Difference between revisions of "Test graph - BioConductor package dependancies"

From FollowTheScore
Jump to: navigation, search
 
(8 intermediate revisions by 2 users not shown)
Line 1: Line 1:
See also [[Test graph 2]] ...
+
This graph shows the package dependencies for the BioConductor software for the statistical analysis of microarrary data in R. The dependency list was generated from the BioConductor-1.9 software repository HTML pages.
  
{{#wgraph: png | size=500 | svg |
+
Unfortunately it is too large to be used on this webserver (due to memory limitations). A slightly shorter list (75%) would work. See also [[Test graph 2]] ...
node hs133xptentrezgcdf {}
+
 
node hs95av2hsrefseqprobe {}
+
{{#wgraph: png | thumb=40 |
node pfahomology {}
+
nodetype * { font helvR08 }
node mm74av2mmug {}
+
layoutalgorithm=forcedir
node drzebrafishdrenstprobe {}
 
node SpikeInSubset {}
 
node BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 {}
 
node u133aaofav2cdf {}
 
node hs133bptenseprobe {}
 
node dmdrosophila2dmensgprobe {}
 
node rJava {}
 
node hs133av2hsenst {}
 
node hsex10stv2hsensgcdf {}
 
node mmuhomology {}
 
node ade4 {}
 
node hs133bptensgcdf {}
 
node rn230arnentrezgcdf {}
 
node nem {}
 
node mm430mmenseprobe {}
 
node rn230rnense {}
 
node rn230rnug {}
 
node drzebrafishdrensg {}
 
node barley1probe {}
 
node MCRestimate {}
 
node mm74av2mmentrezgcdf {}
 
node rn230arnenst {}
 
node affxparser {}
 
node rat2302 {}
 
node pdmclass {}
 
node hs133aptensgcdf {}
 
node mm430ammrefseqcdf {}
 
node factDesign {}
 
node mouse4302probe {}
 
node mm74av1mmenstcdf {}
 
node mouseLLMappings {}
 
node hgu95eprobe {}
 
node hs133pptensg {}
 
node rnohomology {}
 
node ath1121501 {}
 
node hs133pptenstcdf {}
 
node hsfocushsensg {}
 
node hs133xhsrefseqcdf {}
 
node rn230brnugcdf {}
 
node mm430bmmensgprobe {}
 
node canine2cdf {}
 
node moe430acdf {}
 
node fibroEset {}
 
node rn34arnensecdf {}
 
node Ruuid {}
 
node bronchialIL13 {}
 
node mm74bv2mmentrezgprobe {}
 
node maanova {}
 
node CoCiteStats {}
 
node hs133xptenstcdf {}
 
node hgu95ccdf {}
 
node rgu34bprobe {}
 
node atgenomeattairprobe {}
 
node pkgDepTools {}
 
node hsex10stv2ptenstcdf {}
 
node rae230bcdf {}
 
node rnex10stv1rnug {}
 
node hsfocushsrefseqcdf {}
 
node rtu34cdf {}
 
node mm24kresogen {}
 
node mu11ksubacdf {}
 
node hcg110 {}
 
node yeast2probe {}
 
node mm74av1mmensecdf {}
 
node EBarrays {}
 
node mm74av1mmensgcdf {}
 
node cyp450cdf {}
 
node GeneR {}
 
node mm430bmmentrezg {}
 
node cfahomology {}
 
node mm74av2mmentrezgprobe {}
 
node hs133aptenstprobe {}
 
node grid {}
 
node rguatlas4k {}
 
node mm430mmugprobe {}
 
node faahKO {}
 
node mm11ksubammrefseqprobe {}
 
node hs133ahsense {}
 
node soybeancdf {}
 
node hs133av2hsugcdf {}
 
node R {}
 
node mm430mmentrezg {}
 
node mm74cv2mmense {}
 
node lapmix {}
 
node drehomology {}
 
node mm11ksubbmmentrezgprobe {}
 
node mm430bmmensgcdf {}
 
node SSOAP {}
 
node mgrhomology {}
 
node HIVcDNAvantWout03 {}
 
node mm74bv2mmense {}
 
node mm430bmmrefseq {}
 
node rn34arnug {}
 
node barley1cdf {}
 
node mm11ksubbmmensecdf {}
 
node mu19ksubacdf {}
 
node hs133xptensg {}
 
node mouse4302 {}
 
node RMAPPER {}
 
node mm430bmmug {}
 
node rnex10stv1rnentrezg {}
 
node hs133av2hsenseprobe {}
 
node hgug4111a {}
 
node pairseqsim {}
 
node vvgrapevvtigrprobe {}
 
node hgu95ecdf {}
 
node mm430bmmenstprobe {}
 
node hgu95d {}
 
node mm430ammenstcdf {}
 
node mm430mmensgcdf {}
 
node MAQCsubset {}
 
node hs95av2hsensgcdf {}
 
node mm74av1mmensgprobe {}
 
node mm430bmmugcdf {}
 
node ecoliLeucine {}
 
node mgu74av2probe {}
 
node ath1atrefseq {}
 
node rtu34 {}
 
node cfcanine2cfensgprobe {}
 
node AmpAffyExample {}
 
node SNAData {}
 
node hsfocusptentrezg {}
 
node mm74av2mmensgprobe {}
 
node mm74bv2mmenseprobe {}
 
node hgu95bcdf {}
 
node dmdrosophila2dmrefseq {}
 
node hsfocushsrefseqprobe {}
 
node mgug4120a {}
 
node cMAP {}
 
node lodplot {}
 
node drzebrafishdrensecdf {}
 
node hs133bptenst {}
 
node hsfocushsrefseq {}
 
node RbcBook1 {}
 
node RGtk {}
 
node rn230arnrefseqprobe {}
 
node hs133xhsensecdf {}
 
node drosophila2cdf {}
 
node osriceostigrprobe {}
 
node globaltest {}
 
node rgug4130a {}
 
node hs133ahsenst {}
 
node qtl {}
 
node timecourse {}
 
node mu19ksuba {}
 
node citrusprobe {}
 
node atgenomeatrefseqcdf {}
 
node widgetTools {}
 
node hsex10stv2hsugprobe {}
 
node hgu95b {}
 
node hs133bhsenseprobe {}
 
node mm11ksubammrefseqcdf {}
 
node mm430mmenst {}
 
node GGtools {}
 
node mmex10stv1mmensgprobe {}
 
node hs133xhsensgprobe {}
 
node rgu34b {}
 
node hs133bptensgprobe {}
 
node hs133av2hsensgcdf {}
 
node rn230arnugprobe {}
 
node h10kcod {}
 
node rn230brnensecdf {}
 
node osriceosrefseqprobe {}
 
node drzebrafishdrense {}
 
node humanLLMappings {}
 
node GeneTraffic {}
 
node dmgenome1dmensg {}
 
node rn230brnenseprobe {}
 
node arrayQuality {}
 
node mm11ksubbmmensgcdf {}
 
node zebrafishcdf {}
 
node ricecdf {}
 
node mm74av2mmrefseqprobe {}
 
node ggchickenggensecdf {}
 
node mm74av1mmrefseq {}
 
node hs95av2hsenst {}
 
node hs133xhsug {}
 
node hsfocusptenst {}
 
node hsex10stv2hsrefseqcdf {}
 
node GO {}
 
node rn230arnrefseqcdf {}
 
node wheatcdf {}
 
node LogicReg {}
 
node OrderedList {}
 
node rn230arnenseprobe {}
 
node widgetInvoke {}
 
node moe430a {}
 
node paeg1acdf {}
 
node moe430b {}
 
node yeast2 {}
 
node ecolitk {}
 
node mouse430a2cdf {}
 
node rn230rnenstcdf {}
 
node amap {}
 
node rnex10stv1rnensgprobe {}
 
node rn230brnensg {}
 
node MLInterfaces {}
 
node hs133xptensgprobe {}
 
node hs133bhsense {}
 
node hsfocushsentrezg {}
 
node dmgenome1dmensgprobe {}
 
node hgu95dcdf {}
 
node mm11ksubammugcdf {}
 
node RSNPper {}
 
node mmex10stv1mmensg {}
 
node ecolicdf {}
 
node mm430bmmugprobe {}
 
node OLINgui {}
 
node scehomology {}
 
node atgenomeattair {}
 
node ellipse {}
 
node mm74bv2mmug {}
 
node hs133pptenseprobe {}
 
node mmex10stv1mmentrezg {}
 
node riceprobe {}
 
node hu6800 {}
 
node mu19ksubc {}
 
node yeast2cdf {}
 
node hs133pptenst {}
 
node hgu95aprobe {}
 
node hgug4101a {}
 
node canine2probe {}
 
node qvalue {}
 
node hsex10stv2ptentrezgprobe {}
 
node rtu34probe {}
 
node rn230rnenstprobe {}
 
node mgug4104a {}
 
node egohomology {}
 
node btahomology {}
 
node dmdrosophila2dmenstprobe {}
 
node convert {}
 
node ggahomology {}
 
node hsfocushsensecdf {}
 
node vitisviniferaprobe {}
 
node sagenhaft {}
 
node vvihomology {}
 
node hs133aptenseprobe {}
 
node plier {}
 
node rn230brnentrezg {}
 
node hsfocushsenseprobe {}
 
node rn230brnrefseqprobe {}
 
node mwgcod {}
 
node gaschYHS {}
 
node geneRecommender {}
 
node mm74av1mmentrezgprobe {}
 
node cfcanine2cfugcdf {}
 
node rn230brnensgprobe {}
 
node rn230arnrefseq {}
 
node hs133bhsensecdf {}
 
node geneplotter {}
 
node mgu74aprobe {}
 
node GeneSpring {}
 
node rn230rnensgprobe {}
 
node maizecdf {}
 
node webbioc {}
 
node mm74cv2mmensg {}
 
node mm430mmensgprobe {}
 
node mm74bv2mmugprobe {}
 
node RMAGEML {}
 
node humanCHRLOC {}
 
node dmgenome1dmug {}
 
node cfcanine2cfrefseqprobe {}
 
node mm430bmmensecdf {}
 
node hsex10stv2ptentrezg {}
 
node zebrafish {}
 
node dmdrosophila2dmugprobe {}
 
node mm74av2mmugprobe {}
 
node ggchickenggense {}
 
node ath1121501cdf {}
 
node RGtk2 {}
 
node mmgmos {}
 
node limmaGUI {}
 
node maDB {}
 
node mgu74bprobe {}
 
node hs133ahsensg {}
 
node zebrafishprobe {}
 
node mm74bv2mmensgcdf {}
 
node mm430mmug {}
 
node rnex10stv1rnentrezgcdf {}
 
node mm11ksubammenstcdf {}
 
node ScISI {}
 
node cfcanine2cfrefseq {}
 
node medicagoprobe {}
 
node vvgrapevvtigr {}
 
node mmex10stv1mmug {}
 
node hs133ahsensgprobe {}
 
node codelink {}
 
node facsDorit {}
 
node mm74bv2mmentrezg {}
 
node rn230rnenseprobe {}
 
node chickencdf {}
 
node GeneTS {}
 
node cellHTS {}
 
node rn34arnrefseqprobe {}
 
node matchprobes {}
 
node hsex10stv2hsrefseqprobe {}
 
node hs133bhsrefseqprobe {}
 
node soybeanprobe {}
 
node hs95av2ptenseprobe {}
 
node mm11ksubbmmentrezg {}
 
node hs95av2hsugprobe {}
 
node hs133av2hsensg {}
 
node dmdrosophila2dmrefseqcdf {}
 
node SpikeIn {}
 
node hs95av2hsentrezgprobe {}
 
node hgu133a2cdf {}
 
node mmex10stv1mmenstprobe {}
 
node hgu95av2cdf {}
 
node GeneCycle {}
 
node cairoDevice {}
 
node Rredland {}
 
node hs133pptensgcdf {}
 
node rnex10stv1rnensgcdf {}
 
node medicagocdf {}
 
node ggchickenggensgcdf {}
 
node davidTiling {}
 
node grDevices {}
 
node Biostrings {}
 
node LMGene {}
 
node hs133pptentrezg {}
 
node celeganscdf {}
 
node Icens {}
 
node hs95av2hsensg {}
 
node hs133bhsensg {}
 
node hgu133plus2 {}
 
node mm74cv2mmrefseq {}
 
node annotate {}
 
node hsfocushsentrezgcdf {}
 
node GLAD {}
 
node hypergraph {}
 
node hsex10stv2ptensgcdf {}
 
node drzebrafishdrenstcdf {}
 
node ggchickenggugprobe {}
 
node ye6100subdcdf {}
 
node hs133aptentrezgprobe {}
 
node mm430bmmenseprobe {}
 
node rn230brnensgcdf {}
 
node rn230arnensg {}
 
node hs133xptenst {}
 
node hs133av2hsrefseqprobe {}
 
node hs133bhsensgcdf {}
 
node hsex10stv2ptense {}
 
node mm74av2mmrefseq {}
 
node plasmodiumanophelescdf {}
 
node hsfocushsug {}
 
node rnu34probe {}
 
node mm430bmmense {}
 
node hi16cod {}
 
node drzebrafishdrrefseqcdf {}
 
node hs133av2ptensg {}
 
node DNAcopy {}
 
node affyQCReport {}
 
node porcineprobe {}
 
node hsfocusptensecdf {}
 
node rn230arnenstprobe {}
 
node cfcanine2cfensg {}
 
node mouseCHRLOC {}
 
node ggchickenggenstcdf {}
 
node mm11ksubammensg {}
 
node osriceostigrcdf {}
 
node mmex10stv1mmrefseqcdf {}
 
node RColorBrewer {}
 
node SJava {}
 
node hgu95a {}
 
node mm74cv2mmenst {}
 
node indac {}
 
node mm74av1mmug {}
 
node mm430bmmrefseqcdf {}
 
node Heatplus {}
 
node rnex10stv1rnugcdf {}
 
node beadarraySNP {}
 
node hs133aptenstcdf {}
 
node mm11ksubbmmugprobe {}
 
node xcms {}
 
node hgu133b {}
 
node hs133xptense {}
 
node hs133av2hsentrezgprobe {}
 
node rn230brnense {}
 
node strucchange {}
 
node rn230arnense {}
 
node chickenprobe {}
 
node rgu34bcdf {}
 
node MANOR {}
 
node mm430ammentrezgprobe {}
 
node BioMVCClass {}
 
node hs95av2hsrefseqcdf {}
 
node hs133aptensg {}
 
node rn230brnug {}
 
node nnet {}
 
node mm11ksubammrefseq {}
 
node hs133bhsenst {}
 
node rn230brnenst {}
 
node mm430ammensgcdf {}
 
node cfcanine2cfug {}
 
node drzebrafishdrentrezgcdf {}
 
node mmex10stv1mmentrezgcdf {}
 
node hs133bptensecdf {}
 
node hs133ahsrefseqcdf {}
 
node rnu34 {}
 
node rae230bprobe {}
 
node mm430bmmentrezgcdf {}
 
node mm74av2mmrefseqcdf {}
 
node PFAM {}
 
node mm74cv2mmugcdf {}
 
node SparseM {}
 
node XML {}
 
node hs95av2ptensgcdf {}
 
node affyPLM {}
 
node drzebrafishdrenst {}
 
node hs95av2ptenstprobe {}
 
node rnex10stv1rnrefseqprobe {}
 
node mm430mmugcdf {}
 
node copa {}
 
node ggchickenggrefseqprobe {}
 
node dmgenome1dmrefseqcdf {}
 
node mm74av1mmrefseqprobe {}
 
node adSplit {}
 
node mm74av1mmentrezg {}
 
node mm11ksubammenstprobe {}
 
node ppiStats {}
 
node rn230brnrefseqcdf {}
 
node test3cdf {}
 
node hu35ksubaprobe {}
 
node hs133av2hsensecdf {}
 
node makecdfenv {}
 
node R.oo {}
 
node methods {}
 
node mm11ksubbmmentrezgcdf {}
 
node hsex10stv2hsensecdf {}
 
node hs133bhsentrezg {}
 
node hs133phsenst {}
 
node mm74av1mmugcdf {}
 
node rn230brnenstcdf {}
 
node hsfocushsugprobe {}
 
node drzebrafishdrrefseqprobe {}
 
node hs133av2hsense {}
 
node hs133av2hsentrezg {}
 
node BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 {}
 
node mu6500subdcdf {}
 
node colorspace {}
 
node agprobe {}
 
node hgu133acdf {}
 
node ecoliasv2cdf {}
 
node mm11ksubbmmenstprobe {}
 
node rn230brnentrezgprobe {}
 
node hgu95cprobe {}
 
node hsfocusptensg {}
 
node maSigPro {}
 
node rn230rnrefseqcdf {}
 
node beadarray {}
 
node SBMLR {}
 
node mm74av2mmensgcdf {}
 
node bovineprobe {}
 
node rn230rnentrezg {}
 
node ABarray {}
 
node hu6800subacdf {}
 
node hsfocushsense {}
 
node cfcanine2cfrefseqcdf {}
 
node SAGx {}
 
node bim {}
 
node DEDS {}
 
node mm74bv2mmrefseqcdf {}
 
node hs133av2ptense {}
 
node hgu95dprobe {}
 
node dmdrosophila2dmenst {}
 
node dmgenome1dmrefseq {}
 
node bioDist {}
 
node hgu133bprobe {}
 
node hsfocushsentrezgprobe {}
 
node reb {}
 
node hs95av2ptense {}
 
node mm430ammentrezgcdf {}
 
node hsex10stv2hsenseprobe {}
 
node simulatorAPMS {}
 
node GraphAT {}
 
node hgu95av2probe {}
 
node hs95av2ptentrezgcdf {}
 
node rn34arnense {}
 
node mmex10stv1mmugprobe {}
 
node hs133av2ptentrezgcdf {}
 
node mm74cv2mmrefseqprobe {}
 
node hu35ksubb {}
 
node hsfocushsenst {}
 
node adme16cod {}
 
node mm11ksubbmmug {}
 
node rnex10stv1rnugprobe {}
 
node rgu34aprobe {}
 
node pcot2 {}
 
node mgu74cv2 {}
 
node hsfocusptenstprobe {}
 
node mu11ksubbcdf {}
 
node hsex10stv2ptenstprobe {}
 
node Biobase {}
 
node mm74bv2mmensgprobe {}
 
node mm430mmenstprobe {}
 
node vsn {}
 
node daMA {}
 
node hs133phsugprobe {}
 
node hsfocusptensgcdf {}
 
node hs133phsentrezg {}
 
node m10kcod {}
 
node hsex10stv2hsentrezgcdf {}
 
node hsex10stv2hsentrezgprobe {}
 
node vitisviniferacdf {}
 
node pathRender {}
 
node hs133bhsenstprobe {}
 
node rnex10stv1rnenseprobe {}
 
node HEM {}
 
node ssize {}
 
node mm11ksubbmmensgprobe {}
 
node mmex10stv1mmense {}
 
node rn34arnenstcdf {}
 
node estrogen {}
 
node yeastCC {}
 
node GEOquery {}
 
node rn230rnugcdf {}
 
node mu11ksubb {}
 
node stepNorm {}
 
node mm430ammensecdf {}
 
node hs133xhsrefseqprobe {}
 
node mm430bmmenstcdf {}
 
node codetools {}
 
node affydata {}
 
node hs95av2hsug {}
 
node cfcanine2cfense {}
 
node hthgu133acdf {}
 
node hs133phsrefseqprobe {}
 
node lattice {}
 
node MCMCpack {}
 
node htratfocuscdf {}
 
node mm430mmrefseqprobe {}
 
node hs133bhsrefseqcdf {}
 
node mm11ksubammensecdf {}
 
node tools {}
 
node rgug4105a {}
 
node dmgenome1dmensecdf {}
 
node plasmodiumanophelesprobe {}
 
node ye6100subacdf {}
 
node hs133ahsugprobe {}
 
node rnex10stv1rnenst {}
 
node KEGGSOAP {}
 
node GlobalAncova {}
 
node combinat {}
 
node hs95av2ptentrezgprobe {}
 
node mm11ksubammensgprobe {}
 
node dmehomology {}
 
node quantsmooth {}
 
node rae230b {}
 
node MergeMaid {}
 
node hs95av2hsenseprobe {}
 
node rnex10stv1rnenstprobe {}
 
node MASS {}
 
node beta7 {}
 
node hs95av2hsensgprobe {}
 
node macat {}
 
node rnu34cdf {}
 
node affycomp {}
 
node mgu74b {}
 
node osriceosrefseq {}
 
node spotSegmentation {}
 
node ggchickenggenseprobe {}
 
node mm430ammenseprobe {}
 
node dmdrosophila2dmensg {}
 
node splicegear {}
 
node hs133pptentrezgcdf {}
 
node idiogram {}
 
node rn34arnugcdf {}
 
node hs95av2hsense {}
 
node r10kcod {}
 
node siggenes {}
 
node drosgenome1 {}
 
node mm74av1mmrefseqcdf {}
 
node ggchickenggugcdf {}
 
node drzebrafishdrugprobe {}
 
node Mfuzz {}
 
node ggchickenggensgprobe {}
 
node hs133xptentrezgprobe {}
 
node hs133phsug {}
 
node hsfocusptense {}
 
node hs133phsensgcdf {}
 
node mgu74av2cdf {}
 
node hs133pptense {}
 
node rae230aprobe {}
 
node rn34arnensgprobe {}
 
node atgenomeattigrcdf {}
 
node locfit {}
 
node SAGElyzer {}
 
node hs133xptensgcdf {}
 
node hs133ahsentrezgprobe {}
 
node gcrma {}
 
node pgUtils {}
 
node mm430ammentrezg {}
 
node hgu133atagcdf {}
 
node cluster {}
 
node NONE {}
 
node hgug4110b {}
 
node ygs98 {}
 
node dmgenome1dmense {}
 
node marray {}
 
node aroma.light {}
 
node mm11ksubbmmenstcdf {}
 
node cfcanine2cfentrezgcdf {}
 
node hs133aptensecdf {}
 
node mm11ksubammugprobe {}
 
node hs133bptentrezgprobe {}
 
node mu19ksubb {}
 
node mda {}
 
node survival {}
 
node rn230rnentrezgprobe {}
 
node hs133pptensgprobe {}
 
node GeneNet {}
 
node mm74av2mmense {}
 
node pickgene {}
 
node hs95av2hsugcdf {}
 
node hs133xhsentrezgprobe {}
 
node hsfocusptentrezgcdf {}
 
node ptrhomology {}
 
node EBImage {}
 
node made4 {}
 
node hgu95e {}
 
node lymphoma {}
 
node mm430ammugcdf {}
 
node rn230arnentrezgprobe {}
 
node mm11ksubbmmensg {}
 
node mm74bv2mmenstprobe {}
 
node hs133phsrefseq {}
 
node hu35ksubccdf {}
 
node hs133av2ptentrezg {}
 
node rn34arnentrezg {}
 
node hgu2beta7 {}
 
node rn34arnenseprobe {}
 
node hs133xhsenstcdf {}
 
node rn34arnenst {}
 
node test1cdf {}
 
node mm430mmrefseqcdf {}
 
node mm74av2mmugcdf {}
 
node hs133xhsentrezg {}
 
node MVCClass {}
 
node utils {}
 
node pamr {}
 
node HEEBOdata {}
 
node metaArray {}
 
node gtkDevice {}
 
node hs133av2hsrefseq {}
 
node cfcanine2cfentrezg {}
 
node hs133ahsugcdf {}
 
node rfcdmin {}
 
node canineprobe {}
 
node mu6500subacdf {}
 
node mm430ammensgprobe {}
 
node rama {}
 
node hgu133a2probe {}
 
node hs133av2hsensgprobe {}
 
node poplarprobe {}
 
node RCurl {}
 
node affycoretools {}
 
node hs133bhsentrezgcdf {}
 
node hs133phsense {}
 
node hs133av2ptensgprobe {}
 
node hguDKFZ31 {}
 
node ontoTools {}
 
node rat2302probe {}
 
node hsex10stv2ptensgprobe {}
 
node moe430bcdf {}
 
node mu19ksubccdf {}
 
node celhomology {}
 
node dmdrosophila2dmense {}
 
node gff3Plotter {}
 
node hs133av2hsenstcdf {}
 
node akima {}
 
node rgu34a {}
 
node ecoli2probe {}
 
node mm74cv2mmug {}
 
node dmgenome1dmenstcdf {}
 
node odesolve {}
 
node ppiData {}
 
node kidpack {}
 
node klahomology {}
 
node hs133ahsug {}
 
node ri16cod {}
 
node hs133aptentrezgcdf {}
 
node mm11ksubbmmenst {}
 
node quantreg {}
 
node ag {}
 
node mm74bv2mmensg {}
 
node rn34arnrefseq {}
 
node hs133av2hsug {}
 
node hs95av2ptensg {}
 
node rat2302cdf {}
 
node hgu133bcdf {}
 
node pixmap {}
 
node paeg1aprobe {}
 
node ath1attairprobe {}
 
node cfcanine2cfenst {}
 
node twilight {}
 
node hs133aptensgprobe {}
 
node aCGH {}
 
node applera {}
 
node hs95av2hsrefseq {}
 
node ye6100subbcdf {}
 
node drzebrafishdrenseprobe {}
 
node hsfocushsugcdf {}
 
node hs133av2hsentrezgcdf {}
 
node mm11ksubammentrezgcdf {}
 
node ALLMLL {}
 
node hs133xptensecdf {}
 
node gridBase {}
 
node rnex10stv1rnensecdf {}
 
node hgubeta7 {}
 
node GeneMeta {}
 
node ggchickenggrefseqcdf {}
 
node drzebrafishdrugcdf {}
 
node hs133phsentrezgprobe {}
 
node osriceostigr {}
 
node iSNetwork {}
 
node multtest {}
 
node diffGeneAnalysis {}
 
node sschomology {}
 
node dmdrosophila2dmenstcdf {}
 
node hs133av2ptenstprobe {}
 
node mgu74bv2 {}
 
node hsfocushsensgprobe {}
 
node mm11ksubammense {}
 
node rn230arnenstcdf {}
 
node hsfocushsensgcdf {}
 
node rnex10stv1rnensg {}
 
node hs133av2ptensecdf {}
 
node hs133bhsensgprobe {}
 
node saureuscdf {}
 
node nudge {}
 
node ath1attigrprobe {}
 
node clusterStab {}
 
node hsex10stv2hsentrezg {}
 
node rnex10stv1rnentrezgprobe {}
 
node splines {}
 
node tcltk {}
 
node mm11ksubammensgcdf {}
 
node hs95av2ptenstcdf {}
 
node u133x3pcdf {}
 
node hs133bptentrezg {}
 
node rnex10stv1rnense {}
 
node R2HTML {}
 
node mmex10stv1mmrefseq {}
 
node BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 {}
 
node Iyer517 {}
 
node rn230arnensecdf {}
 
node MeasurementError.cor {}
 
node h20kcod {}
 
node ROC {}
 
node hs95av2hsentrezgcdf {}
 
node maizeprobe {}
 
node rn230rnrefseqprobe {}
 
node rn230rnensgcdf {}
 
node rn34arnentrezgprobe {}
 
node hs133av2hsugprobe {}
 
node ye6100subccdf {}
 
node rn230brnentrezgcdf {}
 
node hgu133plus2cdf {}
 
node DynDoc {}
 
node mm74av2mmenstprobe {}
 
node mm430ammug {}
 
node DBI {}
 
node mm74av1mmentrezgcdf {}
 
node zmahomology {}
 
node mm11ksubbmmugcdf {}
 
node tilingArray {}
 
node hsex10stv2hsenstprobe {}
 
node mm74bv2mmugcdf {}
 
node hs95av2ptentrezg {}
 
node mu6500subbcdf {}
 
node hs133xhsugcdf {}
 
node hs133bhsug {}
 
node biomaRt {}
 
node mgu74bcdf {}
 
node MantelCorr {}
 
node hs133ahsenstcdf {}
 
node hs133bptentrezgcdf {}
 
node hs133ahsrefseq {}
 
node OCplus {}
 
node logicFS {}
 
node plgem {}
 
node atgenomeattaircdf {}
 
node mclust {}
 
node hgug4112a {}
 
node mm11ksubammug {}
 
node hgu133aprobe {}
 
node ath1atrefseqcdf {}
 
node hcg110probe {}
 
node RSvgDevice {}
 
node mm74av2mmenseprobe {}
 
node hgu133plus2probe {}
 
node AnnBuilder {}
 
node hs133bhsugprobe {}
 
node rflowcyt {}
 
node cfcanine2cfenstcdf {}
 
node hsex10stv2ptensecdf {}
 
node hcg110cdf {}
 
node RdbiPgSQL {}
 
node mgug4122a {}
 
node vvgrapevvtigrcdf {}
 
node mm11ksubbmmense {}
 
node mguatlas5k {}
 
node hguatlas13k {}
 
node hs133aptense {}
 
node hgfocusprobe {}
 
node prada {}
 
node gaggle {}
 
node mmex10stv1mmensgcdf {}
 
node mgu74av2 {}
 
node cfcanine2cfensecdf {}
 
node tkrplot {}
 
node ath1attair {}
 
node ALL {}
 
node drosophila2probe {}
 
node RankProd {}
 
node hsex10stv2ptensg {}
 
node gmahomology {}
 
node hgfocuscdf {}
 
node spikeLI {}
 
node mm74cv2mmugprobe {}
 
node mm430mmrefseq {}
 
node osriceosrefseqcdf {}
 
node cfcanine2cfensgcdf {}
 
node hsex10stv2hsug {}
 
node mgu74cv2cdf {}
 
node golubEsets {}
 
node ggchickenggenstprobe {}
 
node mm11ksubbmmrefseq {}
 
node hs25kresogen {}
 
node minpack.lm {}
 
node mm74av2mmensecdf {}
 
node hu6800subccdf {}
 
node mm74bv2mmensecdf {}
 
node dmdrosophila2dmrefseqprobe {}
 
node moe430aprobe {}
 
node OLIN {}
 
node mm430ammugprobe {}
 
node goTools {}
 
node hu35ksubacdf {}
 
node mm74av1mmenstprobe {}
 
node hgu133a2 {}
 
node mm74bv2mmrefseqprobe {}
 
node mm74bv2mmenstcdf {}
 
node nnNorm {}
 
node affyio {}
 
node rn34arnugprobe {}
 
node mm74bv2mmenst {}
 
node panp {}
 
node mm74bv2mmentrezgcdf {}
 
node dmgenome1dmenseprobe {}
 
node e1071 {}
 
node dmgenome1dmenstprobe {}
 
node xenopuslaevisprobe {}
 
node hs133ahsenseprobe {}
 
node mmex10stv1mmenstcdf {}
 
node hs133phsrefseqcdf {}
 
node mm430ammenst {}
 
node rn230arnensgcdf {}
 
node BSgenome {}
 
node mu6500subccdf {}
 
node xenopuslaevis {}
 
node mm430ammenstprobe {}
 
node celegans {}
 
node hs133phsugcdf {}
 
node rwgcod {}
 
node bsubtiliscdf {}
 
node dmgenome1dmugcdf {}
 
node hs133aptentrezg {}
 
node mgu74bv2probe {}
 
node hsex10stv2ptentrezgcdf {}
 
node hs133xhsrefseq {}
 
node KEGG {}
 
node rn230rnensg {}
 
node mm74cv2mmenstprobe {}
 
node cfcanine2cfugprobe {}
 
node genArise {}
 
node hs133pptentrezgprobe {}
 
node LogitBoost {}
 
node ggchickenggrefseq {}
 
node hguqiagenv3 {}
 
node randomForest {}
 
node rhesusprobe {}
 
node canine2 {}
 
node yeastExpData {}
 
node ecoliprobe {}
 
node hs133av2hsenstprobe {}
 
node BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 {}
 
node hu35ksubdprobe {}
 
node ath1attaircdf {}
 
node tkWidgets {}
 
node gpls {}
 
node harbChIP {}
 
node ygs98cdf {}
 
node mu11ksubbprobe {}
 
node hs133xhsentrezgcdf {}
 
node arrayQCplot {}
 
node drosgenome1cdf {}
 
node hgu133atagprobe {}
 
node u133x3p {}
 
node graph {}
 
node hs133av2ptensgcdf {}
 
node Resourcerer {}
 
node omyhomology {}
 
node mouse4302cdf {}
 
node limma {}
 
node hsfocusptenstcdf {}
 
node bsubtilisprobe {}
 
node mmex10stv1mmentrezgprobe {}
 
node mi16cod {}
 
node mm74cv2mmentrezgcdf {}
 
node hs133bptenstprobe {}
 
node mm430bmmrefseqprobe {}
 
node rn230arnensgprobe {}
 
node arrayMagic {}
 
node Rgraphviz {}
 
node atgenomeatrefseqprobe {}
 
node rn34arnensg {}
 
node affypdnn {}
 
node ath1attigrcdf {}
 
node hs133ahsenstprobe {}
 
node digest {}
 
node mouse430a2 {}
 
node dmgenome1dmugprobe {}
 
node mm74cv2mmensgcdf {}
 
node atgenomeatrefseq {}
 
node edd {}
 
node rn230rnugprobe {}
 
node genefilter {}
 
node hsex10stv2hsenstcdf {}
 
node cinhomology {}
 
node BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 {}
 
node u133x3pprobe {}
 
node xtrhomology {}
 
node maCorrPlot {}
 
node Harshlight {}
 
node apComplex {}
 
node hexbin {}
 
node spohomology {}
 
node ggchickenggensg {}
 
node rn230brnugprobe {}
 
node hsex10stv2ptenst {}
 
node ath1atrefseqprobe {}
 
node hs95av2ptensgprobe {}
 
node hsfocusptensgprobe {}
 
node hs95av2hsensecdf {}
 
node ProData {}
 
node iSPlot {}
 
node osahomology {}
 
node drzebrafishdrentrezg {}
 
node rn34arnentrezgcdf {}
 
node mgu74cv2probe {}
 
node rgu34ccdf {}
 
node sigPathway {}
 
node RSQLite {}
 
node mm74av1mmenst {}
 
node mm430mmenstcdf {}
 
node hgug4100a {}
 
node agahomology {}
 
node hgfocus {}
 
node rn34arnensgcdf {}
 
node rn230arnugcdf {}
 
node ath1121501probe {}
 
node sugarcanecdf {}
 
node ggchickenggug {}
 
node drzebrafishdrug {}
 
node poplarcdf {}
 
node weaver {}
 
node hs133bhsentrezgprobe {}
 
node hvuhomology {}
 
node hs133ahsensgcdf {}
 
node test3probe {}
 
node hs95av2ptensecdf {}
 
node sizepower {}
 
node mmex10stv1mmensecdf {}
 
node mm74av2mmensg {}
 
node xtable {}
 
node ecoli2cdf {}
 
node simpleaffy {}
 
node mm11ksubammentrezg {}
 
node hs133phsenseprobe {}
 
node dmgenome1dmenst {}
 
node mm11ksubammenseprobe {}
 
node tomatocdf {}
 
node hu6800subdcdf {}
 
node drzebrafishdrrefseq {}
 
node mgug4121a {}
 
node m20kcod {}
 
node dmdrosophila2dmugcdf {}
 
node ecoliasv2probe {}
 
node mmex10stv1mmugcdf {}
 
node TypeInfo {}
 
node bridge {}
 
node mm430bmmentrezgprobe {}
 
node mm430ammrefseqprobe {}
 
node hgu133a {}
 
node mouse430a2probe {}
 
node BeadExplorer {}
 
node hs133phsenstcdf {}
 
node hs133bptense {}
 
node mm430mmensg {}
 
node ath1attigr {}
 
node hsex10stv2hsrefseq {}
 
node mgu74a {}
 
node hgu95bprobe {}
 
node rn230brnrefseq {}
 
node hs133phsensgprobe {}
 
node ratLLMappings {}
 
node dmgenome1dmrefseqprobe {}
 
node dmgenome1dmensgcdf {}
 
node hs133xhsugprobe {}
 
node hs133av2hsrefseqcdf {}
 
node hs133xhsenstprobe {}
 
node mm74av1mmensg {}
 
node rgu34cprobe {}
 
node hu35ksubcprobe {}
 
node drosophila2 {}
 
node porcinecdf {}
 
node dmdrosophila2dmenseprobe {}
 
node pcaMethods {}
 
node hsex10stv2hsensgprobe {}
 
node mm430mmentrezgcdf {}
 
node biocViews {}
 
node caninecdf {}
 
node citruscdf {}
 
node mm74av1mmenseprobe {}
 
node rnex10stv1rnrefseq {}
 
node hu35ksuba {}
 
node hs133phsenstprobe {}
 
node mm74av2mmenst {}
 
node hs133aptenst {}
 
node mm74cv2mmrefseqcdf {}
 
node hs133bhsenstcdf {}
 
node rn34arnenstprobe {}
 
node hs133phsentrezgcdf {}
 
node hs133bhsrefseq {}
 
node mm430ammense {}
 
node mm74av2mmentrezg {}
 
node graphics {}
 
node hs133xhsensg {}
 
node GGdata {}
 
node hu35ksubbprobe {}
 
node xenopuslaeviscdf {}
 
node mm74cv2mmentrezgprobe {}
 
node cfcanine2cfenseprobe {}
 
node mm74cv2mmentrezg {}
 
node hs133av2ptenseprobe {}
 
node dmdrosophila2dmensecdf {}
 
node hsfocusptenseprobe {}
 
node mgu74bv2cdf {}
 
node mm11ksubbmmenseprobe {}
 
node rn230rnrefseq {}
 
node hs133ahsensecdf {}
 
node sscore {}
 
node mm430mmentrezgprobe {}
 
node mmex10stv1mmenst {}
 
node mu11ksubaprobe {}
 
node affylmGUI {}
 
node hsahomology {}
 
node mm430ammrefseq {}
 
node hs133bhsugcdf {}
 
node mm430mmensecdf {}
 
node athhomology {}
 
node mm74cv2mmenstcdf {}
 
node altcdfenvs {}
 
node cghMCR {}
 
node hu6800subbcdf {}
 
node hu6800probe {}
 
node mu19ksubbcdf {}
 
node hs133av2ptentrezgprobe {}
 
node RMySQL {}
 
node PROcess {}
 
node hs95av2hsentrezg {}
 
node ncrhomology {}
 
node agcdf {}
 
node bovinecdf {}
 
node mmex10stv1mmrefseqprobe {}
 
node ratCHRLOC {}
 
node dmdrosophila2dmensgcdf {}
 
node rae230a {}
 
node hs133xhsensgcdf {}
 
node mgu74c {}
 
node hs133av2ptenstcdf {}
 
node hu35ksubdcdf {}
 
node hgu95acdf {}
 
node hsfocushsenstcdf {}
 
node sugarcaneprobe {}
 
node Rdbi {}
 
node mm74cv2mmensgprobe {}
 
node hwgcod {}
 
node hs133av2ptenst {}
 
node hsex10stv2hsensg {}
 
node hopach {}
 
node ygs98probe {}
 
node wheatprobe {}
 
node RBGL {}
 
node KernSmooth {}
 
node rn230arnug {}
 
node stats {}
 
node stam {}
 
node hs133ahsentrezgcdf {}
 
node sma {}
 
node atgenomeattigr {}
 
node hu35ksubbcdf {}
 
node hsfocushsenstprobe {}
 
node fields {}
 
node hs133bptenstcdf {}
 
node hivprtplus2cdf {}
 
node drzebrafishdrensgprobe {}
 
node ggchickenggenst {}
 
node moe430bprobe {}
 
node YEAST {}
 
node hs133phsensg {}
 
node cfcanine2cfenstprobe {}
 
node mm74cv2mmenseprobe {}
 
node mm74av2mmenstcdf {}
 
node annaffy {}
 
node safe {}
 
node hgu95av2 {}
 
node mgu74ccdf {}
 
node rgu34c {}
 
node CLL {}
 
node tomatoprobe {}
 
node rn230rnenst {}
 
node mm74cv2mmensecdf {}
 
node hgu95c {}
 
node drzebrafishdrensgcdf {}
 
node hs133phsensecdf {}
 
node mm74bv2mmrefseq {}
 
node hs133ahsrefseqprobe {}
 
node mm11ksubbmmrefseqprobe {}
 
node hsex10stv2ptenseprobe {}
 
node mgu74acdf {}
 
node hs133ahsentrezg {}
 
node hs95av2hsenstprobe {}
 
node GOstats {}
 
node gp53cdf {}
 
node hs95av2hsenstcdf {}
 
node ctc {}
 
node impute {}
 
node snapCGH {}
 
node mm11ksubammentrezgprobe {}
 
node dmdrosophila2dmug {}
 
node pls {}
 
node rnex10stv1rnenstcdf {}
 
node hs133xhsenseprobe {}
 
node mgu74cprobe {}
 
node xlahomology {}
 
node hu6800cdf {}
 
node mm74av1mmugprobe {}
 
node rgu34acdf {}
 
node taehomology {}
 
node hsex10stv2hsense {}
 
node BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 {}
 
node hsfocusptentrezgprobe {}
 
node mm74av1mmense {}
 
node rn230brnenstprobe {}
 
node mm11ksubbmmrefseqcdf {}
 
node hs133bptensg {}
 
node hs133xptenstprobe {}
 
node hu35ksubd {}
 
node LPE {}
 
node rae230acdf {}
 
node hs133xhsense {}
 
node ChromoViz {}
 
node mm430mmense {}
 
node BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 {}
 
node lungExpression {}
 
node atgenomeattigrprobe {}
 
node hs133xhsenst {}
 
node mm430bmmenst {}
 
node test2cdf {}
 
node rn230rnentrezgcdf {}
 
node hsex10stv2hsugcdf {}
 
node splots {}
 
node gdata {}
 
node Category {}
 
node hsex10stv2hsenst {}
 
node mm430bmmensg {}
 
node rn230rnensecdf {}
 
node rn230arnentrezg {}
 
node BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 {}
 
node drzebrafishdrentrezgprobe {}
 
node hu35ksubc {}
 
node mu11ksuba {}
 
node MEEBOdata {}
 
node hs133pptenstprobe {}
 
node class {}
 
node colonCA {}
 
node rhesuscdf {}
 
node rn34arnrefseqcdf {}
 
node rnex10stv1rnrefseqcdf {}
 
node mmex10stv1mmenseprobe {}
 
node saureusprobe {}
 
node mm11ksubammenst {}
 
node celegansprobe {}
 
node affy {}
 
node scatterplot3d {}
 
node fdrame {}
 
node stjudem {}
 
node drosgenome1probe {}
 
node cfcanine2cfentrezgprobe {}
 
node hs133xptentrezg {}
 
node hs133xptenseprobe {}
 
node hs133pptensecdf {}
 
node hs95av2ptenst {}
 
node mm430ammensg {}
 
 
edge gpls NONE {}
 
edge gpls NONE {}
 
edge sigPathway R {}
 
edge sigPathway R {}
Line 1,253: Line 47:
 
edge biomaRt XML {}
 
edge biomaRt XML {}
 
edge biomaRt RCurl {}
 
edge biomaRt RCurl {}
edge gaggle R {}
 
 
edge gaggle rJava {}
 
edge gaggle rJava {}
 
edge gaggle graph {}
 
edge gaggle graph {}
Line 1,260: Line 53:
 
edge affylmGUI affy {}
 
edge affylmGUI affy {}
 
edge affylmGUI Biobase {}
 
edge affylmGUI Biobase {}
edge SAGElyzer R {}
 
 
edge SAGElyzer AnnBuilder {}
 
edge SAGElyzer AnnBuilder {}
 
edge SAGElyzer tkWidgets {}
 
edge SAGElyzer tkWidgets {}
Line 1,266: Line 58:
 
edge SAGElyzer annotate {}
 
edge SAGElyzer annotate {}
 
edge GeneR NONE {}
 
edge GeneR NONE {}
edge GeneSpring R {}
 
 
edge GeneSpring Biobase {}
 
edge GeneSpring Biobase {}
 
edge GeneSpring methods {}
 
edge GeneSpring methods {}
edge geneplotter R {}
 
 
edge geneplotter annotate {}
 
edge geneplotter annotate {}
 
edge geneplotter Biobase {}
 
edge geneplotter Biobase {}
 
edge geneplotter methods {}
 
edge geneplotter methods {}
edge Rdbi R {}
 
edge BioMVCClass R {}
 
 
edge BioMVCClass methods {}
 
edge BioMVCClass methods {}
 
edge BioMVCClass MVCClass {}
 
edge BioMVCClass MVCClass {}
Line 1,289: Line 77:
 
edge snapCGH cluster {}
 
edge snapCGH cluster {}
 
edge snapCGH methods {}
 
edge snapCGH methods {}
edge bioDist R {}
 
 
edge bioDist methods {}
 
edge bioDist methods {}
 
edge bioDist Biobase {}
 
edge bioDist Biobase {}
edge marray R {}
 
 
edge marray limma {}
 
edge marray limma {}
 
edge marray methods {}
 
edge marray methods {}
edge tkWidgets R {}
 
 
edge tkWidgets methods {}
 
edge tkWidgets methods {}
 
edge tkWidgets widgetTools {}
 
edge tkWidgets widgetTools {}
 
edge tkWidgets DynDoc {}
 
edge tkWidgets DynDoc {}
 
edge rama NONE {}
 
edge rama NONE {}
edge Ruuid R {}
 
 
edge Ruuid methods {}
 
edge Ruuid methods {}
edge arrayQuality R {}
 
 
edge arrayQuality marray {}
 
edge arrayQuality marray {}
 
edge arrayQuality limma {}
 
edge arrayQuality limma {}
Line 1,322: Line 105:
 
edge ppiStats Rgraphviz {}
 
edge ppiStats Rgraphviz {}
 
edge ppiStats Category {}
 
edge ppiStats Category {}
edge pcaMethods R {}
 
 
edge pcaMethods MASS {}
 
edge pcaMethods MASS {}
 
edge pcaMethods ellipse {}
 
edge pcaMethods ellipse {}
 
edge pcaMethods pls {}
 
edge pcaMethods pls {}
 
edge pcaMethods methods {}
 
edge pcaMethods methods {}
edge RankProd R {}
 
 
edge GlobalAncova methods {}
 
edge GlobalAncova methods {}
edge webbioc R {}
 
 
edge webbioc Biobase {}
 
edge webbioc Biobase {}
 
edge webbioc affy {}
 
edge webbioc affy {}
Line 1,344: Line 124:
 
edge widgetInvoke XML {}
 
edge widgetInvoke XML {}
 
edge widgetInvoke RGtk {}
 
edge widgetInvoke RGtk {}
edge hexbin R {}
 
 
edge hexbin methods {}
 
edge hexbin methods {}
 
edge hexbin grid {}
 
edge hexbin grid {}
 
edge hexbin lattice {}
 
edge hexbin lattice {}
 
edge hexbin colorspace {}
 
edge hexbin colorspace {}
edge matchprobes R {}
 
 
edge matchprobes Biobase {}
 
edge matchprobes Biobase {}
 
edge matchprobes affy {}
 
edge matchprobes affy {}
Line 1,355: Line 133:
 
edge siggenes multtest {}
 
edge siggenes multtest {}
 
edge siggenes Biobase {}
 
edge siggenes Biobase {}
edge AnnBuilder R {}
 
 
edge AnnBuilder methods {}
 
edge AnnBuilder methods {}
 
edge AnnBuilder Biobase {}
 
edge AnnBuilder Biobase {}
Line 1,365: Line 142:
 
edge RBGL graph {}
 
edge RBGL graph {}
 
edge RBGL methods {}
 
edge RBGL methods {}
edge biocViews R {}
 
 
edge biocViews methods {}
 
edge biocViews methods {}
 
edge biocViews tools {}
 
edge biocViews tools {}
Line 1,371: Line 147:
 
edge biocViews RBGL {}
 
edge biocViews RBGL {}
 
edge biocViews XML {}
 
edge biocViews XML {}
edge CoCiteStats R {}
 
 
edge CoCiteStats humanLLMappings {}
 
edge CoCiteStats humanLLMappings {}
 
edge ChromoViz RSvgDevice {}
 
edge ChromoViz RSvgDevice {}
Line 1,382: Line 157:
 
edge GOstats Category {}
 
edge GOstats Category {}
 
edge GOstats methods {}
 
edge GOstats methods {}
edge prada R {}
 
 
edge prada Biobase {}
 
edge prada Biobase {}
 
edge prada RColorBrewer {}
 
edge prada RColorBrewer {}
Line 1,388: Line 162:
 
edge prada methods {}
 
edge prada methods {}
 
edge prada geneplotter {}
 
edge prada geneplotter {}
edge bridge R {}
 
 
edge bridge rama {}
 
edge bridge rama {}
edge affxparser R {}
 
edge ontoTools R {}
 
 
edge ontoTools methods {}
 
edge ontoTools methods {}
 
edge ontoTools graph {}
 
edge ontoTools graph {}
Line 1,398: Line 169:
 
edge ontoTools Biobase {}
 
edge ontoTools Biobase {}
 
edge ontoTools annotate {}
 
edge ontoTools annotate {}
edge MCRestimate R {}
 
 
edge MCRestimate e1071 {}
 
edge MCRestimate e1071 {}
 
edge MCRestimate pamr {}
 
edge MCRestimate pamr {}
Line 1,410: Line 180:
 
edge pkgDepTools RBGL {}
 
edge pkgDepTools RBGL {}
 
edge MeasurementError.cor NONE {}
 
edge MeasurementError.cor NONE {}
edge lapmix R {}
 
 
edge logicFS LogicReg {}
 
edge logicFS LogicReg {}
edge impute R {}
 
 
edge copa Biobase {}
 
edge copa Biobase {}
 
edge copa methods {}
 
edge copa methods {}
Line 1,422: Line 190:
 
edge Category methods {}
 
edge Category methods {}
 
edge Category genefilter {}
 
edge Category genefilter {}
edge Harshlight R {}
 
 
edge Harshlight affy {}
 
edge Harshlight affy {}
edge OrderedList R {}
 
 
edge OrderedList Biobase {}
 
edge OrderedList Biobase {}
 
edge OrderedList twilight {}
 
edge OrderedList twilight {}
edge MVCClass R {}
 
 
edge MVCClass methods {}
 
edge MVCClass methods {}
 
edge panp affy {}
 
edge panp affy {}
 
edge LPE NONE {}
 
edge LPE NONE {}
edge MANOR R {}
 
 
edge MANOR GLAD {}
 
edge MANOR GLAD {}
 
edge RbcBook1 Biobase {}
 
edge RbcBook1 Biobase {}
edge vsn R {}
 
 
edge vsn Biobase {}
 
edge vsn Biobase {}
edge iSPlot R {}
 
 
edge iSPlot methods {}
 
edge iSPlot methods {}
 
edge iSPlot RGtk {}
 
edge iSPlot RGtk {}
Line 1,442: Line 204:
 
edge iSPlot MVCClass {}
 
edge iSPlot MVCClass {}
 
edge pickgene MASS {}
 
edge pickgene MASS {}
edge makecdfenv R {}
 
 
edge makecdfenv methods {}
 
edge makecdfenv methods {}
 
edge makecdfenv Biobase {}
 
edge makecdfenv Biobase {}
Line 1,448: Line 209:
 
edge makecdfenv utils {}
 
edge makecdfenv utils {}
 
edge makecdfenv affyio {}
 
edge makecdfenv affyio {}
edge aCGH R {}
 
 
edge aCGH cluster {}
 
edge aCGH cluster {}
 
edge aCGH survival {}
 
edge aCGH survival {}
Line 1,457: Line 217:
 
edge KEGGSOAP SSOAP {}
 
edge KEGGSOAP SSOAP {}
 
edge KEGGSOAP RCurl {}
 
edge KEGGSOAP RCurl {}
edge annotate R {}
 
 
edge annotate methods {}
 
edge annotate methods {}
 
edge annotate Biobase {}
 
edge annotate Biobase {}
edge limma R {}
 
 
edge limma methods {}
 
edge limma methods {}
edge timecourse R {}
 
 
edge timecourse limma {}
 
edge timecourse limma {}
 
edge timecourse MASS {}
 
edge timecourse MASS {}
 
edge timecourse Biobase {}
 
edge timecourse Biobase {}
 
edge timecourse methods {}
 
edge timecourse methods {}
edge qvalue R {}
 
edge nem R {}
 
 
edge nem e1071 {}
 
edge nem e1071 {}
 
edge nem graph {}
 
edge nem graph {}
 
edge nem Rgraphviz {}
 
edge nem Rgraphviz {}
 
edge nem RBGL {}
 
edge nem RBGL {}
edge HEM R {}
 
 
edge HEM Biobase {}
 
edge HEM Biobase {}
 
edge SBMLR XML {}
 
edge SBMLR XML {}
 
edge SBMLR odesolve {}
 
edge SBMLR odesolve {}
edge MLInterfaces R {}
 
 
edge MLInterfaces Biobase {}
 
edge MLInterfaces Biobase {}
 
edge MLInterfaces methods {}
 
edge MLInterfaces methods {}
 
edge MLInterfaces genefilter {}
 
edge MLInterfaces genefilter {}
edge weaver R {}
 
 
edge weaver digest {}
 
edge weaver digest {}
 
edge weaver tools {}
 
edge weaver tools {}
Line 1,489: Line 241:
 
edge goTools annotate {}
 
edge goTools annotate {}
 
edge goTools GO {}
 
edge goTools GO {}
edge applera R {}
 
 
edge applera Biobase {}
 
edge applera Biobase {}
 
edge applera methods {}
 
edge applera methods {}
Line 1,499: Line 250:
 
edge applera prada {}
 
edge applera prada {}
 
edge applera combinat {}
 
edge applera combinat {}
edge annaffy R {}
 
 
edge annaffy methods {}
 
edge annaffy methods {}
 
edge annaffy Biobase {}
 
edge annaffy Biobase {}
 
edge annaffy GO {}
 
edge annaffy GO {}
 
edge annaffy KEGG {}
 
edge annaffy KEGG {}
edge spotSegmentation R {}
 
 
edge spotSegmentation mclust {}
 
edge spotSegmentation mclust {}
edge geneRecommender R {}
 
 
edge geneRecommender Biobase {}
 
edge geneRecommender Biobase {}
edge codelink R {}
 
 
edge codelink methods {}
 
edge codelink methods {}
 
edge codelink limma {}
 
edge codelink limma {}
 
edge codelink annotate {}
 
edge codelink annotate {}
edge widgetTools R {}
 
 
edge widgetTools methods {}
 
edge widgetTools methods {}
 
edge widgetTools utils {}
 
edge widgetTools utils {}
edge splots R {}
 
 
edge splots grid {}
 
edge splots grid {}
 
edge RSNPper methods {}
 
edge RSNPper methods {}
Line 1,521: Line 266:
 
edge RSNPper tools {}
 
edge RSNPper tools {}
 
edge RSNPper XML {}
 
edge RSNPper XML {}
edge GeneMeta R {}
 
 
edge GeneMeta methods {}
 
edge GeneMeta methods {}
 
edge GeneMeta Biobase {}
 
edge GeneMeta Biobase {}
 
edge GeneMeta genefilter {}
 
edge GeneMeta genefilter {}
 
edge GEOquery methods {}
 
edge GEOquery methods {}
edge globaltest R {}
 
 
edge globaltest methods {}
 
edge globaltest methods {}
 
edge globaltest graphics {}
 
edge globaltest graphics {}
Line 1,533: Line 276:
 
edge pathRender Rgraphviz {}
 
edge pathRender Rgraphviz {}
 
edge pathRender cMAP {}
 
edge pathRender cMAP {}
edge convert R {}
 
 
edge convert Biobase {}
 
edge convert Biobase {}
 
edge convert limma {}
 
edge convert limma {}
Line 1,539: Line 281:
 
edge convert utils {}
 
edge convert utils {}
 
edge convert methods {}
 
edge convert methods {}
edge MantelCorr R {}
 
edge stam R {}
 
 
edge stam GO {}
 
edge stam GO {}
 
edge stam Biobase {}
 
edge stam Biobase {}
Line 1,547: Line 287:
 
edge stam annaffy {}
 
edge stam annaffy {}
 
edge stam methods {}
 
edge stam methods {}
edge BSgenome R {}
 
 
edge BSgenome methods {}
 
edge BSgenome methods {}
 
edge BSgenome Biostrings {}
 
edge BSgenome Biostrings {}
 
edge pdmclass Biobase {}
 
edge pdmclass Biobase {}
edge pdmclass R {}
 
 
edge pdmclass fibroEset {}
 
edge pdmclass fibroEset {}
 
edge pdmclass mda {}
 
edge pdmclass mda {}
edge cellHTS R {}
 
 
edge cellHTS prada {}
 
edge cellHTS prada {}
 
edge cellHTS RColorBrewer {}
 
edge cellHTS RColorBrewer {}
Line 1,560: Line 297:
 
edge cellHTS genefilter {}
 
edge cellHTS genefilter {}
 
edge metaArray MergeMaid {}
 
edge metaArray MergeMaid {}
edge EBImage R {}
 
 
edge EBImage methods {}
 
edge EBImage methods {}
 
edge arrayQCplot RGtk2 {}
 
edge arrayQCplot RGtk2 {}
 
edge arrayQCplot cairoDevice {}
 
edge arrayQCplot cairoDevice {}
 
edge arrayQCplot LPE {}
 
edge arrayQCplot LPE {}
edge hopach R {}
 
 
edge hopach cluster {}
 
edge hopach cluster {}
 
edge hopach Biobase {}
 
edge hopach Biobase {}
Line 1,572: Line 307:
 
edge ssize xtable {}
 
edge ssize xtable {}
 
edge apComplex graph {}
 
edge apComplex graph {}
edge tilingArray R {}
 
 
edge tilingArray methods {}
 
edge tilingArray methods {}
 
edge tilingArray Biobase {}
 
edge tilingArray Biobase {}
Line 1,584: Line 318:
 
edge tilingArray pixmap {}
 
edge tilingArray pixmap {}
 
edge RMAPPER methods {}
 
edge RMAPPER methods {}
edge splicegear R {}
 
 
edge splicegear methods {}
 
edge splicegear methods {}
 
edge splicegear utils {}
 
edge splicegear utils {}
Line 1,591: Line 324:
 
edge splicegear XML {}
 
edge splicegear XML {}
 
edge splicegear annotate {}
 
edge splicegear annotate {}
edge gff3Plotter R {}
 
 
edge gff3Plotter methods {}
 
edge gff3Plotter methods {}
edge mmgmos R {}
 
 
edge mmgmos methods {}
 
edge mmgmos methods {}
 
edge mmgmos Biobase {}
 
edge mmgmos Biobase {}
 
edge mmgmos affy {}
 
edge mmgmos affy {}
edge plgem R {}
 
 
edge plgem Biobase {}
 
edge plgem Biobase {}
 
edge plgem MASS {}
 
edge plgem MASS {}
edge DEDS R {}
 
 
edge DEDS methods {}
 
edge DEDS methods {}
edge pgUtils R {}
 
 
edge pgUtils Rdbi {}
 
edge pgUtils Rdbi {}
 
edge pgUtils RdbiPgSQL {}
 
edge pgUtils RdbiPgSQL {}
 
edge pgUtils methods {}
 
edge pgUtils methods {}
edge hypergraph R {}
 
 
edge hypergraph methods {}
 
edge hypergraph methods {}
 
edge hypergraph graph {}
 
edge hypergraph graph {}
edge arrayMagic R {}
 
 
edge arrayMagic methods {}
 
edge arrayMagic methods {}
 
edge arrayMagic utils {}
 
edge arrayMagic utils {}
Line 1,617: Line 343:
 
edge arrayMagic genefilter {}
 
edge arrayMagic genefilter {}
 
edge nudge stats {}
 
edge nudge stats {}
edge sscore R {}
 
 
edge sscore affy {}
 
edge sscore affy {}
 
edge sscore affxparser {}
 
edge sscore affxparser {}
Line 1,625: Line 350:
 
edge simulatorAPMS ScISI {}
 
edge simulatorAPMS ScISI {}
 
edge simulatorAPMS ppiStats {}
 
edge simulatorAPMS ppiStats {}
edge affy R {}
 
 
edge affy Biobase {}
 
edge affy Biobase {}
 
edge affy methods {}
 
edge affy methods {}
 
edge affy utils {}
 
edge affy utils {}
 
edge affy affyio {}
 
edge affy affyio {}
edge OCplus R {}
 
 
edge OCplus akima {}
 
edge OCplus akima {}
 
edge OCplus multtest {}
 
edge OCplus multtest {}
Line 1,636: Line 359:
 
edge macat Biobase {}
 
edge macat Biobase {}
 
edge macat annotate {}
 
edge macat annotate {}
edge idiogram R {}
 
 
edge idiogram methods {}
 
edge idiogram methods {}
 
edge idiogram Biobase {}
 
edge idiogram Biobase {}
 
edge idiogram annotate {}
 
edge idiogram annotate {}
edge pcot2 R {}
 
 
edge pcot2 grDevices {}
 
edge pcot2 grDevices {}
 
edge pcot2 Biobase {}
 
edge pcot2 Biobase {}
 
edge pcot2 amap {}
 
edge pcot2 amap {}
edge iSNetwork R {}
 
 
edge iSNetwork methods {}
 
edge iSNetwork methods {}
 
edge iSNetwork graph {}
 
edge iSNetwork graph {}
Line 1,654: Line 374:
 
edge iSNetwork Biobase {}
 
edge iSNetwork Biobase {}
 
edge iSNetwork annotate {}
 
edge iSNetwork annotate {}
edge affyPLM R {}
 
 
edge affyPLM affy {}
 
edge affyPLM affy {}
 
edge affyPLM affydata {}
 
edge affyPLM affydata {}
Line 1,661: Line 380:
 
edge affyPLM gcrma {}
 
edge affyPLM gcrma {}
 
edge spikeLI utils {}
 
edge spikeLI utils {}
edge genefilter R {}
 
 
edge genefilter methods {}
 
edge genefilter methods {}
 
edge genefilter Biobase {}
 
edge genefilter Biobase {}
 
edge genefilter survival {}
 
edge genefilter survival {}
edge altcdfenvs R {}
 
 
edge altcdfenvs methods {}
 
edge altcdfenvs methods {}
 
edge altcdfenvs Biobase {}
 
edge altcdfenvs Biobase {}
Line 1,671: Line 388:
 
edge altcdfenvs matchprobes {}
 
edge altcdfenvs matchprobes {}
 
edge altcdfenvs makecdfenv {}
 
edge altcdfenvs makecdfenv {}
edge OLIN R {}
 
 
edge OLIN methods {}
 
edge OLIN methods {}
 
edge OLIN stats {}
 
edge OLIN stats {}
Line 1,682: Line 398:
 
edge beadarraySNP quantsmooth {}
 
edge beadarraySNP quantsmooth {}
 
edge Heatplus NONE {}
 
edge Heatplus NONE {}
edge GeneTS R {}
 
 
edge GeneTS GeneCycle {}
 
edge GeneTS GeneCycle {}
 
edge GeneTS GeneNet {}
 
edge GeneTS GeneNet {}
edge safe R {}
 
 
edge safe methods {}
 
edge safe methods {}
 
edge safe Biobase {}
 
edge safe Biobase {}
edge Rgraphviz R {}
 
 
edge Rgraphviz methods {}
 
edge Rgraphviz methods {}
 
edge Rgraphviz graph {}
 
edge Rgraphviz graph {}
 
edge Rgraphviz geneplotter {}
 
edge Rgraphviz geneplotter {}
edge RdbiPgSQL R {}
 
 
edge RdbiPgSQL Rdbi {}
 
edge RdbiPgSQL Rdbi {}
edge twilight R {}
 
 
edge twilight splines {}
 
edge twilight splines {}
 
edge twilight stats {}
 
edge twilight stats {}
edge GeneTraffic R {}
 
 
edge GeneTraffic Biobase {}
 
edge GeneTraffic Biobase {}
 
edge GeneTraffic affy {}
 
edge GeneTraffic affy {}
Line 1,705: Line 415:
 
edge GeneTraffic digest {}
 
edge GeneTraffic digest {}
 
edge GeneTraffic methods {}
 
edge GeneTraffic methods {}
edge simpleaffy R {}
 
 
edge simpleaffy affy {}
 
edge simpleaffy affy {}
 
edge simpleaffy genefilter {}
 
edge simpleaffy genefilter {}
edge maSigPro R {}
 
 
edge maSigPro Biobase {}
 
edge maSigPro Biobase {}
 
edge Icens survival {}
 
edge Icens survival {}
 
edge Rredland methods {}
 
edge Rredland methods {}
 
edge Rredland graph {}
 
edge Rredland graph {}
edge graph R {}
 
 
edge graph methods {}
 
edge graph methods {}
edge nnNorm R {}
 
 
edge nnNorm nnet {}
 
edge nnNorm nnet {}
 
edge nnNorm marray {}
 
edge nnNorm marray {}
edge genArise R {}
 
 
edge genArise locfit {}
 
edge genArise locfit {}
 
edge genArise tkrplot {}
 
edge genArise tkrplot {}
 
edge genArise xtable {}
 
edge genArise xtable {}
 
edge genArise methods {}
 
edge genArise methods {}
edge EBarrays R {}
 
 
edge EBarrays Biobase {}
 
edge EBarrays Biobase {}
 
edge EBarrays methods {}
 
edge EBarrays methods {}
 
edge EBarrays utils {}
 
edge EBarrays utils {}
 
edge EBarrays lattice {}
 
edge EBarrays lattice {}
edge reb R {}
 
 
edge reb Biobase {}
 
edge reb Biobase {}
 
edge reb idiogram {}
 
edge reb idiogram {}
edge SAGx R {}
 
 
edge SAGx stats {}
 
edge SAGx stats {}
 
edge SAGx multtest {}
 
edge SAGx multtest {}
 
edge SAGx sma {}
 
edge SAGx sma {}
 
edge SAGx methods {}
 
edge SAGx methods {}
edge maanova R {}
 
 
edge RMAGEML marray {}
 
edge RMAGEML marray {}
 
edge RMAGEML limma {}
 
edge RMAGEML limma {}
Line 1,747: Line 448:
 
edge edd nnet {}
 
edge edd nnet {}
 
edge edd xtable {}
 
edge edd xtable {}
edge maDB R {}
 
 
edge maDB Biobase {}
 
edge maDB Biobase {}
 
edge maDB affy {}
 
edge maDB affy {}
Line 1,754: Line 454:
 
edge DynDoc methods {}
 
edge DynDoc methods {}
 
edge DynDoc tools {}
 
edge DynDoc tools {}
edge BeadExplorer R {}
 
 
edge BeadExplorer methods {}
 
edge BeadExplorer methods {}
 
edge BeadExplorer widgetTools {}
 
edge BeadExplorer widgetTools {}
Line 1,769: Line 468:
 
edge ABarray Biobase {}
 
edge ABarray Biobase {}
 
edge ABarray multtest {}
 
edge ABarray multtest {}
edge GGtools R {}
 
 
edge GGtools methods {}
 
edge GGtools methods {}
 
edge GGtools Biobase {}
 
edge GGtools Biobase {}
 
edge GGtools hgfocus {}
 
edge GGtools hgfocus {}
 
edge GGtools geneplotter {}
 
edge GGtools geneplotter {}
edge Biobase R {}
 
 
edge Biobase tools {}
 
edge Biobase tools {}
 
edge Biobase methods {}
 
edge Biobase methods {}
Line 1,781: Line 478:
 
edge factDesign affy {}
 
edge factDesign affy {}
 
edge factDesign stats {}
 
edge factDesign stats {}
edge sagenhaft R {}
 
 
edge sagenhaft SparseM {}
 
edge sagenhaft SparseM {}
edge ROC R {}
 
 
edge ROC utils {}
 
edge ROC utils {}
 
edge ROC methods {}
 
edge ROC methods {}
 
edge bim stats {}
 
edge bim stats {}
 
edge bim qtl {}
 
edge bim qtl {}
edge gcrma R {}
 
 
edge gcrma Biobase {}
 
edge gcrma Biobase {}
 
edge gcrma affy {}
 
edge gcrma affy {}
 
edge gcrma matchprobes {}
 
edge gcrma matchprobes {}
 
edge gcrma splines {}
 
edge gcrma splines {}
edge adSplit R {}
 
 
edge adSplit methods {}
 
edge adSplit methods {}
 
edge adSplit stats {}
 
edge adSplit stats {}
Line 1,802: Line 495:
 
edge adSplit GO {}
 
edge adSplit GO {}
 
edge adSplit KEGG {}
 
edge adSplit KEGG {}
edge Resourcerer R {}
 
 
edge Resourcerer AnnBuilder {}
 
edge Resourcerer AnnBuilder {}
edge GLAD R {}
 
edge MergeMaid R {}
 
 
edge MergeMaid survival {}
 
edge MergeMaid survival {}
 
edge MergeMaid Biobase {}
 
edge MergeMaid Biobase {}
 
edge MergeMaid MASS {}
 
edge MergeMaid MASS {}
 
edge MergeMaid methods {}
 
edge MergeMaid methods {}
edge plier R {}
 
 
edge plier affy {}
 
edge plier affy {}
 
edge quantsmooth quantreg {}
 
edge quantsmooth quantreg {}
 
edge quantsmooth lodplot {}
 
edge quantsmooth lodplot {}
edge affycomp R {}
 
 
edge affycomp Biobase {}
 
edge affycomp Biobase {}
edge stepNorm R {}
 
 
edge stepNorm marray {}
 
edge stepNorm marray {}
 
edge stepNorm MASS {}
 
edge stepNorm MASS {}
 
edge stepNorm methods {}
 
edge stepNorm methods {}
 
edge clusterStab Biobase {}
 
edge clusterStab Biobase {}
edge clusterStab R {}
 
 
edge clusterStab methods {}
 
edge clusterStab methods {}
edge affyQCReport R {}
 
 
edge affyQCReport Biobase {}
 
edge affyQCReport Biobase {}
 
edge affyQCReport affy {}
 
edge affyQCReport affy {}
 
edge affyQCReport simpleaffy {}
 
edge affyQCReport simpleaffy {}
edge affypdnn R {}
 
 
edge affypdnn affy {}
 
edge affypdnn affy {}
 
edge affypdnn affydata {}
 
edge affypdnn affydata {}
 
edge affypdnn hgu95av2probe {}
 
edge affypdnn hgu95av2probe {}
edge affydata R {}
 
 
edge affydata affy {}
 
edge affydata affy {}
 
edge pairseqsim methods {}
 
edge pairseqsim methods {}
Line 1,845: Line 528:
 
edge ScISI YEAST {}
 
edge ScISI YEAST {}
 
edge ScISI xtable {}
 
edge ScISI xtable {}
edge multtest R {}
 
 
edge multtest methods {}
 
edge multtest methods {}
 
edge multtest Biobase {}
 
edge multtest Biobase {}
 
edge multtest survival {}
 
edge multtest survival {}
 
edge ctc NONE {}
 
edge ctc NONE {}
edge yeastExpData R {}
 
 
edge yeastExpData graph {}
 
edge yeastExpData graph {}
 
edge golubEsets Biobase {}
 
edge golubEsets Biobase {}
edge estrogen R {}
 
 
edge estrogen affy {}
 
edge estrogen affy {}
 
edge MAQCsubset Biobase {}
 
edge MAQCsubset Biobase {}
 
edge fibroEset Biobase {}
 
edge fibroEset Biobase {}
 
edge HEEBOdata NONE {}
 
edge HEEBOdata NONE {}
edge facsDorit R {}
 
 
edge facsDorit prada {}
 
edge facsDorit prada {}
 
edge Iyer517 Biobase {}
 
edge Iyer517 Biobase {}
edge stjudem R {}
 
 
edge stjudem utils {}
 
edge stjudem utils {}
edge ProData R {}
 
 
edge ProData Biobase {}
 
edge ProData Biobase {}
edge SpikeIn R {}
 
 
edge SpikeIn affy {}
 
edge SpikeIn affy {}
 
edge ALL Biobase {}
 
edge ALL Biobase {}
edge faahKO R {}
 
edge AmpAffyExample R {}
 
 
edge AmpAffyExample affy {}
 
edge AmpAffyExample affy {}
edge rfcdmin R {}
 
edge hgu2beta7 R {}
 
edge kidpack R {}
 
 
edge kidpack Biobase {}
 
edge kidpack Biobase {}
edge CLL R {}
 
 
edge CLL affy {}
 
edge CLL affy {}
 
edge CLL Biobase {}
 
edge CLL Biobase {}
edge SpikeInSubset R {}
 
 
edge SpikeInSubset Biobase {}
 
edge SpikeInSubset Biobase {}
 
edge SpikeInSubset affy {}
 
edge SpikeInSubset affy {}
 
edge gaschYHS Biobase {}
 
edge gaschYHS Biobase {}
edge ALLMLL R {}
 
 
edge ALLMLL affy {}
 
edge ALLMLL affy {}
 
edge bronchialIL13 affy {}
 
edge bronchialIL13 affy {}
edge beta7 R {}
 
 
edge beta7 marray {}
 
edge beta7 marray {}
edge lungExpression R {}
 
 
edge lungExpression Biobase {}
 
edge lungExpression Biobase {}
 
edge HIVcDNAvantWout03 NONE {}
 
edge HIVcDNAvantWout03 NONE {}
Line 1,894: Line 560:
 
edge ppiData Rgraphviz {}
 
edge ppiData Rgraphviz {}
 
edge ppiData graph {}
 
edge ppiData graph {}
edge lymphoma R {}
 
 
edge colonCA Biobase {}
 
edge colonCA Biobase {}
edge SNAData R {}
 
 
edge SNAData graph {}
 
edge SNAData graph {}
edge ecoliLeucine R {}
 
 
edge ecoliLeucine affy {}
 
edge ecoliLeucine affy {}
edge davidTiling R {}
 
 
edge davidTiling Biobase {}
 
edge davidTiling Biobase {}
 
edge davidTiling tilingArray {}
 
edge davidTiling tilingArray {}
 
edge davidTiling GO {}
 
edge davidTiling GO {}
 
edge MEEBOdata NONE {}
 
edge MEEBOdata NONE {}
edge GGdata R {}
 
 
edge GGdata Biobase {}
 
edge GGdata Biobase {}
 
edge GGdata hgfocus {}
 
edge GGdata hgfocus {}
edge rn230rnentrezgprobe R {}
 
 
edge rn230rnentrezgprobe matchprobes {}
 
edge rn230rnentrezgprobe matchprobes {}
edge rn230brnrefseqprobe R {}
 
 
edge rn230brnrefseqprobe matchprobes {}
 
edge rn230brnrefseqprobe matchprobes {}
 
edge dmgenome1dmense utils {}
 
edge dmgenome1dmense utils {}
edge medicagoprobe R {}
 
 
edge medicagoprobe matchprobes {}
 
edge medicagoprobe matchprobes {}
 
edge dmgenome1dmugcdf utils {}
 
edge dmgenome1dmugcdf utils {}
Line 1,920: Line 578:
 
edge mm430ammensgcdf utils {}
 
edge mm430ammensgcdf utils {}
 
edge mm430ammrefseqcdf utils {}
 
edge mm430ammrefseqcdf utils {}
edge hsfocushsenstprobe R {}
 
 
edge hsfocushsenstprobe matchprobes {}
 
edge hsfocushsenstprobe matchprobes {}
edge ath1121501 R {}
 
edge hs133bhsentrezgprobe R {}
 
 
edge hs133bhsentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hs133bhsentrezgprobe matchprobes {}
 
edge drzebrafishdrugcdf utils {}
 
edge drzebrafishdrugcdf utils {}
 
edge mm430ammentrezg utils {}
 
edge mm430ammentrezg utils {}
edge hgu133bprobe R {}
 
 
edge hgu133bprobe matchprobes {}
 
edge hgu133bprobe matchprobes {}
edge mmex10stv1mmentrezgprobe R {}
 
 
edge mmex10stv1mmentrezgprobe matchprobes {}
 
edge mmex10stv1mmentrezgprobe matchprobes {}
edge rn34arnenseprobe R {}
 
 
edge rn34arnenseprobe matchprobes {}
 
edge rn34arnenseprobe matchprobes {}
 
edge soybeancdf utils {}
 
edge soybeancdf utils {}
edge hs133xptensgprobe R {}
 
 
edge hs133xptensgprobe matchprobes {}
 
edge hs133xptensgprobe matchprobes {}
edge rgug4105a R {}
 
edge rtu34probe R {}
 
 
edge rtu34probe matchprobes {}
 
edge rtu34probe matchprobes {}
 
edge hsex10stv2hsensgcdf utils {}
 
edge hsex10stv2hsensgcdf utils {}
Line 1,945: Line 594:
 
edge mm74av2mmensgcdf utils {}
 
edge mm74av2mmensgcdf utils {}
 
edge mm74bv2mmentrezgcdf utils {}
 
edge mm74bv2mmentrezgcdf utils {}
edge rn230rnenstprobe R {}
 
 
edge rn230rnenstprobe matchprobes {}
 
edge rn230rnenstprobe matchprobes {}
edge h10kcod R {}
 
 
edge hs95av2hsrefseq utils {}
 
edge hs95av2hsrefseq utils {}
 
edge hsex10stv2hsentrezg utils {}
 
edge hsex10stv2hsentrezg utils {}
edge mm430bmmenstprobe R {}
 
 
edge mm430bmmenstprobe matchprobes {}
 
edge mm430bmmenstprobe matchprobes {}
 
edge hsex10stv2hsense utils {}
 
edge hsex10stv2hsense utils {}
 
edge mm74av2mmentrezg utils {}
 
edge mm74av2mmentrezg utils {}
edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 R {}
 
 
edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 methods {}
 
edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 methods {}
 
edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 Biostrings {}
 
edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 Biostrings {}
 
edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 BSgenome {}
 
edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 BSgenome {}
 
edge dmgenome1dmensg utils {}
 
edge dmgenome1dmensg utils {}
edge rgu34a R {}
 
 
edge mm430bmmensecdf utils {}
 
edge mm430bmmensecdf utils {}
edge dmehomology R {}
 
 
edge mm430mmensgcdf utils {}
 
edge mm430mmensgcdf utils {}
edge hu35ksubaprobe R {}
 
 
edge hu35ksubaprobe matchprobes {}
 
edge hu35ksubaprobe matchprobes {}
edge rn230brnensgprobe R {}
 
 
edge rn230brnensgprobe matchprobes {}
 
edge rn230brnensgprobe matchprobes {}
 
edge hsex10stv2ptense utils {}
 
edge hsex10stv2ptense utils {}
edge osriceostigrprobe R {}
 
 
edge osriceostigrprobe matchprobes {}
 
edge osriceostigrprobe matchprobes {}
edge hsex10stv2hsentrezgprobe R {}
 
 
edge hsex10stv2hsentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hsex10stv2hsentrezgprobe matchprobes {}
edge cfcanine2cfenstprobe R {}
 
 
edge cfcanine2cfenstprobe matchprobes {}
 
edge cfcanine2cfenstprobe matchprobes {}
 
edge mm430mmentrezg utils {}
 
edge mm430mmentrezg utils {}
edge mm74av1mmrefseqprobe R {}
 
 
edge mm74av1mmrefseqprobe matchprobes {}
 
edge mm74av1mmrefseqprobe matchprobes {}
 
edge rnex10stv1rnrefseq utils {}
 
edge rnex10stv1rnrefseq utils {}
 
edge atgenomeattaircdf utils {}
 
edge atgenomeattaircdf utils {}
edge zmahomology R {}
 
edge rgu34b R {}
 
 
edge hs133xptensgcdf utils {}
 
edge hs133xptensgcdf utils {}
 
edge mu19ksubccdf utils {}
 
edge mu19ksubccdf utils {}
 
edge hgu95ecdf utils {}
 
edge hgu95ecdf utils {}
 
edge atgenomeatrefseqcdf utils {}
 
edge atgenomeatrefseqcdf utils {}
edge hs133phsrefseqprobe R {}
 
 
edge hs133phsrefseqprobe matchprobes {}
 
edge hs133phsrefseqprobe matchprobes {}
 
edge hsex10stv2hsensg utils {}
 
edge hsex10stv2hsensg utils {}
 
edge hs133xptentrezg utils {}
 
edge hs133xptentrezg utils {}
edge saureusprobe R {}
 
 
edge saureusprobe matchprobes {}
 
edge saureusprobe matchprobes {}
edge hs133av2hsenseprobe R {}
 
 
edge hs133av2hsenseprobe matchprobes {}
 
edge hs133av2hsenseprobe matchprobes {}
edge rhesusprobe R {}
 
 
edge rhesusprobe matchprobes {}
 
edge rhesusprobe matchprobes {}
 
edge mm74av2mmense utils {}
 
edge mm74av2mmense utils {}
 
edge mm11ksubammenstcdf utils {}
 
edge mm11ksubammenstcdf utils {}
edge hguqiagenv3 R {}
 
edge rgu34c R {}
 
 
edge mmex10stv1mmrefseq utils {}
 
edge mmex10stv1mmrefseq utils {}
 
edge cfcanine2cfentrezgcdf utils {}
 
edge cfcanine2cfentrezgcdf utils {}
edge ggchickenggenstprobe R {}
 
 
edge ggchickenggenstprobe matchprobes {}
 
edge ggchickenggenstprobe matchprobes {}
 
edge cyp450cdf utils {}
 
edge cyp450cdf utils {}
 
edge hsex10stv2ptensg utils {}
 
edge hsex10stv2ptensg utils {}
edge hs133pptenseprobe R {}
 
 
edge hs133pptenseprobe matchprobes {}
 
edge hs133pptenseprobe matchprobes {}
 
edge hs133xhsensgcdf utils {}
 
edge hs133xhsensgcdf utils {}
 
edge poplarcdf utils {}
 
edge poplarcdf utils {}
edge dmdrosophila2dmrefseqprobe R {}
 
 
edge dmdrosophila2dmrefseqprobe matchprobes {}
 
edge dmdrosophila2dmrefseqprobe matchprobes {}
edge hs95av2hsrefseqprobe R {}
 
 
edge hs95av2hsrefseqprobe matchprobes {}
 
edge hs95av2hsrefseqprobe matchprobes {}
 
edge hs133xhsentrezg utils {}
 
edge hs133xhsentrezg utils {}
edge hgug4100a R {}
 
 
edge mm11ksubammugcdf utils {}
 
edge mm11ksubammugcdf utils {}
 
edge mm74av2mmensg utils {}
 
edge mm74av2mmensg utils {}
edge rgug4130a R {}
 
edge hsex10stv2hsenstprobe R {}
 
 
edge hsex10stv2hsenstprobe matchprobes {}
 
edge hsex10stv2hsenstprobe matchprobes {}
edge mgu74cprobe R {}
 
 
edge mgu74cprobe matchprobes {}
 
edge mgu74cprobe matchprobes {}
edge mwgcod R {}
 
edge hsfocushsenseprobe R {}
 
 
edge hsfocushsenseprobe matchprobes {}
 
edge hsfocushsenseprobe matchprobes {}
edge mm24kresogen R {}
 
 
edge hs133bhsentrezgcdf utils {}
 
edge hs133bhsentrezgcdf utils {}
 
edge mmex10stv1mmense utils {}
 
edge mmex10stv1mmense utils {}
edge mm11ksubammenstprobe R {}
 
 
edge mm11ksubammenstprobe matchprobes {}
 
edge mm11ksubammenstprobe matchprobes {}
edge hs133av2ptensgprobe R {}
 
 
edge hs133av2ptensgprobe matchprobes {}
 
edge hs133av2ptensgprobe matchprobes {}
edge osahomology R {}
 
 
edge drzebrafishdrense utils {}
 
edge drzebrafishdrense utils {}
 
edge mm430mmrefseqcdf utils {}
 
edge mm430mmrefseqcdf utils {}
 
edge cfcanine2cfenstcdf utils {}
 
edge cfcanine2cfenstcdf utils {}
 
edge hs133aptenstcdf utils {}
 
edge hs133aptenstcdf utils {}
edge rn230rnenseprobe R {}
 
 
edge rn230rnenseprobe matchprobes {}
 
edge rn230rnenseprobe matchprobes {}
edge mm430bmmenseprobe R {}
 
 
edge mm430bmmenseprobe matchprobes {}
 
edge mm430bmmenseprobe matchprobes {}
 
edge mm74av1mmug utils {}
 
edge mm74av1mmug utils {}
Line 2,047: Line 660:
 
edge rae230bcdf utils {}
 
edge rae230bcdf utils {}
 
edge hu6800cdf utils {}
 
edge hu6800cdf utils {}
edge ath1attairprobe R {}
 
 
edge ath1attairprobe matchprobes {}
 
edge ath1attairprobe matchprobes {}
edge canineprobe R {}
 
 
edge canineprobe matchprobes {}
 
edge canineprobe matchprobes {}
 
edge mmex10stv1mmensg utils {}
 
edge mmex10stv1mmensg utils {}
 
edge hs133ahsrefseqcdf utils {}
 
edge hs133ahsrefseqcdf utils {}
edge cfcanine2cfenseprobe R {}
 
 
edge cfcanine2cfenseprobe matchprobes {}
 
edge cfcanine2cfenseprobe matchprobes {}
 
edge rnex10stv1rnugcdf utils {}
 
edge rnex10stv1rnugcdf utils {}
Line 2,062: Line 672:
 
edge ggchickenggenstcdf utils {}
 
edge ggchickenggenstcdf utils {}
 
edge mm74cv2mmenstcdf utils {}
 
edge mm74cv2mmenstcdf utils {}
edge zebrafish R {}
 
edge hsfocusptensgprobe R {}
 
 
edge hsfocusptensgprobe matchprobes {}
 
edge hsfocusptensgprobe matchprobes {}
edge mgug4121a R {}
 
edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 R {}
 
 
edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 methods {}
 
edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 methods {}
 
edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 Biostrings {}
 
edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 Biostrings {}
 
edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 BSgenome {}
 
edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 BSgenome {}
edge scehomology R {}
 
edge hs133bhsenstprobe R {}
 
 
edge hs133bhsenstprobe matchprobes {}
 
edge hs133bhsenstprobe matchprobes {}
edge mm11ksubammugprobe R {}
 
 
edge mm11ksubammugprobe matchprobes {}
 
edge mm11ksubammugprobe matchprobes {}
edge ggchickenggenseprobe R {}
 
 
edge ggchickenggenseprobe matchprobes {}
 
edge ggchickenggenseprobe matchprobes {}
 
edge mm430mmense utils {}
 
edge mm430mmense utils {}
edge mm74cv2mmenstprobe R {}
 
 
edge mm74cv2mmenstprobe matchprobes {}
 
edge mm74cv2mmenstprobe matchprobes {}
 
edge dmdrosophila2dmenst utils {}
 
edge dmdrosophila2dmenst utils {}
 
edge tomatocdf utils {}
 
edge tomatocdf utils {}
 
edge mm74av1mmenst utils {}
 
edge mm74av1mmenst utils {}
edge mgu74bv2probe R {}
 
 
edge mgu74bv2probe matchprobes {}
 
edge mgu74bv2probe matchprobes {}
 
edge rn230arnenstcdf utils {}
 
edge rn230arnenstcdf utils {}
 
edge hgu133acdf utils {}
 
edge hgu133acdf utils {}
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 R {}
 
 
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 methods {}
 
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 methods {}
 
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 Biostrings {}
 
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 Biostrings {}
 
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 BSgenome {}
 
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 BSgenome {}
edge hs95av2hsenstprobe R {}
 
 
edge hs95av2hsenstprobe matchprobes {}
 
edge hs95av2hsenstprobe matchprobes {}
edge vvihomology R {}
 
edge atgenomeattigrprobe R {}
 
 
edge atgenomeattigrprobe matchprobes {}
 
edge atgenomeattigrprobe matchprobes {}
 
edge cfcanine2cfense utils {}
 
edge cfcanine2cfense utils {}
Line 2,100: Line 696:
 
edge mm74cv2mmentrezgcdf utils {}
 
edge mm74cv2mmentrezgcdf utils {}
 
edge hs133ahsense utils {}
 
edge hs133ahsense utils {}
edge rae230a R {}
 
edge dmdrosophila2dmenstprobe R {}
 
 
edge dmdrosophila2dmenstprobe matchprobes {}
 
edge dmdrosophila2dmenstprobe matchprobes {}
edge hsex10stv2hsenseprobe R {}
 
 
edge hsex10stv2hsenseprobe matchprobes {}
 
edge hsex10stv2hsenseprobe matchprobes {}
edge hsfocusptentrezgprobe R {}
 
 
edge hsfocusptentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hsfocusptentrezgprobe matchprobes {}
 
edge rnex10stv1rnentrezg utils {}
 
edge rnex10stv1rnentrezg utils {}
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 R {}
 
 
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 methods {}
 
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 methods {}
 
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 Biostrings {}
 
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 Biostrings {}
 
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 BSgenome {}
 
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 BSgenome {}
 
edge moe430bcdf utils {}
 
edge moe430bcdf utils {}
edge rnex10stv1rnensgprobe R {}
 
 
edge rnex10stv1rnensgprobe matchprobes {}
 
edge rnex10stv1rnensgprobe matchprobes {}
edge mm430mmentrezgprobe R {}
 
 
edge mm430mmentrezgprobe matchprobes {}
 
edge mm430mmentrezgprobe matchprobes {}
 
edge ye6100subacdf utils {}
 
edge ye6100subacdf utils {}
 
edge mm430mmensg utils {}
 
edge mm430mmensg utils {}
 
edge hs133xhsug utils {}
 
edge hs133xhsug utils {}
edge mm11ksubammenseprobe R {}
 
 
edge mm11ksubammenseprobe matchprobes {}
 
edge mm11ksubammenseprobe matchprobes {}
 
edge chickencdf utils {}
 
edge chickencdf utils {}
Line 2,126: Line 714:
 
edge hs133aptense utils {}
 
edge hs133aptense utils {}
 
edge rn230rnenstcdf utils {}
 
edge rn230rnenstcdf utils {}
edge rn230arnenstprobe R {}
 
 
edge rn230arnenstprobe matchprobes {}
 
edge rn230arnenstprobe matchprobes {}
edge rae230b R {}
 
 
edge cfcanine2cfrefseq utils {}
 
edge cfcanine2cfrefseq utils {}
edge hs25kresogen R {}
 
 
edge mm430bmmentrezg utils {}
 
edge mm430bmmentrezg utils {}
edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 R {}
 
 
edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 methods {}
 
edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 methods {}
 
edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 Biostrings {}
 
edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 Biostrings {}
 
edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 BSgenome {}
 
edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 BSgenome {}
edge cfcanine2cfugprobe R {}
 
 
edge cfcanine2cfugprobe matchprobes {}
 
edge cfcanine2cfugprobe matchprobes {}
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 R {}
 
 
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 methods {}
 
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 methods {}
 
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 Biostrings {}
 
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 Biostrings {}
Line 2,145: Line 727:
 
edge zebrafishcdf utils {}
 
edge zebrafishcdf utils {}
 
edge rat2302cdf utils {}
 
edge rat2302cdf utils {}
edge moe430bprobe R {}
 
 
edge moe430bprobe matchprobes {}
 
edge moe430bprobe matchprobes {}
 
edge rn230rnugcdf utils {}
 
edge rn230rnugcdf utils {}
 
edge cfcanine2cfensg utils {}
 
edge cfcanine2cfensg utils {}
edge hgu95bprobe R {}
 
 
edge hgu95bprobe matchprobes {}
 
edge hgu95bprobe matchprobes {}
 
edge yeast2cdf utils {}
 
edge yeast2cdf utils {}
edge hgu133plus2probe R {}
 
 
edge hgu133plus2probe matchprobes {}
 
edge hgu133plus2probe matchprobes {}
 
edge hs133ahsensg utils {}
 
edge hs133ahsensg utils {}
 
edge mm74av1mmrefseqcdf utils {}
 
edge mm74av1mmrefseqcdf utils {}
edge mmex10stv1mmenstprobe R {}
 
 
edge mmex10stv1mmenstprobe matchprobes {}
 
edge mmex10stv1mmenstprobe matchprobes {}
edge celhomology R {}
 
edge cfahomology R {}
 
 
edge hsfocusptenstcdf utils {}
 
edge hsfocusptenstcdf utils {}
edge klahomology R {}
 
 
edge mm74bv2mmensecdf utils {}
 
edge mm74bv2mmensecdf utils {}
 
edge rn230brnug utils {}
 
edge rn230brnug utils {}
 
edge hs133xhsrefseqcdf utils {}
 
edge hs133xhsrefseqcdf utils {}
 
edge hs133aptensg utils {}
 
edge hs133aptensg utils {}
edge hgu133a2probe R {}
 
 
edge hgu133a2probe matchprobes {}
 
edge hgu133a2probe matchprobes {}
edge citrusprobe R {}
 
 
edge citrusprobe matchprobes {}
 
edge citrusprobe matchprobes {}
edge hs133ahsugprobe R {}
 
 
edge hs133ahsugprobe matchprobes {}
 
edge hs133ahsugprobe matchprobes {}
edge hsex10stv2ptensgprobe R {}
 
 
edge hsex10stv2ptensgprobe matchprobes {}
 
edge hsex10stv2ptensgprobe matchprobes {}
edge ggchickenggugprobe R {}
 
 
edge ggchickenggugprobe matchprobes {}
 
edge ggchickenggugprobe matchprobes {}
edge mm74cv2mmugprobe R {}
 
 
edge mm74cv2mmugprobe matchprobes {}
 
edge mm74cv2mmugprobe matchprobes {}
 
edge dmgenome1dmenst utils {}
 
edge dmgenome1dmenst utils {}
edge rn34arnentrezgprobe R {}
 
 
edge rn34arnentrezgprobe matchprobes {}
 
edge rn34arnentrezgprobe matchprobes {}
edge hgu95av2 R {}
 
edge mm74av2mmenstprobe R {}
 
 
edge mm74av2mmenstprobe matchprobes {}
 
edge mm74av2mmenstprobe matchprobes {}
edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 R {}
 
 
edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 methods {}
 
edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 methods {}
 
edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 Biostrings {}
 
edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 Biostrings {}
 
edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 BSgenome {}
 
edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 BSgenome {}
 
edge mmex10stv1mmensecdf utils {}
 
edge mmex10stv1mmensecdf utils {}
edge hs133bhsenseprobe R {}
 
 
edge hs133bhsenseprobe matchprobes {}
 
edge hs133bhsenseprobe matchprobes {}
 
edge hsfocushsenstcdf utils {}
 
edge hsfocushsenstcdf utils {}
edge mm74cv2mmentrezgprobe R {}
 
 
edge mm74cv2mmentrezgprobe matchprobes {}
 
edge mm74cv2mmentrezgprobe matchprobes {}
 
edge mm11ksubbmmenstcdf utils {}
 
edge mm11ksubbmmenstcdf utils {}
edge mm74cv2mmenseprobe R {}
 
 
edge mm74cv2mmenseprobe matchprobes {}
 
edge mm74cv2mmenseprobe matchprobes {}
 
edge hs133xhsense utils {}
 
edge hs133xhsense utils {}
edge ratLLMappings R {}
 
 
edge dmdrosophila2dmug utils {}
 
edge dmdrosophila2dmug utils {}
edge hgug4101a R {}
 
edge mm74bv2mmensgprobe R {}
 
 
edge mm74bv2mmensgprobe matchprobes {}
 
edge mm74bv2mmensgprobe matchprobes {}
edge rgu34cprobe R {}
 
 
edge rgu34cprobe matchprobes {}
 
edge rgu34cprobe matchprobes {}
edge rn230arnugprobe R {}
 
 
edge rn230arnugprobe matchprobes {}
 
edge rn230arnugprobe matchprobes {}
 
edge hs133xptense utils {}
 
edge hs133xptense utils {}
 
edge hsex10stv2hsenst utils {}
 
edge hsex10stv2hsenst utils {}
edge hs95av2hsenseprobe R {}
 
 
edge hs95av2hsenseprobe matchprobes {}
 
edge hs95av2hsenseprobe matchprobes {}
 
edge mgu74bv2cdf utils {}
 
edge mgu74bv2cdf utils {}
 
edge rn34arnrefseqcdf utils {}
 
edge rn34arnrefseqcdf utils {}
 
edge hsex10stv2ptenst utils {}
 
edge hsex10stv2ptenst utils {}
edge ygs98 R {}
 
edge dmdrosophila2dmenseprobe R {}
 
 
edge dmdrosophila2dmenseprobe matchprobes {}
 
edge dmdrosophila2dmenseprobe matchprobes {}
 
edge hthgu133acdf utils {}
 
edge hthgu133acdf utils {}
edge agprobe R {}
 
 
edge agprobe matchprobes {}
 
edge agprobe matchprobes {}
edge hsfocushsentrezgprobe R {}
 
 
edge hsfocushsentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hsfocushsentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hs133xhsensg utils {}
 
edge hs133xhsensg utils {}
 
edge drzebrafishdrensgcdf utils {}
 
edge drzebrafishdrensgcdf utils {}
 
edge dmgenome1dmensgcdf utils {}
 
edge dmgenome1dmensgcdf utils {}
edge hu35ksubdprobe R {}
 
 
edge hu35ksubdprobe matchprobes {}
 
edge hu35ksubdprobe matchprobes {}
edge egohomology R {}
 
edge hs133bptensgprobe R {}
 
 
edge hs133bptensgprobe matchprobes {}
 
edge hs133bptensgprobe matchprobes {}
edge rtu34 R {}
 
edge rn230rnugprobe R {}
 
 
edge rn230rnugprobe matchprobes {}
 
edge rn230rnugprobe matchprobes {}
edge maizeprobe R {}
 
 
edge maizeprobe matchprobes {}
 
edge maizeprobe matchprobes {}
edge rn230arnenseprobe R {}
 
 
edge rn230arnenseprobe matchprobes {}
 
edge rn230arnenseprobe matchprobes {}
 
edge drzebrafishdrentrezg utils {}
 
edge drzebrafishdrentrezg utils {}
 
edge hs133xptensg utils {}
 
edge hs133xptensg utils {}
 
edge hs133pptenstcdf utils {}
 
edge hs133pptenstcdf utils {}
edge hgu133a2 R {}
 
 
edge mm74av2mmenst utils {}
 
edge mm74av2mmenst utils {}
edge vvgrapevvtigrprobe R {}
 
 
edge vvgrapevvtigrprobe matchprobes {}
 
edge vvgrapevvtigrprobe matchprobes {}
 
edge hsex10stv2hsugcdf utils {}
 
edge hsex10stv2hsugcdf utils {}
Line 2,250: Line 793:
 
edge mm430ammugcdf utils {}
 
edge mm430ammugcdf utils {}
 
edge ggchickenggrefseq utils {}
 
edge ggchickenggrefseq utils {}
edge hs95av2ptensgprobe R {}
 
 
edge hs95av2ptensgprobe matchprobes {}
 
edge hs95av2ptensgprobe matchprobes {}
 
edge hs133av2hsrefseqcdf utils {}
 
edge hs133av2hsrefseqcdf utils {}
edge mmex10stv1mmenseprobe R {}
 
 
edge mmex10stv1mmenseprobe matchprobes {}
 
edge mmex10stv1mmenseprobe matchprobes {}
edge mm430ammensgprobe R {}
 
 
edge mm430ammensgprobe matchprobes {}
 
edge mm430ammensgprobe matchprobes {}
edge hs133ahsrefseqprobe R {}
 
 
edge hs133ahsrefseqprobe matchprobes {}
 
edge hs133ahsrefseqprobe matchprobes {}
edge mgug4122a R {}
 
 
edge hs133bhsense utils {}
 
edge hs133bhsense utils {}
 
edge hs133phsenstcdf utils {}
 
edge hs133phsenstcdf utils {}
 
edge hs133bptentrezgcdf utils {}
 
edge hs133bptentrezgcdf utils {}
edge hgu133aprobe R {}
 
 
edge hgu133aprobe matchprobes {}
 
edge hgu133aprobe matchprobes {}
 
edge hs133bhsenstcdf utils {}
 
edge hs133bhsenstcdf utils {}
 
edge dmdrosophila2dmrefseq utils {}
 
edge dmdrosophila2dmrefseq utils {}
 
edge hs133bptense utils {}
 
edge hs133bptense utils {}
edge mm74av2mmenseprobe R {}
 
 
edge mm74av2mmenseprobe matchprobes {}
 
edge mm74av2mmenseprobe matchprobes {}
 
edge mm11ksubammense utils {}
 
edge mm11ksubammense utils {}
Line 2,274: Line 810:
 
edge mmex10stv1mmenst utils {}
 
edge mmex10stv1mmenst utils {}
 
edge dmdrosophila2dmenstcdf utils {}
 
edge dmdrosophila2dmenstcdf utils {}
edge hsfocushsugprobe R {}
 
 
edge hsfocushsugprobe matchprobes {}
 
edge hsfocushsugprobe matchprobes {}
 
edge atgenomeattigr utils {}
 
edge atgenomeattigr utils {}
 
edge hgu133atagcdf utils {}
 
edge hgu133atagcdf utils {}
edge mm11ksubbmmugprobe R {}
 
 
edge mm11ksubbmmugprobe matchprobes {}
 
edge mm11ksubbmmugprobe matchprobes {}
 
edge drzebrafishdrenst utils {}
 
edge drzebrafishdrenst utils {}
 
edge hgu133a2cdf utils {}
 
edge hgu133a2cdf utils {}
edge drzebrafishdrenstprobe R {}
 
 
edge drzebrafishdrenstprobe matchprobes {}
 
edge drzebrafishdrenstprobe matchprobes {}
 
edge hs133phsentrezgcdf utils {}
 
edge hs133phsentrezgcdf utils {}
Line 2,289: Line 822:
 
edge hs95av2hsentrezgcdf utils {}
 
edge hs95av2hsentrezgcdf utils {}
 
edge ye6100subccdf utils {}
 
edge ye6100subccdf utils {}
edge rn34arnrefseqprobe R {}
 
 
edge rn34arnrefseqprobe matchprobes {}
 
edge rn34arnrefseqprobe matchprobes {}
 
edge hsfocushsrefseqcdf utils {}
 
edge hsfocushsrefseqcdf utils {}
Line 2,297: Line 829:
 
edge hs133bptensg utils {}
 
edge hs133bptensg utils {}
 
edge mm11ksubammensg utils {}
 
edge mm11ksubammensg utils {}
edge mgrhomology R {}
 
edge cinhomology R {}
 
 
edge rn230rnrefseqcdf utils {}
 
edge rn230rnrefseqcdf utils {}
 
edge mu6500subacdf utils {}
 
edge mu6500subacdf utils {}
 
edge hs133pptense utils {}
 
edge hs133pptense utils {}
edge tomatoprobe R {}
 
 
edge tomatoprobe matchprobes {}
 
edge tomatoprobe matchprobes {}
 
edge rgu34acdf utils {}
 
edge rgu34acdf utils {}
 
edge mm430bmmrefseqcdf utils {}
 
edge mm430bmmrefseqcdf utils {}
edge osriceosrefseqprobe R {}
 
 
edge osriceosrefseqprobe matchprobes {}
 
edge osriceosrefseqprobe matchprobes {}
edge mi16cod R {}
 
 
edge dmdrosophila2dmugcdf utils {}
 
edge dmdrosophila2dmugcdf utils {}
edge bovineprobe R {}
 
 
edge bovineprobe matchprobes {}
 
edge bovineprobe matchprobes {}
 
edge hgu95av2cdf utils {}
 
edge hgu95av2cdf utils {}
edge m20kcod R {}
 
 
edge mm74bv2mmensgcdf utils {}
 
edge mm74bv2mmensgcdf utils {}
 
edge mm11ksubbmmugcdf utils {}
 
edge mm11ksubbmmugcdf utils {}
edge gmahomology R {}
 
 
edge mgu74bcdf utils {}
 
edge mgu74bcdf utils {}
 
edge mm74av1mmugcdf utils {}
 
edge mm74av1mmugcdf utils {}
 
edge cfcanine2cfrefseqcdf utils {}
 
edge cfcanine2cfrefseqcdf utils {}
edge ri16cod R {}
 
 
edge hu6800subbcdf utils {}
 
edge hu6800subbcdf utils {}
 
edge hs133phsensg utils {}
 
edge hs133phsensg utils {}
 
edge rn34arnenstcdf utils {}
 
edge rn34arnenstcdf utils {}
 
edge mm74bv2mmentrezg utils {}
 
edge mm74bv2mmentrezg utils {}
edge mm74av1mmentrezgprobe R {}
 
 
edge mm74av1mmentrezgprobe matchprobes {}
 
edge mm74av1mmentrezgprobe matchprobes {}
 
edge mm430mmenst utils {}
 
edge mm430mmenst utils {}
 
edge hsfocushsugcdf utils {}
 
edge hsfocushsugcdf utils {}
edge test3probe R {}
 
 
edge test3probe matchprobes {}
 
edge test3probe matchprobes {}
edge soybeanprobe R {}
 
 
edge soybeanprobe matchprobes {}
 
edge soybeanprobe matchprobes {}
edge ratCHRLOC R {}
 
 
edge mmex10stv1mmensgcdf utils {}
 
edge mmex10stv1mmensgcdf utils {}
edge humanLLMappings R {}
 
 
edge hs133pptensg utils {}
 
edge hs133pptensg utils {}
 
edge mm74av1mmenstcdf utils {}
 
edge mm74av1mmenstcdf utils {}
edge dmgenome1dmenstprobe R {}
 
 
edge dmgenome1dmenstprobe matchprobes {}
 
edge dmgenome1dmenstprobe matchprobes {}
 
edge hgu95bcdf utils {}
 
edge hgu95bcdf utils {}
edge mgu74bprobe R {}
 
 
edge mgu74bprobe matchprobes {}
 
edge mgu74bprobe matchprobes {}
edge rat2302 R {}
 
 
edge mmex10stv1mmentrezg utils {}
 
edge mmex10stv1mmentrezg utils {}
 
edge hs133xhsugcdf utils {}
 
edge hs133xhsugcdf utils {}
edge hs133phsugprobe R {}
 
 
edge hs133phsugprobe matchprobes {}
 
edge hs133phsugprobe matchprobes {}
 
edge ggchickenggrefseqcdf utils {}
 
edge ggchickenggrefseqcdf utils {}
 
edge cfcanine2cfenst utils {}
 
edge cfcanine2cfenst utils {}
edge mm430ammrefseqprobe R {}
 
 
edge mm430ammrefseqprobe matchprobes {}
 
edge mm430ammrefseqprobe matchprobes {}
 
edge mm74av2mmug utils {}
 
edge mm74av2mmug utils {}
edge mm430mmensgprobe R {}
 
 
edge mm430mmensgprobe matchprobes {}
 
edge mm430mmensgprobe matchprobes {}
 
edge hs133phsugcdf utils {}
 
edge hs133phsugcdf utils {}
edge hs133bhsugprobe R {}
 
 
edge hs133bhsugprobe matchprobes {}
 
edge hs133bhsugprobe matchprobes {}
 
edge hs133ahsenst utils {}
 
edge hs133ahsenst utils {}
 
edge rnex10stv1rnentrezgcdf utils {}
 
edge rnex10stv1rnentrezgcdf utils {}
 
edge hs133ahsug utils {}
 
edge hs133ahsug utils {}
edge dmdrosophila2dmugprobe R {}
 
 
edge dmdrosophila2dmugprobe matchprobes {}
 
edge dmdrosophila2dmugprobe matchprobes {}
 
edge mm11ksubbmmrefseq utils {}
 
edge mm11ksubbmmrefseq utils {}
 
edge hs133aptenst utils {}
 
edge hs133aptenst utils {}
edge mgug4104a R {}
 
 
edge hs133av2hsentrezgcdf utils {}
 
edge hs133av2hsentrezgcdf utils {}
 
edge test1cdf utils {}
 
edge test1cdf utils {}
edge adme16cod R {}
 
 
edge rn230arnugcdf utils {}
 
edge rn230arnugcdf utils {}
 
edge maizecdf utils {}
 
edge maizecdf utils {}
edge pfahomology R {}
 
edge xlahomology R {}
 
edge ggahomology R {}
 
edge plasmodiumanophelesprobe R {}
 
 
edge plasmodiumanophelesprobe matchprobes {}
 
edge plasmodiumanophelesprobe matchprobes {}
edge drzebrafishdrenseprobe R {}
 
 
edge drzebrafishdrenseprobe matchprobes {}
 
edge drzebrafishdrenseprobe matchprobes {}
edge hs133ahsensgprobe R {}
 
 
edge hs133ahsensgprobe matchprobes {}
 
edge hs133ahsensgprobe matchprobes {}
 
edge hsex10stv2hsrefseqcdf utils {}
 
edge hsex10stv2hsrefseqcdf utils {}
 
edge rn34arnrefseq utils {}
 
edge rn34arnrefseq utils {}
 
edge mm74av1mmrefseq utils {}
 
edge mm74av1mmrefseq utils {}
edge spohomology R {}
 
 
edge gp53cdf utils {}
 
edge gp53cdf utils {}
 
edge mm11ksubammrefseqcdf utils {}
 
edge mm11ksubammrefseqcdf utils {}
edge ecoliasv2probe R {}
 
 
edge ecoliasv2probe matchprobes {}
 
edge ecoliasv2probe matchprobes {}
edge rn230brnugprobe R {}
 
 
edge rn230brnugprobe matchprobes {}
 
edge rn230brnugprobe matchprobes {}
edge mgu74av2 R {}
 
edge hs133aptenstprobe R {}
 
 
edge hs133aptenstprobe matchprobes {}
 
edge hs133aptenstprobe matchprobes {}
edge atgenomeattairprobe R {}
 
 
edge atgenomeattairprobe matchprobes {}
 
edge atgenomeattairprobe matchprobes {}
 
edge hs133av2ptenstcdf utils {}
 
edge hs133av2ptenstcdf utils {}
edge mgu74cv2probe R {}
 
 
edge mgu74cv2probe matchprobes {}
 
edge mgu74cv2probe matchprobes {}
 
edge hs95av2hsense utils {}
 
edge hs95av2hsense utils {}
 
edge ggchickenggug utils {}
 
edge ggchickenggug utils {}
edge hgu95eprobe R {}
 
 
edge hgu95eprobe matchprobes {}
 
edge hgu95eprobe matchprobes {}
edge hs133pptentrezgprobe R {}
 
 
edge hs133pptentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hs133pptentrezgprobe matchprobes {}
edge canine2probe R {}
 
 
edge canine2probe matchprobes {}
 
edge canine2probe matchprobes {}
 
edge mm11ksubbmmense utils {}
 
edge mm11ksubbmmense utils {}
 
edge hsfocushsense utils {}
 
edge hsfocushsense utils {}
edge mguatlas5k R {}
 
edge hwgcod R {}
 
edge mm11ksubbmmenstprobe R {}
 
 
edge mm11ksubbmmenstprobe matchprobes {}
 
edge mm11ksubbmmenstprobe matchprobes {}
 
edge rn230arnense utils {}
 
edge rn230arnense utils {}
 
edge hs95av2ptense utils {}
 
edge hs95av2ptense utils {}
 
edge ath1attigr utils {}
 
edge ath1attigr utils {}
edge yeast2probe R {}
 
 
edge yeast2probe matchprobes {}
 
edge yeast2probe matchprobes {}
 
edge mm430bmmrefseq utils {}
 
edge mm430bmmrefseq utils {}
Line 2,421: Line 909:
 
edge hs133av2hsenstcdf utils {}
 
edge hs133av2hsenstcdf utils {}
 
edge agcdf utils {}
 
edge agcdf utils {}
edge rn34arnugprobe R {}
 
 
edge rn34arnugprobe matchprobes {}
 
edge rn34arnugprobe matchprobes {}
 
edge hs133xhsenst utils {}
 
edge hs133xhsenst utils {}
edge canine2 R {}
 
 
edge hs95av2hsensg utils {}
 
edge hs95av2hsensg utils {}
 
edge hu35ksubdcdf utils {}
 
edge hu35ksubdcdf utils {}
edge mm74av1mmugprobe R {}
 
 
edge mm74av1mmugprobe matchprobes {}
 
edge mm74av1mmugprobe matchprobes {}
edge hu35ksuba R {}
 
edge dmgenome1dmenseprobe R {}
 
 
edge dmgenome1dmenseprobe matchprobes {}
 
edge dmgenome1dmenseprobe matchprobes {}
 
edge mm11ksubbmmensg utils {}
 
edge mm11ksubbmmensg utils {}
edge humanCHRLOC R {}
 
 
edge hs133xptenst utils {}
 
edge hs133xptenst utils {}
 
edge hsfocushsensg utils {}
 
edge hsfocushsensg utils {}
edge cfcanine2cfrefseqprobe R {}
 
 
edge cfcanine2cfrefseqprobe matchprobes {}
 
edge cfcanine2cfrefseqprobe matchprobes {}
edge hs133phsenstprobe R {}
 
 
edge hs133phsenstprobe matchprobes {}
 
edge hs133phsenstprobe matchprobes {}
 
edge hs133bhsrefseqcdf utils {}
 
edge hs133bhsrefseqcdf utils {}
 
edge rn230arnensg utils {}
 
edge rn230arnensg utils {}
 
edge hs95av2ptensg utils {}
 
edge hs95av2ptensg utils {}
edge ncrhomology R {}
 
 
edge mm430mmug utils {}
 
edge mm430mmug utils {}
edge btahomology R {}
 
 
edge mm74cv2mmrefseqcdf utils {}
 
edge mm74cv2mmrefseqcdf utils {}
 
edge ath1121501cdf utils {}
 
edge ath1121501cdf utils {}
 
edge hsfocusptensg utils {}
 
edge hsfocusptensg utils {}
 
edge ricecdf utils {}
 
edge ricecdf utils {}
edge hu35ksubb R {}
 
 
edge mm11ksubammensecdf utils {}
 
edge mm11ksubammensecdf utils {}
edge wheatprobe R {}
 
 
edge wheatprobe matchprobes {}
 
edge wheatprobe matchprobes {}
 
edge hs133av2hsugcdf utils {}
 
edge hs133av2hsugcdf utils {}
 
edge drosophila2cdf utils {}
 
edge drosophila2cdf utils {}
edge moe430aprobe R {}
 
 
edge moe430aprobe matchprobes {}
 
edge moe430aprobe matchprobes {}
 
edge hs95av2ptenstcdf utils {}
 
edge hs95av2ptenstcdf utils {}
 
edge hs95av2hsrefseqcdf utils {}
 
edge hs95av2hsrefseqcdf utils {}
edge hgu95aprobe R {}
 
 
edge hgu95aprobe matchprobes {}
 
edge hgu95aprobe matchprobes {}
 
edge atgenomeattigrcdf utils {}
 
edge atgenomeattigrcdf utils {}
edge barley1probe R {}
 
 
edge barley1probe matchprobes {}
 
edge barley1probe matchprobes {}
edge hu35ksubc R {}
 
edge mm74av1mmensgprobe R {}
 
 
edge mm74av1mmensgprobe matchprobes {}
 
edge mm74av1mmensgprobe matchprobes {}
 
edge mu6500subccdf utils {}
 
edge mu6500subccdf utils {}
edge hguDKFZ31 R {}
 
 
edge dmdrosophila2dmrefseqcdf utils {}
 
edge dmdrosophila2dmrefseqcdf utils {}
edge dmgenome1dmrefseqprobe R {}
 
 
edge dmgenome1dmrefseqprobe matchprobes {}
 
edge dmgenome1dmrefseqprobe matchprobes {}
 
edge rgu34ccdf utils {}
 
edge rgu34ccdf utils {}
edge hgfocus R {}
 
edge hs133xhsensgprobe R {}
 
 
edge hs133xhsensgprobe matchprobes {}
 
edge hs133xhsensgprobe matchprobes {}
 
edge hsfocushsrefseq utils {}
 
edge hsfocushsrefseq utils {}
edge GO R {}
 
edge hcg110probe R {}
 
 
edge hcg110probe matchprobes {}
 
edge hcg110probe matchprobes {}
edge hu35ksubd R {}
 
 
edge hs95av2hsenstcdf utils {}
 
edge hs95av2hsenstcdf utils {}
 
edge mm430mmentrezgcdf utils {}
 
edge mm430mmentrezgcdf utils {}
 
edge hs133bhsrefseq utils {}
 
edge hs133bhsrefseq utils {}
edge hs133aptenseprobe R {}
 
 
edge hs133aptenseprobe matchprobes {}
 
edge hs133aptenseprobe matchprobes {}
edge rn230rnrefseqprobe R {}
 
 
edge rn230rnrefseqprobe matchprobes {}
 
edge rn230rnrefseqprobe matchprobes {}
edge hs133xptenstprobe R {}
 
 
edge hs133xptenstprobe matchprobes {}
 
edge hs133xptenstprobe matchprobes {}
edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 R {}
 
 
edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 methods {}
 
edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 methods {}
 
edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 Biostrings {}
 
edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 Biostrings {}
 
edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 BSgenome {}
 
edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 BSgenome {}
edge mu11ksubbprobe R {}
 
 
edge mu11ksubbprobe matchprobes {}
 
edge mu11ksubbprobe matchprobes {}
 
edge rn230arnrefseqcdf utils {}
 
edge rn230arnrefseqcdf utils {}
Line 2,501: Line 960:
 
edge hu6800subdcdf utils {}
 
edge hu6800subdcdf utils {}
 
edge mm74bv2mmug utils {}
 
edge mm74bv2mmug utils {}
edge hcg110 R {}
 
 
edge ecoliasv2cdf utils {}
 
edge ecoliasv2cdf utils {}
 
edge hs133bhsenst utils {}
 
edge hs133bhsenst utils {}
edge mm74av2mmentrezgprobe R {}
 
 
edge mm74av2mmentrezgprobe matchprobes {}
 
edge mm74av2mmentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hivprtplus2cdf utils {}
 
edge hivprtplus2cdf utils {}
edge hs133phsentrezgprobe R {}
 
 
edge hs133phsentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hs133phsentrezgprobe matchprobes {}
edge mm11ksubbmmenseprobe R {}
 
 
edge mm11ksubbmmenseprobe matchprobes {}
 
edge mm11ksubbmmenseprobe matchprobes {}
 
edge cfcanine2cfensecdf utils {}
 
edge cfcanine2cfensecdf utils {}
edge hs133xptentrezgprobe R {}
 
 
edge hs133xptentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hs133xptentrezgprobe matchprobes {}
 
edge mm74av1mmentrezgcdf utils {}
 
edge mm74av1mmentrezgcdf utils {}
Line 2,518: Line 972:
 
edge hs133bptenst utils {}
 
edge hs133bptenst utils {}
 
edge mu19ksubbcdf utils {}
 
edge mu19ksubbcdf utils {}
edge rn230brnenstprobe R {}
 
 
edge rn230brnenstprobe matchprobes {}
 
edge rn230brnenstprobe matchprobes {}
 
edge mm11ksubammenst utils {}
 
edge mm11ksubammenst utils {}
Line 2,524: Line 977:
 
edge hgu95dcdf utils {}
 
edge hgu95dcdf utils {}
 
edge mmex10stv1mmrefseqcdf utils {}
 
edge mmex10stv1mmrefseqcdf utils {}
edge mm74cv2mmrefseqprobe R {}
 
 
edge mm74cv2mmrefseqprobe matchprobes {}
 
edge mm74cv2mmrefseqprobe matchprobes {}
edge rgu34bprobe R {}
 
 
edge rgu34bprobe matchprobes {}
 
edge rgu34bprobe matchprobes {}
edge hs133av2hsugprobe R {}
 
 
edge hs133av2hsugprobe matchprobes {}
 
edge hs133av2hsugprobe matchprobes {}
 
edge drzebrafishdrug utils {}
 
edge drzebrafishdrug utils {}
Line 2,535: Line 985:
 
edge mm430mmugcdf utils {}
 
edge mm430mmugcdf utils {}
 
edge mm430ammenstcdf utils {}
 
edge mm430ammenstcdf utils {}
edge rn34arnensgprobe R {}
 
 
edge rn34arnensgprobe matchprobes {}
 
edge rn34arnensgprobe matchprobes {}
 
edge mgu74av2cdf utils {}
 
edge mgu74av2cdf utils {}
edge ath1121501probe R {}
 
 
edge ath1121501probe matchprobes {}
 
edge ath1121501probe matchprobes {}
 
edge rn230rnug utils {}
 
edge rn230rnug utils {}
 
edge osriceostigr utils {}
 
edge osriceostigr utils {}
 
edge citruscdf utils {}
 
edge citruscdf utils {}
edge mmuhomology R {}
 
 
edge mm74av2mmrefseqcdf utils {}
 
edge mm74av2mmrefseqcdf utils {}
 
edge hs133av2hsense utils {}
 
edge hs133av2hsense utils {}
 
edge hs133ahsensecdf utils {}
 
edge hs133ahsensecdf utils {}
edge hs133phsenseprobe R {}
 
 
edge hs133phsenseprobe matchprobes {}
 
edge hs133phsenseprobe matchprobes {}
edge indac R {}
 
 
edge hsex10stv2hsenstcdf utils {}
 
edge hsex10stv2hsenstcdf utils {}
 
edge ggchickenggensecdf utils {}
 
edge ggchickenggensecdf utils {}
Line 2,558: Line 1,003:
 
edge hs133av2ptense utils {}
 
edge hs133av2ptense utils {}
 
edge hs133phsenst utils {}
 
edge hs133phsenst utils {}
edge mm74av2mmrefseqprobe R {}
 
 
edge mm74av2mmrefseqprobe matchprobes {}
 
edge mm74av2mmrefseqprobe matchprobes {}
 
edge mm430ammentrezgcdf utils {}
 
edge mm430ammentrezgcdf utils {}
edge hu35ksubcprobe R {}
 
 
edge hu35ksubcprobe matchprobes {}
 
edge hu35ksubcprobe matchprobes {}
 
edge rn230brnense utils {}
 
edge rn230brnense utils {}
Line 2,568: Line 1,011:
 
edge mm430bmmugcdf utils {}
 
edge mm430bmmugcdf utils {}
 
edge mm430mmenstcdf utils {}
 
edge mm430mmenstcdf utils {}
edge mm11ksubammrefseqprobe R {}
 
 
edge mm11ksubammrefseqprobe matchprobes {}
 
edge mm11ksubammrefseqprobe matchprobes {}
edge chickenprobe R {}
 
 
edge chickenprobe matchprobes {}
 
edge chickenprobe matchprobes {}
edge hgu95a R {}
 
 
edge hs133av2hsensg utils {}
 
edge hs133av2hsensg utils {}
 
edge rn230arnentrezgcdf utils {}
 
edge rn230arnentrezgcdf utils {}
edge atgenomeatrefseqprobe R {}
 
 
edge atgenomeatrefseqprobe matchprobes {}
 
edge atgenomeatrefseqprobe matchprobes {}
edge poplarprobe R {}
 
 
edge poplarprobe matchprobes {}
 
edge poplarprobe matchprobes {}
 
edge rn230arnensecdf utils {}
 
edge rn230arnensecdf utils {}
edge hs133av2hsensgprobe R {}
 
 
edge hs133av2hsensgprobe matchprobes {}
 
edge hs133av2hsensgprobe matchprobes {}
 
edge plasmodiumanophelescdf utils {}
 
edge plasmodiumanophelescdf utils {}
 
edge hs133xptenstcdf utils {}
 
edge hs133xptenstcdf utils {}
 
edge hs133av2ptensg utils {}
 
edge hs133av2ptensg utils {}
edge bsubtilisprobe R {}
 
 
edge bsubtilisprobe matchprobes {}
 
edge bsubtilisprobe matchprobes {}
edge rn230arnrefseqprobe R {}
 
 
edge rn230arnrefseqprobe matchprobes {}
 
edge rn230arnrefseqprobe matchprobes {}
edge hgu95b R {}
 
edge hs95av2hsugprobe R {}
 
 
edge hs95av2hsugprobe matchprobes {}
 
edge hs95av2hsugprobe matchprobes {}
edge hs133av2ptenstprobe R {}
 
 
edge hs133av2ptenstprobe matchprobes {}
 
edge hs133av2ptenstprobe matchprobes {}
 
edge mm74cv2mmense utils {}
 
edge mm74cv2mmense utils {}
edge hs133pptensgprobe R {}
 
 
edge hs133pptensgprobe matchprobes {}
 
edge hs133pptensgprobe matchprobes {}
 
edge rn230brnensg utils {}
 
edge rn230brnensg utils {}
edge hs133xptenseprobe R {}
 
 
edge hs133xptenseprobe matchprobes {}
 
edge hs133xptenseprobe matchprobes {}
 
edge rae230acdf utils {}
 
edge rae230acdf utils {}
edge rnohomology R {}
 
 
edge mu11ksubbcdf utils {}
 
edge mu11ksubbcdf utils {}
 
edge hs133xhsentrezgcdf utils {}
 
edge hs133xhsentrezgcdf utils {}
 
edge mouse430a2cdf utils {}
 
edge mouse430a2cdf utils {}
edge hgfocusprobe R {}
 
 
edge hgfocusprobe matchprobes {}
 
edge hgfocusprobe matchprobes {}
edge hgu95c R {}
 
 
edge hs133xhsenstcdf utils {}
 
edge hs133xhsenstcdf utils {}
 
edge drosgenome1cdf utils {}
 
edge drosgenome1cdf utils {}
 
edge hsex10stv2hsentrezgcdf utils {}
 
edge hsex10stv2hsentrezgcdf utils {}
 
edge rn230rnensecdf utils {}
 
edge rn230rnensecdf utils {}
edge yeast2 R {}
 
 
edge rn230brnrefseq utils {}
 
edge rn230brnrefseq utils {}
edge cfcanine2cfentrezgprobe R {}
 
 
edge cfcanine2cfentrezgprobe matchprobes {}
 
edge cfcanine2cfentrezgprobe matchprobes {}
edge mouse430a2 R {}
 
 
edge hs133av2ptentrezgcdf utils {}
 
edge hs133av2ptentrezgcdf utils {}
edge hs133xhsentrezgprobe R {}
 
 
edge hs133xhsentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hs133xhsentrezgprobe matchprobes {}
edge rn230brnenseprobe R {}
 
 
edge rn230brnenseprobe matchprobes {}
 
edge rn230brnenseprobe matchprobes {}
edge hsfocushsensgprobe R {}
 
 
edge hsfocushsensgprobe matchprobes {}
 
edge hsfocushsensgprobe matchprobes {}
edge taehomology R {}
 
edge hgu95d R {}
 
 
edge hs133av2hsrefseq utils {}
 
edge hs133av2hsrefseq utils {}
 
edge mm74cv2mmensg utils {}
 
edge mm74cv2mmensg utils {}
edge mm430ammugprobe R {}
 
 
edge mm430ammugprobe matchprobes {}
 
edge mm430ammugprobe matchprobes {}
edge mouseCHRLOC R {}
 
edge ag R {}
 
edge hsfocusptenstprobe R {}
 
 
edge hsfocusptenstprobe matchprobes {}
 
edge hsfocusptenstprobe matchprobes {}
 
edge mm11ksubammensgcdf utils {}
 
edge mm11ksubammensgcdf utils {}
 
edge hsfocusptensecdf utils {}
 
edge hsfocusptensecdf utils {}
 
edge hsex10stv2hsrefseq utils {}
 
edge hsex10stv2hsrefseq utils {}
edge rn230rnensgprobe R {}
 
 
edge rn230rnensgprobe matchprobes {}
 
edge rn230rnensgprobe matchprobes {}
edge hgu95e R {}
 
 
edge hs133xhsrefseq utils {}
 
edge hs133xhsrefseq utils {}
edge mm430bmmensgprobe R {}
 
 
edge mm430bmmensgprobe matchprobes {}
 
edge mm430bmmensgprobe matchprobes {}
 
edge mm11ksubammentrezg utils {}
 
edge mm11ksubammentrezg utils {}
edge hsex10stv2hsugprobe R {}
 
 
edge hsex10stv2hsugprobe matchprobes {}
 
edge hsex10stv2hsugprobe matchprobes {}
edge mgu74cv2 R {}
 
edge ath1atrefseqprobe R {}
 
 
edge ath1atrefseqprobe matchprobes {}
 
edge ath1atrefseqprobe matchprobes {}
edge mm74av2mmugprobe R {}
 
 
edge mm74av2mmugprobe matchprobes {}
 
edge mm74av2mmugprobe matchprobes {}
 
edge mm74av2mmugcdf utils {}
 
edge mm74av2mmugcdf utils {}
Line 2,655: Line 1,063:
 
edge mm74cv2mmug utils {}
 
edge mm74cv2mmug utils {}
 
edge osriceostigrcdf utils {}
 
edge osriceostigrcdf utils {}
edge mm11ksubammentrezgprobe R {}
 
 
edge mm11ksubammentrezgprobe matchprobes {}
 
edge mm11ksubammentrezgprobe matchprobes {}
 
edge mmex10stv1mmug utils {}
 
edge mmex10stv1mmug utils {}
edge hs95av2ptentrezgprobe R {}
 
 
edge hs95av2ptentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hs95av2ptentrezgprobe matchprobes {}
 
edge drzebrafishdrrefseqcdf utils {}
 
edge drzebrafishdrrefseqcdf utils {}
edge drehomology R {}
 
edge m10kcod R {}
 
edge cfcanine2cfensgprobe R {}
 
 
edge cfcanine2cfensgprobe matchprobes {}
 
edge cfcanine2cfensgprobe matchprobes {}
 
edge hs95av2hsenst utils {}
 
edge hs95av2hsenst utils {}
 
edge hsfocushsensecdf utils {}
 
edge hsfocushsensecdf utils {}
 
edge ath1attaircdf utils {}
 
edge ath1attaircdf utils {}
edge mm430mmugprobe R {}
 
 
edge mm430mmugprobe matchprobes {}
 
edge mm430mmugprobe matchprobes {}
 
edge mm11ksubbmmenst utils {}
 
edge mm11ksubbmmenst utils {}
Line 2,676: Line 1,078:
 
edge rn230arnenst utils {}
 
edge rn230arnenst utils {}
 
edge hs95av2ptenst utils {}
 
edge hs95av2ptenst utils {}
edge r10kcod R {}
 
 
edge hsfocusptenst utils {}
 
edge hsfocusptenst utils {}
edge xenopuslaevis R {}
 
 
edge mm430ammug utils {}
 
edge mm430ammug utils {}
edge mgu74aprobe R {}
 
 
edge mgu74aprobe matchprobes {}
 
edge mgu74aprobe matchprobes {}
edge moe430a R {}
 
edge rnex10stv1rnenstprobe R {}
 
 
edge rnex10stv1rnenstprobe matchprobes {}
 
edge rnex10stv1rnenstprobe matchprobes {}
edge ggchickenggensgprobe R {}
 
 
edge ggchickenggensgprobe matchprobes {}
 
edge ggchickenggensgprobe matchprobes {}
 
edge hs133bhsug utils {}
 
edge hs133bhsug utils {}
 
edge mm11ksubammentrezgcdf utils {}
 
edge mm11ksubammentrezgcdf utils {}
 
edge cfcanine2cfensgcdf utils {}
 
edge cfcanine2cfensgcdf utils {}
edge YEAST R {}
 
edge hs133av2ptenseprobe R {}
 
 
edge hs133av2ptenseprobe matchprobes {}
 
edge hs133av2ptenseprobe matchprobes {}
 
edge hs133aptensgcdf utils {}
 
edge hs133aptensgcdf utils {}
Line 2,697: Line 1,091:
 
edge rn230brnugcdf utils {}
 
edge rn230brnugcdf utils {}
 
edge hs133aptentrezg utils {}
 
edge hs133aptentrezg utils {}
edge moe430b R {}
 
 
edge mm11ksubammrefseq utils {}
 
edge mm11ksubammrefseq utils {}
edge rae230bprobe R {}
 
 
edge rae230bprobe matchprobes {}
 
edge rae230bprobe matchprobes {}
edge mouse430a2probe R {}
 
 
edge mouse430a2probe matchprobes {}
 
edge mouse430a2probe matchprobes {}
edge hs133xhsugprobe R {}
 
 
edge hs133xhsugprobe matchprobes {}
 
edge hs133xhsugprobe matchprobes {}
 
edge mm74cv2mmrefseq utils {}
 
edge mm74cv2mmrefseq utils {}
edge hgu133atagprobe R {}
 
 
edge hgu133atagprobe matchprobes {}
 
edge hgu133atagprobe matchprobes {}
edge rwgcod R {}
 
 
edge hs133pptensecdf utils {}
 
edge hs133pptensecdf utils {}
edge hsex10stv2hsensgprobe R {}
 
 
edge hsex10stv2hsensgprobe matchprobes {}
 
edge hsex10stv2hsensgprobe matchprobes {}
 
edge rn34arnense utils {}
 
edge rn34arnense utils {}
Line 2,720: Line 1,107:
 
edge hs133bptensecdf utils {}
 
edge hs133bptensecdf utils {}
 
edge rnex10stv1rnug utils {}
 
edge rnex10stv1rnug utils {}
edge drzebrafishdrrefseqprobe R {}
 
 
edge drzebrafishdrrefseqprobe matchprobes {}
 
edge drzebrafishdrrefseqprobe matchprobes {}
edge mm11ksubammensgprobe R {}
 
 
edge mm11ksubammensgprobe matchprobes {}
 
edge mm11ksubammensgprobe matchprobes {}
 
edge hs133ahsentrezg utils {}
 
edge hs133ahsentrezg utils {}
edge u133x3p R {}
 
 
edge hs133phsrefseq utils {}
 
edge hs133phsrefseq utils {}
edge riceprobe R {}
 
 
edge riceprobe matchprobes {}
 
edge riceprobe matchprobes {}
 
edge mm74cv2mmentrezg utils {}
 
edge mm74cv2mmentrezg utils {}
edge hsex10stv2ptenstprobe R {}
 
 
edge hsex10stv2ptenstprobe matchprobes {}
 
edge hsex10stv2ptenstprobe matchprobes {}
edge hsfocusptenseprobe R {}
 
 
edge hsfocusptenseprobe matchprobes {}
 
edge hsfocusptenseprobe matchprobes {}
 
edge mm430bmmenstcdf utils {}
 
edge mm430bmmenstcdf utils {}
 
edge barley1cdf utils {}
 
edge barley1cdf utils {}
 
edge hs133phsensecdf utils {}
 
edge hs133phsensecdf utils {}
edge hgubeta7 R {}
 
edge hgu95dprobe R {}
 
 
edge hgu95dprobe matchprobes {}
 
edge hgu95dprobe matchprobes {}
 
edge celeganscdf utils {}
 
edge celeganscdf utils {}
 
edge hs133bhsensecdf utils {}
 
edge hs133bhsensecdf utils {}
edge drosophila2 R {}
 
 
edge rn34arnensg utils {}
 
edge rn34arnensg utils {}
 
edge mm430ammense utils {}
 
edge mm430ammense utils {}
 
edge mm430ammrefseq utils {}
 
edge mm430ammrefseq utils {}
 
edge rn230arnensgcdf utils {}
 
edge rn230arnensgcdf utils {}
edge hs95av2hsentrezgprobe R {}
 
 
edge hs95av2hsentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hs95av2hsentrezgprobe matchprobes {}
 
edge dmdrosophila2dmensecdf utils {}
 
edge dmdrosophila2dmensecdf utils {}
 
edge rn230arnentrezg utils {}
 
edge rn230arnentrezg utils {}
edge mm74bv2mmenstprobe R {}
 
 
edge mm74bv2mmenstprobe matchprobes {}
 
edge mm74bv2mmenstprobe matchprobes {}
edge ecoli2probe R {}
 
 
edge ecoli2probe matchprobes {}
 
edge ecoli2probe matchprobes {}
 
edge cfcanine2cfugcdf utils {}
 
edge cfcanine2cfugcdf utils {}
 
edge hs133ahsentrezgcdf utils {}
 
edge hs133ahsentrezgcdf utils {}
edge hs133bhsensgprobe R {}
 
 
edge hs133bhsensgprobe matchprobes {}
 
edge hs133bhsensgprobe matchprobes {}
 
edge rn230brnensecdf utils {}
 
edge rn230brnensecdf utils {}
 
edge rn230rnensgcdf utils {}
 
edge rn230rnensgcdf utils {}
edge hgug4110b R {}
 
edge rnex10stv1rnenseprobe R {}
 
 
edge rnex10stv1rnenseprobe matchprobes {}
 
edge rnex10stv1rnenseprobe matchprobes {}
 
edge mm430ammensg utils {}
 
edge mm430ammensg utils {}
edge mm74cv2mmensgprobe R {}
 
 
edge mm74cv2mmensgprobe matchprobes {}
 
edge mm74cv2mmensgprobe matchprobes {}
 
edge mm11ksubbmmrefseqcdf utils {}
 
edge mm11ksubbmmrefseqcdf utils {}
edge PFAM R {}
 
 
edge PFAM RSQLite {}
 
edge PFAM RSQLite {}
 
edge rn230rnentrezg utils {}
 
edge rn230rnentrezg utils {}
edge hs133bptenstprobe R {}
 
 
edge hs133bptenstprobe matchprobes {}
 
edge hs133bptenstprobe matchprobes {}
edge hgu133plus2 R {}
 
 
edge hs133av2hsenst utils {}
 
edge hs133av2hsenst utils {}
edge drosophila2probe R {}
 
 
edge drosophila2probe matchprobes {}
 
edge drosophila2probe matchprobes {}
 
edge u133x3pcdf utils {}
 
edge u133x3pcdf utils {}
edge hs95av2hsensgprobe R {}
 
 
edge hs95av2hsensgprobe matchprobes {}
 
edge hs95av2hsensgprobe matchprobes {}
 
edge hs133av2ptenst utils {}
 
edge hs133av2ptenst utils {}
Line 2,785: Line 1,151:
 
edge rtu34cdf utils {}
 
edge rtu34cdf utils {}
 
edge hsfocusptensgcdf utils {}
 
edge hsfocusptensgcdf utils {}
edge dmdrosophila2dmensgprobe R {}
 
 
edge dmdrosophila2dmensgprobe matchprobes {}
 
edge dmdrosophila2dmensgprobe matchprobes {}
 
edge rn230brnenst utils {}
 
edge rn230brnenst utils {}
edge rnex10stv1rnrefseqprobe R {}
 
 
edge rnex10stv1rnrefseqprobe matchprobes {}
 
edge rnex10stv1rnrefseqprobe matchprobes {}
edge hs95av2ptenstprobe R {}
 
 
edge hs95av2ptenstprobe matchprobes {}
 
edge hs95av2ptenstprobe matchprobes {}
 
edge hsfocusptentrezg utils {}
 
edge hsfocusptentrezg utils {}
edge rnex10stv1rnugprobe R {}
 
 
edge rnex10stv1rnugprobe matchprobes {}
 
edge rnex10stv1rnugprobe matchprobes {}
edge mm430ammenstprobe R {}
 
 
edge mm430ammenstprobe matchprobes {}
 
edge mm430ammenstprobe matchprobes {}
 
edge hgu133bcdf utils {}
 
edge hgu133bcdf utils {}
Line 2,802: Line 1,163:
 
edge hs133phsrefseqcdf utils {}
 
edge hs133phsrefseqcdf utils {}
 
edge ggchickenggense utils {}
 
edge ggchickenggense utils {}
edge xenopuslaevisprobe R {}
 
 
edge xenopuslaevisprobe matchprobes {}
 
edge xenopuslaevisprobe matchprobes {}
 
edge hcg110cdf utils {}
 
edge hcg110cdf utils {}
 
edge hs133ahsrefseq utils {}
 
edge hs133ahsrefseq utils {}
edge mm11ksubbmmentrezgprobe R {}
 
 
edge mm11ksubbmmentrezgprobe matchprobes {}
 
edge mm11ksubbmmentrezgprobe matchprobes {}
edge hsex10stv2ptenseprobe R {}
 
 
edge hsex10stv2ptenseprobe matchprobes {}
 
edge hsex10stv2ptenseprobe matchprobes {}
 
edge mm74av1mmensecdf utils {}
 
edge mm74av1mmensecdf utils {}
edge rn230arnensgprobe R {}
 
 
edge rn230arnensgprobe matchprobes {}
 
edge rn230arnensgprobe matchprobes {}
 
edge rn230rnrefseq utils {}
 
edge rn230rnrefseq utils {}
 
edge hs133ahsugcdf utils {}
 
edge hs133ahsugcdf utils {}
 
edge hsfocushsentrezgcdf utils {}
 
edge hsfocushsentrezgcdf utils {}
edge mu11ksubaprobe R {}
 
 
edge mu11ksubaprobe matchprobes {}
 
edge mu11ksubaprobe matchprobes {}
 
edge drzebrafishdrenstcdf utils {}
 
edge drzebrafishdrenstcdf utils {}
 
edge dmgenome1dmenstcdf utils {}
 
edge dmgenome1dmenstcdf utils {}
edge mm430bmmugprobe R {}
 
 
edge mm430bmmugprobe matchprobes {}
 
edge mm430bmmugprobe matchprobes {}
 
edge hsfocushsensgcdf utils {}
 
edge hsfocushsensgcdf utils {}
Line 2,829: Line 1,184:
 
edge canine2cdf utils {}
 
edge canine2cdf utils {}
 
edge hs133xptentrezgcdf utils {}
 
edge hs133xptentrezgcdf utils {}
edge hs133bhsrefseqprobe R {}
 
 
edge hs133bhsrefseqprobe matchprobes {}
 
edge hs133bhsrefseqprobe matchprobes {}
 
edge mm74cv2mmenst utils {}
 
edge mm74cv2mmenst utils {}
Line 2,837: Line 1,191:
 
edge hsex10stv2ptentrezgcdf utils {}
 
edge hsex10stv2ptentrezgcdf utils {}
 
edge rnex10stv1rnense utils {}
 
edge rnex10stv1rnense utils {}
edge rnu34 R {}
 
 
edge vvgrapevvtigrcdf utils {}
 
edge vvgrapevvtigrcdf utils {}
edge mmex10stv1mmensgprobe R {}
 
 
edge mmex10stv1mmensgprobe matchprobes {}
 
edge mmex10stv1mmensgprobe matchprobes {}
 
edge ggchickenggensg utils {}
 
edge ggchickenggensg utils {}
edge rnex10stv1rnentrezgprobe R {}
 
 
edge rnex10stv1rnentrezgprobe matchprobes {}
 
edge rnex10stv1rnentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hsfocushsug utils {}
 
edge hsfocushsug utils {}
 
edge rn230rnense utils {}
 
edge rn230rnense utils {}
edge mm74bv2mmenseprobe R {}
 
 
edge mm74bv2mmenseprobe matchprobes {}
 
edge mm74bv2mmenseprobe matchprobes {}
edge rgu34aprobe R {}
 
 
edge rgu34aprobe matchprobes {}
 
edge rgu34aprobe matchprobes {}
edge hi16cod R {}
 
 
edge vvgrapevvtigr utils {}
 
edge vvgrapevvtigr utils {}
edge mm74av2mmensgprobe R {}
 
 
edge mm74av2mmensgprobe matchprobes {}
 
edge mm74av2mmensgprobe matchprobes {}
 
edge rhesuscdf utils {}
 
edge rhesuscdf utils {}
edge zebrafishprobe R {}
 
 
edge zebrafishprobe matchprobes {}
 
edge zebrafishprobe matchprobes {}
edge hsfocushsrefseqprobe R {}
 
 
edge hsfocushsrefseqprobe matchprobes {}
 
edge hsfocushsrefseqprobe matchprobes {}
edge h20kcod R {}
 
 
edge mgu74acdf utils {}
 
edge mgu74acdf utils {}
 
edge hu6800subacdf utils {}
 
edge hu6800subacdf utils {}
Line 2,865: Line 1,209:
 
edge hs133pptensgcdf utils {}
 
edge hs133pptensgcdf utils {}
 
edge hs133av2ptensecdf utils {}
 
edge hs133av2ptensecdf utils {}
edge hu35ksubbprobe R {}
 
 
edge hu35ksubbprobe matchprobes {}
 
edge hu35ksubbprobe matchprobes {}
edge rnu34probe R {}
 
 
edge rnu34probe matchprobes {}
 
edge rnu34probe matchprobes {}
 
edge xenopuslaeviscdf utils {}
 
edge xenopuslaeviscdf utils {}
edge hs133bptenseprobe R {}
 
 
edge hs133bptenseprobe matchprobes {}
 
edge hs133bptenseprobe matchprobes {}
edge ptrhomology R {}
 
 
edge rn230rnensg utils {}
 
edge rn230rnensg utils {}
 
edge rn34arnug utils {}
 
edge rn34arnug utils {}
Line 2,882: Line 1,222:
 
edge hgu95acdf utils {}
 
edge hgu95acdf utils {}
 
edge ath1atrefseqcdf utils {}
 
edge ath1atrefseqcdf utils {}
edge hs133av2ptentrezgprobe R {}
 
 
edge hs133av2ptentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hs133av2ptentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hs133bptentrezg utils {}
 
edge hs133bptentrezg utils {}
edge hs133xhsrefseqprobe R {}
 
 
edge hs133xhsrefseqprobe matchprobes {}
 
edge hs133xhsrefseqprobe matchprobes {}
 
edge hs133phsensgcdf utils {}
 
edge hs133phsensgcdf utils {}
 
edge hs133av2hsensecdf utils {}
 
edge hs133av2hsensecdf utils {}
edge hs95av2ptenseprobe R {}
 
 
edge hs95av2ptenseprobe matchprobes {}
 
edge hs95av2ptenseprobe matchprobes {}
edge mouse4302 R {}
 
edge rn230arnentrezgprobe R {}
 
 
edge rn230arnentrezgprobe matchprobes {}
 
edge rn230arnentrezgprobe matchprobes {}
edge mm430ammentrezgprobe R {}
 
 
edge mm430ammentrezgprobe matchprobes {}
 
edge mm430ammentrezgprobe matchprobes {}
edge mm430ammenseprobe R {}
 
 
edge mm430ammenseprobe matchprobes {}
 
edge mm430ammenseprobe matchprobes {}
edge hs133aptentrezgprobe R {}
 
 
edge hs133aptentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hs133aptentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hs133bhsensgcdf utils {}
 
edge hs133bhsensgcdf utils {}
 
edge hs133phsentrezg utils {}
 
edge hs133phsentrezg utils {}
 
edge mm74bv2mmense utils {}
 
edge mm74bv2mmense utils {}
edge rat2302probe R {}
 
 
edge rat2302probe matchprobes {}
 
edge rat2302probe matchprobes {}
edge hguatlas13k R {}
 
edge mouse4302probe R {}
 
 
edge mouse4302probe matchprobes {}
 
edge mouse4302probe matchprobes {}
 
edge hs133bhsentrezg utils {}
 
edge hs133bhsentrezg utils {}
edge mm430mmenstprobe R {}
 
 
edge mm430mmenstprobe matchprobes {}
 
edge mm430mmenstprobe matchprobes {}
 
edge atgenomeattair utils {}
 
edge atgenomeattair utils {}
 
edge mm430bmmensg utils {}
 
edge mm430bmmensg utils {}
edge hsahomology R {}
 
edge drzebrafishdrugprobe R {}
 
 
edge drzebrafishdrugprobe matchprobes {}
 
edge drzebrafishdrugprobe matchprobes {}
edge cMAP R {}
 
 
edge ecoli2cdf utils {}
 
edge ecoli2cdf utils {}
edge dmgenome1dmugprobe R {}
 
 
edge dmgenome1dmugprobe matchprobes {}
 
edge dmgenome1dmugprobe matchprobes {}
 
edge dmdrosophila2dmensgcdf utils {}
 
edge dmdrosophila2dmensgcdf utils {}
edge celegans R {}
 
edge rguatlas4k R {}
 
 
edge bsubtiliscdf utils {}
 
edge bsubtiliscdf utils {}
 
edge mm74bv2mmenstcdf utils {}
 
edge mm74bv2mmenstcdf utils {}
 
edge rn230arnrefseq utils {}
 
edge rn230arnrefseq utils {}
edge hs133av2hsrefseqprobe R {}
 
 
edge hs133av2hsrefseqprobe matchprobes {}
 
edge hs133av2hsrefseqprobe matchprobes {}
edge xtrhomology R {}
 
 
edge atgenomeatrefseq utils {}
 
edge atgenomeatrefseq utils {}
edge hgug4111a R {}
 
edge mm430bmmrefseqprobe R {}
 
 
edge mm430bmmrefseqprobe matchprobes {}
 
edge mm430bmmrefseqprobe matchprobes {}
 
edge hs95av2ptensecdf utils {}
 
edge hs95av2ptensecdf utils {}
 
edge ygs98cdf utils {}
 
edge ygs98cdf utils {}
edge hs133ahsenstprobe R {}
 
 
edge hs133ahsenstprobe matchprobes {}
 
edge hs133ahsenstprobe matchprobes {}
 
edge mm74bv2mmensg utils {}
 
edge mm74bv2mmensg utils {}
Line 2,941: Line 1,258:
 
edge hgu133plus2cdf utils {}
 
edge hgu133plus2cdf utils {}
 
edge mmex10stv1mmenstcdf utils {}
 
edge mmex10stv1mmenstcdf utils {}
edge mmex10stv1mmrefseqprobe R {}
 
 
edge mmex10stv1mmrefseqprobe matchprobes {}
 
edge mmex10stv1mmrefseqprobe matchprobes {}
edge ygs98probe R {}
 
 
edge ygs98probe matchprobes {}
 
edge ygs98probe matchprobes {}
 
edge rn230brnentrezg utils {}
 
edge rn230brnentrezg utils {}
edge hsex10stv2hsrefseqprobe R {}
 
 
edge hsex10stv2hsrefseqprobe matchprobes {}
 
edge hsex10stv2hsrefseqprobe matchprobes {}
 
edge rn34arnenst utils {}
 
edge rn34arnenst utils {}
edge agahomology R {}
 
 
edge hs95av2hsensecdf utils {}
 
edge hs95av2hsensecdf utils {}
edge mm430mmrefseqprobe R {}
 
 
edge mm430mmrefseqprobe matchprobes {}
 
edge mm430mmrefseqprobe matchprobes {}
edge mm74bv2mmentrezgprobe R {}
 
 
edge mm74bv2mmentrezgprobe matchprobes {}
 
edge mm74bv2mmentrezgprobe matchprobes {}
edge drosgenome1 R {}
 
edge drzebrafishdrensgprobe R {}
 
 
edge drzebrafishdrensgprobe matchprobes {}
 
edge drzebrafishdrensgprobe matchprobes {}
 
edge cfcanine2cfug utils {}
 
edge cfcanine2cfug utils {}
 
edge rn34arnensgcdf utils {}
 
edge rn34arnensgcdf utils {}
 
edge hu35ksubccdf utils {}
 
edge hu35ksubccdf utils {}
edge mu19ksuba R {}
 
 
edge mm430bmmug utils {}
 
edge mm430bmmug utils {}
 
edge rn34arnentrezg utils {}
 
edge rn34arnentrezg utils {}
 
edge mm74av1mmensgcdf utils {}
 
edge mm74av1mmensgcdf utils {}
edge hs133av2hsentrezgprobe R {}
 
 
edge hs133av2hsentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hs133av2hsentrezgprobe matchprobes {}
 
edge mm430ammenst utils {}
 
edge mm430ammenst utils {}
Line 2,972: Line 1,279:
 
edge ggchickenggugcdf utils {}
 
edge ggchickenggugcdf utils {}
 
edge mm74av1mmentrezg utils {}
 
edge mm74av1mmentrezg utils {}
edge mu19ksubb R {}
 
 
edge drzebrafishdrrefseq utils {}
 
edge drzebrafishdrrefseq utils {}
edge ecoliprobe R {}
 
 
edge ecoliprobe matchprobes {}
 
edge ecoliprobe matchprobes {}
edge athhomology R {}
 
 
edge ye6100subdcdf utils {}
 
edge ye6100subdcdf utils {}
 
edge hs95av2hsug utils {}
 
edge hs95av2hsug utils {}
edge porcineprobe R {}
 
 
edge porcineprobe matchprobes {}
 
edge porcineprobe matchprobes {}
 
edge mm430ammensecdf utils {}
 
edge mm430ammensecdf utils {}
 
edge hs133aptentrezgcdf utils {}
 
edge hs133aptentrezgcdf utils {}
edge mgu74a R {}
 
 
edge mm74bv2mmrefseq utils {}
 
edge mm74bv2mmrefseq utils {}
edge hs133ahsentrezgprobe R {}
 
 
edge hs133ahsentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hs133ahsentrezgprobe matchprobes {}
edge mu19ksubc R {}
 
edge mm430mmenseprobe R {}
 
 
edge mm430mmenseprobe matchprobes {}
 
edge mm430mmenseprobe matchprobes {}
edge ath1attigrprobe R {}
 
 
edge ath1attigrprobe matchprobes {}
 
edge ath1attigrprobe matchprobes {}
 
edge rn230rnentrezgcdf utils {}
 
edge rn230rnentrezgcdf utils {}
Line 2,997: Line 1,295:
 
edge mm74av2mmensecdf utils {}
 
edge mm74av2mmensecdf utils {}
 
edge mm74av2mmentrezgcdf utils {}
 
edge mm74av2mmentrezgcdf utils {}
edge mgu74b R {}
 
 
edge rgu34bcdf utils {}
 
edge rgu34bcdf utils {}
edge rae230aprobe R {}
 
 
edge rae230aprobe matchprobes {}
 
edge rae230aprobe matchprobes {}
edge sugarcaneprobe R {}
 
 
edge sugarcaneprobe matchprobes {}
 
edge sugarcaneprobe matchprobes {}
edge mm74bv2mmugprobe R {}
 
 
edge mm74bv2mmugprobe matchprobes {}
 
edge mm74bv2mmugprobe matchprobes {}
 
edge saureuscdf utils {}
 
edge saureuscdf utils {}
edge mgu74av2probe R {}
 
 
edge mgu74av2probe matchprobes {}
 
edge mgu74av2probe matchprobes {}
 
edge htratfocuscdf utils {}
 
edge htratfocuscdf utils {}
edge mm74av1mmenstprobe R {}
 
 
edge mm74av1mmenstprobe matchprobes {}
 
edge mm74av1mmenstprobe matchprobes {}
 
edge mm430mmensecdf utils {}
 
edge mm430mmensecdf utils {}
edge dmgenome1dmensgprobe R {}
 
 
edge dmgenome1dmensgprobe matchprobes {}
 
edge dmgenome1dmensgprobe matchprobes {}
 
edge drzebrafishdrentrezgcdf utils {}
 
edge drzebrafishdrentrezgcdf utils {}
edge mgu74c R {}
 
 
edge mgu74ccdf utils {}
 
edge mgu74ccdf utils {}
 
edge mm74cv2mmugcdf utils {}
 
edge mm74cv2mmugcdf utils {}
 
edge hu6800subccdf utils {}
 
edge hu6800subccdf utils {}
edge hs133ahsenseprobe R {}
 
 
edge hs133ahsenseprobe matchprobes {}
 
edge hs133ahsenseprobe matchprobes {}
edge hs133xhsenstprobe R {}
 
 
edge hs133xhsenstprobe matchprobes {}
 
edge hs133xhsenstprobe matchprobes {}
edge mmex10stv1mmugprobe R {}
 
 
edge mmex10stv1mmugprobe matchprobes {}
 
edge mmex10stv1mmugprobe matchprobes {}
 
edge rnex10stv1rnrefseqcdf utils {}
 
edge rnex10stv1rnrefseqcdf utils {}
 
edge mouse4302cdf utils {}
 
edge mouse4302cdf utils {}
 
edge hs133av2ptensgcdf utils {}
 
edge hs133av2ptensgcdf utils {}
edge paeg1aprobe R {}
 
 
edge paeg1aprobe matchprobes {}
 
edge paeg1aprobe matchprobes {}
 
edge hs133xptensecdf utils {}
 
edge hs133xptensecdf utils {}
Line 3,035: Line 1,321:
 
edge hgu95ccdf utils {}
 
edge hgu95ccdf utils {}
 
edge mm430bmmentrezgcdf utils {}
 
edge mm430bmmentrezgcdf utils {}
edge hvuhomology R {}
 
 
edge hsfocusptentrezgcdf utils {}
 
edge hsfocusptentrezgcdf utils {}
 
edge ath1attair utils {}
 
edge ath1attair utils {}
 
edge ggchickenggenst utils {}
 
edge ggchickenggenst utils {}
 
edge wheatcdf utils {}
 
edge wheatcdf utils {}
edge celegansprobe R {}
 
 
edge celegansprobe matchprobes {}
 
edge celegansprobe matchprobes {}
edge hgu95cprobe R {}
 
 
edge hgu95cprobe matchprobes {}
 
edge hgu95cprobe matchprobes {}
edge vitisviniferaprobe R {}
 
 
edge vitisviniferaprobe matchprobes {}
 
edge vitisviniferaprobe matchprobes {}
edge hgu95av2probe R {}
 
 
edge hgu95av2probe matchprobes {}
 
edge hgu95av2probe matchprobes {}
edge drosgenome1probe R {}
 
 
edge drosgenome1probe matchprobes {}
 
edge drosgenome1probe matchprobes {}
 
edge hs133av2hsensgcdf utils {}
 
edge hs133av2hsensgcdf utils {}
edge rn230brnentrezgprobe R {}
 
 
edge rn230brnentrezgprobe matchprobes {}
 
edge rn230brnentrezgprobe matchprobes {}
edge mm430bmmentrezgprobe R {}
 
 
edge mm430bmmentrezgprobe matchprobes {}
 
edge mm430bmmentrezgprobe matchprobes {}
edge hs133bptentrezgprobe R {}
 
 
edge hs133bptentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hs133bptentrezgprobe matchprobes {}
 
edge rn230brnentrezgcdf utils {}
 
edge rn230brnentrezgcdf utils {}
 
edge hs133xhsensecdf utils {}
 
edge hs133xhsensecdf utils {}
edge hu6800 R {}
 
edge hgu133a R {}
 
 
edge hs133av2hsentrezg utils {}
 
edge hs133av2hsentrezg utils {}
 
edge osriceosrefseqcdf utils {}
 
edge osriceosrefseqcdf utils {}
 
edge hgfocuscdf utils {}
 
edge hgfocuscdf utils {}
 
edge test2cdf utils {}
 
edge test2cdf utils {}
edge hs133aptensgprobe R {}
 
 
edge hs133aptensgprobe matchprobes {}
 
edge hs133aptensgprobe matchprobes {}
 
edge mmex10stv1mmugcdf utils {}
 
edge mmex10stv1mmugcdf utils {}
edge rn34arnenstprobe R {}
 
 
edge rn34arnenstprobe matchprobes {}
 
edge rn34arnenstprobe matchprobes {}
 
edge rnex10stv1rnenst utils {}
 
edge rnex10stv1rnenst utils {}
 
edge dmdrosophila2dmense utils {}
 
edge dmdrosophila2dmense utils {}
 
edge mm74av1mmense utils {}
 
edge mm74av1mmense utils {}
edge mouseLLMappings R {}
 
 
edge rn230arnug utils {}
 
edge rn230arnug utils {}
 
edge rn230rnenst utils {}
 
edge rn230rnenst utils {}
edge hgu133b R {}
 
edge KEGG R {}
 
edge mm11ksubbmmensgprobe R {}
 
 
edge mm11ksubbmmensgprobe matchprobes {}
 
edge mm11ksubbmmensgprobe matchprobes {}
edge mu11ksuba R {}
 
edge drzebrafishdrentrezgprobe R {}
 
 
edge drzebrafishdrentrezgprobe matchprobes {}
 
edge drzebrafishdrentrezgprobe matchprobes {}
edge sschomology R {}
 
 
edge rn34arnentrezgcdf utils {}
 
edge rn34arnentrezgcdf utils {}
 
edge hs95av2ptensgcdf utils {}
 
edge hs95av2ptensgcdf utils {}
edge hsex10stv2ptentrezgprobe R {}
 
 
edge hsex10stv2ptentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hsex10stv2ptentrezgprobe matchprobes {}
 
edge hs133av2hsug utils {}
 
edge hs133av2hsug utils {}
 
edge mm74bv2mmrefseqcdf utils {}
 
edge mm74bv2mmrefseqcdf utils {}
 
edge hs95av2ptentrezg utils {}
 
edge hs95av2ptentrezg utils {}
edge hgug4112a R {}
 
edge mu11ksubb R {}
 
 
edge dmgenome1dmug utils {}
 
edge dmgenome1dmug utils {}
 
edge mgu74cv2cdf utils {}
 
edge mgu74cv2cdf utils {}
Line 3,098: Line 1,361:
 
edge dmdrosophila2dmensg utils {}
 
edge dmdrosophila2dmensg utils {}
 
edge mm74av1mmensg utils {}
 
edge mm74av1mmensg utils {}
edge mm74av1mmenseprobe R {}
 
 
edge mm74av1mmenseprobe matchprobes {}
 
edge mm74av1mmenseprobe matchprobes {}
edge omyhomology R {}
 
 
edge hs133bhsugcdf utils {}
 
edge hs133bhsugcdf utils {}
 
edge mm430bmmenst utils {}
 
edge mm430bmmenst utils {}
edge hs133av2hsenstprobe R {}
 
 
edge hs133av2hsenstprobe matchprobes {}
 
edge hs133av2hsenstprobe matchprobes {}
edge hs133phsensgprobe R {}
 
 
edge hs133phsensgprobe matchprobes {}
 
edge hs133phsensgprobe matchprobes {}
 
edge hs95av2hsensgcdf utils {}
 
edge hs95av2hsensgcdf utils {}
 
edge mu11ksubacdf utils {}
 
edge mu11ksubacdf utils {}
edge hs133xhsenseprobe R {}
 
 
edge hs133xhsenseprobe matchprobes {}
 
edge hs133xhsenseprobe matchprobes {}
edge ggchickenggrefseqprobe R {}
 
 
edge ggchickenggrefseqprobe matchprobes {}
 
edge ggchickenggrefseqprobe matchprobes {}
 
edge porcinecdf utils {}
 
edge porcinecdf utils {}
edge mgug4120a R {}
 
edge mgu74bv2 R {}
 
edge u133x3pprobe R {}
 
 
edge u133x3pprobe matchprobes {}
 
edge u133x3pprobe matchprobes {}
edge mm11ksubbmmrefseqprobe R {}
 
 
edge mm11ksubbmmrefseqprobe matchprobes {}
 
edge mm11ksubbmmrefseqprobe matchprobes {}
 
edge hs95av2hsentrezg utils {}
 
edge hs95av2hsentrezg utils {}
edge hu6800probe R {}
 
 
edge hu6800probe matchprobes {}
 
edge hu6800probe matchprobes {}
edge hs133pptenstprobe R {}
 
 
edge hs133pptenstprobe matchprobes {}
 
edge hs133pptenstprobe matchprobes {}
edge mm74bv2mmrefseqprobe R {}
 
 
edge mm74bv2mmrefseqprobe matchprobes {}
 
edge mm74bv2mmrefseqprobe matchprobes {}
 
edge ath1attigrcdf utils {}
 
edge ath1attigrcdf utils {}
Line 3,132: Line 1,382:
 
edge hsex10stv2ptensgcdf utils {}
 
edge hsex10stv2ptensgcdf utils {}
 
edge LogitBoost NONE {}
 
edge LogitBoost NONE {}
edge codetools R {}
 
edge RGtk R {}
 
edge XML R {}
 
 
edge XML methods {}
 
edge XML methods {}
edge SJava R {}
 
edge RMySQL R {}
 
 
edge RMySQL methods {}
 
edge RMySQL methods {}
 
edge RMySQL DBI {}
 
edge RMySQL DBI {}
edge SSOAP R {}
 
 
edge SSOAP methods {}
 
edge SSOAP methods {}
 
edge SSOAP XML {}
 
edge SSOAP XML {}

Latest revision as of 13:22, 6 October 2007

This graph shows the package dependencies for the BioConductor software for the statistical analysis of microarrary data in R. The dependency list was generated from the BioConductor-1.9 software repository HTML pages.

Unfortunately it is too large to be used on this webserver (due to memory limitations). A slightly shorter list (75%) would work. See also Test graph 2 ...

{{#wgraph: png | thumb=40 | nodetype * { font helvR08 } layoutalgorithm=forcedir edge gpls NONE {} edge sigPathway R {} edge TypeInfo methods {} edge Biostrings R {} edge Biostrings methods {} edge Mfuzz R {} edge Mfuzz Biobase {} edge Mfuzz e1071 {} edge LMGene R {} edge LMGene Biobase {} edge LMGene multtest {} edge LMGene survival {} edge ecolitk R {} edge ecolitk affy {} edge ecolitk ecoliLeucine {} edge ecolitk ecolicdf {} edge ecolitk Biobase {} edge maCorrPlot NONE {} edge OLINgui R {} edge OLINgui OLIN {} edge xcms R {} edge xcms methods {} edge rflowcyt R {} edge rflowcyt survival {} edge rflowcyt xtable {} edge rflowcyt stats {} edge rflowcyt KernSmooth {} edge rflowcyt MASS {} edge rflowcyt grid {} edge rflowcyt methods {} edge rflowcyt hexbin {} edge rflowcyt rfcdmin {} edge rflowcyt fields {} edge rflowcyt lattice {} edge rflowcyt locfit {} edge daMA MASS {} edge made4 ade4 {} edge made4 scatterplot3d {} edge biomaRt methods {} edge biomaRt XML {} edge biomaRt RCurl {} edge gaggle rJava {} edge gaggle graph {} edge affylmGUI limma {} edge affylmGUI tcltk {} edge affylmGUI affy {} edge affylmGUI Biobase {} edge SAGElyzer AnnBuilder {} edge SAGElyzer tkWidgets {} edge SAGElyzer genefilter {} edge SAGElyzer annotate {} edge GeneR NONE {} edge GeneSpring Biobase {} edge GeneSpring methods {} edge geneplotter annotate {} edge geneplotter Biobase {} edge geneplotter methods {} edge BioMVCClass methods {} edge BioMVCClass MVCClass {} edge BioMVCClass Biobase {} edge BioMVCClass graph {} edge BioMVCClass Rgraphviz {} edge sizepower stats {} edge PROcess Icens {} edge snapCGH limma {} edge snapCGH tilingArray {} edge snapCGH DNAcopy {} edge snapCGH aCGH {} edge snapCGH GLAD {} edge snapCGH cluster {} edge snapCGH methods {} edge bioDist methods {} edge bioDist Biobase {} edge marray limma {} edge marray methods {} edge tkWidgets methods {} edge tkWidgets widgetTools {} edge tkWidgets DynDoc {} edge rama NONE {} edge Ruuid methods {} edge arrayQuality marray {} edge arrayQuality limma {} edge arrayQuality convert {} edge arrayQuality hexbin {} edge arrayQuality gridBase {} edge arrayQuality RColorBrewer {} edge GraphAT MCMCpack {} edge GraphAT graph {} edge beadarray limma {} edge beadarray Biobase {} edge beadarray affy {} edge beadarray methods {} edge ppiStats apComplex {} edge ppiStats GO {} edge ppiStats GOstats {} edge ppiStats YEAST {} edge ppiStats graph {} edge ppiStats Rgraphviz {} edge ppiStats Category {} edge pcaMethods MASS {} edge pcaMethods ellipse {} edge pcaMethods pls {} edge pcaMethods methods {} edge GlobalAncova methods {} edge webbioc Biobase {} edge webbioc affy {} edge webbioc multtest {} edge webbioc annaffy {} edge webbioc vsn {} edge webbioc gcrma {} edge webbioc qvalue {} edge cghMCR methods {} edge cghMCR DNAcopy {} edge cghMCR marray {} edge cghMCR arrayQuality {} edge widgetInvoke methods {} edge widgetInvoke XML {} edge widgetInvoke RGtk {} edge hexbin methods {} edge hexbin grid {} edge hexbin lattice {} edge hexbin colorspace {} edge matchprobes Biobase {} edge matchprobes affy {} edge siggenes methods {} edge siggenes multtest {} edge siggenes Biobase {} edge AnnBuilder methods {} edge AnnBuilder Biobase {} edge AnnBuilder XML {} edge AnnBuilder annotate {} edge AnnBuilder utils {} edge AnnBuilder RSQLite {} edge pamr NONE {} edge RBGL graph {} edge RBGL methods {} edge biocViews methods {} edge biocViews tools {} edge biocViews graph {} edge biocViews RBGL {} edge biocViews XML {} edge CoCiteStats humanLLMappings {} edge ChromoViz RSvgDevice {} edge ChromoViz XML {} edge GOstats graph {} edge GOstats GO {} edge GOstats annotate {} edge GOstats RBGL {} edge GOstats Biobase {} edge GOstats Category {} edge GOstats methods {} edge prada Biobase {} edge prada RColorBrewer {} edge prada grid {} edge prada methods {} edge prada geneplotter {} edge bridge rama {} edge ontoTools methods {} edge ontoTools graph {} edge ontoTools SparseM {} edge ontoTools GO {} edge ontoTools Biobase {} edge ontoTools annotate {} edge MCRestimate e1071 {} edge MCRestimate pamr {} edge MCRestimate randomForest {} edge MCRestimate RColorBrewer {} edge MCRestimate Biobase {} edge MCRestimate golubEsets {} edge aroma.light R.oo {} edge pkgDepTools methods {} edge pkgDepTools graph {} edge pkgDepTools RBGL {} edge MeasurementError.cor NONE {} edge logicFS LogicReg {} edge copa Biobase {} edge copa methods {} edge Category Biobase {} edge Category KEGG {} edge Category GO {} edge Category graph {} edge Category annotate {} edge Category methods {} edge Category genefilter {} edge Harshlight affy {} edge OrderedList Biobase {} edge OrderedList twilight {} edge MVCClass methods {} edge panp affy {} edge LPE NONE {} edge MANOR GLAD {} edge RbcBook1 Biobase {} edge vsn Biobase {} edge iSPlot methods {} edge iSPlot RGtk {} edge iSPlot gtkDevice {} edge iSPlot MVCClass {} edge pickgene MASS {} edge makecdfenv methods {} edge makecdfenv Biobase {} edge makecdfenv affy {} edge makecdfenv utils {} edge makecdfenv affyio {} edge aCGH cluster {} edge aCGH survival {} edge aCGH multtest {} edge aCGH sma {} edge KEGGSOAP methods {} edge KEGGSOAP XML {} edge KEGGSOAP SSOAP {} edge KEGGSOAP RCurl {} edge annotate methods {} edge annotate Biobase {} edge limma methods {} edge timecourse limma {} edge timecourse MASS {} edge timecourse Biobase {} edge timecourse methods {} edge nem e1071 {} edge nem graph {} edge nem Rgraphviz {} edge nem RBGL {} edge HEM Biobase {} edge SBMLR XML {} edge SBMLR odesolve {} edge MLInterfaces Biobase {} edge MLInterfaces methods {} edge MLInterfaces genefilter {} edge weaver digest {} edge weaver tools {} edge weaver utils {} edge weaver codetools {} edge goTools Biobase {} edge goTools annotate {} edge goTools GO {} edge applera Biobase {} edge applera methods {} edge applera affy {} edge applera genefilter {} edge applera limma {} edge applera geneplotter {} edge applera RColorBrewer {} edge applera prada {} edge applera combinat {} edge annaffy methods {} edge annaffy Biobase {} edge annaffy GO {} edge annaffy KEGG {} edge spotSegmentation mclust {} edge geneRecommender Biobase {} edge codelink methods {} edge codelink limma {} edge codelink annotate {} edge widgetTools methods {} edge widgetTools utils {} edge splots grid {} edge RSNPper methods {} edge RSNPper utils {} edge RSNPper tools {} edge RSNPper XML {} edge GeneMeta methods {} edge GeneMeta Biobase {} edge GeneMeta genefilter {} edge GEOquery methods {} edge globaltest methods {} edge globaltest graphics {} edge globaltest multtest {} edge pathRender graph {} edge pathRender Rgraphviz {} edge pathRender cMAP {} edge convert Biobase {} edge convert limma {} edge convert marray {} edge convert utils {} edge convert methods {} edge stam GO {} edge stam Biobase {} edge stam pamr {} edge stam cluster {} edge stam annaffy {} edge stam methods {} edge BSgenome methods {} edge BSgenome Biostrings {} edge pdmclass Biobase {} edge pdmclass fibroEset {} edge pdmclass mda {} edge cellHTS prada {} edge cellHTS RColorBrewer {} edge cellHTS Biobase {} edge cellHTS genefilter {} edge metaArray MergeMaid {} edge EBImage methods {} edge arrayQCplot RGtk2 {} edge arrayQCplot cairoDevice {} edge arrayQCplot LPE {} edge hopach cluster {} edge hopach Biobase {} edge DNAcopy NONE {} edge ssize gdata {} edge ssize xtable {} edge apComplex graph {} edge tilingArray methods {} edge tilingArray Biobase {} edge tilingArray affy {} edge tilingArray RColorBrewer {} edge tilingArray grid {} edge tilingArray strucchange {} edge tilingArray vsn {} edge tilingArray genefilter {} edge tilingArray geneplotter {} edge tilingArray pixmap {} edge RMAPPER methods {} edge splicegear methods {} edge splicegear utils {} edge splicegear grid {} edge splicegear Biobase {} edge splicegear XML {} edge splicegear annotate {} edge gff3Plotter methods {} edge mmgmos methods {} edge mmgmos Biobase {} edge mmgmos affy {} edge plgem Biobase {} edge plgem MASS {} edge DEDS methods {} edge pgUtils Rdbi {} edge pgUtils RdbiPgSQL {} edge pgUtils methods {} edge hypergraph methods {} edge hypergraph graph {} edge arrayMagic methods {} edge arrayMagic utils {} edge arrayMagic Biobase {} edge arrayMagic vsn {} edge arrayMagic limma {} edge arrayMagic genefilter {} edge nudge stats {} edge sscore affy {} edge sscore affxparser {} edge simulatorAPMS graph {} edge simulatorAPMS apComplex {} edge simulatorAPMS Rgraphviz {} edge simulatorAPMS ScISI {} edge simulatorAPMS ppiStats {} edge affy Biobase {} edge affy methods {} edge affy utils {} edge affy affyio {} edge OCplus akima {} edge OCplus multtest {} edge diffGeneAnalysis minpack.lm {} edge macat Biobase {} edge macat annotate {} edge idiogram methods {} edge idiogram Biobase {} edge idiogram annotate {} edge pcot2 grDevices {} edge pcot2 Biobase {} edge pcot2 amap {} edge iSNetwork methods {} edge iSNetwork graph {} edge iSNetwork Rgraphviz {} edge iSNetwork RGtk {} edge iSNetwork gtkDevice {} edge iSNetwork BioMVCClass {} edge iSNetwork MVCClass {} edge iSNetwork Biobase {} edge iSNetwork annotate {} edge affyPLM affy {} edge affyPLM affydata {} edge affyPLM Biobase {} edge affyPLM methods {} edge affyPLM gcrma {} edge spikeLI utils {} edge genefilter methods {} edge genefilter Biobase {} edge genefilter survival {} edge altcdfenvs methods {} edge altcdfenvs Biobase {} edge altcdfenvs affy {} edge altcdfenvs matchprobes {} edge altcdfenvs makecdfenv {} edge OLIN methods {} edge OLIN stats {} edge OLIN locfit {} edge OLIN Biobase {} edge OLIN marray {} edge beadarraySNP methods {} edge beadarraySNP Biobase {} edge beadarraySNP limma {} edge beadarraySNP quantsmooth {} edge Heatplus NONE {} edge GeneTS GeneCycle {} edge GeneTS GeneNet {} edge safe methods {} edge safe Biobase {} edge Rgraphviz methods {} edge Rgraphviz graph {} edge Rgraphviz geneplotter {} edge RdbiPgSQL Rdbi {} edge twilight splines {} edge twilight stats {} edge GeneTraffic Biobase {} edge GeneTraffic affy {} edge GeneTraffic marray {} edge GeneTraffic SSOAP {} edge GeneTraffic XML {} edge GeneTraffic digest {} edge GeneTraffic methods {} edge simpleaffy affy {} edge simpleaffy genefilter {} edge maSigPro Biobase {} edge Icens survival {} edge Rredland methods {} edge Rredland graph {} edge graph methods {} edge nnNorm nnet {} edge nnNorm marray {} edge genArise locfit {} edge genArise tkrplot {} edge genArise xtable {} edge genArise methods {} edge EBarrays Biobase {} edge EBarrays methods {} edge EBarrays utils {} edge EBarrays lattice {} edge reb Biobase {} edge reb idiogram {} edge SAGx stats {} edge SAGx multtest {} edge SAGx sma {} edge SAGx methods {} edge RMAGEML marray {} edge RMAGEML limma {} edge RMAGEML Biobase {} edge affyio methods {} edge edd methods {} edge edd golubEsets {} edge edd Biobase {} edge edd class {} edge edd nnet {} edge edd xtable {} edge maDB Biobase {} edge maDB affy {} edge maDB limma {} edge maDB methods {} edge DynDoc methods {} edge DynDoc tools {} edge BeadExplorer methods {} edge BeadExplorer widgetTools {} edge BeadExplorer affy {} edge BeadExplorer R2HTML {} edge BeadExplorer grDevices {} edge BeadExplorer tkWidgets {} edge affycoretools affy {} edge affycoretools limma {} edge affycoretools GOstats {} edge affycoretools biomaRt {} edge limmaGUI limma {} edge limmaGUI tcltk {} edge ABarray Biobase {} edge ABarray multtest {} edge GGtools methods {} edge GGtools Biobase {} edge GGtools hgfocus {} edge GGtools geneplotter {} edge Biobase tools {} edge Biobase methods {} edge Biobase utils {} edge factDesign Biobase {} edge factDesign affy {} edge factDesign stats {} edge sagenhaft SparseM {} edge ROC utils {} edge ROC methods {} edge bim stats {} edge bim qtl {} edge gcrma Biobase {} edge gcrma affy {} edge gcrma matchprobes {} edge gcrma splines {} edge adSplit methods {} edge adSplit stats {} edge adSplit cluster {} edge adSplit multtest {} edge adSplit Biobase {} edge adSplit affy {} edge adSplit GO {} edge adSplit KEGG {} edge Resourcerer AnnBuilder {} edge MergeMaid survival {} edge MergeMaid Biobase {} edge MergeMaid MASS {} edge MergeMaid methods {} edge plier affy {} edge quantsmooth quantreg {} edge quantsmooth lodplot {} edge affycomp Biobase {} edge stepNorm marray {} edge stepNorm MASS {} edge stepNorm methods {} edge clusterStab Biobase {} edge clusterStab methods {} edge affyQCReport Biobase {} edge affyQCReport affy {} edge affyQCReport simpleaffy {} edge affypdnn affy {} edge affypdnn affydata {} edge affypdnn hgu95av2probe {} edge affydata affy {} edge pairseqsim methods {} edge pairseqsim stats {} edge fdrame NONE {} edge ScISI methods {} edge ScISI apComplex {} edge ScISI GO {} edge ScISI GOstats {} edge ScISI graph {} edge ScISI RBGL {} edge ScISI Rgraphviz {} edge ScISI YEAST {} edge ScISI xtable {} edge multtest methods {} edge multtest Biobase {} edge multtest survival {} edge ctc NONE {} edge yeastExpData graph {} edge golubEsets Biobase {} edge estrogen affy {} edge MAQCsubset Biobase {} edge fibroEset Biobase {} edge HEEBOdata NONE {} edge facsDorit prada {} edge Iyer517 Biobase {} edge stjudem utils {} edge ProData Biobase {} edge SpikeIn affy {} edge ALL Biobase {} edge AmpAffyExample affy {} edge kidpack Biobase {} edge CLL affy {} edge CLL Biobase {} edge SpikeInSubset Biobase {} edge SpikeInSubset affy {} edge gaschYHS Biobase {} edge ALLMLL affy {} edge bronchialIL13 affy {} edge beta7 marray {} edge lungExpression Biobase {} edge HIVcDNAvantWout03 NONE {} edge yeastCC Biobase {} edge harbChIP Biobase {} edge ppiData Rgraphviz {} edge ppiData graph {} edge colonCA Biobase {} edge SNAData graph {} edge ecoliLeucine affy {} edge davidTiling Biobase {} edge davidTiling tilingArray {} edge davidTiling GO {} edge MEEBOdata NONE {} edge GGdata Biobase {} edge GGdata hgfocus {} edge rn230rnentrezgprobe matchprobes {} edge rn230brnrefseqprobe matchprobes {} edge dmgenome1dmense utils {} edge medicagoprobe matchprobes {} edge dmgenome1dmugcdf utils {} edge hsex10stv2ptentrezg utils {} edge caninecdf utils {} edge mm430ammensgcdf utils {} edge mm430ammrefseqcdf utils {} edge hsfocushsenstprobe matchprobes {} edge hs133bhsentrezgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrugcdf utils {} edge mm430ammentrezg utils {} edge hgu133bprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmentrezgprobe matchprobes {} edge rn34arnenseprobe matchprobes {} edge soybeancdf utils {} edge hs133xptensgprobe matchprobes {} edge rtu34probe matchprobes {} edge hsex10stv2hsensgcdf utils {} edge rnex10stv1rnensecdf utils {} edge mm11ksubbmmentrezgcdf utils {} edge mu6500subdcdf utils {} edge mm74av2mmensgcdf utils {} edge mm74bv2mmentrezgcdf utils {} edge rn230rnenstprobe matchprobes {} edge hs95av2hsrefseq utils {} edge hsex10stv2hsentrezg utils {} edge mm430bmmenstprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsense utils {} edge mm74av2mmentrezg utils {} edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 methods {} edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 Biostrings {} edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 BSgenome {} edge dmgenome1dmensg utils {} edge mm430bmmensecdf utils {} edge mm430mmensgcdf utils {} edge hu35ksubaprobe matchprobes {} edge rn230brnensgprobe matchprobes {} edge hsex10stv2ptense utils {} edge osriceostigrprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsentrezgprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfenstprobe matchprobes {} edge mm430mmentrezg utils {} edge mm74av1mmrefseqprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnrefseq utils {} edge atgenomeattaircdf utils {} edge hs133xptensgcdf utils {} edge mu19ksubccdf utils {} edge hgu95ecdf utils {} edge atgenomeatrefseqcdf utils {} edge hs133phsrefseqprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsensg utils {} edge hs133xptentrezg utils {} edge saureusprobe matchprobes {} edge hs133av2hsenseprobe matchprobes {} edge rhesusprobe matchprobes {} edge mm74av2mmense utils {} edge mm11ksubammenstcdf utils {} edge mmex10stv1mmrefseq utils {} edge cfcanine2cfentrezgcdf utils {} edge ggchickenggenstprobe matchprobes {} edge cyp450cdf utils {} edge hsex10stv2ptensg utils {} edge hs133pptenseprobe matchprobes {} edge hs133xhsensgcdf utils {} edge poplarcdf utils {} edge dmdrosophila2dmrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2hsrefseqprobe matchprobes {} edge hs133xhsentrezg utils {} edge mm11ksubammugcdf utils {} edge mm74av2mmensg utils {} edge hsex10stv2hsenstprobe matchprobes {} edge mgu74cprobe matchprobes {} edge hsfocushsenseprobe matchprobes {} edge hs133bhsentrezgcdf utils {} edge mmex10stv1mmense utils {} edge mm11ksubammenstprobe matchprobes {} edge hs133av2ptensgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrense utils {} edge mm430mmrefseqcdf utils {} edge cfcanine2cfenstcdf utils {} edge hs133aptenstcdf utils {} edge rn230rnenseprobe matchprobes {} edge mm430bmmenseprobe matchprobes {} edge mm74av1mmug utils {} edge bovinecdf utils {} edge drzebrafishdrensecdf utils {} edge dmgenome1dmensecdf utils {} edge rae230bcdf utils {} edge hu6800cdf utils {} edge ath1attairprobe matchprobes {} edge canineprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmensg utils {} edge hs133ahsrefseqcdf utils {} edge cfcanine2cfenseprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnugcdf utils {} edge mm74av2mmrefseq utils {} edge hs133ahsenstcdf utils {} edge mm430mmrefseq utils {} edge drzebrafishdrensg utils {} edge ggchickenggenstcdf utils {} edge mm74cv2mmenstcdf utils {} edge hsfocusptensgprobe matchprobes {} edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 methods {} edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 Biostrings {} edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 BSgenome {} edge hs133bhsenstprobe matchprobes {} edge mm11ksubammugprobe matchprobes {} edge ggchickenggenseprobe matchprobes {} edge mm430mmense utils {} edge mm74cv2mmenstprobe matchprobes {} edge dmdrosophila2dmenst utils {} edge tomatocdf utils {} edge mm74av1mmenst utils {} edge mgu74bv2probe matchprobes {} edge rn230arnenstcdf utils {} edge hgu133acdf utils {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 methods {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 Biostrings {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 BSgenome {} edge hs95av2hsenstprobe matchprobes {} edge atgenomeattigrprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfense utils {} edge rnex10stv1rnensgcdf utils {} edge mm74cv2mmentrezgcdf utils {} edge hs133ahsense utils {} edge dmdrosophila2dmenstprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsenseprobe matchprobes {} edge hsfocusptentrezgprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnentrezg utils {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 methods {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 Biostrings {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 BSgenome {} edge moe430bcdf utils {} edge rnex10stv1rnensgprobe matchprobes {} edge mm430mmentrezgprobe matchprobes {} edge ye6100subacdf utils {} edge mm430mmensg utils {} edge hs133xhsug utils {} edge mm11ksubammenseprobe matchprobes {} edge chickencdf utils {} edge mm430bmmensgcdf utils {} edge hs133aptense utils {} edge rn230rnenstcdf utils {} edge rn230arnenstprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfrefseq utils {} edge mm430bmmentrezg utils {} edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 methods {} edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 Biostrings {} edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 BSgenome {} edge cfcanine2cfugprobe matchprobes {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 methods {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 Biostrings {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 BSgenome {} edge hs133phsug utils {} edge zebrafishcdf utils {} edge rat2302cdf utils {} edge moe430bprobe matchprobes {} edge rn230rnugcdf utils {} edge cfcanine2cfensg utils {} edge hgu95bprobe matchprobes {} edge yeast2cdf utils {} edge hgu133plus2probe matchprobes {} edge hs133ahsensg utils {} edge mm74av1mmrefseqcdf utils {} edge mmex10stv1mmenstprobe matchprobes {} edge hsfocusptenstcdf utils {} edge mm74bv2mmensecdf utils {} edge rn230brnug utils {} edge hs133xhsrefseqcdf utils {} edge hs133aptensg utils {} edge hgu133a2probe matchprobes {} edge citrusprobe matchprobes {} edge hs133ahsugprobe matchprobes {} edge hsex10stv2ptensgprobe matchprobes {} edge ggchickenggugprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmugprobe matchprobes {} edge dmgenome1dmenst utils {} edge rn34arnentrezgprobe matchprobes {} edge mm74av2mmenstprobe matchprobes {} edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 methods {} edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 Biostrings {} edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 BSgenome {} edge mmex10stv1mmensecdf utils {} edge hs133bhsenseprobe matchprobes {} edge hsfocushsenstcdf utils {} edge mm74cv2mmentrezgprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmenstcdf utils {} edge mm74cv2mmenseprobe matchprobes {} edge hs133xhsense utils {} edge dmdrosophila2dmug utils {} edge mm74bv2mmensgprobe matchprobes {} edge rgu34cprobe matchprobes {} edge rn230arnugprobe matchprobes {} edge hs133xptense utils {} edge hsex10stv2hsenst utils {} edge hs95av2hsenseprobe matchprobes {} edge mgu74bv2cdf utils {} edge rn34arnrefseqcdf utils {} edge hsex10stv2ptenst utils {} edge dmdrosophila2dmenseprobe matchprobes {} edge hthgu133acdf utils {} edge agprobe matchprobes {} edge hsfocushsentrezgprobe matchprobes {} edge hs133xhsensg utils {} edge drzebrafishdrensgcdf utils {} edge dmgenome1dmensgcdf utils {} edge hu35ksubdprobe matchprobes {} edge hs133bptensgprobe matchprobes {} edge rn230rnugprobe matchprobes {} edge maizeprobe matchprobes {} edge rn230arnenseprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrentrezg utils {} edge hs133xptensg utils {} edge hs133pptenstcdf utils {} edge mm74av2mmenst utils {} edge vvgrapevvtigrprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsugcdf utils {} edge hs133bptenstcdf utils {} edge paeg1acdf utils {} edge mm11ksubammug utils {} edge mm430ammugcdf utils {} edge ggchickenggrefseq utils {} edge hs95av2ptensgprobe matchprobes {} edge hs133av2hsrefseqcdf utils {} edge mmex10stv1mmenseprobe matchprobes {} edge mm430ammensgprobe matchprobes {} edge hs133ahsrefseqprobe matchprobes {} edge hs133bhsense utils {} edge hs133phsenstcdf utils {} edge hs133bptentrezgcdf utils {} edge hgu133aprobe matchprobes {} edge hs133bhsenstcdf utils {} edge dmdrosophila2dmrefseq utils {} edge hs133bptense utils {} edge mm74av2mmenseprobe matchprobes {} edge mm11ksubammense utils {} edge hu35ksubbcdf utils {} edge mmex10stv1mmenst utils {} edge dmdrosophila2dmenstcdf utils {} edge hsfocushsugprobe matchprobes {} edge atgenomeattigr utils {} edge hgu133atagcdf utils {} edge mm11ksubbmmugprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrenst utils {} edge hgu133a2cdf utils {} edge drzebrafishdrenstprobe matchprobes {} edge hs133phsentrezgcdf utils {} edge hs95av2hsugcdf utils {} edge hs133bhsensg utils {} edge hs95av2hsentrezgcdf utils {} edge ye6100subccdf utils {} edge rn34arnrefseqprobe matchprobes {} edge hsfocushsrefseqcdf utils {} edge hsex10stv2hsug utils {} edge rn230brnenstcdf utils {} edge hs133phsense utils {} edge hs133bptensg utils {} edge mm11ksubammensg utils {} edge rn230rnrefseqcdf utils {} edge mu6500subacdf utils {} edge hs133pptense utils {} edge tomatoprobe matchprobes {} edge rgu34acdf utils {} edge mm430bmmrefseqcdf utils {} edge osriceosrefseqprobe matchprobes {} edge dmdrosophila2dmugcdf utils {} edge bovineprobe matchprobes {} edge hgu95av2cdf utils {} edge mm74bv2mmensgcdf utils {} edge mm11ksubbmmugcdf utils {} edge mgu74bcdf utils {} edge mm74av1mmugcdf utils {} edge cfcanine2cfrefseqcdf utils {} edge hu6800subbcdf utils {} edge hs133phsensg utils {} edge rn34arnenstcdf utils {} edge mm74bv2mmentrezg utils {} edge mm74av1mmentrezgprobe matchprobes {} edge mm430mmenst utils {} edge hsfocushsugcdf utils {} edge test3probe matchprobes {} edge soybeanprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmensgcdf utils {} edge hs133pptensg utils {} edge mm74av1mmenstcdf utils {} edge dmgenome1dmenstprobe matchprobes {} edge hgu95bcdf utils {} edge mgu74bprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmentrezg utils {} edge hs133xhsugcdf utils {} edge hs133phsugprobe matchprobes {} edge ggchickenggrefseqcdf utils {} edge cfcanine2cfenst utils {} edge mm430ammrefseqprobe matchprobes {} edge mm74av2mmug utils {} edge mm430mmensgprobe matchprobes {} edge hs133phsugcdf utils {} edge hs133bhsugprobe matchprobes {} edge hs133ahsenst utils {} edge rnex10stv1rnentrezgcdf utils {} edge hs133ahsug utils {} edge dmdrosophila2dmugprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmrefseq utils {} edge hs133aptenst utils {} edge hs133av2hsentrezgcdf utils {} edge test1cdf utils {} edge rn230arnugcdf utils {} edge maizecdf utils {} edge plasmodiumanophelesprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrenseprobe matchprobes {} edge hs133ahsensgprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsrefseqcdf utils {} edge rn34arnrefseq utils {} edge mm74av1mmrefseq utils {} edge gp53cdf utils {} edge mm11ksubammrefseqcdf utils {} edge ecoliasv2probe matchprobes {} edge rn230brnugprobe matchprobes {} edge hs133aptenstprobe matchprobes {} edge atgenomeattairprobe matchprobes {} edge hs133av2ptenstcdf utils {} edge mgu74cv2probe matchprobes {} edge hs95av2hsense utils {} edge ggchickenggug utils {} edge hgu95eprobe matchprobes {} edge hs133pptentrezgprobe matchprobes {} edge canine2probe matchprobes {} edge mm11ksubbmmense utils {} edge hsfocushsense utils {} edge mm11ksubbmmenstprobe matchprobes {} edge rn230arnense utils {} edge hs95av2ptense utils {} edge ath1attigr utils {} edge yeast2probe matchprobes {} edge mm430bmmrefseq utils {} edge hsfocusptense utils {} edge hs133av2hsenstcdf utils {} edge agcdf utils {} edge rn34arnugprobe matchprobes {} edge hs133xhsenst utils {} edge hs95av2hsensg utils {} edge hu35ksubdcdf utils {} edge mm74av1mmugprobe matchprobes {} edge dmgenome1dmenseprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmensg utils {} edge hs133xptenst utils {} edge hsfocushsensg utils {} edge cfcanine2cfrefseqprobe matchprobes {} edge hs133phsenstprobe matchprobes {} edge hs133bhsrefseqcdf utils {} edge rn230arnensg utils {} edge hs95av2ptensg utils {} edge mm430mmug utils {} edge mm74cv2mmrefseqcdf utils {} edge ath1121501cdf utils {} edge hsfocusptensg utils {} edge ricecdf utils {} edge mm11ksubammensecdf utils {} edge wheatprobe matchprobes {} edge hs133av2hsugcdf utils {} edge drosophila2cdf utils {} edge moe430aprobe matchprobes {} edge hs95av2ptenstcdf utils {} edge hs95av2hsrefseqcdf utils {} edge hgu95aprobe matchprobes {} edge atgenomeattigrcdf utils {} edge barley1probe matchprobes {} edge mm74av1mmensgprobe matchprobes {} edge mu6500subccdf utils {} edge dmdrosophila2dmrefseqcdf utils {} edge dmgenome1dmrefseqprobe matchprobes {} edge rgu34ccdf utils {} edge hs133xhsensgprobe matchprobes {} edge hsfocushsrefseq utils {} edge hcg110probe matchprobes {} edge hs95av2hsenstcdf utils {} edge mm430mmentrezgcdf utils {} edge hs133bhsrefseq utils {} edge hs133aptenseprobe matchprobes {} edge rn230rnrefseqprobe matchprobes {} edge hs133xptenstprobe matchprobes {} edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 methods {} edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 Biostrings {} edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 BSgenome {} edge mu11ksubbprobe matchprobes {} edge rn230arnrefseqcdf utils {} edge osriceosrefseq utils {} edge hu6800subdcdf utils {} edge mm74bv2mmug utils {} edge ecoliasv2cdf utils {} edge hs133bhsenst utils {} edge mm74av2mmentrezgprobe matchprobes {} edge hivprtplus2cdf utils {} edge hs133phsentrezgprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmenseprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfensecdf utils {} edge hs133xptentrezgprobe matchprobes {} edge mm74av1mmentrezgcdf utils {} edge hs133aptensecdf utils {} edge hs133bptenst utils {} edge mu19ksubbcdf utils {} edge rn230brnenstprobe matchprobes {} edge mm11ksubammenst utils {} edge hsex10stv2ptenstcdf utils {} edge hgu95dcdf utils {} edge mmex10stv1mmrefseqcdf utils {} edge mm74cv2mmrefseqprobe matchprobes {} edge rgu34bprobe matchprobes {} edge hs133av2hsugprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrug utils {} edge hs133pptentrezgcdf utils {} edge hs95av2ptentrezgcdf utils {} edge mm430mmugcdf utils {} edge mm430ammenstcdf utils {} edge rn34arnensgprobe matchprobes {} edge mgu74av2cdf utils {} edge ath1121501probe matchprobes {} edge rn230rnug utils {} edge osriceostigr utils {} edge citruscdf utils {} edge mm74av2mmrefseqcdf utils {} edge hs133av2hsense utils {} edge hs133ahsensecdf utils {} edge hs133phsenseprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsenstcdf utils {} edge ggchickenggensecdf utils {} edge mm74av2mmenstcdf utils {} edge mm74cv2mmensecdf utils {} edge test3cdf utils {} edge ath1atrefseq utils {} edge hs133av2ptense utils {} edge hs133phsenst utils {} edge mm74av2mmrefseqprobe matchprobes {} edge mm430ammentrezgcdf utils {} edge hu35ksubcprobe matchprobes {} edge rn230brnense utils {} edge hs133pptenst utils {} edge mm11ksubbmmug utils {} edge mm430bmmugcdf utils {} edge mm430mmenstcdf utils {} edge mm11ksubammrefseqprobe matchprobes {} edge chickenprobe matchprobes {} edge hs133av2hsensg utils {} edge rn230arnentrezgcdf utils {} edge atgenomeatrefseqprobe matchprobes {} edge poplarprobe matchprobes {} edge rn230arnensecdf utils {} edge hs133av2hsensgprobe matchprobes {} edge plasmodiumanophelescdf utils {} edge hs133xptenstcdf utils {} edge hs133av2ptensg utils {} edge bsubtilisprobe matchprobes {} edge rn230arnrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2hsugprobe matchprobes {} edge hs133av2ptenstprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmense utils {} edge hs133pptensgprobe matchprobes {} edge rn230brnensg utils {} edge hs133xptenseprobe matchprobes {} edge rae230acdf utils {} edge mu11ksubbcdf utils {} edge hs133xhsentrezgcdf utils {} edge mouse430a2cdf utils {} edge hgfocusprobe matchprobes {} edge hs133xhsenstcdf utils {} edge drosgenome1cdf utils {} edge hsex10stv2hsentrezgcdf utils {} edge rn230rnensecdf utils {} edge rn230brnrefseq utils {} edge cfcanine2cfentrezgprobe matchprobes {} edge hs133av2ptentrezgcdf utils {} edge hs133xhsentrezgprobe matchprobes {} edge rn230brnenseprobe matchprobes {} edge hsfocushsensgprobe matchprobes {} edge hs133av2hsrefseq utils {} edge mm74cv2mmensg utils {} edge mm430ammugprobe matchprobes {} edge hsfocusptenstprobe matchprobes {} edge mm11ksubammensgcdf utils {} edge hsfocusptensecdf utils {} edge hsex10stv2hsrefseq utils {} edge rn230rnensgprobe matchprobes {} edge hs133xhsrefseq utils {} edge mm430bmmensgprobe matchprobes {} edge mm11ksubammentrezg utils {} edge hsex10stv2hsugprobe matchprobes {} edge ath1atrefseqprobe matchprobes {} edge mm74av2mmugprobe matchprobes {} edge mm74av2mmugcdf utils {} edge rnu34cdf utils {} edge mm74cv2mmug utils {} edge osriceostigrcdf utils {} edge mm11ksubammentrezgprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmug utils {} edge hs95av2ptentrezgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrrefseqcdf utils {} edge cfcanine2cfensgprobe matchprobes {} edge hs95av2hsenst utils {} edge hsfocushsensecdf utils {} edge ath1attaircdf utils {} edge mm430mmugprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmenst utils {} edge moe430acdf utils {} edge hsfocushsenst utils {} edge mm11ksubbmmensecdf utils {} edge rn230arnenst utils {} edge hs95av2ptenst utils {} edge hsfocusptenst utils {} edge mm430ammug utils {} edge mgu74aprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnenstprobe matchprobes {} edge ggchickenggensgprobe matchprobes {} edge hs133bhsug utils {} edge mm11ksubammentrezgcdf utils {} edge cfcanine2cfensgcdf utils {} edge hs133av2ptenseprobe matchprobes {} edge hs133aptensgcdf utils {} edge cfcanine2cfentrezg utils {} edge rn230brnugcdf utils {} edge hs133aptentrezg utils {} edge mm11ksubammrefseq utils {} edge rae230bprobe matchprobes {} edge mouse430a2probe matchprobes {} edge hs133xhsugprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmrefseq utils {} edge hgu133atagprobe matchprobes {} edge hs133pptensecdf utils {} edge hsex10stv2hsensgprobe matchprobes {} edge rn34arnense utils {} edge hs133ahsensgcdf utils {} edge dmgenome1dmrefseqcdf utils {} edge rnex10stv1rnenstcdf utils {} edge ggchickenggensgcdf utils {} edge mm74cv2mmensgcdf utils {} edge hs133bptensecdf utils {} edge rnex10stv1rnug utils {} edge drzebrafishdrrefseqprobe matchprobes {} edge mm11ksubammensgprobe matchprobes {} edge hs133ahsentrezg utils {} edge hs133phsrefseq utils {} edge riceprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmentrezg utils {} edge hsex10stv2ptenstprobe matchprobes {} edge hsfocusptenseprobe matchprobes {} edge mm430bmmenstcdf utils {} edge barley1cdf utils {} edge hs133phsensecdf utils {} edge hgu95dprobe matchprobes {} edge celeganscdf utils {} edge hs133bhsensecdf utils {} edge rn34arnensg utils {} edge mm430ammense utils {} edge mm430ammrefseq utils {} edge rn230arnensgcdf utils {} edge hs95av2hsentrezgprobe matchprobes {} edge dmdrosophila2dmensecdf utils {} edge rn230arnentrezg utils {} edge mm74bv2mmenstprobe matchprobes {} edge ecoli2probe matchprobes {} edge cfcanine2cfugcdf utils {} edge hs133ahsentrezgcdf utils {} edge hs133bhsensgprobe matchprobes {} edge rn230brnensecdf utils {} edge rn230rnensgcdf utils {} edge rnex10stv1rnenseprobe matchprobes {} edge mm430ammensg utils {} edge mm74cv2mmensgprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmrefseqcdf utils {} edge PFAM RSQLite {} edge rn230rnentrezg utils {} edge hs133bptenstprobe matchprobes {} edge hs133av2hsenst utils {} edge drosophila2probe matchprobes {} edge u133x3pcdf utils {} edge hs95av2hsensgprobe matchprobes {} edge hs133av2ptenst utils {} edge sugarcanecdf utils {} edge medicagocdf utils {} edge rtu34cdf utils {} edge hsfocusptensgcdf utils {} edge dmdrosophila2dmensgprobe matchprobes {} edge rn230brnenst utils {} edge rnex10stv1rnrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2ptenstprobe matchprobes {} edge hsfocusptentrezg utils {} edge rnex10stv1rnugprobe matchprobes {} edge mm430ammenstprobe matchprobes {} edge hgu133bcdf utils {} edge rn34arnensecdf utils {} edge hu35ksubacdf utils {} edge hs133phsrefseqcdf utils {} edge ggchickenggense utils {} edge xenopuslaevisprobe matchprobes {} edge hcg110cdf utils {} edge hs133ahsrefseq utils {} edge mm11ksubbmmentrezgprobe matchprobes {} edge hsex10stv2ptenseprobe matchprobes {} edge mm74av1mmensecdf utils {} edge rn230arnensgprobe matchprobes {} edge rn230rnrefseq utils {} edge hs133ahsugcdf utils {} edge hsfocushsentrezgcdf utils {} edge mu11ksubaprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrenstcdf utils {} edge dmgenome1dmenstcdf utils {} edge mm430bmmugprobe matchprobes {} edge hsfocushsensgcdf utils {} edge mm11ksubbmmensgcdf utils {} edge ye6100subbcdf utils {} edge mmex10stv1mmentrezgcdf utils {} edge hsfocushsentrezg utils {} edge canine2cdf utils {} edge hs133xptentrezgcdf utils {} edge hs133bhsrefseqprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmenst utils {} edge mm11ksubbmmentrezg utils {} edge ecolicdf utils {} edge mm74bv2mmugcdf utils {} edge hsex10stv2ptentrezgcdf utils {} edge rnex10stv1rnense utils {} edge vvgrapevvtigrcdf utils {} edge mmex10stv1mmensgprobe matchprobes {} edge ggchickenggensg utils {} edge rnex10stv1rnentrezgprobe matchprobes {} edge hsfocushsug utils {} edge rn230rnense utils {} edge mm74bv2mmenseprobe matchprobes {} edge rgu34aprobe matchprobes {} edge vvgrapevvtigr utils {} edge mm74av2mmensgprobe matchprobes {} edge rhesuscdf utils {} edge zebrafishprobe matchprobes {} edge hsfocushsrefseqprobe matchprobes {} edge mgu74acdf utils {} edge hu6800subacdf utils {} edge rnex10stv1rnensg utils {} edge hs133pptensgcdf utils {} edge hs133av2ptensecdf utils {} edge hu35ksubbprobe matchprobes {} edge rnu34probe matchprobes {} edge xenopuslaeviscdf utils {} edge hs133bptenseprobe matchprobes {} edge rn230rnensg utils {} edge rn34arnug utils {} edge rn230brnrefseqcdf utils {} edge dmgenome1dmrefseq utils {} edge hs133bptensgcdf utils {} edge hs133pptentrezg utils {} edge mm430bmmense utils {} edge hgu95acdf utils {} edge ath1atrefseqcdf utils {} edge hs133av2ptentrezgprobe matchprobes {} edge hs133bptentrezg utils {} edge hs133xhsrefseqprobe matchprobes {} edge hs133phsensgcdf utils {} edge hs133av2hsensecdf utils {} edge hs95av2ptenseprobe matchprobes {} edge rn230arnentrezgprobe matchprobes {} edge mm430ammentrezgprobe matchprobes {} edge mm430ammenseprobe matchprobes {} edge hs133aptentrezgprobe matchprobes {} edge hs133bhsensgcdf utils {} edge hs133phsentrezg utils {} edge mm74bv2mmense utils {} edge rat2302probe matchprobes {} edge mouse4302probe matchprobes {} edge hs133bhsentrezg utils {} edge mm430mmenstprobe matchprobes {} edge atgenomeattair utils {} edge mm430bmmensg utils {} edge drzebrafishdrugprobe matchprobes {} edge ecoli2cdf utils {} edge dmgenome1dmugprobe matchprobes {} edge dmdrosophila2dmensgcdf utils {} edge bsubtiliscdf utils {} edge mm74bv2mmenstcdf utils {} edge rn230arnrefseq utils {} edge hs133av2hsrefseqprobe matchprobes {} edge atgenomeatrefseq utils {} edge mm430bmmrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2ptensecdf utils {} edge ygs98cdf utils {} edge hs133ahsenstprobe matchprobes {} edge mm74bv2mmensg utils {} edge rn230brnensgcdf utils {} edge hgu133plus2cdf utils {} edge mmex10stv1mmenstcdf utils {} edge mmex10stv1mmrefseqprobe matchprobes {} edge ygs98probe matchprobes {} edge rn230brnentrezg utils {} edge hsex10stv2hsrefseqprobe matchprobes {} edge rn34arnenst utils {} edge hs95av2hsensecdf utils {} edge mm430mmrefseqprobe matchprobes {} edge mm74bv2mmentrezgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrensgprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfug utils {} edge rn34arnensgcdf utils {} edge hu35ksubccdf utils {} edge mm430bmmug utils {} edge rn34arnentrezg utils {} edge mm74av1mmensgcdf utils {} edge hs133av2hsentrezgprobe matchprobes {} edge mm430ammenst utils {} edge u133aaofav2cdf utils {} edge hsex10stv2ptensecdf utils {} edge ggchickenggugcdf utils {} edge mm74av1mmentrezg utils {} edge drzebrafishdrrefseq utils {} edge ecoliprobe matchprobes {} edge ye6100subdcdf utils {} edge hs95av2hsug utils {} edge porcineprobe matchprobes {} edge mm430ammensecdf utils {} edge hs133aptentrezgcdf utils {} edge mm74bv2mmrefseq utils {} edge hs133ahsentrezgprobe matchprobes {} edge mm430mmenseprobe matchprobes {} edge ath1attigrprobe matchprobes {} edge rn230rnentrezgcdf utils {} edge hsex10stv2hsensecdf utils {} edge mu6500subbcdf utils {} edge mm74av2mmensecdf utils {} edge mm74av2mmentrezgcdf utils {} edge rgu34bcdf utils {} edge rae230aprobe matchprobes {} edge sugarcaneprobe matchprobes {} edge mm74bv2mmugprobe matchprobes {} edge saureuscdf utils {} edge mgu74av2probe matchprobes {} edge htratfocuscdf utils {} edge mm74av1mmenstprobe matchprobes {} edge mm430mmensecdf utils {} edge dmgenome1dmensgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrentrezgcdf utils {} edge mgu74ccdf utils {} edge mm74cv2mmugcdf utils {} edge hu6800subccdf utils {} edge hs133ahsenseprobe matchprobes {} edge hs133xhsenstprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmugprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnrefseqcdf utils {} edge mouse4302cdf utils {} edge hs133av2ptensgcdf utils {} edge paeg1aprobe matchprobes {} edge hs133xptensecdf utils {} edge mu19ksubacdf utils {} edge hs133av2ptentrezg utils {} edge hgu95ccdf utils {} edge mm430bmmentrezgcdf utils {} edge hsfocusptentrezgcdf utils {} edge ath1attair utils {} edge ggchickenggenst utils {} edge wheatcdf utils {} edge celegansprobe matchprobes {} edge hgu95cprobe matchprobes {} edge vitisviniferaprobe matchprobes {} edge hgu95av2probe matchprobes {} edge drosgenome1probe matchprobes {} edge hs133av2hsensgcdf utils {} edge rn230brnentrezgprobe matchprobes {} edge mm430bmmentrezgprobe matchprobes {} edge hs133bptentrezgprobe matchprobes {} edge rn230brnentrezgcdf utils {} edge hs133xhsensecdf utils {} edge hs133av2hsentrezg utils {} edge osriceosrefseqcdf utils {} edge hgfocuscdf utils {} edge test2cdf utils {} edge hs133aptensgprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmugcdf utils {} edge rn34arnenstprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnenst utils {} edge dmdrosophila2dmense utils {} edge mm74av1mmense utils {} edge rn230arnug utils {} edge rn230rnenst utils {} edge mm11ksubbmmensgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrentrezgprobe matchprobes {} edge rn34arnentrezgcdf utils {} edge hs95av2ptensgcdf utils {} edge hsex10stv2ptentrezgprobe matchprobes {} edge hs133av2hsug utils {} edge mm74bv2mmrefseqcdf utils {} edge hs95av2ptentrezg utils {} edge dmgenome1dmug utils {} edge mgu74cv2cdf utils {} edge rn34arnugcdf utils {} edge dmdrosophila2dmensg utils {} edge mm74av1mmensg utils {} edge mm74av1mmenseprobe matchprobes {} edge hs133bhsugcdf utils {} edge mm430bmmenst utils {} edge hs133av2hsenstprobe matchprobes {} edge hs133phsensgprobe matchprobes {} edge hs95av2hsensgcdf utils {} edge mu11ksubacdf utils {} edge hs133xhsenseprobe matchprobes {} edge ggchickenggrefseqprobe matchprobes {} edge porcinecdf utils {} edge u133x3pprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2hsentrezg utils {} edge hu6800probe matchprobes {} edge hs133pptenstprobe matchprobes {} edge mm74bv2mmrefseqprobe matchprobes {} edge ath1attigrcdf utils {} edge mm74bv2mmenst utils {} edge vitisviniferacdf utils {} edge hsex10stv2ptensgcdf utils {} edge LogitBoost NONE {} edge XML methods {} edge RMySQL methods {} edge RMySQL DBI {} edge SSOAP methods {} edge SSOAP XML {} edge SSOAP RCurl {} edge RCurl methods {} }}