge rn230brnensecdf utils {} edge rn230rnensgcdf utils {} edge hgug4110b R {} edge rnex10stv1rnenseprobe R {} edge rnex10stv1rnenseprobe matchprobes {} edge mm430ammensg utils {} edge mm74cv2mmensgprobe R {} edge mm74cv2mmensgprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmrefseqcdf utils {} edge PFAM R {} edge PFAM RSQLite {} edge rn230rnentrezg utils {} edge hs133bptenstprobe R {} edge hs133bptenstprobe matchprobes {} edge hgu133plus2 R {} edge hs133av2hsenst utils {} edge drosophila2probe R {} edge drosophila2probe matchprobes {} edge u133x3pcdf utils {} edge hs95av2hsensgprobe R {} edge hs95av2hsensgprobe matchprobes {} edge hs133av2ptenst utils {} edge sugarcanecdf utils {} edge medicagocdf utils {} edge rtu34cdf utils {} edge hsfocusptensgcdf utils {} edge dmdrosophila2dmensgprobe R {} edge dmdrosophila2dmensgprobe matchprobes {} edge rn230brnenst utils {} edge rnex10stv1rnrefseqprobe R {} edge rnex10stv1rnrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2ptenstprobe R {} edge hs95av2ptenstprobe matchprobes {} edge hsfocusptentrezg utils {} edge rnex10stv1rnugprobe R {} edge rnex10stv1rnugprobe matchprobes {} edge mm430ammenstprobe R {} edge mm430ammenstprobe matchprobes {} edge hgu133bcdf utils {} edge rn34arnensecdf utils {} edge hu35ksubacdf utils {} edge hs133phsrefseqcdf utils {} edge ggchickenggense utils {} edge xenopuslaevisprobe R {} edge xenopuslaevisprobe matchprobes {} edge hcg110cdf utils {} edge hs133ahsrefseq utils {} edge mm11ksubbmmentrezgprobe R {} edge mm11ksubbmmentrezgprobe matchprobes {} edge hsex10stv2ptenseprobe R {} edge hsex10stv2ptenseprobe matchprobes {} edge mm74av1mmensecdf utils {} edge rn230arnensgprobe R {} edge rn230arnensgprobe matchprobes {} edge rn230rnrefseq utils {} edge hs133ahsugcdf utils {} edge hsfocushsentrezgcdf utils {} edge mu11ksubaprobe R {} edge mu11ksubaprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrenstcdf utils {} edge dmgenome1dmenstcdf utils {} edge mm430bmmugprobe R {} edge mm430bmmugprobe matchprobes {} edge hsfocushsensgcdf utils {} edge mm11ksubbmmensgcdf utils {} edge ye6100subbcdf utils {} edge mmex10stv1mmentrezgcdf utils {} edge hsfocushsentrezg utils {} edge canine2cdf utils {} edge hs133xptentrezgcdf utils {} edge hs133bhsrefseqprobe R {} edge hs133bhsrefseqprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmenst utils {} edge mm11ksubbmmentrezg utils {} edge ecolicdf utils {} edge mm74bv2mmugcdf utils {} edge hsex10stv2ptentrezgcdf utils {} edge rnex10stv1rnense utils {} edge rnu34 R {} edge vvgrapevvtigrcdf utils {} edge mmex10stv1mmensgprobe R {} edge mmex10stv1mmensgprobe matchprobes {} edge ggchickenggensg utils {} edge rnex10stv1rnentrezgprobe R {} edge rnex10stv1rnentrezgprobe matchprobes {} edge hsfocushsug utils {} edge rn230rnense utils {} edge mm74bv2mmenseprobe R {} edge mm74bv2mmenseprobe matchprobes {} edge rgu34aprobe R {} edge rgu34aprobe matchprobes {} edge hi16cod R {} edge vvgrapevvtigr utils {} edge mm74av2mmensgprobe R {} edge mm74av2mmensgprobe matchprobes {} edge rhesuscdf utils {} edge zebrafishprobe R {} edge zebrafishprobe matchprobes {} edge hsfocushsrefseqprobe R {} edge hsfocushsrefseqprobe matchprobes {} edge h20kcod R {} edge mgu74acdf utils {} edge hu6800subacdf utils {} edge rnex10stv1rnensg utils {} edge hs133pptensgcdf utils {} edge hs133av2ptensecdf utils {} edge hu35ksubbprobe R {} edge hu35ksubbprobe matchprobes {} edge rnu34probe R {} edge rnu34probe matchprobes {} edge xenopuslaeviscdf utils {} edge hs133bptenseprobe R {} edge hs133bptenseprobe matchprobes {} edge ptrhomology R {} edge rn230rnensg utils {} edge rn34arnug utils {} edge rn230brnrefseqcdf utils {} edge dmgenome1dmrefseq utils {} edge hs133bptensgcdf utils {} edge hs133pptentrezg utils {} edge mm430bmmense utils {} edge hgu95acdf utils {} edge ath1atrefseqcdf utils {} edge hs133av2ptentrezgprobe R {} edge hs133av2ptentrezgprobe matchprobes {} edge hs133bptentrezg utils {} edge hs133xhsrefseqprobe R {} edge hs133xhsrefseqprobe matchprobes {} edge hs133phsensgcdf utils {} edge hs133av2hsensecdf utils {} edge hs95av2ptenseprobe R {} edge hs95av2ptenseprobe matchprobes {} edge mouse4302 R {} edge rn230arnentrezgprobe R {} edge rn230arnentrezgprobe matchprobes {} edge mm430ammentrezgprobe R {} edge mm430ammentrezgprobe matchprobes {} edge mm430ammenseprobe R {} edge mm430ammenseprobe matchprobes {} edge hs133aptentrezgprobe R {} edge hs133aptentrezgprobe matchprobes {} edge hs133bhsensgcdf utils {} edge hs133phsentrezg utils {} edge mm74bv2mmense utils {} edge rat2302probe R {} edge rat2302probe matchprobes {} edge hguatlas13k R {} edge mouse4302probe R {} edge mouse4302probe matchprobes {} edge hs133bhsentrezg utils {} edge mm430mmenstprobe R {} edge mm430mmenstprobe matchprobes {} edge atgenomeattair utils {} edge mm430bmmensg utils {} edge hsahomology R {} edge drzebrafishdrugprobe R {} edge drzebrafishdrugprobe matchprobes {} edge cMAP R {} edge ecoli2cdf utils {} edge dmgenome1dmugprobe R {} edge dmgenome1dmugprobe matchprobes {} edge dmdrosophila2dmensgcdf utils {} edge celegans R {} edge rguatlas4k R {} edge bsubtiliscdf utils {} edge mm74bv2mmenstcdf utils {} edge rn230arnrefseq utils {} edge hs133av2hsrefseqprobe R {} edge hs133av2hsrefseqprobe matchprobes {} edge xtrhomology R {} edge atgenomeatrefseq utils {} edge hgug4111a R {} edge mm430bmmrefseqprobe R {} edge mm430bmmrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2ptensecdf utils {} edge ygs98cdf utils {} edge hs133ahsenstprobe R {} edge hs133ahsenstprobe matchprobes {} edge mm74bv2mmensg utils {} edge rn230brnensgcdf utils {} edge hgu133plus2cdf utils {} edge mmex10stv1mmenstcdf utils {} edge mmex10stv1mmrefseqprobe R {} edge mmex10stv1mmrefseqprobe matchprobes {} edge ygs98probe R {} edge ygs98probe matchprobes {} edge rn230brnentrezg utils {} edge hsex10stv2hsrefseqprobe R {} edge hsex10stv2hsrefseqprobe matchprobes {} edge rn34arnenst utils {} edge agahomology R {} edge hs95av2hsensecdf utils {} edge mm430mmrefseqprobe R {} edge mm430mmrefseqprobe matchprobes {} edge mm74bv2mmentrezgprobe R {} edge mm74bv2mmentrezgprobe matchprobes {} edge drosgenome1 R {} edge drzebrafishdrensgprobe R {} edge drzebrafishdrensgprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfug utils {} edge rn34arnensgcdf utils {} edge hu35ksubccdf utils {} edge mu19ksuba R {} edge mm430bmmug utils {} edge rn34arnentrezg utils {} edge mm74av1mmensgcdf utils {} edge hs133av2hsentrezgprobe R {} edge hs133av2hsentrezgprobe matchprobes {} edge mm430ammenst utils {} edge u133aaofav2cdf utils {} edge hsex10stv2ptensecdf utils {} edge ggchickenggugcdf utils {} edge mm74av1mmentrezg utils {} edge mu19ksubb R {} edge drzebrafishdrrefseq utils {} edge ecoliprobe R {} edge ecoliprobe matchprobes {} edge athhomology R {} edge ye6100subdcdf utils {} edge hs95av2hsug utils {} edge porcineprobe R {} edge porcineprobe matchprobes {} edge mm430ammensecdf utils {} edge hs133aptentrezgcdf utils {} edge mgu74a R {} edge mm74bv2mmrefseq utils {} edge hs133ahsentrezgprobe R {} edge hs133ahsentrezgprobe matchprobes {} edge mu19ksubc R {} edge mm430mmenseprobe R {} edge mm430mmenseprobe matchprobes {} edge ath1attigrprobe R {} edge ath1attigrprobe matchprobes {} edge rn230rnentrezgcdf utils {} edge hsex10stv2hsensecdf utils {} edge mu6500subbcdf utils {} edge mm74av2mmensecdf utils {} edge mm74av2mmentrezgcdf utils {} edge mgu74b R {} edge rgu34bcdf utils {} edge rae230aprobe R {} edge rae230aprobe matchprobes {} edge sugarcaneprobe R {} edge sugarcaneprobe matchprobes {} edge mm74bv2mmugprobe R {} edge mm74bv2mmugprobe matchprobes {} edge saureuscdf utils {} edge mgu74av2probe R {} edge mgu74av2probe matchprobes {} edge htratfocuscdf utils {} edge mm74av1mmenstprobe R {} edge mm74av1mmenstprobe matchprobes {} edge mm430mmensecdf utils {} edge dmgenome1dmensgprobe R {} edge dmgenome1dmensgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrentrezgcdf utils {} edge mgu74c R {} edge mgu74ccdf utils {} edge mm74cv2mmugcdf utils {} edge hu6800subccdf utils {} edge hs133ahsenseprobe R {} edge hs133ahsenseprobe matchprobes {} edge hs133xhsenstprobe R {} edge hs133xhsenstprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmugprobe R {} edge mmex10stv1mmugprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnrefseqcdf utils {} edge mouse4302cdf utils {} edge hs133av2ptensgcdf utils {} edge paeg1aprobe R {} edge paeg1aprobe matchprobes {} edge hs133xptensecdf utils {} edge mu19ksubacdf utils {} edge hs133av2ptentrezg utils {} edge hgu95ccdf utils {} edge mm430bmmentrezgcdf utils {} edge hvuhomology R {} edge hsfocusptentrezgcdf utils {} edge ath1attair utils {} edge ggchickenggenst utils {} edge wheatcdf utils {} edge celegansprobe R {} edge celegansprobe matchprobes {} edge hgu95cprobe R {} edge hgu95cprobe matchprobes {} edge vitisviniferaprobe R {} edge vitisviniferaprobe matchprobes {} edge hgu95av2probe R {} edge hgu95av2probe matchprobes {} edge drosgenome1probe R {} edge drosgenome1probe matchprobes {} edge hs133av2hsensgcdf utils {} edge rn230brnentrezgprobe R {} edge rn230brnentrezgprobe matchprobes {} edge mm430bmmentrezgprobe R {} edge mm430bmmentrezgprobe matchprobes {} edge hs133bptentrezgprobe R {} edge hs133bptentrezgprobe matchprobes {} edge rn230brnentrezgcdf utils {} edge hs133xhsensecdf utils {} edge hu6800 R {} edge hgu133a R {} edge hs133av2hsentrezg utils {} edge osriceosrefseqcdf utils {} edge hgfocuscdf utils {} edge test2cdf utils {} edge hs133aptensgprobe R {} edge hs133aptensgprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmugcdf utils {} edge rn34arnenstprobe R {} edge rn34arnenstprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnenst utils {} edge dmdrosophila2dmense utils {} edge mm74av1mmense utils {} edge mouseLLMappings R {} edge rn230arnug utils {} edge rn230rnenst utils {} edge hgu133b R {} edge KEGG R {} edge mm11ksubbmmensgprobe R {} edge mm11ksubbmmensgprobe matchprobes {} edge mu11ksuba R {} edge drzebrafishdrentrezgprobe R {} edge drzebrafishdrentrezgprobe matchprobes {} edge sschomology R {} edge rn34arnentrezgcdf utils {} edge hs95av2ptensgcdf utils {} edge hsex10stv2ptentrezgprobe R {} edge hsex10stv2ptentrezgprobe matchprobes {} edge hs133av2hsug utils {} edge mm74bv2mmrefseqcdf utils {} edge hs95av2ptentrezg utils {} edge hgug4112a R {} edge mu11ksubb R {} edge dmgenome1dmug utils {} edge mgu74cv2cdf utils {} edge rn34arnugcdf utils {} edge dmdrosophila2dmensg utils {} edge mm74av1mmensg utils {} edge mm74av1mmenseprobe R {} edge mm74av1mmenseprobe matchprobes {} edge omyhomology R {} edge hs133bhsugcdf utils {} edge mm430bmmenst utils {} edge hs133av2hsenstprobe R {} edge hs133av2hsenstprobe matchprobes {} edge hs133phsensgprobe R {} edge hs133phsensgprobe matchprobes {} edge hs95av2hsensgcdf utils {} edge mu11ksubacdf utils {} edge hs133xhsenseprobe R {} edge hs133xhsenseprobe matchprobes {} edge ggchickenggrefseqprobe R {} edge ggchickenggrefseqprobe matchprobes {} edge porcinecdf utils {} edge mgug4120a R {} edge mgu74bv2 R {} edge u133x3pprobe R {} edge u133x3pprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmrefseqprobe R {} edge mm11ksubbmmrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2hsentrezg utils {} edge hu6800probe R {} edge hu6800probe matchprobes {} edge hs133pptenstprobe R {} edge hs133pptenstprobe matchprobes {} edge mm74bv2mmrefseqprobe R {} edge mm74bv2mmrefseqprobe matchprobes {} edge ath1attigrcdf utils {} edge mm74bv2mmenst utils {} edge vitisviniferacdf utils {} edge hsex10stv2ptensgcdf utils {} edge LogitBoost NONE {} edge codetools R {} edge RGtk R {} edge XML R {} edge XML methods {} edge SJava R {} edge RMySQL R {} edge RMySQL methods {} edge RMySQL DBI {} edge SSOAP R {} edge SSOAP methods {} edge SSOAP XML {} edge SSOAP RCurl {} edge RCurl methods {} }}