Difference between revisions of "Test graph - BioConductor package dependancies"
| (5 intermediate revisions by 2 users not shown) | |||
| Line 1: | Line 1: | ||
| − | + | This graph shows the package dependencies for the BioConductor software for the statistical analysis of microarrary data in R. The dependency list was generated from the BioConductor-1.9 software repository HTML pages. | |
| − | {{#wgraph: png | thumb=40 | | + | Unfortunately it is too large to be used on this webserver (due to memory limitations). A slightly shorter list (75%) would work. See also [[Test graph 2]] ... |
| + | |||
| + | {{#wgraph: png | thumb=40 | | ||
| + | nodetype * { font helvR08 } | ||
| + | layoutalgorithm=forcedir | ||
edge gpls NONE {} | edge gpls NONE {} | ||
edge sigPathway R {} | edge sigPathway R {} | ||
| Line 43: | Line 47: | ||
edge biomaRt XML {} | edge biomaRt XML {} | ||
edge biomaRt RCurl {} | edge biomaRt RCurl {} | ||
| − | |||
edge gaggle rJava {} | edge gaggle rJava {} | ||
edge gaggle graph {} | edge gaggle graph {} | ||
| Line 50: | Line 53: | ||
edge affylmGUI affy {} | edge affylmGUI affy {} | ||
edge affylmGUI Biobase {} | edge affylmGUI Biobase {} | ||
| − | |||
edge SAGElyzer AnnBuilder {} | edge SAGElyzer AnnBuilder {} | ||
edge SAGElyzer tkWidgets {} | edge SAGElyzer tkWidgets {} | ||
| Line 56: | Line 58: | ||
edge SAGElyzer annotate {} | edge SAGElyzer annotate {} | ||
edge GeneR NONE {} | edge GeneR NONE {} | ||
| − | |||
edge GeneSpring Biobase {} | edge GeneSpring Biobase {} | ||
edge GeneSpring methods {} | edge GeneSpring methods {} | ||
| − | |||
edge geneplotter annotate {} | edge geneplotter annotate {} | ||
edge geneplotter Biobase {} | edge geneplotter Biobase {} | ||
edge geneplotter methods {} | edge geneplotter methods {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge BioMVCClass methods {} | edge BioMVCClass methods {} | ||
edge BioMVCClass MVCClass {} | edge BioMVCClass MVCClass {} | ||
| Line 79: | Line 77: | ||
edge snapCGH cluster {} | edge snapCGH cluster {} | ||
edge snapCGH methods {} | edge snapCGH methods {} | ||
| − | |||
edge bioDist methods {} | edge bioDist methods {} | ||
edge bioDist Biobase {} | edge bioDist Biobase {} | ||
| − | |||
edge marray limma {} | edge marray limma {} | ||
edge marray methods {} | edge marray methods {} | ||
| − | |||
edge tkWidgets methods {} | edge tkWidgets methods {} | ||
edge tkWidgets widgetTools {} | edge tkWidgets widgetTools {} | ||
edge tkWidgets DynDoc {} | edge tkWidgets DynDoc {} | ||
edge rama NONE {} | edge rama NONE {} | ||
| − | |||
edge Ruuid methods {} | edge Ruuid methods {} | ||
| − | |||
edge arrayQuality marray {} | edge arrayQuality marray {} | ||
edge arrayQuality limma {} | edge arrayQuality limma {} | ||
| Line 112: | Line 105: | ||
edge ppiStats Rgraphviz {} | edge ppiStats Rgraphviz {} | ||
edge ppiStats Category {} | edge ppiStats Category {} | ||
| − | |||
edge pcaMethods MASS {} | edge pcaMethods MASS {} | ||
edge pcaMethods ellipse {} | edge pcaMethods ellipse {} | ||
edge pcaMethods pls {} | edge pcaMethods pls {} | ||
edge pcaMethods methods {} | edge pcaMethods methods {} | ||
| − | |||
edge GlobalAncova methods {} | edge GlobalAncova methods {} | ||
| − | |||
edge webbioc Biobase {} | edge webbioc Biobase {} | ||
edge webbioc affy {} | edge webbioc affy {} | ||
| Line 134: | Line 124: | ||
edge widgetInvoke XML {} | edge widgetInvoke XML {} | ||
edge widgetInvoke RGtk {} | edge widgetInvoke RGtk {} | ||
| − | |||
edge hexbin methods {} | edge hexbin methods {} | ||
edge hexbin grid {} | edge hexbin grid {} | ||
edge hexbin lattice {} | edge hexbin lattice {} | ||
edge hexbin colorspace {} | edge hexbin colorspace {} | ||
| − | |||
edge matchprobes Biobase {} | edge matchprobes Biobase {} | ||
edge matchprobes affy {} | edge matchprobes affy {} | ||
| Line 145: | Line 133: | ||
edge siggenes multtest {} | edge siggenes multtest {} | ||
edge siggenes Biobase {} | edge siggenes Biobase {} | ||
| − | |||
edge AnnBuilder methods {} | edge AnnBuilder methods {} | ||
edge AnnBuilder Biobase {} | edge AnnBuilder Biobase {} | ||
| Line 155: | Line 142: | ||
edge RBGL graph {} | edge RBGL graph {} | ||
edge RBGL methods {} | edge RBGL methods {} | ||
| − | |||
edge biocViews methods {} | edge biocViews methods {} | ||
edge biocViews tools {} | edge biocViews tools {} | ||
| Line 161: | Line 147: | ||
edge biocViews RBGL {} | edge biocViews RBGL {} | ||
edge biocViews XML {} | edge biocViews XML {} | ||
| − | |||
edge CoCiteStats humanLLMappings {} | edge CoCiteStats humanLLMappings {} | ||
edge ChromoViz RSvgDevice {} | edge ChromoViz RSvgDevice {} | ||
| Line 172: | Line 157: | ||
edge GOstats Category {} | edge GOstats Category {} | ||
edge GOstats methods {} | edge GOstats methods {} | ||
| − | |||
edge prada Biobase {} | edge prada Biobase {} | ||
edge prada RColorBrewer {} | edge prada RColorBrewer {} | ||
| Line 178: | Line 162: | ||
edge prada methods {} | edge prada methods {} | ||
edge prada geneplotter {} | edge prada geneplotter {} | ||
| − | |||
edge bridge rama {} | edge bridge rama {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge ontoTools methods {} | edge ontoTools methods {} | ||
edge ontoTools graph {} | edge ontoTools graph {} | ||
| Line 188: | Line 169: | ||
edge ontoTools Biobase {} | edge ontoTools Biobase {} | ||
edge ontoTools annotate {} | edge ontoTools annotate {} | ||
| − | |||
edge MCRestimate e1071 {} | edge MCRestimate e1071 {} | ||
edge MCRestimate pamr {} | edge MCRestimate pamr {} | ||
| Line 200: | Line 180: | ||
edge pkgDepTools RBGL {} | edge pkgDepTools RBGL {} | ||
edge MeasurementError.cor NONE {} | edge MeasurementError.cor NONE {} | ||
| − | |||
edge logicFS LogicReg {} | edge logicFS LogicReg {} | ||
| − | |||
edge copa Biobase {} | edge copa Biobase {} | ||
edge copa methods {} | edge copa methods {} | ||
| Line 212: | Line 190: | ||
edge Category methods {} | edge Category methods {} | ||
edge Category genefilter {} | edge Category genefilter {} | ||
| − | |||
edge Harshlight affy {} | edge Harshlight affy {} | ||
| − | |||
edge OrderedList Biobase {} | edge OrderedList Biobase {} | ||
edge OrderedList twilight {} | edge OrderedList twilight {} | ||
| − | |||
edge MVCClass methods {} | edge MVCClass methods {} | ||
edge panp affy {} | edge panp affy {} | ||
edge LPE NONE {} | edge LPE NONE {} | ||
| − | |||
edge MANOR GLAD {} | edge MANOR GLAD {} | ||
edge RbcBook1 Biobase {} | edge RbcBook1 Biobase {} | ||
| − | |||
edge vsn Biobase {} | edge vsn Biobase {} | ||
| − | |||
edge iSPlot methods {} | edge iSPlot methods {} | ||
edge iSPlot RGtk {} | edge iSPlot RGtk {} | ||
| Line 232: | Line 204: | ||
edge iSPlot MVCClass {} | edge iSPlot MVCClass {} | ||
edge pickgene MASS {} | edge pickgene MASS {} | ||
| − | |||
edge makecdfenv methods {} | edge makecdfenv methods {} | ||
edge makecdfenv Biobase {} | edge makecdfenv Biobase {} | ||
| Line 238: | Line 209: | ||
edge makecdfenv utils {} | edge makecdfenv utils {} | ||
edge makecdfenv affyio {} | edge makecdfenv affyio {} | ||
| − | |||
edge aCGH cluster {} | edge aCGH cluster {} | ||
edge aCGH survival {} | edge aCGH survival {} | ||
| Line 247: | Line 217: | ||
edge KEGGSOAP SSOAP {} | edge KEGGSOAP SSOAP {} | ||
edge KEGGSOAP RCurl {} | edge KEGGSOAP RCurl {} | ||
| − | |||
edge annotate methods {} | edge annotate methods {} | ||
edge annotate Biobase {} | edge annotate Biobase {} | ||
| − | |||
edge limma methods {} | edge limma methods {} | ||
| − | |||
edge timecourse limma {} | edge timecourse limma {} | ||
edge timecourse MASS {} | edge timecourse MASS {} | ||
edge timecourse Biobase {} | edge timecourse Biobase {} | ||
edge timecourse methods {} | edge timecourse methods {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge nem e1071 {} | edge nem e1071 {} | ||
edge nem graph {} | edge nem graph {} | ||
edge nem Rgraphviz {} | edge nem Rgraphviz {} | ||
edge nem RBGL {} | edge nem RBGL {} | ||
| − | |||
edge HEM Biobase {} | edge HEM Biobase {} | ||
edge SBMLR XML {} | edge SBMLR XML {} | ||
edge SBMLR odesolve {} | edge SBMLR odesolve {} | ||
| − | |||
edge MLInterfaces Biobase {} | edge MLInterfaces Biobase {} | ||
edge MLInterfaces methods {} | edge MLInterfaces methods {} | ||
edge MLInterfaces genefilter {} | edge MLInterfaces genefilter {} | ||
| − | |||
edge weaver digest {} | edge weaver digest {} | ||
edge weaver tools {} | edge weaver tools {} | ||
| Line 279: | Line 241: | ||
edge goTools annotate {} | edge goTools annotate {} | ||
edge goTools GO {} | edge goTools GO {} | ||
| − | |||
edge applera Biobase {} | edge applera Biobase {} | ||
edge applera methods {} | edge applera methods {} | ||
| Line 289: | Line 250: | ||
edge applera prada {} | edge applera prada {} | ||
edge applera combinat {} | edge applera combinat {} | ||
| − | |||
edge annaffy methods {} | edge annaffy methods {} | ||
edge annaffy Biobase {} | edge annaffy Biobase {} | ||
edge annaffy GO {} | edge annaffy GO {} | ||
edge annaffy KEGG {} | edge annaffy KEGG {} | ||
| − | |||
edge spotSegmentation mclust {} | edge spotSegmentation mclust {} | ||
| − | |||
edge geneRecommender Biobase {} | edge geneRecommender Biobase {} | ||
| − | |||
edge codelink methods {} | edge codelink methods {} | ||
edge codelink limma {} | edge codelink limma {} | ||
edge codelink annotate {} | edge codelink annotate {} | ||
| − | |||
edge widgetTools methods {} | edge widgetTools methods {} | ||
edge widgetTools utils {} | edge widgetTools utils {} | ||
| − | |||
edge splots grid {} | edge splots grid {} | ||
edge RSNPper methods {} | edge RSNPper methods {} | ||
| Line 311: | Line 266: | ||
edge RSNPper tools {} | edge RSNPper tools {} | ||
edge RSNPper XML {} | edge RSNPper XML {} | ||
| − | |||
edge GeneMeta methods {} | edge GeneMeta methods {} | ||
edge GeneMeta Biobase {} | edge GeneMeta Biobase {} | ||
edge GeneMeta genefilter {} | edge GeneMeta genefilter {} | ||
edge GEOquery methods {} | edge GEOquery methods {} | ||
| − | |||
edge globaltest methods {} | edge globaltest methods {} | ||
edge globaltest graphics {} | edge globaltest graphics {} | ||
| Line 323: | Line 276: | ||
edge pathRender Rgraphviz {} | edge pathRender Rgraphviz {} | ||
edge pathRender cMAP {} | edge pathRender cMAP {} | ||
| − | |||
edge convert Biobase {} | edge convert Biobase {} | ||
edge convert limma {} | edge convert limma {} | ||
| Line 329: | Line 281: | ||
edge convert utils {} | edge convert utils {} | ||
edge convert methods {} | edge convert methods {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge stam GO {} | edge stam GO {} | ||
edge stam Biobase {} | edge stam Biobase {} | ||
| Line 337: | Line 287: | ||
edge stam annaffy {} | edge stam annaffy {} | ||
edge stam methods {} | edge stam methods {} | ||
| − | |||
edge BSgenome methods {} | edge BSgenome methods {} | ||
edge BSgenome Biostrings {} | edge BSgenome Biostrings {} | ||
edge pdmclass Biobase {} | edge pdmclass Biobase {} | ||
| − | |||
edge pdmclass fibroEset {} | edge pdmclass fibroEset {} | ||
edge pdmclass mda {} | edge pdmclass mda {} | ||
| − | |||
edge cellHTS prada {} | edge cellHTS prada {} | ||
edge cellHTS RColorBrewer {} | edge cellHTS RColorBrewer {} | ||
| Line 350: | Line 297: | ||
edge cellHTS genefilter {} | edge cellHTS genefilter {} | ||
edge metaArray MergeMaid {} | edge metaArray MergeMaid {} | ||
| − | |||
edge EBImage methods {} | edge EBImage methods {} | ||
edge arrayQCplot RGtk2 {} | edge arrayQCplot RGtk2 {} | ||
edge arrayQCplot cairoDevice {} | edge arrayQCplot cairoDevice {} | ||
edge arrayQCplot LPE {} | edge arrayQCplot LPE {} | ||
| − | |||
edge hopach cluster {} | edge hopach cluster {} | ||
edge hopach Biobase {} | edge hopach Biobase {} | ||
| Line 362: | Line 307: | ||
edge ssize xtable {} | edge ssize xtable {} | ||
edge apComplex graph {} | edge apComplex graph {} | ||
| − | |||
edge tilingArray methods {} | edge tilingArray methods {} | ||
edge tilingArray Biobase {} | edge tilingArray Biobase {} | ||
| Line 374: | Line 318: | ||
edge tilingArray pixmap {} | edge tilingArray pixmap {} | ||
edge RMAPPER methods {} | edge RMAPPER methods {} | ||
| − | |||
edge splicegear methods {} | edge splicegear methods {} | ||
edge splicegear utils {} | edge splicegear utils {} | ||
| Line 381: | Line 324: | ||
edge splicegear XML {} | edge splicegear XML {} | ||
edge splicegear annotate {} | edge splicegear annotate {} | ||
| − | |||
edge gff3Plotter methods {} | edge gff3Plotter methods {} | ||
| − | |||
edge mmgmos methods {} | edge mmgmos methods {} | ||
edge mmgmos Biobase {} | edge mmgmos Biobase {} | ||
edge mmgmos affy {} | edge mmgmos affy {} | ||
| − | |||
edge plgem Biobase {} | edge plgem Biobase {} | ||
edge plgem MASS {} | edge plgem MASS {} | ||
| − | |||
edge DEDS methods {} | edge DEDS methods {} | ||
| − | |||
edge pgUtils Rdbi {} | edge pgUtils Rdbi {} | ||
edge pgUtils RdbiPgSQL {} | edge pgUtils RdbiPgSQL {} | ||
edge pgUtils methods {} | edge pgUtils methods {} | ||
| − | |||
edge hypergraph methods {} | edge hypergraph methods {} | ||
edge hypergraph graph {} | edge hypergraph graph {} | ||
| − | |||
edge arrayMagic methods {} | edge arrayMagic methods {} | ||
edge arrayMagic utils {} | edge arrayMagic utils {} | ||
| Line 407: | Line 343: | ||
edge arrayMagic genefilter {} | edge arrayMagic genefilter {} | ||
edge nudge stats {} | edge nudge stats {} | ||
| − | |||
edge sscore affy {} | edge sscore affy {} | ||
edge sscore affxparser {} | edge sscore affxparser {} | ||
| Line 415: | Line 350: | ||
edge simulatorAPMS ScISI {} | edge simulatorAPMS ScISI {} | ||
edge simulatorAPMS ppiStats {} | edge simulatorAPMS ppiStats {} | ||
| − | |||
edge affy Biobase {} | edge affy Biobase {} | ||
edge affy methods {} | edge affy methods {} | ||
edge affy utils {} | edge affy utils {} | ||
edge affy affyio {} | edge affy affyio {} | ||
| − | |||
edge OCplus akima {} | edge OCplus akima {} | ||
edge OCplus multtest {} | edge OCplus multtest {} | ||
| Line 426: | Line 359: | ||
edge macat Biobase {} | edge macat Biobase {} | ||
edge macat annotate {} | edge macat annotate {} | ||
| − | |||
edge idiogram methods {} | edge idiogram methods {} | ||
edge idiogram Biobase {} | edge idiogram Biobase {} | ||
edge idiogram annotate {} | edge idiogram annotate {} | ||
| − | |||
edge pcot2 grDevices {} | edge pcot2 grDevices {} | ||
edge pcot2 Biobase {} | edge pcot2 Biobase {} | ||
edge pcot2 amap {} | edge pcot2 amap {} | ||
| − | |||
edge iSNetwork methods {} | edge iSNetwork methods {} | ||
edge iSNetwork graph {} | edge iSNetwork graph {} | ||
| Line 444: | Line 374: | ||
edge iSNetwork Biobase {} | edge iSNetwork Biobase {} | ||
edge iSNetwork annotate {} | edge iSNetwork annotate {} | ||
| − | |||
edge affyPLM affy {} | edge affyPLM affy {} | ||
edge affyPLM affydata {} | edge affyPLM affydata {} | ||
| Line 451: | Line 380: | ||
edge affyPLM gcrma {} | edge affyPLM gcrma {} | ||
edge spikeLI utils {} | edge spikeLI utils {} | ||
| − | |||
edge genefilter methods {} | edge genefilter methods {} | ||
edge genefilter Biobase {} | edge genefilter Biobase {} | ||
edge genefilter survival {} | edge genefilter survival {} | ||
| − | |||
edge altcdfenvs methods {} | edge altcdfenvs methods {} | ||
edge altcdfenvs Biobase {} | edge altcdfenvs Biobase {} | ||
| Line 461: | Line 388: | ||
edge altcdfenvs matchprobes {} | edge altcdfenvs matchprobes {} | ||
edge altcdfenvs makecdfenv {} | edge altcdfenvs makecdfenv {} | ||
| − | |||
edge OLIN methods {} | edge OLIN methods {} | ||
edge OLIN stats {} | edge OLIN stats {} | ||
| Line 472: | Line 398: | ||
edge beadarraySNP quantsmooth {} | edge beadarraySNP quantsmooth {} | ||
edge Heatplus NONE {} | edge Heatplus NONE {} | ||
| − | |||
edge GeneTS GeneCycle {} | edge GeneTS GeneCycle {} | ||
edge GeneTS GeneNet {} | edge GeneTS GeneNet {} | ||
| − | |||
edge safe methods {} | edge safe methods {} | ||
edge safe Biobase {} | edge safe Biobase {} | ||
| − | |||
edge Rgraphviz methods {} | edge Rgraphviz methods {} | ||
edge Rgraphviz graph {} | edge Rgraphviz graph {} | ||
edge Rgraphviz geneplotter {} | edge Rgraphviz geneplotter {} | ||
| − | |||
edge RdbiPgSQL Rdbi {} | edge RdbiPgSQL Rdbi {} | ||
| − | |||
edge twilight splines {} | edge twilight splines {} | ||
edge twilight stats {} | edge twilight stats {} | ||
| − | |||
edge GeneTraffic Biobase {} | edge GeneTraffic Biobase {} | ||
edge GeneTraffic affy {} | edge GeneTraffic affy {} | ||
| Line 495: | Line 415: | ||
edge GeneTraffic digest {} | edge GeneTraffic digest {} | ||
edge GeneTraffic methods {} | edge GeneTraffic methods {} | ||
| − | |||
edge simpleaffy affy {} | edge simpleaffy affy {} | ||
edge simpleaffy genefilter {} | edge simpleaffy genefilter {} | ||
| − | |||
edge maSigPro Biobase {} | edge maSigPro Biobase {} | ||
edge Icens survival {} | edge Icens survival {} | ||
edge Rredland methods {} | edge Rredland methods {} | ||
edge Rredland graph {} | edge Rredland graph {} | ||
| − | |||
edge graph methods {} | edge graph methods {} | ||
| − | |||
edge nnNorm nnet {} | edge nnNorm nnet {} | ||
edge nnNorm marray {} | edge nnNorm marray {} | ||
| − | |||
edge genArise locfit {} | edge genArise locfit {} | ||
edge genArise tkrplot {} | edge genArise tkrplot {} | ||
edge genArise xtable {} | edge genArise xtable {} | ||
edge genArise methods {} | edge genArise methods {} | ||
| − | |||
edge EBarrays Biobase {} | edge EBarrays Biobase {} | ||
edge EBarrays methods {} | edge EBarrays methods {} | ||
edge EBarrays utils {} | edge EBarrays utils {} | ||
edge EBarrays lattice {} | edge EBarrays lattice {} | ||
| − | |||
edge reb Biobase {} | edge reb Biobase {} | ||
edge reb idiogram {} | edge reb idiogram {} | ||
| − | |||
edge SAGx stats {} | edge SAGx stats {} | ||
edge SAGx multtest {} | edge SAGx multtest {} | ||
edge SAGx sma {} | edge SAGx sma {} | ||
edge SAGx methods {} | edge SAGx methods {} | ||
| − | |||
edge RMAGEML marray {} | edge RMAGEML marray {} | ||
edge RMAGEML limma {} | edge RMAGEML limma {} | ||
| Line 537: | Line 448: | ||
edge edd nnet {} | edge edd nnet {} | ||
edge edd xtable {} | edge edd xtable {} | ||
| − | |||
edge maDB Biobase {} | edge maDB Biobase {} | ||
edge maDB affy {} | edge maDB affy {} | ||
| Line 544: | Line 454: | ||
edge DynDoc methods {} | edge DynDoc methods {} | ||
edge DynDoc tools {} | edge DynDoc tools {} | ||
| − | |||
edge BeadExplorer methods {} | edge BeadExplorer methods {} | ||
edge BeadExplorer widgetTools {} | edge BeadExplorer widgetTools {} | ||
| Line 559: | Line 468: | ||
edge ABarray Biobase {} | edge ABarray Biobase {} | ||
edge ABarray multtest {} | edge ABarray multtest {} | ||
| − | |||
edge GGtools methods {} | edge GGtools methods {} | ||
edge GGtools Biobase {} | edge GGtools Biobase {} | ||
edge GGtools hgfocus {} | edge GGtools hgfocus {} | ||
edge GGtools geneplotter {} | edge GGtools geneplotter {} | ||
| − | |||
edge Biobase tools {} | edge Biobase tools {} | ||
edge Biobase methods {} | edge Biobase methods {} | ||
| Line 571: | Line 478: | ||
edge factDesign affy {} | edge factDesign affy {} | ||
edge factDesign stats {} | edge factDesign stats {} | ||
| − | |||
edge sagenhaft SparseM {} | edge sagenhaft SparseM {} | ||
| − | |||
edge ROC utils {} | edge ROC utils {} | ||
edge ROC methods {} | edge ROC methods {} | ||
edge bim stats {} | edge bim stats {} | ||
edge bim qtl {} | edge bim qtl {} | ||
| − | |||
edge gcrma Biobase {} | edge gcrma Biobase {} | ||
edge gcrma affy {} | edge gcrma affy {} | ||
edge gcrma matchprobes {} | edge gcrma matchprobes {} | ||
edge gcrma splines {} | edge gcrma splines {} | ||
| − | |||
edge adSplit methods {} | edge adSplit methods {} | ||
edge adSplit stats {} | edge adSplit stats {} | ||
| Line 592: | Line 495: | ||
edge adSplit GO {} | edge adSplit GO {} | ||
edge adSplit KEGG {} | edge adSplit KEGG {} | ||
| − | |||
edge Resourcerer AnnBuilder {} | edge Resourcerer AnnBuilder {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge MergeMaid survival {} | edge MergeMaid survival {} | ||
edge MergeMaid Biobase {} | edge MergeMaid Biobase {} | ||
edge MergeMaid MASS {} | edge MergeMaid MASS {} | ||
edge MergeMaid methods {} | edge MergeMaid methods {} | ||
| − | |||
edge plier affy {} | edge plier affy {} | ||
edge quantsmooth quantreg {} | edge quantsmooth quantreg {} | ||
edge quantsmooth lodplot {} | edge quantsmooth lodplot {} | ||
| − | |||
edge affycomp Biobase {} | edge affycomp Biobase {} | ||
| − | |||
edge stepNorm marray {} | edge stepNorm marray {} | ||
edge stepNorm MASS {} | edge stepNorm MASS {} | ||
edge stepNorm methods {} | edge stepNorm methods {} | ||
edge clusterStab Biobase {} | edge clusterStab Biobase {} | ||
| − | |||
edge clusterStab methods {} | edge clusterStab methods {} | ||
| − | |||
edge affyQCReport Biobase {} | edge affyQCReport Biobase {} | ||
edge affyQCReport affy {} | edge affyQCReport affy {} | ||
edge affyQCReport simpleaffy {} | edge affyQCReport simpleaffy {} | ||
| − | |||
edge affypdnn affy {} | edge affypdnn affy {} | ||
edge affypdnn affydata {} | edge affypdnn affydata {} | ||
edge affypdnn hgu95av2probe {} | edge affypdnn hgu95av2probe {} | ||
| − | |||
edge affydata affy {} | edge affydata affy {} | ||
edge pairseqsim methods {} | edge pairseqsim methods {} | ||
| Line 635: | Line 528: | ||
edge ScISI YEAST {} | edge ScISI YEAST {} | ||
edge ScISI xtable {} | edge ScISI xtable {} | ||
| − | |||
edge multtest methods {} | edge multtest methods {} | ||
edge multtest Biobase {} | edge multtest Biobase {} | ||
edge multtest survival {} | edge multtest survival {} | ||
edge ctc NONE {} | edge ctc NONE {} | ||
| − | |||
edge yeastExpData graph {} | edge yeastExpData graph {} | ||
edge golubEsets Biobase {} | edge golubEsets Biobase {} | ||
| − | |||
edge estrogen affy {} | edge estrogen affy {} | ||
edge MAQCsubset Biobase {} | edge MAQCsubset Biobase {} | ||
edge fibroEset Biobase {} | edge fibroEset Biobase {} | ||
edge HEEBOdata NONE {} | edge HEEBOdata NONE {} | ||
| − | |||
edge facsDorit prada {} | edge facsDorit prada {} | ||
edge Iyer517 Biobase {} | edge Iyer517 Biobase {} | ||
| − | |||
edge stjudem utils {} | edge stjudem utils {} | ||
| − | |||
edge ProData Biobase {} | edge ProData Biobase {} | ||
| − | |||
edge SpikeIn affy {} | edge SpikeIn affy {} | ||
edge ALL Biobase {} | edge ALL Biobase {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge AmpAffyExample affy {} | edge AmpAffyExample affy {} | ||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
edge kidpack Biobase {} | edge kidpack Biobase {} | ||
| − | |||
edge CLL affy {} | edge CLL affy {} | ||
edge CLL Biobase {} | edge CLL Biobase {} | ||
| − | |||
edge SpikeInSubset Biobase {} | edge SpikeInSubset Biobase {} | ||
edge SpikeInSubset affy {} | edge SpikeInSubset affy {} | ||
edge gaschYHS Biobase {} | edge gaschYHS Biobase {} | ||
| − | |||
edge ALLMLL affy {} | edge ALLMLL affy {} | ||
edge bronchialIL13 affy {} | edge bronchialIL13 affy {} | ||
| − | |||
edge beta7 marray {} | edge beta7 marray {} | ||
| − | |||
edge lungExpression Biobase {} | edge lungExpression Biobase {} | ||
edge HIVcDNAvantWout03 NONE {} | edge HIVcDNAvantWout03 NONE {} | ||
| Line 684: | Line 560: | ||
edge ppiData Rgraphviz {} | edge ppiData Rgraphviz {} | ||
edge ppiData graph {} | edge ppiData graph {} | ||
| − | |||
edge colonCA Biobase {} | edge colonCA Biobase {} | ||
| − | |||
edge SNAData graph {} | edge SNAData graph {} | ||
| − | |||
edge ecoliLeucine affy {} | edge ecoliLeucine affy {} | ||
| − | |||
edge davidTiling Biobase {} | edge davidTiling Biobase {} | ||
edge davidTiling tilingArray {} | edge davidTiling tilingArray {} | ||
edge davidTiling GO {} | edge davidTiling GO {} | ||
edge MEEBOdata NONE {} | edge MEEBOdata NONE {} | ||
| − | |||
edge GGdata Biobase {} | edge GGdata Biobase {} | ||
edge GGdata hgfocus {} | edge GGdata hgfocus {} | ||
| − | |||
edge rn230rnentrezgprobe matchprobes {} | edge rn230rnentrezgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge rn230brnrefseqprobe matchprobes {} | edge rn230brnrefseqprobe matchprobes {} | ||
edge dmgenome1dmense utils {} | edge dmgenome1dmense utils {} | ||
| − | |||
edge medicagoprobe matchprobes {} | edge medicagoprobe matchprobes {} | ||
edge dmgenome1dmugcdf utils {} | edge dmgenome1dmugcdf utils {} | ||
| Line 710: | Line 578: | ||
edge mm430ammensgcdf utils {} | edge mm430ammensgcdf utils {} | ||
edge mm430ammrefseqcdf utils {} | edge mm430ammrefseqcdf utils {} | ||
| − | |||
edge hsfocushsenstprobe matchprobes {} | edge hsfocushsenstprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge hs133bhsentrezgprobe matchprobes {} | edge hs133bhsentrezgprobe matchprobes {} | ||
edge drzebrafishdrugcdf utils {} | edge drzebrafishdrugcdf utils {} | ||
edge mm430ammentrezg utils {} | edge mm430ammentrezg utils {} | ||
| − | |||
edge hgu133bprobe matchprobes {} | edge hgu133bprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mmex10stv1mmentrezgprobe matchprobes {} | edge mmex10stv1mmentrezgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge rn34arnenseprobe matchprobes {} | edge rn34arnenseprobe matchprobes {} | ||
edge soybeancdf utils {} | edge soybeancdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs133xptensgprobe matchprobes {} | edge hs133xptensgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge rtu34probe matchprobes {} | edge rtu34probe matchprobes {} | ||
edge hsex10stv2hsensgcdf utils {} | edge hsex10stv2hsensgcdf utils {} | ||
| Line 735: | Line 594: | ||
edge mm74av2mmensgcdf utils {} | edge mm74av2mmensgcdf utils {} | ||
edge mm74bv2mmentrezgcdf utils {} | edge mm74bv2mmentrezgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge rn230rnenstprobe matchprobes {} | edge rn230rnenstprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs95av2hsrefseq utils {} | edge hs95av2hsrefseq utils {} | ||
edge hsex10stv2hsentrezg utils {} | edge hsex10stv2hsentrezg utils {} | ||
| − | |||
edge mm430bmmenstprobe matchprobes {} | edge mm430bmmenstprobe matchprobes {} | ||
edge hsex10stv2hsense utils {} | edge hsex10stv2hsense utils {} | ||
edge mm74av2mmentrezg utils {} | edge mm74av2mmentrezg utils {} | ||
| − | |||
edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 methods {} | edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 methods {} | ||
edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 Biostrings {} | edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 Biostrings {} | ||
edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 BSgenome {} | edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 BSgenome {} | ||
edge dmgenome1dmensg utils {} | edge dmgenome1dmensg utils {} | ||
| − | |||
edge mm430bmmensecdf utils {} | edge mm430bmmensecdf utils {} | ||
| − | |||
edge mm430mmensgcdf utils {} | edge mm430mmensgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge hu35ksubaprobe matchprobes {} | edge hu35ksubaprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge rn230brnensgprobe matchprobes {} | edge rn230brnensgprobe matchprobes {} | ||
edge hsex10stv2ptense utils {} | edge hsex10stv2ptense utils {} | ||
| − | |||
edge osriceostigrprobe matchprobes {} | edge osriceostigrprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hsex10stv2hsentrezgprobe matchprobes {} | edge hsex10stv2hsentrezgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge cfcanine2cfenstprobe matchprobes {} | edge cfcanine2cfenstprobe matchprobes {} | ||
edge mm430mmentrezg utils {} | edge mm430mmentrezg utils {} | ||
| − | |||
edge mm74av1mmrefseqprobe matchprobes {} | edge mm74av1mmrefseqprobe matchprobes {} | ||
edge rnex10stv1rnrefseq utils {} | edge rnex10stv1rnrefseq utils {} | ||
edge atgenomeattaircdf utils {} | edge atgenomeattaircdf utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge hs133xptensgcdf utils {} | edge hs133xptensgcdf utils {} | ||
edge mu19ksubccdf utils {} | edge mu19ksubccdf utils {} | ||
edge hgu95ecdf utils {} | edge hgu95ecdf utils {} | ||
edge atgenomeatrefseqcdf utils {} | edge atgenomeatrefseqcdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs133phsrefseqprobe matchprobes {} | edge hs133phsrefseqprobe matchprobes {} | ||
edge hsex10stv2hsensg utils {} | edge hsex10stv2hsensg utils {} | ||
edge hs133xptentrezg utils {} | edge hs133xptentrezg utils {} | ||
| − | |||
edge saureusprobe matchprobes {} | edge saureusprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133av2hsenseprobe matchprobes {} | edge hs133av2hsenseprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge rhesusprobe matchprobes {} | edge rhesusprobe matchprobes {} | ||
edge mm74av2mmense utils {} | edge mm74av2mmense utils {} | ||
edge mm11ksubammenstcdf utils {} | edge mm11ksubammenstcdf utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge mmex10stv1mmrefseq utils {} | edge mmex10stv1mmrefseq utils {} | ||
edge cfcanine2cfentrezgcdf utils {} | edge cfcanine2cfentrezgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge ggchickenggenstprobe matchprobes {} | edge ggchickenggenstprobe matchprobes {} | ||
edge cyp450cdf utils {} | edge cyp450cdf utils {} | ||
edge hsex10stv2ptensg utils {} | edge hsex10stv2ptensg utils {} | ||
| − | |||
edge hs133pptenseprobe matchprobes {} | edge hs133pptenseprobe matchprobes {} | ||
edge hs133xhsensgcdf utils {} | edge hs133xhsensgcdf utils {} | ||
edge poplarcdf utils {} | edge poplarcdf utils {} | ||
| − | |||
edge dmdrosophila2dmrefseqprobe matchprobes {} | edge dmdrosophila2dmrefseqprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs95av2hsrefseqprobe matchprobes {} | edge hs95av2hsrefseqprobe matchprobes {} | ||
edge hs133xhsentrezg utils {} | edge hs133xhsentrezg utils {} | ||
| − | |||
edge mm11ksubammugcdf utils {} | edge mm11ksubammugcdf utils {} | ||
edge mm74av2mmensg utils {} | edge mm74av2mmensg utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge hsex10stv2hsenstprobe matchprobes {} | edge hsex10stv2hsenstprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mgu74cprobe matchprobes {} | edge mgu74cprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge hsfocushsenseprobe matchprobes {} | edge hsfocushsenseprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133bhsentrezgcdf utils {} | edge hs133bhsentrezgcdf utils {} | ||
edge mmex10stv1mmense utils {} | edge mmex10stv1mmense utils {} | ||
| − | |||
edge mm11ksubammenstprobe matchprobes {} | edge mm11ksubammenstprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133av2ptensgprobe matchprobes {} | edge hs133av2ptensgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge drzebrafishdrense utils {} | edge drzebrafishdrense utils {} | ||
edge mm430mmrefseqcdf utils {} | edge mm430mmrefseqcdf utils {} | ||
edge cfcanine2cfenstcdf utils {} | edge cfcanine2cfenstcdf utils {} | ||
edge hs133aptenstcdf utils {} | edge hs133aptenstcdf utils {} | ||
| − | |||
edge rn230rnenseprobe matchprobes {} | edge rn230rnenseprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mm430bmmenseprobe matchprobes {} | edge mm430bmmenseprobe matchprobes {} | ||
edge mm74av1mmug utils {} | edge mm74av1mmug utils {} | ||
| Line 837: | Line 660: | ||
edge rae230bcdf utils {} | edge rae230bcdf utils {} | ||
edge hu6800cdf utils {} | edge hu6800cdf utils {} | ||
| − | |||
edge ath1attairprobe matchprobes {} | edge ath1attairprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge canineprobe matchprobes {} | edge canineprobe matchprobes {} | ||
edge mmex10stv1mmensg utils {} | edge mmex10stv1mmensg utils {} | ||
edge hs133ahsrefseqcdf utils {} | edge hs133ahsrefseqcdf utils {} | ||
| − | |||
edge cfcanine2cfenseprobe matchprobes {} | edge cfcanine2cfenseprobe matchprobes {} | ||
edge rnex10stv1rnugcdf utils {} | edge rnex10stv1rnugcdf utils {} | ||
| Line 852: | Line 672: | ||
edge ggchickenggenstcdf utils {} | edge ggchickenggenstcdf utils {} | ||
edge mm74cv2mmenstcdf utils {} | edge mm74cv2mmenstcdf utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge hsfocusptensgprobe matchprobes {} | edge hsfocusptensgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 methods {} | edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 methods {} | ||
edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 Biostrings {} | edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 Biostrings {} | ||
edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 BSgenome {} | edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 BSgenome {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge hs133bhsenstprobe matchprobes {} | edge hs133bhsenstprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mm11ksubammugprobe matchprobes {} | edge mm11ksubammugprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge ggchickenggenseprobe matchprobes {} | edge ggchickenggenseprobe matchprobes {} | ||
edge mm430mmense utils {} | edge mm430mmense utils {} | ||
| − | |||
edge mm74cv2mmenstprobe matchprobes {} | edge mm74cv2mmenstprobe matchprobes {} | ||
edge dmdrosophila2dmenst utils {} | edge dmdrosophila2dmenst utils {} | ||
edge tomatocdf utils {} | edge tomatocdf utils {} | ||
edge mm74av1mmenst utils {} | edge mm74av1mmenst utils {} | ||
| − | |||
edge mgu74bv2probe matchprobes {} | edge mgu74bv2probe matchprobes {} | ||
edge rn230arnenstcdf utils {} | edge rn230arnenstcdf utils {} | ||
edge hgu133acdf utils {} | edge hgu133acdf utils {} | ||
| − | |||
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 methods {} | edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 methods {} | ||
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 Biostrings {} | edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 Biostrings {} | ||
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 BSgenome {} | edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 BSgenome {} | ||
| − | |||
edge hs95av2hsenstprobe matchprobes {} | edge hs95av2hsenstprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge atgenomeattigrprobe matchprobes {} | edge atgenomeattigrprobe matchprobes {} | ||
edge cfcanine2cfense utils {} | edge cfcanine2cfense utils {} | ||
| Line 890: | Line 696: | ||
edge mm74cv2mmentrezgcdf utils {} | edge mm74cv2mmentrezgcdf utils {} | ||
edge hs133ahsense utils {} | edge hs133ahsense utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge dmdrosophila2dmenstprobe matchprobes {} | edge dmdrosophila2dmenstprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hsex10stv2hsenseprobe matchprobes {} | edge hsex10stv2hsenseprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hsfocusptentrezgprobe matchprobes {} | edge hsfocusptentrezgprobe matchprobes {} | ||
edge rnex10stv1rnentrezg utils {} | edge rnex10stv1rnentrezg utils {} | ||
| − | |||
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 methods {} | edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 methods {} | ||
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 Biostrings {} | edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 Biostrings {} | ||
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 BSgenome {} | edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 BSgenome {} | ||
edge moe430bcdf utils {} | edge moe430bcdf utils {} | ||
| − | |||
edge rnex10stv1rnensgprobe matchprobes {} | edge rnex10stv1rnensgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mm430mmentrezgprobe matchprobes {} | edge mm430mmentrezgprobe matchprobes {} | ||
edge ye6100subacdf utils {} | edge ye6100subacdf utils {} | ||
edge mm430mmensg utils {} | edge mm430mmensg utils {} | ||
edge hs133xhsug utils {} | edge hs133xhsug utils {} | ||
| − | |||
edge mm11ksubammenseprobe matchprobes {} | edge mm11ksubammenseprobe matchprobes {} | ||
edge chickencdf utils {} | edge chickencdf utils {} | ||
| Line 916: | Line 714: | ||
edge hs133aptense utils {} | edge hs133aptense utils {} | ||
edge rn230rnenstcdf utils {} | edge rn230rnenstcdf utils {} | ||
| − | |||
edge rn230arnenstprobe matchprobes {} | edge rn230arnenstprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge cfcanine2cfrefseq utils {} | edge cfcanine2cfrefseq utils {} | ||
| − | |||
edge mm430bmmentrezg utils {} | edge mm430bmmentrezg utils {} | ||
| − | |||
edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 methods {} | edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 methods {} | ||
edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 Biostrings {} | edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 Biostrings {} | ||
edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 BSgenome {} | edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 BSgenome {} | ||
| − | |||
edge cfcanine2cfugprobe matchprobes {} | edge cfcanine2cfugprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 methods {} | edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 methods {} | ||
edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 Biostrings {} | edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 Biostrings {} | ||
| Line 935: | Line 727: | ||
edge zebrafishcdf utils {} | edge zebrafishcdf utils {} | ||
edge rat2302cdf utils {} | edge rat2302cdf utils {} | ||
| − | |||
edge moe430bprobe matchprobes {} | edge moe430bprobe matchprobes {} | ||
edge rn230rnugcdf utils {} | edge rn230rnugcdf utils {} | ||
edge cfcanine2cfensg utils {} | edge cfcanine2cfensg utils {} | ||
| − | |||
edge hgu95bprobe matchprobes {} | edge hgu95bprobe matchprobes {} | ||
edge yeast2cdf utils {} | edge yeast2cdf utils {} | ||
| − | |||
edge hgu133plus2probe matchprobes {} | edge hgu133plus2probe matchprobes {} | ||
edge hs133ahsensg utils {} | edge hs133ahsensg utils {} | ||
edge mm74av1mmrefseqcdf utils {} | edge mm74av1mmrefseqcdf utils {} | ||
| − | |||
edge mmex10stv1mmenstprobe matchprobes {} | edge mmex10stv1mmenstprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge hsfocusptenstcdf utils {} | edge hsfocusptenstcdf utils {} | ||
| − | |||
edge mm74bv2mmensecdf utils {} | edge mm74bv2mmensecdf utils {} | ||
edge rn230brnug utils {} | edge rn230brnug utils {} | ||
edge hs133xhsrefseqcdf utils {} | edge hs133xhsrefseqcdf utils {} | ||
edge hs133aptensg utils {} | edge hs133aptensg utils {} | ||
| − | |||
edge hgu133a2probe matchprobes {} | edge hgu133a2probe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge citrusprobe matchprobes {} | edge citrusprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133ahsugprobe matchprobes {} | edge hs133ahsugprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hsex10stv2ptensgprobe matchprobes {} | edge hsex10stv2ptensgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge ggchickenggugprobe matchprobes {} | edge ggchickenggugprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mm74cv2mmugprobe matchprobes {} | edge mm74cv2mmugprobe matchprobes {} | ||
edge dmgenome1dmenst utils {} | edge dmgenome1dmenst utils {} | ||
| − | |||
edge rn34arnentrezgprobe matchprobes {} | edge rn34arnentrezgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge mm74av2mmenstprobe matchprobes {} | edge mm74av2mmenstprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 methods {} | edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 methods {} | ||
edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 Biostrings {} | edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 Biostrings {} | ||
edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 BSgenome {} | edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 BSgenome {} | ||
edge mmex10stv1mmensecdf utils {} | edge mmex10stv1mmensecdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs133bhsenseprobe matchprobes {} | edge hs133bhsenseprobe matchprobes {} | ||
edge hsfocushsenstcdf utils {} | edge hsfocushsenstcdf utils {} | ||
| − | |||
edge mm74cv2mmentrezgprobe matchprobes {} | edge mm74cv2mmentrezgprobe matchprobes {} | ||
edge mm11ksubbmmenstcdf utils {} | edge mm11ksubbmmenstcdf utils {} | ||
| − | |||
edge mm74cv2mmenseprobe matchprobes {} | edge mm74cv2mmenseprobe matchprobes {} | ||
edge hs133xhsense utils {} | edge hs133xhsense utils {} | ||
| − | |||
edge dmdrosophila2dmug utils {} | edge dmdrosophila2dmug utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge mm74bv2mmensgprobe matchprobes {} | edge mm74bv2mmensgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge rgu34cprobe matchprobes {} | edge rgu34cprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge rn230arnugprobe matchprobes {} | edge rn230arnugprobe matchprobes {} | ||
edge hs133xptense utils {} | edge hs133xptense utils {} | ||
edge hsex10stv2hsenst utils {} | edge hsex10stv2hsenst utils {} | ||
| − | |||
edge hs95av2hsenseprobe matchprobes {} | edge hs95av2hsenseprobe matchprobes {} | ||
edge mgu74bv2cdf utils {} | edge mgu74bv2cdf utils {} | ||
edge rn34arnrefseqcdf utils {} | edge rn34arnrefseqcdf utils {} | ||
edge hsex10stv2ptenst utils {} | edge hsex10stv2ptenst utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge dmdrosophila2dmenseprobe matchprobes {} | edge dmdrosophila2dmenseprobe matchprobes {} | ||
edge hthgu133acdf utils {} | edge hthgu133acdf utils {} | ||
| − | |||
edge agprobe matchprobes {} | edge agprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hsfocushsentrezgprobe matchprobes {} | edge hsfocushsentrezgprobe matchprobes {} | ||
edge hs133xhsensg utils {} | edge hs133xhsensg utils {} | ||
edge drzebrafishdrensgcdf utils {} | edge drzebrafishdrensgcdf utils {} | ||
edge dmgenome1dmensgcdf utils {} | edge dmgenome1dmensgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge hu35ksubdprobe matchprobes {} | edge hu35ksubdprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge hs133bptensgprobe matchprobes {} | edge hs133bptensgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge rn230rnugprobe matchprobes {} | edge rn230rnugprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge maizeprobe matchprobes {} | edge maizeprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge rn230arnenseprobe matchprobes {} | edge rn230arnenseprobe matchprobes {} | ||
edge drzebrafishdrentrezg utils {} | edge drzebrafishdrentrezg utils {} | ||
edge hs133xptensg utils {} | edge hs133xptensg utils {} | ||
edge hs133pptenstcdf utils {} | edge hs133pptenstcdf utils {} | ||
| − | |||
edge mm74av2mmenst utils {} | edge mm74av2mmenst utils {} | ||
| − | |||
edge vvgrapevvtigrprobe matchprobes {} | edge vvgrapevvtigrprobe matchprobes {} | ||
edge hsex10stv2hsugcdf utils {} | edge hsex10stv2hsugcdf utils {} | ||
| Line 1,040: | Line 793: | ||
edge mm430ammugcdf utils {} | edge mm430ammugcdf utils {} | ||
edge ggchickenggrefseq utils {} | edge ggchickenggrefseq utils {} | ||
| − | |||
edge hs95av2ptensgprobe matchprobes {} | edge hs95av2ptensgprobe matchprobes {} | ||
edge hs133av2hsrefseqcdf utils {} | edge hs133av2hsrefseqcdf utils {} | ||
| − | |||
edge mmex10stv1mmenseprobe matchprobes {} | edge mmex10stv1mmenseprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mm430ammensgprobe matchprobes {} | edge mm430ammensgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133ahsrefseqprobe matchprobes {} | edge hs133ahsrefseqprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133bhsense utils {} | edge hs133bhsense utils {} | ||
edge hs133phsenstcdf utils {} | edge hs133phsenstcdf utils {} | ||
edge hs133bptentrezgcdf utils {} | edge hs133bptentrezgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge hgu133aprobe matchprobes {} | edge hgu133aprobe matchprobes {} | ||
edge hs133bhsenstcdf utils {} | edge hs133bhsenstcdf utils {} | ||
edge dmdrosophila2dmrefseq utils {} | edge dmdrosophila2dmrefseq utils {} | ||
edge hs133bptense utils {} | edge hs133bptense utils {} | ||
| − | |||
edge mm74av2mmenseprobe matchprobes {} | edge mm74av2mmenseprobe matchprobes {} | ||
edge mm11ksubammense utils {} | edge mm11ksubammense utils {} | ||
| Line 1,064: | Line 810: | ||
edge mmex10stv1mmenst utils {} | edge mmex10stv1mmenst utils {} | ||
edge dmdrosophila2dmenstcdf utils {} | edge dmdrosophila2dmenstcdf utils {} | ||
| − | |||
edge hsfocushsugprobe matchprobes {} | edge hsfocushsugprobe matchprobes {} | ||
edge atgenomeattigr utils {} | edge atgenomeattigr utils {} | ||
edge hgu133atagcdf utils {} | edge hgu133atagcdf utils {} | ||
| − | |||
edge mm11ksubbmmugprobe matchprobes {} | edge mm11ksubbmmugprobe matchprobes {} | ||
edge drzebrafishdrenst utils {} | edge drzebrafishdrenst utils {} | ||
edge hgu133a2cdf utils {} | edge hgu133a2cdf utils {} | ||
| − | |||
edge drzebrafishdrenstprobe matchprobes {} | edge drzebrafishdrenstprobe matchprobes {} | ||
edge hs133phsentrezgcdf utils {} | edge hs133phsentrezgcdf utils {} | ||
| Line 1,079: | Line 822: | ||
edge hs95av2hsentrezgcdf utils {} | edge hs95av2hsentrezgcdf utils {} | ||
edge ye6100subccdf utils {} | edge ye6100subccdf utils {} | ||
| − | |||
edge rn34arnrefseqprobe matchprobes {} | edge rn34arnrefseqprobe matchprobes {} | ||
edge hsfocushsrefseqcdf utils {} | edge hsfocushsrefseqcdf utils {} | ||
| Line 1,087: | Line 829: | ||
edge hs133bptensg utils {} | edge hs133bptensg utils {} | ||
edge mm11ksubammensg utils {} | edge mm11ksubammensg utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge rn230rnrefseqcdf utils {} | edge rn230rnrefseqcdf utils {} | ||
edge mu6500subacdf utils {} | edge mu6500subacdf utils {} | ||
edge hs133pptense utils {} | edge hs133pptense utils {} | ||
| − | |||
edge tomatoprobe matchprobes {} | edge tomatoprobe matchprobes {} | ||
edge rgu34acdf utils {} | edge rgu34acdf utils {} | ||
edge mm430bmmrefseqcdf utils {} | edge mm430bmmrefseqcdf utils {} | ||
| − | |||
edge osriceosrefseqprobe matchprobes {} | edge osriceosrefseqprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge dmdrosophila2dmugcdf utils {} | edge dmdrosophila2dmugcdf utils {} | ||
| − | |||
edge bovineprobe matchprobes {} | edge bovineprobe matchprobes {} | ||
edge hgu95av2cdf utils {} | edge hgu95av2cdf utils {} | ||
| − | |||
edge mm74bv2mmensgcdf utils {} | edge mm74bv2mmensgcdf utils {} | ||
edge mm11ksubbmmugcdf utils {} | edge mm11ksubbmmugcdf utils {} | ||
| − | |||
edge mgu74bcdf utils {} | edge mgu74bcdf utils {} | ||
edge mm74av1mmugcdf utils {} | edge mm74av1mmugcdf utils {} | ||
edge cfcanine2cfrefseqcdf utils {} | edge cfcanine2cfrefseqcdf utils {} | ||
| − | |||
edge hu6800subbcdf utils {} | edge hu6800subbcdf utils {} | ||
edge hs133phsensg utils {} | edge hs133phsensg utils {} | ||
edge rn34arnenstcdf utils {} | edge rn34arnenstcdf utils {} | ||
edge mm74bv2mmentrezg utils {} | edge mm74bv2mmentrezg utils {} | ||
| − | |||
edge mm74av1mmentrezgprobe matchprobes {} | edge mm74av1mmentrezgprobe matchprobes {} | ||
edge mm430mmenst utils {} | edge mm430mmenst utils {} | ||
edge hsfocushsugcdf utils {} | edge hsfocushsugcdf utils {} | ||
| − | |||
edge test3probe matchprobes {} | edge test3probe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge soybeanprobe matchprobes {} | edge soybeanprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mmex10stv1mmensgcdf utils {} | edge mmex10stv1mmensgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs133pptensg utils {} | edge hs133pptensg utils {} | ||
edge mm74av1mmenstcdf utils {} | edge mm74av1mmenstcdf utils {} | ||
| − | |||
edge dmgenome1dmenstprobe matchprobes {} | edge dmgenome1dmenstprobe matchprobes {} | ||
edge hgu95bcdf utils {} | edge hgu95bcdf utils {} | ||
| − | |||
edge mgu74bprobe matchprobes {} | edge mgu74bprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mmex10stv1mmentrezg utils {} | edge mmex10stv1mmentrezg utils {} | ||
edge hs133xhsugcdf utils {} | edge hs133xhsugcdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs133phsugprobe matchprobes {} | edge hs133phsugprobe matchprobes {} | ||
edge ggchickenggrefseqcdf utils {} | edge ggchickenggrefseqcdf utils {} | ||
edge cfcanine2cfenst utils {} | edge cfcanine2cfenst utils {} | ||
| − | |||
edge mm430ammrefseqprobe matchprobes {} | edge mm430ammrefseqprobe matchprobes {} | ||
edge mm74av2mmug utils {} | edge mm74av2mmug utils {} | ||
| − | |||
edge mm430mmensgprobe matchprobes {} | edge mm430mmensgprobe matchprobes {} | ||
edge hs133phsugcdf utils {} | edge hs133phsugcdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs133bhsugprobe matchprobes {} | edge hs133bhsugprobe matchprobes {} | ||
edge hs133ahsenst utils {} | edge hs133ahsenst utils {} | ||
edge rnex10stv1rnentrezgcdf utils {} | edge rnex10stv1rnentrezgcdf utils {} | ||
edge hs133ahsug utils {} | edge hs133ahsug utils {} | ||
| − | |||
edge dmdrosophila2dmugprobe matchprobes {} | edge dmdrosophila2dmugprobe matchprobes {} | ||
edge mm11ksubbmmrefseq utils {} | edge mm11ksubbmmrefseq utils {} | ||
edge hs133aptenst utils {} | edge hs133aptenst utils {} | ||
| − | |||
edge hs133av2hsentrezgcdf utils {} | edge hs133av2hsentrezgcdf utils {} | ||
edge test1cdf utils {} | edge test1cdf utils {} | ||
| − | |||
edge rn230arnugcdf utils {} | edge rn230arnugcdf utils {} | ||
edge maizecdf utils {} | edge maizecdf utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
edge plasmodiumanophelesprobe matchprobes {} | edge plasmodiumanophelesprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge drzebrafishdrenseprobe matchprobes {} | edge drzebrafishdrenseprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133ahsensgprobe matchprobes {} | edge hs133ahsensgprobe matchprobes {} | ||
edge hsex10stv2hsrefseqcdf utils {} | edge hsex10stv2hsrefseqcdf utils {} | ||
edge rn34arnrefseq utils {} | edge rn34arnrefseq utils {} | ||
edge mm74av1mmrefseq utils {} | edge mm74av1mmrefseq utils {} | ||
| − | |||
edge gp53cdf utils {} | edge gp53cdf utils {} | ||
edge mm11ksubammrefseqcdf utils {} | edge mm11ksubammrefseqcdf utils {} | ||
| − | |||
edge ecoliasv2probe matchprobes {} | edge ecoliasv2probe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge rn230brnugprobe matchprobes {} | edge rn230brnugprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge hs133aptenstprobe matchprobes {} | edge hs133aptenstprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge atgenomeattairprobe matchprobes {} | edge atgenomeattairprobe matchprobes {} | ||
edge hs133av2ptenstcdf utils {} | edge hs133av2ptenstcdf utils {} | ||
| − | |||
edge mgu74cv2probe matchprobes {} | edge mgu74cv2probe matchprobes {} | ||
edge hs95av2hsense utils {} | edge hs95av2hsense utils {} | ||
edge ggchickenggug utils {} | edge ggchickenggug utils {} | ||
| − | |||
edge hgu95eprobe matchprobes {} | edge hgu95eprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133pptentrezgprobe matchprobes {} | edge hs133pptentrezgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge canine2probe matchprobes {} | edge canine2probe matchprobes {} | ||
edge mm11ksubbmmense utils {} | edge mm11ksubbmmense utils {} | ||
edge hsfocushsense utils {} | edge hsfocushsense utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
edge mm11ksubbmmenstprobe matchprobes {} | edge mm11ksubbmmenstprobe matchprobes {} | ||
edge rn230arnense utils {} | edge rn230arnense utils {} | ||
edge hs95av2ptense utils {} | edge hs95av2ptense utils {} | ||
edge ath1attigr utils {} | edge ath1attigr utils {} | ||
| − | |||
edge yeast2probe matchprobes {} | edge yeast2probe matchprobes {} | ||
edge mm430bmmrefseq utils {} | edge mm430bmmrefseq utils {} | ||
| Line 1,211: | Line 909: | ||
edge hs133av2hsenstcdf utils {} | edge hs133av2hsenstcdf utils {} | ||
edge agcdf utils {} | edge agcdf utils {} | ||
| − | |||
edge rn34arnugprobe matchprobes {} | edge rn34arnugprobe matchprobes {} | ||
edge hs133xhsenst utils {} | edge hs133xhsenst utils {} | ||
| − | |||
edge hs95av2hsensg utils {} | edge hs95av2hsensg utils {} | ||
edge hu35ksubdcdf utils {} | edge hu35ksubdcdf utils {} | ||
| − | |||
edge mm74av1mmugprobe matchprobes {} | edge mm74av1mmugprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge dmgenome1dmenseprobe matchprobes {} | edge dmgenome1dmenseprobe matchprobes {} | ||
edge mm11ksubbmmensg utils {} | edge mm11ksubbmmensg utils {} | ||
| − | |||
edge hs133xptenst utils {} | edge hs133xptenst utils {} | ||
edge hsfocushsensg utils {} | edge hsfocushsensg utils {} | ||
| − | |||
edge cfcanine2cfrefseqprobe matchprobes {} | edge cfcanine2cfrefseqprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133phsenstprobe matchprobes {} | edge hs133phsenstprobe matchprobes {} | ||
edge hs133bhsrefseqcdf utils {} | edge hs133bhsrefseqcdf utils {} | ||
edge rn230arnensg utils {} | edge rn230arnensg utils {} | ||
edge hs95av2ptensg utils {} | edge hs95av2ptensg utils {} | ||
| − | |||
edge mm430mmug utils {} | edge mm430mmug utils {} | ||
| − | |||
edge mm74cv2mmrefseqcdf utils {} | edge mm74cv2mmrefseqcdf utils {} | ||
edge ath1121501cdf utils {} | edge ath1121501cdf utils {} | ||
edge hsfocusptensg utils {} | edge hsfocusptensg utils {} | ||
edge ricecdf utils {} | edge ricecdf utils {} | ||
| − | |||
edge mm11ksubammensecdf utils {} | edge mm11ksubammensecdf utils {} | ||
| − | |||
edge wheatprobe matchprobes {} | edge wheatprobe matchprobes {} | ||
edge hs133av2hsugcdf utils {} | edge hs133av2hsugcdf utils {} | ||
edge drosophila2cdf utils {} | edge drosophila2cdf utils {} | ||
| − | |||
edge moe430aprobe matchprobes {} | edge moe430aprobe matchprobes {} | ||
edge hs95av2ptenstcdf utils {} | edge hs95av2ptenstcdf utils {} | ||
edge hs95av2hsrefseqcdf utils {} | edge hs95av2hsrefseqcdf utils {} | ||
| − | |||
edge hgu95aprobe matchprobes {} | edge hgu95aprobe matchprobes {} | ||
edge atgenomeattigrcdf utils {} | edge atgenomeattigrcdf utils {} | ||
| − | |||
edge barley1probe matchprobes {} | edge barley1probe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge mm74av1mmensgprobe matchprobes {} | edge mm74av1mmensgprobe matchprobes {} | ||
edge mu6500subccdf utils {} | edge mu6500subccdf utils {} | ||
| − | |||
edge dmdrosophila2dmrefseqcdf utils {} | edge dmdrosophila2dmrefseqcdf utils {} | ||
| − | |||
edge dmgenome1dmrefseqprobe matchprobes {} | edge dmgenome1dmrefseqprobe matchprobes {} | ||
edge rgu34ccdf utils {} | edge rgu34ccdf utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge hs133xhsensgprobe matchprobes {} | edge hs133xhsensgprobe matchprobes {} | ||
edge hsfocushsrefseq utils {} | edge hsfocushsrefseq utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge hcg110probe matchprobes {} | edge hcg110probe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs95av2hsenstcdf utils {} | edge hs95av2hsenstcdf utils {} | ||
edge mm430mmentrezgcdf utils {} | edge mm430mmentrezgcdf utils {} | ||
edge hs133bhsrefseq utils {} | edge hs133bhsrefseq utils {} | ||
| − | |||
edge hs133aptenseprobe matchprobes {} | edge hs133aptenseprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge rn230rnrefseqprobe matchprobes {} | edge rn230rnrefseqprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133xptenstprobe matchprobes {} | edge hs133xptenstprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 methods {} | edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 methods {} | ||
edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 Biostrings {} | edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 Biostrings {} | ||
edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 BSgenome {} | edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 BSgenome {} | ||
| − | |||
edge mu11ksubbprobe matchprobes {} | edge mu11ksubbprobe matchprobes {} | ||
edge rn230arnrefseqcdf utils {} | edge rn230arnrefseqcdf utils {} | ||
| Line 1,291: | Line 960: | ||
edge hu6800subdcdf utils {} | edge hu6800subdcdf utils {} | ||
edge mm74bv2mmug utils {} | edge mm74bv2mmug utils {} | ||
| − | |||
edge ecoliasv2cdf utils {} | edge ecoliasv2cdf utils {} | ||
edge hs133bhsenst utils {} | edge hs133bhsenst utils {} | ||
| − | |||
edge mm74av2mmentrezgprobe matchprobes {} | edge mm74av2mmentrezgprobe matchprobes {} | ||
edge hivprtplus2cdf utils {} | edge hivprtplus2cdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs133phsentrezgprobe matchprobes {} | edge hs133phsentrezgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mm11ksubbmmenseprobe matchprobes {} | edge mm11ksubbmmenseprobe matchprobes {} | ||
edge cfcanine2cfensecdf utils {} | edge cfcanine2cfensecdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs133xptentrezgprobe matchprobes {} | edge hs133xptentrezgprobe matchprobes {} | ||
edge mm74av1mmentrezgcdf utils {} | edge mm74av1mmentrezgcdf utils {} | ||
| Line 1,308: | Line 972: | ||
edge hs133bptenst utils {} | edge hs133bptenst utils {} | ||
edge mu19ksubbcdf utils {} | edge mu19ksubbcdf utils {} | ||
| − | |||
edge rn230brnenstprobe matchprobes {} | edge rn230brnenstprobe matchprobes {} | ||
edge mm11ksubammenst utils {} | edge mm11ksubammenst utils {} | ||
| Line 1,314: | Line 977: | ||
edge hgu95dcdf utils {} | edge hgu95dcdf utils {} | ||
edge mmex10stv1mmrefseqcdf utils {} | edge mmex10stv1mmrefseqcdf utils {} | ||
| − | |||
edge mm74cv2mmrefseqprobe matchprobes {} | edge mm74cv2mmrefseqprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge rgu34bprobe matchprobes {} | edge rgu34bprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133av2hsugprobe matchprobes {} | edge hs133av2hsugprobe matchprobes {} | ||
edge drzebrafishdrug utils {} | edge drzebrafishdrug utils {} | ||
| Line 1,325: | Line 985: | ||
edge mm430mmugcdf utils {} | edge mm430mmugcdf utils {} | ||
edge mm430ammenstcdf utils {} | edge mm430ammenstcdf utils {} | ||
| − | |||
edge rn34arnensgprobe matchprobes {} | edge rn34arnensgprobe matchprobes {} | ||
edge mgu74av2cdf utils {} | edge mgu74av2cdf utils {} | ||
| − | |||
edge ath1121501probe matchprobes {} | edge ath1121501probe matchprobes {} | ||
edge rn230rnug utils {} | edge rn230rnug utils {} | ||
edge osriceostigr utils {} | edge osriceostigr utils {} | ||
edge citruscdf utils {} | edge citruscdf utils {} | ||
| − | |||
edge mm74av2mmrefseqcdf utils {} | edge mm74av2mmrefseqcdf utils {} | ||
edge hs133av2hsense utils {} | edge hs133av2hsense utils {} | ||
edge hs133ahsensecdf utils {} | edge hs133ahsensecdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs133phsenseprobe matchprobes {} | edge hs133phsenseprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hsex10stv2hsenstcdf utils {} | edge hsex10stv2hsenstcdf utils {} | ||
edge ggchickenggensecdf utils {} | edge ggchickenggensecdf utils {} | ||
| Line 1,348: | Line 1,003: | ||
edge hs133av2ptense utils {} | edge hs133av2ptense utils {} | ||
edge hs133phsenst utils {} | edge hs133phsenst utils {} | ||
| − | |||
edge mm74av2mmrefseqprobe matchprobes {} | edge mm74av2mmrefseqprobe matchprobes {} | ||
edge mm430ammentrezgcdf utils {} | edge mm430ammentrezgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge hu35ksubcprobe matchprobes {} | edge hu35ksubcprobe matchprobes {} | ||
edge rn230brnense utils {} | edge rn230brnense utils {} | ||
| Line 1,358: | Line 1,011: | ||
edge mm430bmmugcdf utils {} | edge mm430bmmugcdf utils {} | ||
edge mm430mmenstcdf utils {} | edge mm430mmenstcdf utils {} | ||
| − | |||
edge mm11ksubammrefseqprobe matchprobes {} | edge mm11ksubammrefseqprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge chickenprobe matchprobes {} | edge chickenprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133av2hsensg utils {} | edge hs133av2hsensg utils {} | ||
edge rn230arnentrezgcdf utils {} | edge rn230arnentrezgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge atgenomeatrefseqprobe matchprobes {} | edge atgenomeatrefseqprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge poplarprobe matchprobes {} | edge poplarprobe matchprobes {} | ||
edge rn230arnensecdf utils {} | edge rn230arnensecdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs133av2hsensgprobe matchprobes {} | edge hs133av2hsensgprobe matchprobes {} | ||
edge plasmodiumanophelescdf utils {} | edge plasmodiumanophelescdf utils {} | ||
edge hs133xptenstcdf utils {} | edge hs133xptenstcdf utils {} | ||
edge hs133av2ptensg utils {} | edge hs133av2ptensg utils {} | ||
| − | |||
edge bsubtilisprobe matchprobes {} | edge bsubtilisprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge rn230arnrefseqprobe matchprobes {} | edge rn230arnrefseqprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge hs95av2hsugprobe matchprobes {} | edge hs95av2hsugprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133av2ptenstprobe matchprobes {} | edge hs133av2ptenstprobe matchprobes {} | ||
edge mm74cv2mmense utils {} | edge mm74cv2mmense utils {} | ||
| − | |||
edge hs133pptensgprobe matchprobes {} | edge hs133pptensgprobe matchprobes {} | ||
edge rn230brnensg utils {} | edge rn230brnensg utils {} | ||
| − | |||
edge hs133xptenseprobe matchprobes {} | edge hs133xptenseprobe matchprobes {} | ||
edge rae230acdf utils {} | edge rae230acdf utils {} | ||
| − | |||
edge mu11ksubbcdf utils {} | edge mu11ksubbcdf utils {} | ||
edge hs133xhsentrezgcdf utils {} | edge hs133xhsentrezgcdf utils {} | ||
edge mouse430a2cdf utils {} | edge mouse430a2cdf utils {} | ||
| − | |||
edge hgfocusprobe matchprobes {} | edge hgfocusprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133xhsenstcdf utils {} | edge hs133xhsenstcdf utils {} | ||
edge drosgenome1cdf utils {} | edge drosgenome1cdf utils {} | ||
edge hsex10stv2hsentrezgcdf utils {} | edge hsex10stv2hsentrezgcdf utils {} | ||
edge rn230rnensecdf utils {} | edge rn230rnensecdf utils {} | ||
| − | |||
edge rn230brnrefseq utils {} | edge rn230brnrefseq utils {} | ||
| − | |||
edge cfcanine2cfentrezgprobe matchprobes {} | edge cfcanine2cfentrezgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133av2ptentrezgcdf utils {} | edge hs133av2ptentrezgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs133xhsentrezgprobe matchprobes {} | edge hs133xhsentrezgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge rn230brnenseprobe matchprobes {} | edge rn230brnenseprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hsfocushsensgprobe matchprobes {} | edge hsfocushsensgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge hs133av2hsrefseq utils {} | edge hs133av2hsrefseq utils {} | ||
edge mm74cv2mmensg utils {} | edge mm74cv2mmensg utils {} | ||
| − | |||
edge mm430ammugprobe matchprobes {} | edge mm430ammugprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
edge hsfocusptenstprobe matchprobes {} | edge hsfocusptenstprobe matchprobes {} | ||
edge mm11ksubammensgcdf utils {} | edge mm11ksubammensgcdf utils {} | ||
edge hsfocusptensecdf utils {} | edge hsfocusptensecdf utils {} | ||
edge hsex10stv2hsrefseq utils {} | edge hsex10stv2hsrefseq utils {} | ||
| − | |||
edge rn230rnensgprobe matchprobes {} | edge rn230rnensgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133xhsrefseq utils {} | edge hs133xhsrefseq utils {} | ||
| − | |||
edge mm430bmmensgprobe matchprobes {} | edge mm430bmmensgprobe matchprobes {} | ||
edge mm11ksubammentrezg utils {} | edge mm11ksubammentrezg utils {} | ||
| − | |||
edge hsex10stv2hsugprobe matchprobes {} | edge hsex10stv2hsugprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge ath1atrefseqprobe matchprobes {} | edge ath1atrefseqprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mm74av2mmugprobe matchprobes {} | edge mm74av2mmugprobe matchprobes {} | ||
edge mm74av2mmugcdf utils {} | edge mm74av2mmugcdf utils {} | ||
| Line 1,445: | Line 1,063: | ||
edge mm74cv2mmug utils {} | edge mm74cv2mmug utils {} | ||
edge osriceostigrcdf utils {} | edge osriceostigrcdf utils {} | ||
| − | |||
edge mm11ksubammentrezgprobe matchprobes {} | edge mm11ksubammentrezgprobe matchprobes {} | ||
edge mmex10stv1mmug utils {} | edge mmex10stv1mmug utils {} | ||
| − | |||
edge hs95av2ptentrezgprobe matchprobes {} | edge hs95av2ptentrezgprobe matchprobes {} | ||
edge drzebrafishdrrefseqcdf utils {} | edge drzebrafishdrrefseqcdf utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
edge cfcanine2cfensgprobe matchprobes {} | edge cfcanine2cfensgprobe matchprobes {} | ||
edge hs95av2hsenst utils {} | edge hs95av2hsenst utils {} | ||
edge hsfocushsensecdf utils {} | edge hsfocushsensecdf utils {} | ||
edge ath1attaircdf utils {} | edge ath1attaircdf utils {} | ||
| − | |||
edge mm430mmugprobe matchprobes {} | edge mm430mmugprobe matchprobes {} | ||
edge mm11ksubbmmenst utils {} | edge mm11ksubbmmenst utils {} | ||
| Line 1,466: | Line 1,078: | ||
edge rn230arnenst utils {} | edge rn230arnenst utils {} | ||
edge hs95av2ptenst utils {} | edge hs95av2ptenst utils {} | ||
| − | |||
edge hsfocusptenst utils {} | edge hsfocusptenst utils {} | ||
| − | |||
edge mm430ammug utils {} | edge mm430ammug utils {} | ||
| − | |||
edge mgu74aprobe matchprobes {} | edge mgu74aprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge rnex10stv1rnenstprobe matchprobes {} | edge rnex10stv1rnenstprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge ggchickenggensgprobe matchprobes {} | edge ggchickenggensgprobe matchprobes {} | ||
edge hs133bhsug utils {} | edge hs133bhsug utils {} | ||
edge mm11ksubammentrezgcdf utils {} | edge mm11ksubammentrezgcdf utils {} | ||
edge cfcanine2cfensgcdf utils {} | edge cfcanine2cfensgcdf utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge hs133av2ptenseprobe matchprobes {} | edge hs133av2ptenseprobe matchprobes {} | ||
edge hs133aptensgcdf utils {} | edge hs133aptensgcdf utils {} | ||
| Line 1,487: | Line 1,091: | ||
edge rn230brnugcdf utils {} | edge rn230brnugcdf utils {} | ||
edge hs133aptentrezg utils {} | edge hs133aptentrezg utils {} | ||
| − | |||
edge mm11ksubammrefseq utils {} | edge mm11ksubammrefseq utils {} | ||
| − | |||
edge rae230bprobe matchprobes {} | edge rae230bprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mouse430a2probe matchprobes {} | edge mouse430a2probe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133xhsugprobe matchprobes {} | edge hs133xhsugprobe matchprobes {} | ||
edge mm74cv2mmrefseq utils {} | edge mm74cv2mmrefseq utils {} | ||
| − | |||
edge hgu133atagprobe matchprobes {} | edge hgu133atagprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133pptensecdf utils {} | edge hs133pptensecdf utils {} | ||
| − | |||
edge hsex10stv2hsensgprobe matchprobes {} | edge hsex10stv2hsensgprobe matchprobes {} | ||
edge rn34arnense utils {} | edge rn34arnense utils {} | ||
| Line 1,510: | Line 1,107: | ||
edge hs133bptensecdf utils {} | edge hs133bptensecdf utils {} | ||
edge rnex10stv1rnug utils {} | edge rnex10stv1rnug utils {} | ||
| − | |||
edge drzebrafishdrrefseqprobe matchprobes {} | edge drzebrafishdrrefseqprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mm11ksubammensgprobe matchprobes {} | edge mm11ksubammensgprobe matchprobes {} | ||
edge hs133ahsentrezg utils {} | edge hs133ahsentrezg utils {} | ||
| − | |||
edge hs133phsrefseq utils {} | edge hs133phsrefseq utils {} | ||
| − | |||
edge riceprobe matchprobes {} | edge riceprobe matchprobes {} | ||
edge mm74cv2mmentrezg utils {} | edge mm74cv2mmentrezg utils {} | ||
| − | |||
edge hsex10stv2ptenstprobe matchprobes {} | edge hsex10stv2ptenstprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hsfocusptenseprobe matchprobes {} | edge hsfocusptenseprobe matchprobes {} | ||
edge mm430bmmenstcdf utils {} | edge mm430bmmenstcdf utils {} | ||
edge barley1cdf utils {} | edge barley1cdf utils {} | ||
edge hs133phsensecdf utils {} | edge hs133phsensecdf utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge hgu95dprobe matchprobes {} | edge hgu95dprobe matchprobes {} | ||
edge celeganscdf utils {} | edge celeganscdf utils {} | ||
edge hs133bhsensecdf utils {} | edge hs133bhsensecdf utils {} | ||
| − | |||
edge rn34arnensg utils {} | edge rn34arnensg utils {} | ||
edge mm430ammense utils {} | edge mm430ammense utils {} | ||
edge mm430ammrefseq utils {} | edge mm430ammrefseq utils {} | ||
edge rn230arnensgcdf utils {} | edge rn230arnensgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs95av2hsentrezgprobe matchprobes {} | edge hs95av2hsentrezgprobe matchprobes {} | ||
edge dmdrosophila2dmensecdf utils {} | edge dmdrosophila2dmensecdf utils {} | ||
edge rn230arnentrezg utils {} | edge rn230arnentrezg utils {} | ||
| − | |||
edge mm74bv2mmenstprobe matchprobes {} | edge mm74bv2mmenstprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge ecoli2probe matchprobes {} | edge ecoli2probe matchprobes {} | ||
edge cfcanine2cfugcdf utils {} | edge cfcanine2cfugcdf utils {} | ||
edge hs133ahsentrezgcdf utils {} | edge hs133ahsentrezgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs133bhsensgprobe matchprobes {} | edge hs133bhsensgprobe matchprobes {} | ||
edge rn230brnensecdf utils {} | edge rn230brnensecdf utils {} | ||
edge rn230rnensgcdf utils {} | edge rn230rnensgcdf utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge rnex10stv1rnenseprobe matchprobes {} | edge rnex10stv1rnenseprobe matchprobes {} | ||
edge mm430ammensg utils {} | edge mm430ammensg utils {} | ||
| − | |||
edge mm74cv2mmensgprobe matchprobes {} | edge mm74cv2mmensgprobe matchprobes {} | ||
edge mm11ksubbmmrefseqcdf utils {} | edge mm11ksubbmmrefseqcdf utils {} | ||
| − | |||
edge PFAM RSQLite {} | edge PFAM RSQLite {} | ||
edge rn230rnentrezg utils {} | edge rn230rnentrezg utils {} | ||
| − | |||
edge hs133bptenstprobe matchprobes {} | edge hs133bptenstprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133av2hsenst utils {} | edge hs133av2hsenst utils {} | ||
| − | |||
edge drosophila2probe matchprobes {} | edge drosophila2probe matchprobes {} | ||
edge u133x3pcdf utils {} | edge u133x3pcdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs95av2hsensgprobe matchprobes {} | edge hs95av2hsensgprobe matchprobes {} | ||
edge hs133av2ptenst utils {} | edge hs133av2ptenst utils {} | ||
| Line 1,575: | Line 1,151: | ||
edge rtu34cdf utils {} | edge rtu34cdf utils {} | ||
edge hsfocusptensgcdf utils {} | edge hsfocusptensgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge dmdrosophila2dmensgprobe matchprobes {} | edge dmdrosophila2dmensgprobe matchprobes {} | ||
edge rn230brnenst utils {} | edge rn230brnenst utils {} | ||
| − | |||
edge rnex10stv1rnrefseqprobe matchprobes {} | edge rnex10stv1rnrefseqprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs95av2ptenstprobe matchprobes {} | edge hs95av2ptenstprobe matchprobes {} | ||
edge hsfocusptentrezg utils {} | edge hsfocusptentrezg utils {} | ||
| − | |||
edge rnex10stv1rnugprobe matchprobes {} | edge rnex10stv1rnugprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mm430ammenstprobe matchprobes {} | edge mm430ammenstprobe matchprobes {} | ||
edge hgu133bcdf utils {} | edge hgu133bcdf utils {} | ||
| Line 1,592: | Line 1,163: | ||
edge hs133phsrefseqcdf utils {} | edge hs133phsrefseqcdf utils {} | ||
edge ggchickenggense utils {} | edge ggchickenggense utils {} | ||
| − | |||
edge xenopuslaevisprobe matchprobes {} | edge xenopuslaevisprobe matchprobes {} | ||
edge hcg110cdf utils {} | edge hcg110cdf utils {} | ||
edge hs133ahsrefseq utils {} | edge hs133ahsrefseq utils {} | ||
| − | |||
edge mm11ksubbmmentrezgprobe matchprobes {} | edge mm11ksubbmmentrezgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hsex10stv2ptenseprobe matchprobes {} | edge hsex10stv2ptenseprobe matchprobes {} | ||
edge mm74av1mmensecdf utils {} | edge mm74av1mmensecdf utils {} | ||
| − | |||
edge rn230arnensgprobe matchprobes {} | edge rn230arnensgprobe matchprobes {} | ||
edge rn230rnrefseq utils {} | edge rn230rnrefseq utils {} | ||
edge hs133ahsugcdf utils {} | edge hs133ahsugcdf utils {} | ||
edge hsfocushsentrezgcdf utils {} | edge hsfocushsentrezgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge mu11ksubaprobe matchprobes {} | edge mu11ksubaprobe matchprobes {} | ||
edge drzebrafishdrenstcdf utils {} | edge drzebrafishdrenstcdf utils {} | ||
edge dmgenome1dmenstcdf utils {} | edge dmgenome1dmenstcdf utils {} | ||
| − | |||
edge mm430bmmugprobe matchprobes {} | edge mm430bmmugprobe matchprobes {} | ||
edge hsfocushsensgcdf utils {} | edge hsfocushsensgcdf utils {} | ||
| Line 1,619: | Line 1,184: | ||
edge canine2cdf utils {} | edge canine2cdf utils {} | ||
edge hs133xptentrezgcdf utils {} | edge hs133xptentrezgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs133bhsrefseqprobe matchprobes {} | edge hs133bhsrefseqprobe matchprobes {} | ||
edge mm74cv2mmenst utils {} | edge mm74cv2mmenst utils {} | ||
| Line 1,627: | Line 1,191: | ||
edge hsex10stv2ptentrezgcdf utils {} | edge hsex10stv2ptentrezgcdf utils {} | ||
edge rnex10stv1rnense utils {} | edge rnex10stv1rnense utils {} | ||
| − | |||
edge vvgrapevvtigrcdf utils {} | edge vvgrapevvtigrcdf utils {} | ||
| − | |||
edge mmex10stv1mmensgprobe matchprobes {} | edge mmex10stv1mmensgprobe matchprobes {} | ||
edge ggchickenggensg utils {} | edge ggchickenggensg utils {} | ||
| − | |||
edge rnex10stv1rnentrezgprobe matchprobes {} | edge rnex10stv1rnentrezgprobe matchprobes {} | ||
edge hsfocushsug utils {} | edge hsfocushsug utils {} | ||
edge rn230rnense utils {} | edge rn230rnense utils {} | ||
| − | |||
edge mm74bv2mmenseprobe matchprobes {} | edge mm74bv2mmenseprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge rgu34aprobe matchprobes {} | edge rgu34aprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge vvgrapevvtigr utils {} | edge vvgrapevvtigr utils {} | ||
| − | |||
edge mm74av2mmensgprobe matchprobes {} | edge mm74av2mmensgprobe matchprobes {} | ||
edge rhesuscdf utils {} | edge rhesuscdf utils {} | ||
| − | |||
edge zebrafishprobe matchprobes {} | edge zebrafishprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hsfocushsrefseqprobe matchprobes {} | edge hsfocushsrefseqprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mgu74acdf utils {} | edge mgu74acdf utils {} | ||
edge hu6800subacdf utils {} | edge hu6800subacdf utils {} | ||
| Line 1,655: | Line 1,209: | ||
edge hs133pptensgcdf utils {} | edge hs133pptensgcdf utils {} | ||
edge hs133av2ptensecdf utils {} | edge hs133av2ptensecdf utils {} | ||
| − | |||
edge hu35ksubbprobe matchprobes {} | edge hu35ksubbprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge rnu34probe matchprobes {} | edge rnu34probe matchprobes {} | ||
edge xenopuslaeviscdf utils {} | edge xenopuslaeviscdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs133bptenseprobe matchprobes {} | edge hs133bptenseprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge rn230rnensg utils {} | edge rn230rnensg utils {} | ||
edge rn34arnug utils {} | edge rn34arnug utils {} | ||
| Line 1,672: | Line 1,222: | ||
edge hgu95acdf utils {} | edge hgu95acdf utils {} | ||
edge ath1atrefseqcdf utils {} | edge ath1atrefseqcdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs133av2ptentrezgprobe matchprobes {} | edge hs133av2ptentrezgprobe matchprobes {} | ||
edge hs133bptentrezg utils {} | edge hs133bptentrezg utils {} | ||
| − | |||
edge hs133xhsrefseqprobe matchprobes {} | edge hs133xhsrefseqprobe matchprobes {} | ||
edge hs133phsensgcdf utils {} | edge hs133phsensgcdf utils {} | ||
edge hs133av2hsensecdf utils {} | edge hs133av2hsensecdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs95av2ptenseprobe matchprobes {} | edge hs95av2ptenseprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge rn230arnentrezgprobe matchprobes {} | edge rn230arnentrezgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mm430ammentrezgprobe matchprobes {} | edge mm430ammentrezgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mm430ammenseprobe matchprobes {} | edge mm430ammenseprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133aptentrezgprobe matchprobes {} | edge hs133aptentrezgprobe matchprobes {} | ||
edge hs133bhsensgcdf utils {} | edge hs133bhsensgcdf utils {} | ||
edge hs133phsentrezg utils {} | edge hs133phsentrezg utils {} | ||
edge mm74bv2mmense utils {} | edge mm74bv2mmense utils {} | ||
| − | |||
edge rat2302probe matchprobes {} | edge rat2302probe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge mouse4302probe matchprobes {} | edge mouse4302probe matchprobes {} | ||
edge hs133bhsentrezg utils {} | edge hs133bhsentrezg utils {} | ||
| − | |||
edge mm430mmenstprobe matchprobes {} | edge mm430mmenstprobe matchprobes {} | ||
edge atgenomeattair utils {} | edge atgenomeattair utils {} | ||
edge mm430bmmensg utils {} | edge mm430bmmensg utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge drzebrafishdrugprobe matchprobes {} | edge drzebrafishdrugprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge ecoli2cdf utils {} | edge ecoli2cdf utils {} | ||
| − | |||
edge dmgenome1dmugprobe matchprobes {} | edge dmgenome1dmugprobe matchprobes {} | ||
edge dmdrosophila2dmensgcdf utils {} | edge dmdrosophila2dmensgcdf utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge bsubtiliscdf utils {} | edge bsubtiliscdf utils {} | ||
edge mm74bv2mmenstcdf utils {} | edge mm74bv2mmenstcdf utils {} | ||
edge rn230arnrefseq utils {} | edge rn230arnrefseq utils {} | ||
| − | |||
edge hs133av2hsrefseqprobe matchprobes {} | edge hs133av2hsrefseqprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge atgenomeatrefseq utils {} | edge atgenomeatrefseq utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge mm430bmmrefseqprobe matchprobes {} | edge mm430bmmrefseqprobe matchprobes {} | ||
edge hs95av2ptensecdf utils {} | edge hs95av2ptensecdf utils {} | ||
edge ygs98cdf utils {} | edge ygs98cdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs133ahsenstprobe matchprobes {} | edge hs133ahsenstprobe matchprobes {} | ||
edge mm74bv2mmensg utils {} | edge mm74bv2mmensg utils {} | ||
| Line 1,731: | Line 1,258: | ||
edge hgu133plus2cdf utils {} | edge hgu133plus2cdf utils {} | ||
edge mmex10stv1mmenstcdf utils {} | edge mmex10stv1mmenstcdf utils {} | ||
| − | |||
edge mmex10stv1mmrefseqprobe matchprobes {} | edge mmex10stv1mmrefseqprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge ygs98probe matchprobes {} | edge ygs98probe matchprobes {} | ||
edge rn230brnentrezg utils {} | edge rn230brnentrezg utils {} | ||
| − | |||
edge hsex10stv2hsrefseqprobe matchprobes {} | edge hsex10stv2hsrefseqprobe matchprobes {} | ||
edge rn34arnenst utils {} | edge rn34arnenst utils {} | ||
| − | |||
edge hs95av2hsensecdf utils {} | edge hs95av2hsensecdf utils {} | ||
| − | |||
edge mm430mmrefseqprobe matchprobes {} | edge mm430mmrefseqprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mm74bv2mmentrezgprobe matchprobes {} | edge mm74bv2mmentrezgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge drzebrafishdrensgprobe matchprobes {} | edge drzebrafishdrensgprobe matchprobes {} | ||
edge cfcanine2cfug utils {} | edge cfcanine2cfug utils {} | ||
edge rn34arnensgcdf utils {} | edge rn34arnensgcdf utils {} | ||
edge hu35ksubccdf utils {} | edge hu35ksubccdf utils {} | ||
| − | |||
edge mm430bmmug utils {} | edge mm430bmmug utils {} | ||
edge rn34arnentrezg utils {} | edge rn34arnentrezg utils {} | ||
edge mm74av1mmensgcdf utils {} | edge mm74av1mmensgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs133av2hsentrezgprobe matchprobes {} | edge hs133av2hsentrezgprobe matchprobes {} | ||
edge mm430ammenst utils {} | edge mm430ammenst utils {} | ||
| Line 1,762: | Line 1,279: | ||
edge ggchickenggugcdf utils {} | edge ggchickenggugcdf utils {} | ||
edge mm74av1mmentrezg utils {} | edge mm74av1mmentrezg utils {} | ||
| − | |||
edge drzebrafishdrrefseq utils {} | edge drzebrafishdrrefseq utils {} | ||
| − | |||
edge ecoliprobe matchprobes {} | edge ecoliprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge ye6100subdcdf utils {} | edge ye6100subdcdf utils {} | ||
edge hs95av2hsug utils {} | edge hs95av2hsug utils {} | ||
| − | |||
edge porcineprobe matchprobes {} | edge porcineprobe matchprobes {} | ||
edge mm430ammensecdf utils {} | edge mm430ammensecdf utils {} | ||
edge hs133aptentrezgcdf utils {} | edge hs133aptentrezgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge mm74bv2mmrefseq utils {} | edge mm74bv2mmrefseq utils {} | ||
| − | |||
edge hs133ahsentrezgprobe matchprobes {} | edge hs133ahsentrezgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge mm430mmenseprobe matchprobes {} | edge mm430mmenseprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge ath1attigrprobe matchprobes {} | edge ath1attigrprobe matchprobes {} | ||
edge rn230rnentrezgcdf utils {} | edge rn230rnentrezgcdf utils {} | ||
| Line 1,787: | Line 1,295: | ||
edge mm74av2mmensecdf utils {} | edge mm74av2mmensecdf utils {} | ||
edge mm74av2mmentrezgcdf utils {} | edge mm74av2mmentrezgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge rgu34bcdf utils {} | edge rgu34bcdf utils {} | ||
| − | |||
edge rae230aprobe matchprobes {} | edge rae230aprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge sugarcaneprobe matchprobes {} | edge sugarcaneprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mm74bv2mmugprobe matchprobes {} | edge mm74bv2mmugprobe matchprobes {} | ||
edge saureuscdf utils {} | edge saureuscdf utils {} | ||
| − | |||
edge mgu74av2probe matchprobes {} | edge mgu74av2probe matchprobes {} | ||
edge htratfocuscdf utils {} | edge htratfocuscdf utils {} | ||
| − | |||
edge mm74av1mmenstprobe matchprobes {} | edge mm74av1mmenstprobe matchprobes {} | ||
edge mm430mmensecdf utils {} | edge mm430mmensecdf utils {} | ||
| − | |||
edge dmgenome1dmensgprobe matchprobes {} | edge dmgenome1dmensgprobe matchprobes {} | ||
edge drzebrafishdrentrezgcdf utils {} | edge drzebrafishdrentrezgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge mgu74ccdf utils {} | edge mgu74ccdf utils {} | ||
edge mm74cv2mmugcdf utils {} | edge mm74cv2mmugcdf utils {} | ||
edge hu6800subccdf utils {} | edge hu6800subccdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs133ahsenseprobe matchprobes {} | edge hs133ahsenseprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133xhsenstprobe matchprobes {} | edge hs133xhsenstprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mmex10stv1mmugprobe matchprobes {} | edge mmex10stv1mmugprobe matchprobes {} | ||
edge rnex10stv1rnrefseqcdf utils {} | edge rnex10stv1rnrefseqcdf utils {} | ||
edge mouse4302cdf utils {} | edge mouse4302cdf utils {} | ||
edge hs133av2ptensgcdf utils {} | edge hs133av2ptensgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge paeg1aprobe matchprobes {} | edge paeg1aprobe matchprobes {} | ||
edge hs133xptensecdf utils {} | edge hs133xptensecdf utils {} | ||
| Line 1,825: | Line 1,321: | ||
edge hgu95ccdf utils {} | edge hgu95ccdf utils {} | ||
edge mm430bmmentrezgcdf utils {} | edge mm430bmmentrezgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge hsfocusptentrezgcdf utils {} | edge hsfocusptentrezgcdf utils {} | ||
edge ath1attair utils {} | edge ath1attair utils {} | ||
edge ggchickenggenst utils {} | edge ggchickenggenst utils {} | ||
edge wheatcdf utils {} | edge wheatcdf utils {} | ||
| − | |||
edge celegansprobe matchprobes {} | edge celegansprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hgu95cprobe matchprobes {} | edge hgu95cprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge vitisviniferaprobe matchprobes {} | edge vitisviniferaprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hgu95av2probe matchprobes {} | edge hgu95av2probe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge drosgenome1probe matchprobes {} | edge drosgenome1probe matchprobes {} | ||
edge hs133av2hsensgcdf utils {} | edge hs133av2hsensgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge rn230brnentrezgprobe matchprobes {} | edge rn230brnentrezgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mm430bmmentrezgprobe matchprobes {} | edge mm430bmmentrezgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133bptentrezgprobe matchprobes {} | edge hs133bptentrezgprobe matchprobes {} | ||
edge rn230brnentrezgcdf utils {} | edge rn230brnentrezgcdf utils {} | ||
edge hs133xhsensecdf utils {} | edge hs133xhsensecdf utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge hs133av2hsentrezg utils {} | edge hs133av2hsentrezg utils {} | ||
edge osriceosrefseqcdf utils {} | edge osriceosrefseqcdf utils {} | ||
edge hgfocuscdf utils {} | edge hgfocuscdf utils {} | ||
edge test2cdf utils {} | edge test2cdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs133aptensgprobe matchprobes {} | edge hs133aptensgprobe matchprobes {} | ||
edge mmex10stv1mmugcdf utils {} | edge mmex10stv1mmugcdf utils {} | ||
| − | |||
edge rn34arnenstprobe matchprobes {} | edge rn34arnenstprobe matchprobes {} | ||
edge rnex10stv1rnenst utils {} | edge rnex10stv1rnenst utils {} | ||
edge dmdrosophila2dmense utils {} | edge dmdrosophila2dmense utils {} | ||
edge mm74av1mmense utils {} | edge mm74av1mmense utils {} | ||
| − | |||
edge rn230arnug utils {} | edge rn230arnug utils {} | ||
edge rn230rnenst utils {} | edge rn230rnenst utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
edge mm11ksubbmmensgprobe matchprobes {} | edge mm11ksubbmmensgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge drzebrafishdrentrezgprobe matchprobes {} | edge drzebrafishdrentrezgprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge rn34arnentrezgcdf utils {} | edge rn34arnentrezgcdf utils {} | ||
edge hs95av2ptensgcdf utils {} | edge hs95av2ptensgcdf utils {} | ||
| − | |||
edge hsex10stv2ptentrezgprobe matchprobes {} | edge hsex10stv2ptentrezgprobe matchprobes {} | ||
edge hs133av2hsug utils {} | edge hs133av2hsug utils {} | ||
edge mm74bv2mmrefseqcdf utils {} | edge mm74bv2mmrefseqcdf utils {} | ||
edge hs95av2ptentrezg utils {} | edge hs95av2ptentrezg utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge dmgenome1dmug utils {} | edge dmgenome1dmug utils {} | ||
edge mgu74cv2cdf utils {} | edge mgu74cv2cdf utils {} | ||
| Line 1,888: | Line 1,361: | ||
edge dmdrosophila2dmensg utils {} | edge dmdrosophila2dmensg utils {} | ||
edge mm74av1mmensg utils {} | edge mm74av1mmensg utils {} | ||
| − | |||
edge mm74av1mmenseprobe matchprobes {} | edge mm74av1mmenseprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133bhsugcdf utils {} | edge hs133bhsugcdf utils {} | ||
edge mm430bmmenst utils {} | edge mm430bmmenst utils {} | ||
| − | |||
edge hs133av2hsenstprobe matchprobes {} | edge hs133av2hsenstprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133phsensgprobe matchprobes {} | edge hs133phsensgprobe matchprobes {} | ||
edge hs95av2hsensgcdf utils {} | edge hs95av2hsensgcdf utils {} | ||
edge mu11ksubacdf utils {} | edge mu11ksubacdf utils {} | ||
| − | |||
edge hs133xhsenseprobe matchprobes {} | edge hs133xhsenseprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge ggchickenggrefseqprobe matchprobes {} | edge ggchickenggrefseqprobe matchprobes {} | ||
edge porcinecdf utils {} | edge porcinecdf utils {} | ||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
edge u133x3pprobe matchprobes {} | edge u133x3pprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mm11ksubbmmrefseqprobe matchprobes {} | edge mm11ksubbmmrefseqprobe matchprobes {} | ||
edge hs95av2hsentrezg utils {} | edge hs95av2hsentrezg utils {} | ||
| − | |||
edge hu6800probe matchprobes {} | edge hu6800probe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge hs133pptenstprobe matchprobes {} | edge hs133pptenstprobe matchprobes {} | ||
| − | |||
edge mm74bv2mmrefseqprobe matchprobes {} | edge mm74bv2mmrefseqprobe matchprobes {} | ||
edge ath1attigrcdf utils {} | edge ath1attigrcdf utils {} | ||
| Line 1,922: | Line 1,382: | ||
edge hsex10stv2ptensgcdf utils {} | edge hsex10stv2ptensgcdf utils {} | ||
edge LogitBoost NONE {} | edge LogitBoost NONE {} | ||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
edge XML methods {} | edge XML methods {} | ||
| − | |||
| − | |||
edge RMySQL methods {} | edge RMySQL methods {} | ||
edge RMySQL DBI {} | edge RMySQL DBI {} | ||
| − | |||
edge SSOAP methods {} | edge SSOAP methods {} | ||
edge SSOAP XML {} | edge SSOAP XML {} | ||
Latest revision as of 13:22, 6 October 2007
This graph shows the package dependencies for the BioConductor software for the statistical analysis of microarrary data in R. The dependency list was generated from the BioConductor-1.9 software repository HTML pages.
Unfortunately it is too large to be used on this webserver (due to memory limitations). A slightly shorter list (75%) would work. See also Test graph 2 ...
{{#wgraph: png | thumb=40 | nodetype * { font helvR08 } layoutalgorithm=forcedir edge gpls NONE {} edge sigPathway R {} edge TypeInfo methods {} edge Biostrings R {} edge Biostrings methods {} edge Mfuzz R {} edge Mfuzz Biobase {} edge Mfuzz e1071 {} edge LMGene R {} edge LMGene Biobase {} edge LMGene multtest {} edge LMGene survival {} edge ecolitk R {} edge ecolitk affy {} edge ecolitk ecoliLeucine {} edge ecolitk ecolicdf {} edge ecolitk Biobase {} edge maCorrPlot NONE {} edge OLINgui R {} edge OLINgui OLIN {} edge xcms R {} edge xcms methods {} edge rflowcyt R {} edge rflowcyt survival {} edge rflowcyt xtable {} edge rflowcyt stats {} edge rflowcyt KernSmooth {} edge rflowcyt MASS {} edge rflowcyt grid {} edge rflowcyt methods {} edge rflowcyt hexbin {} edge rflowcyt rfcdmin {} edge rflowcyt fields {} edge rflowcyt lattice {} edge rflowcyt locfit {} edge daMA MASS {} edge made4 ade4 {} edge made4 scatterplot3d {} edge biomaRt methods {} edge biomaRt XML {} edge biomaRt RCurl {} edge gaggle rJava {} edge gaggle graph {} edge affylmGUI limma {} edge affylmGUI tcltk {} edge affylmGUI affy {} edge affylmGUI Biobase {} edge SAGElyzer AnnBuilder {} edge SAGElyzer tkWidgets {} edge SAGElyzer genefilter {} edge SAGElyzer annotate {} edge GeneR NONE {} edge GeneSpring Biobase {} edge GeneSpring methods {} edge geneplotter annotate {} edge geneplotter Biobase {} edge geneplotter methods {} edge BioMVCClass methods {} edge BioMVCClass MVCClass {} edge BioMVCClass Biobase {} edge BioMVCClass graph {} edge BioMVCClass Rgraphviz {} edge sizepower stats {} edge PROcess Icens {} edge snapCGH limma {} edge snapCGH tilingArray {} edge snapCGH DNAcopy {} edge snapCGH aCGH {} edge snapCGH GLAD {} edge snapCGH cluster {} edge snapCGH methods {} edge bioDist methods {} edge bioDist Biobase {} edge marray limma {} edge marray methods {} edge tkWidgets methods {} edge tkWidgets widgetTools {} edge tkWidgets DynDoc {} edge rama NONE {} edge Ruuid methods {} edge arrayQuality marray {} edge arrayQuality limma {} edge arrayQuality convert {} edge arrayQuality hexbin {} edge arrayQuality gridBase {} edge arrayQuality RColorBrewer {} edge GraphAT MCMCpack {} edge GraphAT graph {} edge beadarray limma {} edge beadarray Biobase {} edge beadarray affy {} edge beadarray methods {} edge ppiStats apComplex {} edge ppiStats GO {} edge ppiStats GOstats {} edge ppiStats YEAST {} edge ppiStats graph {} edge ppiStats Rgraphviz {} edge ppiStats Category {} edge pcaMethods MASS {} edge pcaMethods ellipse {} edge pcaMethods pls {} edge pcaMethods methods {} edge GlobalAncova methods {} edge webbioc Biobase {} edge webbioc affy {} edge webbioc multtest {} edge webbioc annaffy {} edge webbioc vsn {} edge webbioc gcrma {} edge webbioc qvalue {} edge cghMCR methods {} edge cghMCR DNAcopy {} edge cghMCR marray {} edge cghMCR arrayQuality {} edge widgetInvoke methods {} edge widgetInvoke XML {} edge widgetInvoke RGtk {} edge hexbin methods {} edge hexbin grid {} edge hexbin lattice {} edge hexbin colorspace {} edge matchprobes Biobase {} edge matchprobes affy {} edge siggenes methods {} edge siggenes multtest {} edge siggenes Biobase {} edge AnnBuilder methods {} edge AnnBuilder Biobase {} edge AnnBuilder XML {} edge AnnBuilder annotate {} edge AnnBuilder utils {} edge AnnBuilder RSQLite {} edge pamr NONE {} edge RBGL graph {} edge RBGL methods {} edge biocViews methods {} edge biocViews tools {} edge biocViews graph {} edge biocViews RBGL {} edge biocViews XML {} edge CoCiteStats humanLLMappings {} edge ChromoViz RSvgDevice {} edge ChromoViz XML {} edge GOstats graph {} edge GOstats GO {} edge GOstats annotate {} edge GOstats RBGL {} edge GOstats Biobase {} edge GOstats Category {} edge GOstats methods {} edge prada Biobase {} edge prada RColorBrewer {} edge prada grid {} edge prada methods {} edge prada geneplotter {} edge bridge rama {} edge ontoTools methods {} edge ontoTools graph {} edge ontoTools SparseM {} edge ontoTools GO {} edge ontoTools Biobase {} edge ontoTools annotate {} edge MCRestimate e1071 {} edge MCRestimate pamr {} edge MCRestimate randomForest {} edge MCRestimate RColorBrewer {} edge MCRestimate Biobase {} edge MCRestimate golubEsets {} edge aroma.light R.oo {} edge pkgDepTools methods {} edge pkgDepTools graph {} edge pkgDepTools RBGL {} edge MeasurementError.cor NONE {} edge logicFS LogicReg {} edge copa Biobase {} edge copa methods {} edge Category Biobase {} edge Category KEGG {} edge Category GO {} edge Category graph {} edge Category annotate {} edge Category methods {} edge Category genefilter {} edge Harshlight affy {} edge OrderedList Biobase {} edge OrderedList twilight {} edge MVCClass methods {} edge panp affy {} edge LPE NONE {} edge MANOR GLAD {} edge RbcBook1 Biobase {} edge vsn Biobase {} edge iSPlot methods {} edge iSPlot RGtk {} edge iSPlot gtkDevice {} edge iSPlot MVCClass {} edge pickgene MASS {} edge makecdfenv methods {} edge makecdfenv Biobase {} edge makecdfenv affy {} edge makecdfenv utils {} edge makecdfenv affyio {} edge aCGH cluster {} edge aCGH survival {} edge aCGH multtest {} edge aCGH sma {} edge KEGGSOAP methods {} edge KEGGSOAP XML {} edge KEGGSOAP SSOAP {} edge KEGGSOAP RCurl {} edge annotate methods {} edge annotate Biobase {} edge limma methods {} edge timecourse limma {} edge timecourse MASS {} edge timecourse Biobase {} edge timecourse methods {} edge nem e1071 {} edge nem graph {} edge nem Rgraphviz {} edge nem RBGL {} edge HEM Biobase {} edge SBMLR XML {} edge SBMLR odesolve {} edge MLInterfaces Biobase {} edge MLInterfaces methods {} edge MLInterfaces genefilter {} edge weaver digest {} edge weaver tools {} edge weaver utils {} edge weaver codetools {} edge goTools Biobase {} edge goTools annotate {} edge goTools GO {} edge applera Biobase {} edge applera methods {} edge applera affy {} edge applera genefilter {} edge applera limma {} edge applera geneplotter {} edge applera RColorBrewer {} edge applera prada {} edge applera combinat {} edge annaffy methods {} edge annaffy Biobase {} edge annaffy GO {} edge annaffy KEGG {} edge spotSegmentation mclust {} edge geneRecommender Biobase {} edge codelink methods {} edge codelink limma {} edge codelink annotate {} edge widgetTools methods {} edge widgetTools utils {} edge splots grid {} edge RSNPper methods {} edge RSNPper utils {} edge RSNPper tools {} edge RSNPper XML {} edge GeneMeta methods {} edge GeneMeta Biobase {} edge GeneMeta genefilter {} edge GEOquery methods {} edge globaltest methods {} edge globaltest graphics {} edge globaltest multtest {} edge pathRender graph {} edge pathRender Rgraphviz {} edge pathRender cMAP {} edge convert Biobase {} edge convert limma {} edge convert marray {} edge convert utils {} edge convert methods {} edge stam GO {} edge stam Biobase {} edge stam pamr {} edge stam cluster {} edge stam annaffy {} edge stam methods {} edge BSgenome methods {} edge BSgenome Biostrings {} edge pdmclass Biobase {} edge pdmclass fibroEset {} edge pdmclass mda {} edge cellHTS prada {} edge cellHTS RColorBrewer {} edge cellHTS Biobase {} edge cellHTS genefilter {} edge metaArray MergeMaid {} edge EBImage methods {} edge arrayQCplot RGtk2 {} edge arrayQCplot cairoDevice {} edge arrayQCplot LPE {} edge hopach cluster {} edge hopach Biobase {} edge DNAcopy NONE {} edge ssize gdata {} edge ssize xtable {} edge apComplex graph {} edge tilingArray methods {} edge tilingArray Biobase {} edge tilingArray affy {} edge tilingArray RColorBrewer {} edge tilingArray grid {} edge tilingArray strucchange {} edge tilingArray vsn {} edge tilingArray genefilter {} edge tilingArray geneplotter {} edge tilingArray pixmap {} edge RMAPPER methods {} edge splicegear methods {} edge splicegear utils {} edge splicegear grid {} edge splicegear Biobase {} edge splicegear XML {} edge splicegear annotate {} edge gff3Plotter methods {} edge mmgmos methods {} edge mmgmos Biobase {} edge mmgmos affy {} edge plgem Biobase {} edge plgem MASS {} edge DEDS methods {} edge pgUtils Rdbi {} edge pgUtils RdbiPgSQL {} edge pgUtils methods {} edge hypergraph methods {} edge hypergraph graph {} edge arrayMagic methods {} edge arrayMagic utils {} edge arrayMagic Biobase {} edge arrayMagic vsn {} edge arrayMagic limma {} edge arrayMagic genefilter {} edge nudge stats {} edge sscore affy {} edge sscore affxparser {} edge simulatorAPMS graph {} edge simulatorAPMS apComplex {} edge simulatorAPMS Rgraphviz {} edge simulatorAPMS ScISI {} edge simulatorAPMS ppiStats {} edge affy Biobase {} edge affy methods {} edge affy utils {} edge affy affyio {} edge OCplus akima {} edge OCplus multtest {} edge diffGeneAnalysis minpack.lm {} edge macat Biobase {} edge macat annotate {} edge idiogram methods {} edge idiogram Biobase {} edge idiogram annotate {} edge pcot2 grDevices {} edge pcot2 Biobase {} edge pcot2 amap {} edge iSNetwork methods {} edge iSNetwork graph {} edge iSNetwork Rgraphviz {} edge iSNetwork RGtk {} edge iSNetwork gtkDevice {} edge iSNetwork BioMVCClass {} edge iSNetwork MVCClass {} edge iSNetwork Biobase {} edge iSNetwork annotate {} edge affyPLM affy {} edge affyPLM affydata {} edge affyPLM Biobase {} edge affyPLM methods {} edge affyPLM gcrma {} edge spikeLI utils {} edge genefilter methods {} edge genefilter Biobase {} edge genefilter survival {} edge altcdfenvs methods {} edge altcdfenvs Biobase {} edge altcdfenvs affy {} edge altcdfenvs matchprobes {} edge altcdfenvs makecdfenv {} edge OLIN methods {} edge OLIN stats {} edge OLIN locfit {} edge OLIN Biobase {} edge OLIN marray {} edge beadarraySNP methods {} edge beadarraySNP Biobase {} edge beadarraySNP limma {} edge beadarraySNP quantsmooth {} edge Heatplus NONE {} edge GeneTS GeneCycle {} edge GeneTS GeneNet {} edge safe methods {} edge safe Biobase {} edge Rgraphviz methods {} edge Rgraphviz graph {} edge Rgraphviz geneplotter {} edge RdbiPgSQL Rdbi {} edge twilight splines {} edge twilight stats {} edge GeneTraffic Biobase {} edge GeneTraffic affy {} edge GeneTraffic marray {} edge GeneTraffic SSOAP {} edge GeneTraffic XML {} edge GeneTraffic digest {} edge GeneTraffic methods {} edge simpleaffy affy {} edge simpleaffy genefilter {} edge maSigPro Biobase {} edge Icens survival {} edge Rredland methods {} edge Rredland graph {} edge graph methods {} edge nnNorm nnet {} edge nnNorm marray {} edge genArise locfit {} edge genArise tkrplot {} edge genArise xtable {} edge genArise methods {} edge EBarrays Biobase {} edge EBarrays methods {} edge EBarrays utils {} edge EBarrays lattice {} edge reb Biobase {} edge reb idiogram {} edge SAGx stats {} edge SAGx multtest {} edge SAGx sma {} edge SAGx methods {} edge RMAGEML marray {} edge RMAGEML limma {} edge RMAGEML Biobase {} edge affyio methods {} edge edd methods {} edge edd golubEsets {} edge edd Biobase {} edge edd class {} edge edd nnet {} edge edd xtable {} edge maDB Biobase {} edge maDB affy {} edge maDB limma {} edge maDB methods {} edge DynDoc methods {} edge DynDoc tools {} edge BeadExplorer methods {} edge BeadExplorer widgetTools {} edge BeadExplorer affy {} edge BeadExplorer R2HTML {} edge BeadExplorer grDevices {} edge BeadExplorer tkWidgets {} edge affycoretools affy {} edge affycoretools limma {} edge affycoretools GOstats {} edge affycoretools biomaRt {} edge limmaGUI limma {} edge limmaGUI tcltk {} edge ABarray Biobase {} edge ABarray multtest {} edge GGtools methods {} edge GGtools Biobase {} edge GGtools hgfocus {} edge GGtools geneplotter {} edge Biobase tools {} edge Biobase methods {} edge Biobase utils {} edge factDesign Biobase {} edge factDesign affy {} edge factDesign stats {} edge sagenhaft SparseM {} edge ROC utils {} edge ROC methods {} edge bim stats {} edge bim qtl {} edge gcrma Biobase {} edge gcrma affy {} edge gcrma matchprobes {} edge gcrma splines {} edge adSplit methods {} edge adSplit stats {} edge adSplit cluster {} edge adSplit multtest {} edge adSplit Biobase {} edge adSplit affy {} edge adSplit GO {} edge adSplit KEGG {} edge Resourcerer AnnBuilder {} edge MergeMaid survival {} edge MergeMaid Biobase {} edge MergeMaid MASS {} edge MergeMaid methods {} edge plier affy {} edge quantsmooth quantreg {} edge quantsmooth lodplot {} edge affycomp Biobase {} edge stepNorm marray {} edge stepNorm MASS {} edge stepNorm methods {} edge clusterStab Biobase {} edge clusterStab methods {} edge affyQCReport Biobase {} edge affyQCReport affy {} edge affyQCReport simpleaffy {} edge affypdnn affy {} edge affypdnn affydata {} edge affypdnn hgu95av2probe {} edge affydata affy {} edge pairseqsim methods {} edge pairseqsim stats {} edge fdrame NONE {} edge ScISI methods {} edge ScISI apComplex {} edge ScISI GO {} edge ScISI GOstats {} edge ScISI graph {} edge ScISI RBGL {} edge ScISI Rgraphviz {} edge ScISI YEAST {} edge ScISI xtable {} edge multtest methods {} edge multtest Biobase {} edge multtest survival {} edge ctc NONE {} edge yeastExpData graph {} edge golubEsets Biobase {} edge estrogen affy {} edge MAQCsubset Biobase {} edge fibroEset Biobase {} edge HEEBOdata NONE {} edge facsDorit prada {} edge Iyer517 Biobase {} edge stjudem utils {} edge ProData Biobase {} edge SpikeIn affy {} edge ALL Biobase {} edge AmpAffyExample affy {} edge kidpack Biobase {} edge CLL affy {} edge CLL Biobase {} edge SpikeInSubset Biobase {} edge SpikeInSubset affy {} edge gaschYHS Biobase {} edge ALLMLL affy {} edge bronchialIL13 affy {} edge beta7 marray {} edge lungExpression Biobase {} edge HIVcDNAvantWout03 NONE {} edge yeastCC Biobase {} edge harbChIP Biobase {} edge ppiData Rgraphviz {} edge ppiData graph {} edge colonCA Biobase {} edge SNAData graph {} edge ecoliLeucine affy {} edge davidTiling Biobase {} edge davidTiling tilingArray {} edge davidTiling GO {} edge MEEBOdata NONE {} edge GGdata Biobase {} edge GGdata hgfocus {} edge rn230rnentrezgprobe matchprobes {} edge rn230brnrefseqprobe matchprobes {} edge dmgenome1dmense utils {} edge medicagoprobe matchprobes {} edge dmgenome1dmugcdf utils {} edge hsex10stv2ptentrezg utils {} edge caninecdf utils {} edge mm430ammensgcdf utils {} edge mm430ammrefseqcdf utils {} edge hsfocushsenstprobe matchprobes {} edge hs133bhsentrezgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrugcdf utils {} edge mm430ammentrezg utils {} edge hgu133bprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmentrezgprobe matchprobes {} edge rn34arnenseprobe matchprobes {} edge soybeancdf utils {} edge hs133xptensgprobe matchprobes {} edge rtu34probe matchprobes {} edge hsex10stv2hsensgcdf utils {} edge rnex10stv1rnensecdf utils {} edge mm11ksubbmmentrezgcdf utils {} edge mu6500subdcdf utils {} edge mm74av2mmensgcdf utils {} edge mm74bv2mmentrezgcdf utils {} edge rn230rnenstprobe matchprobes {} edge hs95av2hsrefseq utils {} edge hsex10stv2hsentrezg utils {} edge mm430bmmenstprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsense utils {} edge mm74av2mmentrezg utils {} edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 methods {} edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 Biostrings {} edge BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 BSgenome {} edge dmgenome1dmensg utils {} edge mm430bmmensecdf utils {} edge mm430mmensgcdf utils {} edge hu35ksubaprobe matchprobes {} edge rn230brnensgprobe matchprobes {} edge hsex10stv2ptense utils {} edge osriceostigrprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsentrezgprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfenstprobe matchprobes {} edge mm430mmentrezg utils {} edge mm74av1mmrefseqprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnrefseq utils {} edge atgenomeattaircdf utils {} edge hs133xptensgcdf utils {} edge mu19ksubccdf utils {} edge hgu95ecdf utils {} edge atgenomeatrefseqcdf utils {} edge hs133phsrefseqprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsensg utils {} edge hs133xptentrezg utils {} edge saureusprobe matchprobes {} edge hs133av2hsenseprobe matchprobes {} edge rhesusprobe matchprobes {} edge mm74av2mmense utils {} edge mm11ksubammenstcdf utils {} edge mmex10stv1mmrefseq utils {} edge cfcanine2cfentrezgcdf utils {} edge ggchickenggenstprobe matchprobes {} edge cyp450cdf utils {} edge hsex10stv2ptensg utils {} edge hs133pptenseprobe matchprobes {} edge hs133xhsensgcdf utils {} edge poplarcdf utils {} edge dmdrosophila2dmrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2hsrefseqprobe matchprobes {} edge hs133xhsentrezg utils {} edge mm11ksubammugcdf utils {} edge mm74av2mmensg utils {} edge hsex10stv2hsenstprobe matchprobes {} edge mgu74cprobe matchprobes {} edge hsfocushsenseprobe matchprobes {} edge hs133bhsentrezgcdf utils {} edge mmex10stv1mmense utils {} edge mm11ksubammenstprobe matchprobes {} edge hs133av2ptensgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrense utils {} edge mm430mmrefseqcdf utils {} edge cfcanine2cfenstcdf utils {} edge hs133aptenstcdf utils {} edge rn230rnenseprobe matchprobes {} edge mm430bmmenseprobe matchprobes {} edge mm74av1mmug utils {} edge bovinecdf utils {} edge drzebrafishdrensecdf utils {} edge dmgenome1dmensecdf utils {} edge rae230bcdf utils {} edge hu6800cdf utils {} edge ath1attairprobe matchprobes {} edge canineprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmensg utils {} edge hs133ahsrefseqcdf utils {} edge cfcanine2cfenseprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnugcdf utils {} edge mm74av2mmrefseq utils {} edge hs133ahsenstcdf utils {} edge mm430mmrefseq utils {} edge drzebrafishdrensg utils {} edge ggchickenggenstcdf utils {} edge mm74cv2mmenstcdf utils {} edge hsfocusptensgprobe matchprobes {} edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 methods {} edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 Biostrings {} edge BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 BSgenome {} edge hs133bhsenstprobe matchprobes {} edge mm11ksubammugprobe matchprobes {} edge ggchickenggenseprobe matchprobes {} edge mm430mmense utils {} edge mm74cv2mmenstprobe matchprobes {} edge dmdrosophila2dmenst utils {} edge tomatocdf utils {} edge mm74av1mmenst utils {} edge mgu74bv2probe matchprobes {} edge rn230arnenstcdf utils {} edge hgu133acdf utils {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 methods {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 Biostrings {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 BSgenome {} edge hs95av2hsenstprobe matchprobes {} edge atgenomeattigrprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfense utils {} edge rnex10stv1rnensgcdf utils {} edge mm74cv2mmentrezgcdf utils {} edge hs133ahsense utils {} edge dmdrosophila2dmenstprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsenseprobe matchprobes {} edge hsfocusptentrezgprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnentrezg utils {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 methods {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 Biostrings {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 BSgenome {} edge moe430bcdf utils {} edge rnex10stv1rnensgprobe matchprobes {} edge mm430mmentrezgprobe matchprobes {} edge ye6100subacdf utils {} edge mm430mmensg utils {} edge hs133xhsug utils {} edge mm11ksubammenseprobe matchprobes {} edge chickencdf utils {} edge mm430bmmensgcdf utils {} edge hs133aptense utils {} edge rn230rnenstcdf utils {} edge rn230arnenstprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfrefseq utils {} edge mm430bmmentrezg utils {} edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 methods {} edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 Biostrings {} edge BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 BSgenome {} edge cfcanine2cfugprobe matchprobes {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 methods {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 Biostrings {} edge BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 BSgenome {} edge hs133phsug utils {} edge zebrafishcdf utils {} edge rat2302cdf utils {} edge moe430bprobe matchprobes {} edge rn230rnugcdf utils {} edge cfcanine2cfensg utils {} edge hgu95bprobe matchprobes {} edge yeast2cdf utils {} edge hgu133plus2probe matchprobes {} edge hs133ahsensg utils {} edge mm74av1mmrefseqcdf utils {} edge mmex10stv1mmenstprobe matchprobes {} edge hsfocusptenstcdf utils {} edge mm74bv2mmensecdf utils {} edge rn230brnug utils {} edge hs133xhsrefseqcdf utils {} edge hs133aptensg utils {} edge hgu133a2probe matchprobes {} edge citrusprobe matchprobes {} edge hs133ahsugprobe matchprobes {} edge hsex10stv2ptensgprobe matchprobes {} edge ggchickenggugprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmugprobe matchprobes {} edge dmgenome1dmenst utils {} edge rn34arnentrezgprobe matchprobes {} edge mm74av2mmenstprobe matchprobes {} edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 methods {} edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 Biostrings {} edge BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 BSgenome {} edge mmex10stv1mmensecdf utils {} edge hs133bhsenseprobe matchprobes {} edge hsfocushsenstcdf utils {} edge mm74cv2mmentrezgprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmenstcdf utils {} edge mm74cv2mmenseprobe matchprobes {} edge hs133xhsense utils {} edge dmdrosophila2dmug utils {} edge mm74bv2mmensgprobe matchprobes {} edge rgu34cprobe matchprobes {} edge rn230arnugprobe matchprobes {} edge hs133xptense utils {} edge hsex10stv2hsenst utils {} edge hs95av2hsenseprobe matchprobes {} edge mgu74bv2cdf utils {} edge rn34arnrefseqcdf utils {} edge hsex10stv2ptenst utils {} edge dmdrosophila2dmenseprobe matchprobes {} edge hthgu133acdf utils {} edge agprobe matchprobes {} edge hsfocushsentrezgprobe matchprobes {} edge hs133xhsensg utils {} edge drzebrafishdrensgcdf utils {} edge dmgenome1dmensgcdf utils {} edge hu35ksubdprobe matchprobes {} edge hs133bptensgprobe matchprobes {} edge rn230rnugprobe matchprobes {} edge maizeprobe matchprobes {} edge rn230arnenseprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrentrezg utils {} edge hs133xptensg utils {} edge hs133pptenstcdf utils {} edge mm74av2mmenst utils {} edge vvgrapevvtigrprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsugcdf utils {} edge hs133bptenstcdf utils {} edge paeg1acdf utils {} edge mm11ksubammug utils {} edge mm430ammugcdf utils {} edge ggchickenggrefseq utils {} edge hs95av2ptensgprobe matchprobes {} edge hs133av2hsrefseqcdf utils {} edge mmex10stv1mmenseprobe matchprobes {} edge mm430ammensgprobe matchprobes {} edge hs133ahsrefseqprobe matchprobes {} edge hs133bhsense utils {} edge hs133phsenstcdf utils {} edge hs133bptentrezgcdf utils {} edge hgu133aprobe matchprobes {} edge hs133bhsenstcdf utils {} edge dmdrosophila2dmrefseq utils {} edge hs133bptense utils {} edge mm74av2mmenseprobe matchprobes {} edge mm11ksubammense utils {} edge hu35ksubbcdf utils {} edge mmex10stv1mmenst utils {} edge dmdrosophila2dmenstcdf utils {} edge hsfocushsugprobe matchprobes {} edge atgenomeattigr utils {} edge hgu133atagcdf utils {} edge mm11ksubbmmugprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrenst utils {} edge hgu133a2cdf utils {} edge drzebrafishdrenstprobe matchprobes {} edge hs133phsentrezgcdf utils {} edge hs95av2hsugcdf utils {} edge hs133bhsensg utils {} edge hs95av2hsentrezgcdf utils {} edge ye6100subccdf utils {} edge rn34arnrefseqprobe matchprobes {} edge hsfocushsrefseqcdf utils {} edge hsex10stv2hsug utils {} edge rn230brnenstcdf utils {} edge hs133phsense utils {} edge hs133bptensg utils {} edge mm11ksubammensg utils {} edge rn230rnrefseqcdf utils {} edge mu6500subacdf utils {} edge hs133pptense utils {} edge tomatoprobe matchprobes {} edge rgu34acdf utils {} edge mm430bmmrefseqcdf utils {} edge osriceosrefseqprobe matchprobes {} edge dmdrosophila2dmugcdf utils {} edge bovineprobe matchprobes {} edge hgu95av2cdf utils {} edge mm74bv2mmensgcdf utils {} edge mm11ksubbmmugcdf utils {} edge mgu74bcdf utils {} edge mm74av1mmugcdf utils {} edge cfcanine2cfrefseqcdf utils {} edge hu6800subbcdf utils {} edge hs133phsensg utils {} edge rn34arnenstcdf utils {} edge mm74bv2mmentrezg utils {} edge mm74av1mmentrezgprobe matchprobes {} edge mm430mmenst utils {} edge hsfocushsugcdf utils {} edge test3probe matchprobes {} edge soybeanprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmensgcdf utils {} edge hs133pptensg utils {} edge mm74av1mmenstcdf utils {} edge dmgenome1dmenstprobe matchprobes {} edge hgu95bcdf utils {} edge mgu74bprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmentrezg utils {} edge hs133xhsugcdf utils {} edge hs133phsugprobe matchprobes {} edge ggchickenggrefseqcdf utils {} edge cfcanine2cfenst utils {} edge mm430ammrefseqprobe matchprobes {} edge mm74av2mmug utils {} edge mm430mmensgprobe matchprobes {} edge hs133phsugcdf utils {} edge hs133bhsugprobe matchprobes {} edge hs133ahsenst utils {} edge rnex10stv1rnentrezgcdf utils {} edge hs133ahsug utils {} edge dmdrosophila2dmugprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmrefseq utils {} edge hs133aptenst utils {} edge hs133av2hsentrezgcdf utils {} edge test1cdf utils {} edge rn230arnugcdf utils {} edge maizecdf utils {} edge plasmodiumanophelesprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrenseprobe matchprobes {} edge hs133ahsensgprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsrefseqcdf utils {} edge rn34arnrefseq utils {} edge mm74av1mmrefseq utils {} edge gp53cdf utils {} edge mm11ksubammrefseqcdf utils {} edge ecoliasv2probe matchprobes {} edge rn230brnugprobe matchprobes {} edge hs133aptenstprobe matchprobes {} edge atgenomeattairprobe matchprobes {} edge hs133av2ptenstcdf utils {} edge mgu74cv2probe matchprobes {} edge hs95av2hsense utils {} edge ggchickenggug utils {} edge hgu95eprobe matchprobes {} edge hs133pptentrezgprobe matchprobes {} edge canine2probe matchprobes {} edge mm11ksubbmmense utils {} edge hsfocushsense utils {} edge mm11ksubbmmenstprobe matchprobes {} edge rn230arnense utils {} edge hs95av2ptense utils {} edge ath1attigr utils {} edge yeast2probe matchprobes {} edge mm430bmmrefseq utils {} edge hsfocusptense utils {} edge hs133av2hsenstcdf utils {} edge agcdf utils {} edge rn34arnugprobe matchprobes {} edge hs133xhsenst utils {} edge hs95av2hsensg utils {} edge hu35ksubdcdf utils {} edge mm74av1mmugprobe matchprobes {} edge dmgenome1dmenseprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmensg utils {} edge hs133xptenst utils {} edge hsfocushsensg utils {} edge cfcanine2cfrefseqprobe matchprobes {} edge hs133phsenstprobe matchprobes {} edge hs133bhsrefseqcdf utils {} edge rn230arnensg utils {} edge hs95av2ptensg utils {} edge mm430mmug utils {} edge mm74cv2mmrefseqcdf utils {} edge ath1121501cdf utils {} edge hsfocusptensg utils {} edge ricecdf utils {} edge mm11ksubammensecdf utils {} edge wheatprobe matchprobes {} edge hs133av2hsugcdf utils {} edge drosophila2cdf utils {} edge moe430aprobe matchprobes {} edge hs95av2ptenstcdf utils {} edge hs95av2hsrefseqcdf utils {} edge hgu95aprobe matchprobes {} edge atgenomeattigrcdf utils {} edge barley1probe matchprobes {} edge mm74av1mmensgprobe matchprobes {} edge mu6500subccdf utils {} edge dmdrosophila2dmrefseqcdf utils {} edge dmgenome1dmrefseqprobe matchprobes {} edge rgu34ccdf utils {} edge hs133xhsensgprobe matchprobes {} edge hsfocushsrefseq utils {} edge hcg110probe matchprobes {} edge hs95av2hsenstcdf utils {} edge mm430mmentrezgcdf utils {} edge hs133bhsrefseq utils {} edge hs133aptenseprobe matchprobes {} edge rn230rnrefseqprobe matchprobes {} edge hs133xptenstprobe matchprobes {} edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 methods {} edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 Biostrings {} edge BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 BSgenome {} edge mu11ksubbprobe matchprobes {} edge rn230arnrefseqcdf utils {} edge osriceosrefseq utils {} edge hu6800subdcdf utils {} edge mm74bv2mmug utils {} edge ecoliasv2cdf utils {} edge hs133bhsenst utils {} edge mm74av2mmentrezgprobe matchprobes {} edge hivprtplus2cdf utils {} edge hs133phsentrezgprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmenseprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfensecdf utils {} edge hs133xptentrezgprobe matchprobes {} edge mm74av1mmentrezgcdf utils {} edge hs133aptensecdf utils {} edge hs133bptenst utils {} edge mu19ksubbcdf utils {} edge rn230brnenstprobe matchprobes {} edge mm11ksubammenst utils {} edge hsex10stv2ptenstcdf utils {} edge hgu95dcdf utils {} edge mmex10stv1mmrefseqcdf utils {} edge mm74cv2mmrefseqprobe matchprobes {} edge rgu34bprobe matchprobes {} edge hs133av2hsugprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrug utils {} edge hs133pptentrezgcdf utils {} edge hs95av2ptentrezgcdf utils {} edge mm430mmugcdf utils {} edge mm430ammenstcdf utils {} edge rn34arnensgprobe matchprobes {} edge mgu74av2cdf utils {} edge ath1121501probe matchprobes {} edge rn230rnug utils {} edge osriceostigr utils {} edge citruscdf utils {} edge mm74av2mmrefseqcdf utils {} edge hs133av2hsense utils {} edge hs133ahsensecdf utils {} edge hs133phsenseprobe matchprobes {} edge hsex10stv2hsenstcdf utils {} edge ggchickenggensecdf utils {} edge mm74av2mmenstcdf utils {} edge mm74cv2mmensecdf utils {} edge test3cdf utils {} edge ath1atrefseq utils {} edge hs133av2ptense utils {} edge hs133phsenst utils {} edge mm74av2mmrefseqprobe matchprobes {} edge mm430ammentrezgcdf utils {} edge hu35ksubcprobe matchprobes {} edge rn230brnense utils {} edge hs133pptenst utils {} edge mm11ksubbmmug utils {} edge mm430bmmugcdf utils {} edge mm430mmenstcdf utils {} edge mm11ksubammrefseqprobe matchprobes {} edge chickenprobe matchprobes {} edge hs133av2hsensg utils {} edge rn230arnentrezgcdf utils {} edge atgenomeatrefseqprobe matchprobes {} edge poplarprobe matchprobes {} edge rn230arnensecdf utils {} edge hs133av2hsensgprobe matchprobes {} edge plasmodiumanophelescdf utils {} edge hs133xptenstcdf utils {} edge hs133av2ptensg utils {} edge bsubtilisprobe matchprobes {} edge rn230arnrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2hsugprobe matchprobes {} edge hs133av2ptenstprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmense utils {} edge hs133pptensgprobe matchprobes {} edge rn230brnensg utils {} edge hs133xptenseprobe matchprobes {} edge rae230acdf utils {} edge mu11ksubbcdf utils {} edge hs133xhsentrezgcdf utils {} edge mouse430a2cdf utils {} edge hgfocusprobe matchprobes {} edge hs133xhsenstcdf utils {} edge drosgenome1cdf utils {} edge hsex10stv2hsentrezgcdf utils {} edge rn230rnensecdf utils {} edge rn230brnrefseq utils {} edge cfcanine2cfentrezgprobe matchprobes {} edge hs133av2ptentrezgcdf utils {} edge hs133xhsentrezgprobe matchprobes {} edge rn230brnenseprobe matchprobes {} edge hsfocushsensgprobe matchprobes {} edge hs133av2hsrefseq utils {} edge mm74cv2mmensg utils {} edge mm430ammugprobe matchprobes {} edge hsfocusptenstprobe matchprobes {} edge mm11ksubammensgcdf utils {} edge hsfocusptensecdf utils {} edge hsex10stv2hsrefseq utils {} edge rn230rnensgprobe matchprobes {} edge hs133xhsrefseq utils {} edge mm430bmmensgprobe matchprobes {} edge mm11ksubammentrezg utils {} edge hsex10stv2hsugprobe matchprobes {} edge ath1atrefseqprobe matchprobes {} edge mm74av2mmugprobe matchprobes {} edge mm74av2mmugcdf utils {} edge rnu34cdf utils {} edge mm74cv2mmug utils {} edge osriceostigrcdf utils {} edge mm11ksubammentrezgprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmug utils {} edge hs95av2ptentrezgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrrefseqcdf utils {} edge cfcanine2cfensgprobe matchprobes {} edge hs95av2hsenst utils {} edge hsfocushsensecdf utils {} edge ath1attaircdf utils {} edge mm430mmugprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmenst utils {} edge moe430acdf utils {} edge hsfocushsenst utils {} edge mm11ksubbmmensecdf utils {} edge rn230arnenst utils {} edge hs95av2ptenst utils {} edge hsfocusptenst utils {} edge mm430ammug utils {} edge mgu74aprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnenstprobe matchprobes {} edge ggchickenggensgprobe matchprobes {} edge hs133bhsug utils {} edge mm11ksubammentrezgcdf utils {} edge cfcanine2cfensgcdf utils {} edge hs133av2ptenseprobe matchprobes {} edge hs133aptensgcdf utils {} edge cfcanine2cfentrezg utils {} edge rn230brnugcdf utils {} edge hs133aptentrezg utils {} edge mm11ksubammrefseq utils {} edge rae230bprobe matchprobes {} edge mouse430a2probe matchprobes {} edge hs133xhsugprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmrefseq utils {} edge hgu133atagprobe matchprobes {} edge hs133pptensecdf utils {} edge hsex10stv2hsensgprobe matchprobes {} edge rn34arnense utils {} edge hs133ahsensgcdf utils {} edge dmgenome1dmrefseqcdf utils {} edge rnex10stv1rnenstcdf utils {} edge ggchickenggensgcdf utils {} edge mm74cv2mmensgcdf utils {} edge hs133bptensecdf utils {} edge rnex10stv1rnug utils {} edge drzebrafishdrrefseqprobe matchprobes {} edge mm11ksubammensgprobe matchprobes {} edge hs133ahsentrezg utils {} edge hs133phsrefseq utils {} edge riceprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmentrezg utils {} edge hsex10stv2ptenstprobe matchprobes {} edge hsfocusptenseprobe matchprobes {} edge mm430bmmenstcdf utils {} edge barley1cdf utils {} edge hs133phsensecdf utils {} edge hgu95dprobe matchprobes {} edge celeganscdf utils {} edge hs133bhsensecdf utils {} edge rn34arnensg utils {} edge mm430ammense utils {} edge mm430ammrefseq utils {} edge rn230arnensgcdf utils {} edge hs95av2hsentrezgprobe matchprobes {} edge dmdrosophila2dmensecdf utils {} edge rn230arnentrezg utils {} edge mm74bv2mmenstprobe matchprobes {} edge ecoli2probe matchprobes {} edge cfcanine2cfugcdf utils {} edge hs133ahsentrezgcdf utils {} edge hs133bhsensgprobe matchprobes {} edge rn230brnensecdf utils {} edge rn230rnensgcdf utils {} edge rnex10stv1rnenseprobe matchprobes {} edge mm430ammensg utils {} edge mm74cv2mmensgprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmrefseqcdf utils {} edge PFAM RSQLite {} edge rn230rnentrezg utils {} edge hs133bptenstprobe matchprobes {} edge hs133av2hsenst utils {} edge drosophila2probe matchprobes {} edge u133x3pcdf utils {} edge hs95av2hsensgprobe matchprobes {} edge hs133av2ptenst utils {} edge sugarcanecdf utils {} edge medicagocdf utils {} edge rtu34cdf utils {} edge hsfocusptensgcdf utils {} edge dmdrosophila2dmensgprobe matchprobes {} edge rn230brnenst utils {} edge rnex10stv1rnrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2ptenstprobe matchprobes {} edge hsfocusptentrezg utils {} edge rnex10stv1rnugprobe matchprobes {} edge mm430ammenstprobe matchprobes {} edge hgu133bcdf utils {} edge rn34arnensecdf utils {} edge hu35ksubacdf utils {} edge hs133phsrefseqcdf utils {} edge ggchickenggense utils {} edge xenopuslaevisprobe matchprobes {} edge hcg110cdf utils {} edge hs133ahsrefseq utils {} edge mm11ksubbmmentrezgprobe matchprobes {} edge hsex10stv2ptenseprobe matchprobes {} edge mm74av1mmensecdf utils {} edge rn230arnensgprobe matchprobes {} edge rn230rnrefseq utils {} edge hs133ahsugcdf utils {} edge hsfocushsentrezgcdf utils {} edge mu11ksubaprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrenstcdf utils {} edge dmgenome1dmenstcdf utils {} edge mm430bmmugprobe matchprobes {} edge hsfocushsensgcdf utils {} edge mm11ksubbmmensgcdf utils {} edge ye6100subbcdf utils {} edge mmex10stv1mmentrezgcdf utils {} edge hsfocushsentrezg utils {} edge canine2cdf utils {} edge hs133xptentrezgcdf utils {} edge hs133bhsrefseqprobe matchprobes {} edge mm74cv2mmenst utils {} edge mm11ksubbmmentrezg utils {} edge ecolicdf utils {} edge mm74bv2mmugcdf utils {} edge hsex10stv2ptentrezgcdf utils {} edge rnex10stv1rnense utils {} edge vvgrapevvtigrcdf utils {} edge mmex10stv1mmensgprobe matchprobes {} edge ggchickenggensg utils {} edge rnex10stv1rnentrezgprobe matchprobes {} edge hsfocushsug utils {} edge rn230rnense utils {} edge mm74bv2mmenseprobe matchprobes {} edge rgu34aprobe matchprobes {} edge vvgrapevvtigr utils {} edge mm74av2mmensgprobe matchprobes {} edge rhesuscdf utils {} edge zebrafishprobe matchprobes {} edge hsfocushsrefseqprobe matchprobes {} edge mgu74acdf utils {} edge hu6800subacdf utils {} edge rnex10stv1rnensg utils {} edge hs133pptensgcdf utils {} edge hs133av2ptensecdf utils {} edge hu35ksubbprobe matchprobes {} edge rnu34probe matchprobes {} edge xenopuslaeviscdf utils {} edge hs133bptenseprobe matchprobes {} edge rn230rnensg utils {} edge rn34arnug utils {} edge rn230brnrefseqcdf utils {} edge dmgenome1dmrefseq utils {} edge hs133bptensgcdf utils {} edge hs133pptentrezg utils {} edge mm430bmmense utils {} edge hgu95acdf utils {} edge ath1atrefseqcdf utils {} edge hs133av2ptentrezgprobe matchprobes {} edge hs133bptentrezg utils {} edge hs133xhsrefseqprobe matchprobes {} edge hs133phsensgcdf utils {} edge hs133av2hsensecdf utils {} edge hs95av2ptenseprobe matchprobes {} edge rn230arnentrezgprobe matchprobes {} edge mm430ammentrezgprobe matchprobes {} edge mm430ammenseprobe matchprobes {} edge hs133aptentrezgprobe matchprobes {} edge hs133bhsensgcdf utils {} edge hs133phsentrezg utils {} edge mm74bv2mmense utils {} edge rat2302probe matchprobes {} edge mouse4302probe matchprobes {} edge hs133bhsentrezg utils {} edge mm430mmenstprobe matchprobes {} edge atgenomeattair utils {} edge mm430bmmensg utils {} edge drzebrafishdrugprobe matchprobes {} edge ecoli2cdf utils {} edge dmgenome1dmugprobe matchprobes {} edge dmdrosophila2dmensgcdf utils {} edge bsubtiliscdf utils {} edge mm74bv2mmenstcdf utils {} edge rn230arnrefseq utils {} edge hs133av2hsrefseqprobe matchprobes {} edge atgenomeatrefseq utils {} edge mm430bmmrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2ptensecdf utils {} edge ygs98cdf utils {} edge hs133ahsenstprobe matchprobes {} edge mm74bv2mmensg utils {} edge rn230brnensgcdf utils {} edge hgu133plus2cdf utils {} edge mmex10stv1mmenstcdf utils {} edge mmex10stv1mmrefseqprobe matchprobes {} edge ygs98probe matchprobes {} edge rn230brnentrezg utils {} edge hsex10stv2hsrefseqprobe matchprobes {} edge rn34arnenst utils {} edge hs95av2hsensecdf utils {} edge mm430mmrefseqprobe matchprobes {} edge mm74bv2mmentrezgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrensgprobe matchprobes {} edge cfcanine2cfug utils {} edge rn34arnensgcdf utils {} edge hu35ksubccdf utils {} edge mm430bmmug utils {} edge rn34arnentrezg utils {} edge mm74av1mmensgcdf utils {} edge hs133av2hsentrezgprobe matchprobes {} edge mm430ammenst utils {} edge u133aaofav2cdf utils {} edge hsex10stv2ptensecdf utils {} edge ggchickenggugcdf utils {} edge mm74av1mmentrezg utils {} edge drzebrafishdrrefseq utils {} edge ecoliprobe matchprobes {} edge ye6100subdcdf utils {} edge hs95av2hsug utils {} edge porcineprobe matchprobes {} edge mm430ammensecdf utils {} edge hs133aptentrezgcdf utils {} edge mm74bv2mmrefseq utils {} edge hs133ahsentrezgprobe matchprobes {} edge mm430mmenseprobe matchprobes {} edge ath1attigrprobe matchprobes {} edge rn230rnentrezgcdf utils {} edge hsex10stv2hsensecdf utils {} edge mu6500subbcdf utils {} edge mm74av2mmensecdf utils {} edge mm74av2mmentrezgcdf utils {} edge rgu34bcdf utils {} edge rae230aprobe matchprobes {} edge sugarcaneprobe matchprobes {} edge mm74bv2mmugprobe matchprobes {} edge saureuscdf utils {} edge mgu74av2probe matchprobes {} edge htratfocuscdf utils {} edge mm74av1mmenstprobe matchprobes {} edge mm430mmensecdf utils {} edge dmgenome1dmensgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrentrezgcdf utils {} edge mgu74ccdf utils {} edge mm74cv2mmugcdf utils {} edge hu6800subccdf utils {} edge hs133ahsenseprobe matchprobes {} edge hs133xhsenstprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmugprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnrefseqcdf utils {} edge mouse4302cdf utils {} edge hs133av2ptensgcdf utils {} edge paeg1aprobe matchprobes {} edge hs133xptensecdf utils {} edge mu19ksubacdf utils {} edge hs133av2ptentrezg utils {} edge hgu95ccdf utils {} edge mm430bmmentrezgcdf utils {} edge hsfocusptentrezgcdf utils {} edge ath1attair utils {} edge ggchickenggenst utils {} edge wheatcdf utils {} edge celegansprobe matchprobes {} edge hgu95cprobe matchprobes {} edge vitisviniferaprobe matchprobes {} edge hgu95av2probe matchprobes {} edge drosgenome1probe matchprobes {} edge hs133av2hsensgcdf utils {} edge rn230brnentrezgprobe matchprobes {} edge mm430bmmentrezgprobe matchprobes {} edge hs133bptentrezgprobe matchprobes {} edge rn230brnentrezgcdf utils {} edge hs133xhsensecdf utils {} edge hs133av2hsentrezg utils {} edge osriceosrefseqcdf utils {} edge hgfocuscdf utils {} edge test2cdf utils {} edge hs133aptensgprobe matchprobes {} edge mmex10stv1mmugcdf utils {} edge rn34arnenstprobe matchprobes {} edge rnex10stv1rnenst utils {} edge dmdrosophila2dmense utils {} edge mm74av1mmense utils {} edge rn230arnug utils {} edge rn230rnenst utils {} edge mm11ksubbmmensgprobe matchprobes {} edge drzebrafishdrentrezgprobe matchprobes {} edge rn34arnentrezgcdf utils {} edge hs95av2ptensgcdf utils {} edge hsex10stv2ptentrezgprobe matchprobes {} edge hs133av2hsug utils {} edge mm74bv2mmrefseqcdf utils {} edge hs95av2ptentrezg utils {} edge dmgenome1dmug utils {} edge mgu74cv2cdf utils {} edge rn34arnugcdf utils {} edge dmdrosophila2dmensg utils {} edge mm74av1mmensg utils {} edge mm74av1mmenseprobe matchprobes {} edge hs133bhsugcdf utils {} edge mm430bmmenst utils {} edge hs133av2hsenstprobe matchprobes {} edge hs133phsensgprobe matchprobes {} edge hs95av2hsensgcdf utils {} edge mu11ksubacdf utils {} edge hs133xhsenseprobe matchprobes {} edge ggchickenggrefseqprobe matchprobes {} edge porcinecdf utils {} edge u133x3pprobe matchprobes {} edge mm11ksubbmmrefseqprobe matchprobes {} edge hs95av2hsentrezg utils {} edge hu6800probe matchprobes {} edge hs133pptenstprobe matchprobes {} edge mm74bv2mmrefseqprobe matchprobes {} edge ath1attigrcdf utils {} edge mm74bv2mmenst utils {} edge vitisviniferacdf utils {} edge hsex10stv2ptensgcdf utils {} edge LogitBoost NONE {} edge XML methods {} edge RMySQL methods {} edge RMySQL DBI {} edge SSOAP methods {} edge SSOAP XML {} edge SSOAP RCurl {} edge RCurl methods {} }}
